MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 2613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007606	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	82775384
2	NC_007606	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	82775385
3	NC_007606	CGCAG	2	10	8352	8361	20 %	0 %	40 %	40 %	82775390
4	NC_007606	CGTAC	2	10	9780	9789	20 %	20 %	20 %	40 %	82775391
5	NC_007606	CGCGC	2	10	10767	10776	0 %	0 %	40 %	60 %	82775393
6	NC_007606	TCTTT	2	10	11860	11869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007606	CCGAT	2	10	17257	17266	20 %	20 %	20 %	40 %	82775400
8	NC_007606	AGCGA	2	10	17645	17654	40 %	0 %	40 %	20 %	82775400
9	NC_007606	TCTGG	2	10	23321	23330	0 %	40 %	40 %	20 %	82775407
10	NC_007606	GGGCA	2	10	24732	24741	20 %	0 %	60 %	20 %	161950172
11	NC_007606	CAGCG	2	10	25011	25020	20 %	0 %	40 %	40 %	82775409
12	NC_007606	ACGAC	2	10	26291	26300	40 %	0 %	20 %	40 %	82775410
13	NC_007606	CCGTC	2	10	32617	32626	0 %	20 %	20 %	60 %	161950171
14	NC_007606	GTGAA	2	10	32627	32636	40 %	20 %	40 %	0 %	161950171
15	NC_007606	GGCAT	2	10	32789	32798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007606	GTTCA	2	10	33014	33023	20 %	40 %	20 %	20 %	82775415
17	NC_007606	ATCCA	2	10	33340	33349	40 %	20 %	0 %	40 %	82775415
18	NC_007606	GTAAG	2	10	33553	33562	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007606	CTTTA	2	10	34603	34612	20 %	60 %	0 %	20 %	82775417
20	NC_007606	TGGCG	2	10	34830	34839	0 %	20 %	60 %	20 %	82775417
21	NC_007606	TCCTC	2	10	35273	35282	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_007606	TTTCA	2	10	37144	37153	20 %	60 %	0 %	20 %	82775421
23	NC_007606	CAGTA	2	10	45425	45434	40 %	20 %	20 %	20 %	82775431
24	NC_007606	GGCGC	2	10	47225	47234	0 %	0 %	60 %	40 %	82775433
25	NC_007606	ATTTA	2	10	47982	47991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007606	CGATG	2	10	50281	50290	20 %	20 %	40 %	20 %	82775435
27	NC_007606	GCGAA	2	10	51222	51231	40 %	0 %	40 %	20 %	82775435
28	NC_007606	CCGTT	2	10	52116	52125	0 %	40 %	20 %	40 %	82775435
29	NC_007606	CACGG	2	10	52493	52502	20 %	0 %	40 %	40 %	82775435
30	NC_007606	CGAAT	2	10	55202	55211	40 %	20 %	20 %	20 %	82775439
31	NC_007606	CCATG	2	10	56740	56749	20 %	20 %	20 %	40 %	82775440
32	NC_007606	CCGTA	2	10	58386	58395	20 %	20 %	20 %	40 %	82775441
33	NC_007606	TTAAA	2	10	59124	59133	60 %	40 %	0 %	0 %	82775441
34	NC_007606	ACCCA	2	10	59867	59876	40 %	0 %	0 %	60 %	82775442
35	NC_007606	TGATC	2	10	61494	61503	20 %	40 %	20 %	20 %	161950169
36	NC_007606	AATCA	2	10	62025	62034	60 %	20 %	0 %	20 %	82775444
37	NC_007606	CGGTT	2	10	62980	62989	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007606	AGGGC	2	10	67325	67334	20 %	0 %	60 %	20 %	82775450
39	NC_007606	GGCGC	2	10	67359	67368	0 %	0 %	60 %	40 %	82775450
40	NC_007606	GAAAC	2	10	68172	68181	60 %	0 %	20 %	20 %	82775450
41	NC_007606	AACGT	2	10	70645	70654	40 %	20 %	20 %	20 %	82775455
42	NC_007606	GCGTC	2	10	73629	73638	0 %	20 %	40 %	40 %	82775458
43	NC_007606	ATGTT	2	10	74443	74452	20 %	60 %	20 %	0 %	82775459
44	NC_007606	CTTCG	2	10	74876	74885	0 %	40 %	20 %	40 %	82775459
45	NC_007606	TGCGT	2	10	75162	75171	0 %	40 %	40 %	20 %	82775459
46	NC_007606	AAAGT	2	10	82197	82206	60 %	20 %	20 %	0 %	82775463
47	NC_007606	GTGCT	2	10	83460	83469	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007606	GGTGA	2	10	85995	86004	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007606	CAGCG	2	10	87331	87340	20 %	0 %	40 %	40 %	82775468
50	NC_007606	TCGCG	2	10	88601	88610	0 %	20 %	40 %	40 %	82775468
