MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007607	AT	3	6	1030	1035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007607	GA	3	6	1192	1197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007607	AT	3	6	3313	3318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007607	AT	3	6	3741	3746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007607	AT	3	6	4266	4271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007607	AT	3	6	5192	5197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007607	TG	3	6	5218	5223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007607	AT	4	8	5343	5350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007607	AG	3	6	5487	5492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007607	AT	3	6	11644	11649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007607	AT	5	10	13351	13360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007607	CT	3	6	13841	13846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007607	CT	3	6	17524	17529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007607	AT	3	6	18719	18724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007607	TC	3	6	19593	19598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007607	TG	3	6	19606	19611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007607	CT	3	6	20516	20521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007607	AG	3	6	20527	20532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007607	AT	3	6	21320	21325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007607	GA	3	6	21628	21633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007607	GT	3	6	25648	25653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007607	GC	3	6	26162	26167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007607	GA	3	6	29410	29415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007607	TG	3	6	36884	36889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007607	AG	3	6	39062	39067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007607	TC	3	6	42330	42335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007607	AT	3	6	42371	42376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007607	AT	3	6	42485	42490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007607	GA	3	6	46805	46810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007607	CT	3	6	46867	46872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007607	TG	3	6	47105	47110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007607	TA	3	6	47671	47676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007607	AT	3	6	47709	47714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007607	AT	3	6	49259	49264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007607	AT	3	6	49508	49513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007607	CA	3	6	51461	51466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007607	CA	3	6	58027	58032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007607	CT	3	6	59952	59957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007607	AT	4	8	60094	60101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007607	AT	3	6	61754	61759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007607	TC	3	6	63167	63172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007607	CA	3	6	63182	63187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007607	GT	3	6	64962	64967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007607	TG	3	6	67555	67560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007607	TA	4	8	69003	69010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007607	AT	3	6	69137	69142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007607	AC	3	6	69214	69219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007607	AT	3	6	70208	70213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007607	TC	3	6	70877	70882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007607	AT	3	6	75414	75419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007607	TA	3	6	78958	78963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007607	TA	3	6	78969	78974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007607	CA	3	6	79443	79448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007607	TG	3	6	79470	79475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007607	GT	3	6	90059	90064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007607	GC	3	6	90938	90943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007607	GC	3	6	91599	91604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007607	AG	4	8	102747	102754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007607	TC	4	8	108890	108897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007607	CT	3	6	125326	125331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007607	AT	3	6	125615	125620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007607	TG	3	6	127049	127054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007607	AT	3	6	127472	127477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007607	AT	3	6	132203	132208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007607	AT	3	6	138194	138199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007607	AT	3	6	138201	138206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007607	AT	3	6	138335	138340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007607	AG	3	6	138364	138369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007607	CA	3	6	152663	152668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007607	TA	3	6	152728	152733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007607	AG	3	6	157945	157950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007607	TA	3	6	157981	157986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007607	AT	3	6	159152	159157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007607	AT	3	6	159931	159936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007607	AC	3	6	159944	159949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007607	TA	3	6	160778	160783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007607	AG	3	6	161835	161840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007607	GC	3	6	164404	164409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007607	TA	3	6	164416	164421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007607	CA	3	6	166215	166220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007607	AT	4	8	169090	169097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007607	AT	3	6	170228	170233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007607	AT	3	6	170282	170287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007607	AT	3	6	177931	177936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007607	AG	3	6	178379	178384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007607	AC	3	6	179070	179075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007607	TA	3	6	179108	179113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007607	GA	3	6	181130	181135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.