MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007606	TCTTT	2	10	11860	11869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007606	GGCAT	2	10	32789	32798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007606	GTAAG	2	10	33553	33562	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007606	TCCTC	2	10	35273	35282	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_007606	ATTTA	2	10	47982	47991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007606	CGGTT	2	10	62980	62989	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007606	GTGCT	2	10	83460	83469	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007606	GGTGA	2	10	85995	86004	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007606	TAGTG	2	10	96083	96092	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007606	ATTTT	2	10	99136	99145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007606	GGGAG	2	10	99300	99309	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007606	CGCCA	2	10	99364	99373	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_007606	ATGTT	2	10	105212	105221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007606	ATCCC	2	10	135060	135069	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_007606	CATCG	2	10	135073	135082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007606	TAACG	2	10	135764	135773	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007606	ATGCC	2	10	136223	136232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007606	CACCG	2	10	153816	153825	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007606	GCGGT	2	10	153836	153845	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007606	GGCGT	2	10	163796	163805	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007606	CGACG	2	10	164835	164844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007606	ACGGG	2	10	179928	179937	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007606	TACGT	2	10	183397	183406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007606	TGGCC	2	10	185118	185127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007606	AAATA	2	10	193010	193019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007606	GTCTG	2	10	193095	193104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007606	TGCGC	2	10	217046	217055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007606	ACAAT	2	10	232963	232972	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007606	CCTTT	2	10	251703	251712	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007606	GTTTC	2	10	275795	275804	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007606	GACGC	2	10	279708	279717	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_007606	ACTCC	2	10	303425	303434	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_007606	GAAAC	2	10	311773	311782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007606	AGCGG	2	10	319631	319640	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007606	CTTTG	2	10	322012	322021	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007606	GCGCC	2	10	326079	326088	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_007606	GTTTG	2	10	333565	333574	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007606	GAAAG	2	10	334084	334093	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007606	CCCAT	2	10	350083	350092	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_007606	TTGCG	2	10	365252	365261	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007606	TCAGG	2	10	369132	369141	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007606	TGAGT	2	10	375481	375490	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007606	CAACA	2	10	375774	375783	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007606	CAGGT	2	10	376768	376777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007606	AAAAT	2	10	387235	387244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007606	CCAGC	2	10	387834	387843	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_007606	GATGC	2	10	392129	392138	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007606	CCTGA	2	10	427275	427284	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007606	TATTT	2	10	433905	433914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007606	ATCAA	2	10	434100	434109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007606	GAAAA	2	10	436477	436486	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007606	AAAGT	2	10	471405	471414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007606	GTCAG	2	10	481467	481476	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007606	CAATT	2	10	485650	485659	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007606	TCCAT	2	10	490594	490603	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007606	GCGCC	2	10	490626	490635	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_007606	GTCAG	2	10	493905	493914	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007606	ATTTA	2	10	502626	502635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007606	GTTAA	2	10	514984	514993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007606	GTGCA	2	10	515484	515493	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007606	GAAAT	2	10	523414	523423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007606	GTTTA	2	10	524644	524653	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007606	ATTTG	2	10	530618	530627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007606	TCAAT	2	10	532923	532932	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007606	TGGAA	2	10	534247	534256	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007606	CGTAA	2	10	535455	535464	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007606	CTGGC	2	10	542500	542509	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007606	GCATA	2	10	547659	547668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_007606	AGCAA	2	10	549018	549027	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007606	ATATT	2	10	550640	550649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007606	ACCAT	2	10	558647	558656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007606	GCACC	2	10	562597	562606	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_007606	CAGGG	2	10	576028	576037	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007606	TGCGA	2	10	577040	577049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007606	TCGCG	2	10	582589	582598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007606	CCTGG	3	15	591406	591420	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_007606	CTGGC	2	10	591773	591782	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007606	GCAGG	2	10	593013	593022	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007606	GCCGC	2	10	593070	593079	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_007606	TCGCG	2	10	593130	593139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007606	CAGGG	2	10	596543	596552	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007606	GCGCC	2	10	596884	596893	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_007606	AAAAT	2	10	632783	632792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007606	TATGT	2	10	640703	640712	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007606	TAATG	2	10	640717	640726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007606	ATAAC	2	10	643466	643475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007606	GTCGT	2	10	653053	653062	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007606	TATTG	2	10	678412	678421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007606	TGATT	2	10	684831	684840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007606	TTACT	2	10	694663	694672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007606	TAAAT	2	10	715261	715270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007606	CTTTA	2	10	715481	715490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007606	CTGCG	2	10	729973	729982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_007606	TTCTC	2	10	730183	730192	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007606	GTTTT	2	10	730904	730913	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007606	GTTTT	2	10	731595	731604	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007606	TTCTT	2	10	737154	737163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007606	TATGT	2	10	746319	746328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007606	TTTCA	2	10	780896	780905	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007606	GTGTG	2	10	787232	787241	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007606	AGCGT	2	10	833499	833508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_007606	TTTAT	2	10	845822	845831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007606	AGCGA	2	10	867238	867247	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007606	ATGAC	2	10	868978	868987	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007606	TATTT	2	10	869041	869050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007606	TTTTC	2	10	877016	877025	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007606	TTATT	2	10	877826	877835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007606	ACCAG	2	10	879229	879238	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_007606	TTCTT	2	10	879784	879793	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_007606	TTATG	2	10	883759	883768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007606	CTTAT	2	10	894273	894282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007606	TAAAA	2	10	894464	894473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007606	AATGT	2	10	908478	908487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007606	TAAAA	2	10	913137	913146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007606	ACAGC	2	10	930427	930436	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007606	ACACA	2	10	937268	937277	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007606	TCGCT	2	10	937960	937969	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007606	TAGAT	2	10	939411	939420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007606	CGCGG	2	10	940571	940580	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007606	CGCGT	2	10	940809	940818	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007606	TCATG	2	10	944258	944267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007606	ACCTG	2	10	958147	958156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007606	AAATA	2	10	977876	977885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007606	TTCGG	2	10	991595	991604	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007606	GGGGA	2	10	993449	993458	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007606	TTTCA	2	10	1001004	1001013	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007606	CATTT	2	10	1010266	1010275	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007606	AAATC	2	10	1020122	1020131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007606	TGCGC	2	10	1022270	1022279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007606	AATAA	2	10	1033302	1033311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007606	CGCTA	2	10	1035582	1035591	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007606	TTATT	2	10	1036440	1036449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007606	TTGCC	2	10	1046198	1046207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_007606	GTCAG	2	10	1074179	1074188	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007606	AAGTG	2	10	1077696	1077705	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007606	TCGGA	2	10	1101550	1101559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007606	TTTTG	2	10	1104166	1104175	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007606	CGCTA	2	10	1104205	1104214	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007606	ATTTT	2	10	1111653	1111662	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007606	TATAA	2	10	1120597	1120606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007606	TTCTA	2	10	1125333	1125342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007606	CTTAC	2	10	1129488	1129497	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_007606	GCCGC	2	10	1133709	1133718	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_007606	AAGCA	2	10	1136922	1136931	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007606	ATAAA	2	10	1149057	1149066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007606	GTTGC	2	10	1155923	1155932	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_007606	TGAAA	2	10	1158722	1158731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_007606	TTAAT	2	10	1301146	1301155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_007606	GTTAT	2	10	2085667	2085676	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_007606	CGATC	2	10	2091890	2091899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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488	NC_007606	AAAGC	2	10	3559860	3559869	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
489	NC_007606	ATACG	2	10	3562068	3562077	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
490	NC_007606	AAGCG	2	10	3563659	3563668	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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