51	NC_007606	TAGTG	2	10	96083	96092	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007606	GATGG	2	10	98308	98317	20 %	20 %	60 %	0 %	82775475
53	NC_007606	ATTTT	2	10	99136	99145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007606	GGGAG	2	10	99300	99309	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007606	CGCCA	2	10	99364	99373	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_007606	GCTTC	2	10	99453	99462	0 %	40 %	20 %	40 %	82775476
57	NC_007606	CCTGG	2	10	100561	100570	0 %	20 %	40 %	40 %	82775477
58	NC_007606	CTGGT	2	10	102280	102289	0 %	40 %	40 %	20 %	161950168
59	NC_007606	GACCG	2	10	102828	102837	20 %	0 %	40 %	40 %	82775479
60	NC_007606	ATGTT	2	10	105212	105221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007606	TGCAT	2	10	106387	106396	20 %	40 %	20 %	20 %	82775484
62	NC_007606	ATTCC	2	10	106557	106566	20 %	40 %	0 %	40 %	82775484
63	NC_007606	GGTTT	2	10	107553	107562	0 %	60 %	40 %	0 %	82775484
64	NC_007606	AGTTC	2	10	111651	111660	20 %	40 %	20 %	20 %	82775489
65	NC_007606	CGTGG	2	10	113024	113033	0 %	20 %	60 %	20 %	82775491
66	NC_007606	TATCG	2	10	113531	113540	20 %	40 %	20 %	20 %	82775491
67	NC_007606	GGGCG	2	10	116428	116437	0 %	0 %	80 %	20 %	82775493
68	NC_007606	GCCTG	2	10	117863	117872	0 %	20 %	40 %	40 %	82775495
69	NC_007606	ACCGT	2	10	119776	119785	20 %	20 %	20 %	40 %	82775496
70	NC_007606	ATCAG	2	10	121549	121558	40 %	20 %	20 %	20 %	82775498
71	NC_007606	AGCCG	2	10	123317	123326	20 %	0 %	40 %	40 %	82775499
72	NC_007606	CGCAG	2	10	125646	125655	20 %	0 %	40 %	40 %	82775501
73	NC_007606	CGCGG	2	10	132816	132825	0 %	0 %	60 %	40 %	82775509
74	NC_007606	ATCCC	2	10	135060	135069	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_007606	CATCG	2	10	135073	135082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007606	TAACG	2	10	135764	135773	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007606	ATGCC	2	10	136223	136232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007606	AATGC	2	10	137505	137514	40 %	20 %	20 %	20 %	82775513
79	NC_007606	TCTGT	2	10	138451	138460	0 %	60 %	20 %	20 %	82775515
80	NC_007606	GCATG	2	10	139544	139553	20 %	20 %	40 %	20 %	82775516
81	NC_007606	GCAGG	2	10	140883	140892	20 %	0 %	60 %	20 %	82775518
82	NC_007606	CGAAG	2	10	142797	142806	40 %	0 %	40 %	20 %	82775519
83	NC_007606	ACACG	2	10	142930	142939	40 %	0 %	20 %	40 %	82775519
84	NC_007606	TCGCG	2	10	143191	143200	0 %	20 %	40 %	40 %	82775519
85	NC_007606	GCATC	2	10	143281	143290	20 %	20 %	20 %	40 %	82775519
86	NC_007606	GACTG	2	10	144599	144608	20 %	20 %	40 %	20 %	82775520
87	NC_007606	AGAGC	2	10	145009	145018	40 %	0 %	40 %	20 %	82775520
88	NC_007606	AGGCG	2	10	150056	150065	20 %	0 %	60 %	20 %	82775523
89	NC_007606	GGTTG	2	10	150801	150810	0 %	40 %	60 %	0 %	82775523
90	NC_007606	CACCG	2	10	153816	153825	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_007606	GCGGT	2	10	153836	153845	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007606	GCGAG	2	10	158752	158761	20 %	0 %	60 %	20 %	161950166
93	NC_007606	GGCGT	2	10	159190	159199	0 %	20 %	60 %	20 %	161950166
94	NC_007606	CCACA	2	10	162094	162103	40 %	0 %	0 %	60 %	82775539
95	NC_007606	GGCGT	2	10	163796	163805	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007606	CGACG	2	10	164835	164844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007606	CTGCG	2	10	166971	166980	0 %	20 %	40 %	40 %	82775540
98	NC_007606	AAAAC	2	10	168822	168831	80 %	0 %	0 %	20 %	82775541
99	NC_007606	TGGTT	2	10	169079	169088	0 %	60 %	40 %	0 %	82775541
100	NC_007606	AACCT	2	10	171160	171169	40 %	20 %	0 %	40 %	82775543
