MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007607	CT	3	6	1673	1678	0 %	50 %	0 %	50 %	82524410
2	NC_007607	AT	3	6	6485	6490	50 %	50 %	0 %	0 %	82524415
3	NC_007607	TA	3	6	7760	7765	50 %	50 %	0 %	0 %	82524416
4	NC_007607	TG	3	6	7820	7825	0 %	50 %	50 %	0 %	82524416
5	NC_007607	TA	3	6	8222	8227	50 %	50 %	0 %	0 %	82524416
6	NC_007607	AT	3	6	8357	8362	50 %	50 %	0 %	0 %	82524416
7	NC_007607	AT	4	8	8915	8922	50 %	50 %	0 %	0 %	82524416
8	NC_007607	CT	3	6	9700	9705	0 %	50 %	0 %	50 %	161986650
9	NC_007607	TC	4	8	9975	9982	0 %	50 %	0 %	50 %	161986650
10	NC_007607	TG	3	6	10680	10685	0 %	50 %	50 %	0 %	82524418
11	NC_007607	AT	3	6	11431	11436	50 %	50 %	0 %	0 %	82524419
12	NC_007607	AT	3	6	11506	11511	50 %	50 %	0 %	0 %	82524419
13	NC_007607	TA	3	6	12751	12756	50 %	50 %	0 %	0 %	82524421
14	NC_007607	AT	3	6	12903	12908	50 %	50 %	0 %	0 %	82524421
15	NC_007607	AT	3	6	13035	13040	50 %	50 %	0 %	0 %	82524421
16	NC_007607	GT	3	6	13257	13262	0 %	50 %	50 %	0 %	82524421
17	NC_007607	TA	4	8	13270	13277	50 %	50 %	0 %	0 %	82524421
18	NC_007607	TG	3	6	15332	15337	0 %	50 %	50 %	0 %	82524425
19	NC_007607	AT	3	6	19437	19442	50 %	50 %	0 %	0 %	82524429
20	NC_007607	AT	3	6	19445	19450	50 %	50 %	0 %	0 %	82524429
21	NC_007607	AG	3	6	20079	20084	50 %	0 %	50 %	0 %	82524430
22	NC_007607	AT	3	6	21159	21164	50 %	50 %	0 %	0 %	82524431
23	NC_007607	TC	4	8	24048	24055	0 %	50 %	0 %	50 %	82524435
24	NC_007607	CG	3	6	24277	24282	0 %	0 %	50 %	50 %	82524435
25	NC_007607	TC	3	6	24391	24396	0 %	50 %	0 %	50 %	82524435
26	NC_007607	CG	3	6	26425	26430	0 %	0 %	50 %	50 %	82524437
27	NC_007607	GT	3	6	26623	26628	0 %	50 %	50 %	0 %	82524437
28	NC_007607	GA	3	6	27315	27320	50 %	0 %	50 %	0 %	82524437
29	NC_007607	AG	3	6	27974	27979	50 %	0 %	50 %	0 %	82524438
30	NC_007607	AT	3	6	28125	28130	50 %	50 %	0 %	0 %	82524438
31	NC_007607	TG	3	6	31667	31672	0 %	50 %	50 %	0 %	82524441
32	NC_007607	AT	3	6	33445	33450	50 %	50 %	0 %	0 %	82524443
33	NC_007607	AT	3	6	35636	35641	50 %	50 %	0 %	0 %	82524444
34	NC_007607	TA	3	6	36056	36061	50 %	50 %	0 %	0 %	82524444
35	NC_007607	GT	3	6	36483	36488	0 %	50 %	50 %	0 %	82524444
36	NC_007607	TG	3	6	37777	37782	0 %	50 %	50 %	0 %	82524446
37	NC_007607	GC	3	6	39832	39837	0 %	0 %	50 %	50 %	82524449
38	NC_007607	TA	3	6	42659	42664	50 %	50 %	0 %	0 %	82524452
39	NC_007607	CA	3	6	43129	43134	50 %	0 %	0 %	50 %	82524453
40	NC_007607	AT	3	6	43877	43882	50 %	50 %	0 %	0 %	82524454
41	NC_007607	TG	3	6	45244	45249	0 %	50 %	50 %	0 %	82524457
42	NC_007607	TC	3	6	46277	46282	0 %	50 %	0 %	50 %	82524459
43	NC_007607	AT	3	6	47801	47806	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
44	NC_007607	TC	3	6	48008	48013	0 %	50 %	0 %	50 %	82524461