101	NC_007606	TGGTC	2	10	171202	171211	0 %	40 %	40 %	20 %	82775543
102	NC_007606	TGGCG	2	10	172447	172456	0 %	20 %	60 %	20 %	82775544
103	NC_007606	TTCCA	2	10	173688	173697	20 %	40 %	0 %	40 %	82775544
104	NC_007606	GGTCC	2	10	178011	178020	0 %	20 %	40 %	40 %	82775549
105	NC_007606	ACGGG	2	10	179928	179937	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007606	GTTTG	2	10	182451	182460	0 %	60 %	40 %	0 %	82775552
107	NC_007606	GTGAT	2	10	182861	182870	20 %	40 %	40 %	0 %	82775552
108	NC_007606	GTGAT	2	10	183152	183161	20 %	40 %	40 %	0 %	82775552
109	NC_007606	TACGT	2	10	183397	183406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007606	TGGCC	2	10	185118	185127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007606	GCCAG	2	10	186866	186875	20 %	0 %	40 %	40 %	82775557
112	NC_007606	GCCAC	2	10	187259	187268	20 %	0 %	20 %	60 %	82775557
113	NC_007606	AAACC	2	10	188155	188164	60 %	0 %	0 %	40 %	82775557
114	NC_007606	GTTCT	2	10	188307	188316	0 %	60 %	20 %	20 %	82775557
115	NC_007606	CTGAA	2	10	190299	190308	40 %	20 %	20 %	20 %	82775559
116	NC_007606	AAGCG	2	10	190363	190372	40 %	0 %	40 %	20 %	82775559
117	NC_007606	TGGTG	2	10	192269	192278	0 %	40 %	60 %	0 %	82775561
118	NC_007606	TGCAC	2	10	192395	192404	20 %	20 %	20 %	40 %	82775561
119	NC_007606	TGCGC	2	10	192788	192797	0 %	20 %	40 %	40 %	82775561
120	NC_007606	AAATA	2	10	193010	193019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007606	GTCTG	2	10	193095	193104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007606	CATGG	2	10	194631	194640	20 %	20 %	40 %	20 %	82775563
123	NC_007606	CAGAT	2	10	195670	195679	40 %	20 %	20 %	20 %	82775564
124	NC_007606	ACTTT	2	10	195803	195812	20 %	60 %	0 %	20 %	82775564
125	NC_007606	GACGT	2	10	199723	199732	20 %	20 %	40 %	20 %	82775567
126	NC_007606	CGACG	2	10	201550	201559	20 %	0 %	40 %	40 %	82775569
127	NC_007606	CCACG	2	10	203391	203400	20 %	0 %	20 %	60 %	82775571
128	NC_007606	GGATG	2	10	204380	204389	20 %	20 %	60 %	0 %	82775572
129	NC_007606	TGGCC	2	10	205444	205453	0 %	20 %	40 %	40 %	82775574
130	NC_007606	ACCGC	2	10	205457	205466	20 %	0 %	20 %	60 %	82775574
131	NC_007606	GTAAC	2	10	206187	206196	40 %	20 %	20 %	20 %	82775574
132	NC_007606	AGCCG	2	10	206815	206824	20 %	0 %	40 %	40 %	82775574
133	NC_007606	GGTGG	2	10	206924	206933	0 %	20 %	80 %	0 %	82775574
134	NC_007606	TGCGC	2	10	217046	217055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007606	TGATT	2	10	221531	221540	20 %	60 %	20 %	0 %	82775589
136	NC_007606	ACAAT	2	10	232963	232972	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007606	TAATT	2	10	233519	233528	40 %	60 %	0 %	0 %	82775596
138	NC_007606	TGTTC	2	10	235286	235295	0 %	60 %	20 %	20 %	82775598
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261	NC_007606	CATCG	2	10	470915	470924	20 %	20 %	20 %	40 %	82775833
262	NC_007606	AAAGT	2	10	471405	471414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_007606	GGGCG	2	10	474436	474445	0 %	0 %	80 %	20 %	82775837
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267	NC_007606	CAGTG	2	10	482191	482200	20 %	20 %	40 %	20 %	161950152
268	NC_007606	CAATT	2	10	485650	485659	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_007606	CTGCG	2	10	485923	485932	0 %	20 %	40 %	40 %	82775850
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402	NC_007606	CAGTG	2	10	682138	682147	20 %	20 %	40 %	20 %	161950150
403	NC_007606	TGATT	2	10	684831	684840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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