45	NC_007607	TA	3	6	48115	48120	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
46	NC_007607	AT	3	6	48426	48431	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
47	NC_007607	TA	4	8	48938	48945	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
48	NC_007607	TC	3	6	49685	49690	0 %	50 %	0 %	50 %	82524462
49	NC_007607	AT	3	6	49894	49899	50 %	50 %	0 %	0 %	82524462
50	NC_007607	AG	3	6	50575	50580	50 %	0 %	50 %	0 %	82524462
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53	NC_007607	TA	3	6	55366	55371	50 %	50 %	0 %	0 %	82524470
54	NC_007607	AT	3	6	55645	55650	50 %	50 %	0 %	0 %	82524470
55	NC_007607	AT	3	6	55698	55703	50 %	50 %	0 %	0 %	82524470
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57	NC_007607	AT	3	6	56858	56863	50 %	50 %	0 %	0 %	82524470
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61	NC_007607	AT	3	6	60967	60972	50 %	50 %	0 %	0 %	82524476
62	NC_007607	AT	3	6	61326	61331	50 %	50 %	0 %	0 %	82524476
63	NC_007607	CT	3	6	63411	63416	0 %	50 %	0 %	50 %	82524480
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66	NC_007607	AC	3	6	65371	65376	50 %	0 %	0 %	50 %	82524482
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68	NC_007607	TG	3	6	65959	65964	0 %	50 %	50 %	0 %	82524483
69	NC_007607	AT	3	6	67192	67197	50 %	50 %	0 %	0 %	82524485
70	NC_007607	AT	3	6	68260	68265	50 %	50 %	0 %	0 %	82524487
71	NC_007607	CT	3	6	68748	68753	0 %	50 %	0 %	50 %	82524488
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73	NC_007607	GA	3	6	71743	71748	50 %	0 %	50 %	0 %	82524494
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108	NC_007607	CA	3	6	99078	99083	50 %	0 %	0 %	50 %	82524528
109	NC_007607	AC	3	6	99157	99162	50 %	0 %	0 %	50 %	82524528
110	NC_007607	TG	3	6	100222	100227	0 %	50 %	50 %	0 %	82524528
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112	NC_007607	TG	3	6	102572	102577	0 %	50 %	50 %	0 %	82524531
113	NC_007607	TG	3	6	103256	103261	0 %	50 %	50 %	0 %	82524533
114	NC_007607	AT	3	6	103327	103332	50 %	50 %	0 %	0 %	82524533
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121	NC_007607	GC	3	6	109422	109427	0 %	0 %	50 %	50 %	82524545
122	NC_007607	TG	3	6	110424	110429	0 %	50 %	50 %	0 %	82524547
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124	NC_007607	AT	3	6	112288	112293	50 %	50 %	0 %	0 %	82524549
125	NC_007607	TC	3	6	114816	114821	0 %	50 %	0 %	50 %	82524553
126	NC_007607	CA	4	8	114822	114829	50 %	0 %	0 %	50 %	82524553
127	NC_007607	GC	3	6	115045	115050	0 %	0 %	50 %	50 %	82524553
128	NC_007607	TG	3	6	116047	116052	0 %	50 %	50 %	0 %	82524554
129	NC_007607	CT	3	6	116836	116841	0 %	50 %	0 %	50 %	82524556
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.