MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 10222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007606	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007606	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	82775384
3	NC_007606	AACC	2	8	464	471	50 %	0 %	0 %	50 %	82775384
4	NC_007606	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	82775384
5	NC_007606	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	82775384
6	NC_007606	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	82775384
7	NC_007606	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	82775385
8	NC_007606	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	82775385
9	NC_007606	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	82775385
10	NC_007606	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	82775385
11	NC_007606	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	82775385
12	NC_007606	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	82775386
13	NC_007606	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	82775388
14	NC_007606	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	82775388
15	NC_007606	GCCA	2	8	7219	7226	25 %	0 %	25 %	50 %	82775389
16	NC_007606	GCAT	2	8	7948	7955	25 %	25 %	25 %	25 %	82775389
17	NC_007606	GGCG	2	8	8079	8086	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007606	CAAC	2	8	8327	8334	50 %	0 %	0 %	50 %	82775390
19	NC_007606	TTGA	2	8	8380	8387	25 %	50 %	25 %	0 %	82775390
20	NC_007606	AAGA	2	8	8803	8810	75 %	0 %	25 %	0 %	82775390
21	NC_007606	CTGT	2	8	9232	9239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007606	AGAT	2	8	9987	9994	50 %	25 %	25 %	0 %	82775392
23	NC_007606	AGAA	2	8	10261	10268	75 %	0 %	25 %	0 %	82775392
24	NC_007606	GAAT	2	8	10508	10515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007606	GCAG	2	8	10664	10671	25 %	0 %	50 %	25 %	82775393
26	NC_007606	CATT	2	8	11342	11349	25 %	50 %	0 %	25 %	82775393
27	NC_007606	CAGT	2	8	11489	11496	25 %	25 %	25 %	25 %	82775394
28	NC_007606	ATTC	2	8	11904	11911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007606	AGTG	2	8	12046	12053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007606	ATGG	2	8	12209	12216	25 %	25 %	50 %	0 %	82775395
31	NC_007606	TGGT	2	8	12300	12307	0 %	50 %	50 %	0 %	82775395
32	NC_007606	ACCG	2	8	12667	12674	25 %	0 %	25 %	50 %	82775395
33	NC_007606	CAAC	2	8	12813	12820	50 %	0 %	0 %	50 %	82775395
34	NC_007606	AAGA	2	8	12887	12894	75 %	0 %	25 %	0 %	82775395
35	NC_007606	CCAT	2	8	13464	13471	25 %	25 %	0 %	50 %	82775395
36	NC_007606	GACA	2	8	15676	15683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007606	AATG	2	8	16537	16544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007606	AACA	2	8	16639	16646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007606	AATT	2	8	16663	16670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007606	TAAT	2	8	16682	16689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007606	GGTT	2	8	17051	17058	0 %	50 %	50 %	0 %	82775400
42	NC_007606	GTGG	2	8	17675	17682	0 %	25 %	75 %	0 %	82775400
43	NC_007606	CGTT	2	8	18047	18054	0 %	50 %	25 %	25 %	82775400
44	NC_007606	TTTA	2	8	18219	18226	25 %	75 %	0 %	0 %	82775401
45	NC_007606	CCAC	2	8	18522	18529	25 %	0 %	0 %	75 %	82775401
46	NC_007606	AATA	2	8	19152	19159	75 %	25 %	0 %	0 %	82775402
47	NC_007606	CTTC	2	8	19174	19181	0 %	50 %	0 %	50 %	82775402
48	NC_007606	CATT	2	8	19726	19733	25 %	50 %	0 %	25 %	82775403
49	NC_007606	GCCA	2	8	20706	20713	25 %	0 %	25 %	50 %	82775405
50	NC_007606	CAGC	2	8	20839	20846	25 %	0 %	25 %	50 %	82775405
51	NC_007606	CCCG	2	8	21895	21902	0 %	0 %	25 %	75 %	82775407
52	NC_007606	AACC	2	8	21934	21941	50 %	0 %	0 %	50 %	82775407
53	NC_007606	GCTG	2	8	22270	22277	0 %	25 %	50 %	25 %	82775407
54	NC_007606	TGAT	2	8	22791	22798	25 %	50 %	25 %	0 %	82775407
55	NC_007606	GTGC	2	8	22802	22809	0 %	25 %	50 %	25 %	82775407
56	NC_007606	TGGC	2	8	23738	23745	0 %	25 %	50 %	25 %	82775407
57	NC_007606	GAAA	2	8	24655	24662	75 %	0 %	25 %	0 %	161950172
58	NC_007606	CTTG	2	8	24670	24677	0 %	50 %	25 %	25 %	161950172
59	NC_007606	GCAC	2	8	24697	24704	25 %	0 %	25 %	50 %	161950172
60	NC_007606	TGGA	2	8	24755	24762	25 %	25 %	50 %	0 %	161950172
61	NC_007606	TAAA	2	8	24920	24927	75 %	25 %	0 %	0 %	161950172
62	NC_007606	TTTC	2	8	25001	25008	0 %	75 %	0 %	25 %	82775409
63	NC_007606	GGTA	2	8	25397	25404	25 %	25 %	50 %	0 %	82775409
64	NC_007606	GGCG	2	8	25550	25557	0 %	0 %	75 %	25 %	82775409
65	NC_007606	CTGG	2	8	26187	26194	0 %	25 %	50 %	25 %	82775410
66	NC_007606	GATA	2	8	26447	26454	50 %	25 %	25 %	0 %	82775410
67	NC_007606	GCGA	2	8	27132	27139	25 %	0 %	50 %	25 %	82775411
68	NC_007606	TCCA	2	8	27673	27680	25 %	25 %	0 %	50 %	82775412
69	NC_007606	GCTG	2	8	27719	27726	0 %	25 %	50 %	25 %	82775412
70	NC_007606	GATT	2	8	27839	27846	25 %	50 %	25 %	0 %	82775412
71	NC_007606	CGCT	2	8	27978	27985	0 %	25 %	25 %	50 %	82775412
72	NC_007606	GCCT	2	8	28261	28268	0 %	25 %	25 %	50 %	82775412
73	NC_007606	GCCC	2	8	29100	29107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_007606	GCTG	2	8	29240	29247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007606	AAAC	2	8	29400	29407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007606	TGGC	2	8	30295	30302	0 %	25 %	50 %	25 %	82775413
77	NC_007606	AGGC	2	8	31508	31515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007606	CCAG	2	8	31916	31923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007606	AATT	2	8	32057	32064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007606	GAAT	2	8	32122	32129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007606	TAAA	2	8	33735	33742	75 %	25 %	0 %	0 %	82775416
82	NC_007606	CGGG	2	8	33748	33755	0 %	0 %	75 %	25 %	82775416
83	NC_007606	CAGG	2	8	33875	33882	25 %	0 %	50 %	25 %	82775416
84	NC_007606	AACG	2	8	33962	33969	50 %	0 %	25 %	25 %	82775416
85	NC_007606	TGTT	2	8	34455	34462	0 %	75 %	25 %	0 %	82775416
86	NC_007606	TGTT	2	8	34847	34854	0 %	75 %	25 %	0 %	82775417
87	NC_007606	TGGG	2	8	35725	35732	0 %	25 %	75 %	0 %	82775418
88	NC_007606	ACAA	2	8	35878	35885	75 %	0 %	0 %	25 %	82775419
89	NC_007606	GATG	2	8	37761	37768	25 %	25 %	50 %	0 %	82775422
90	NC_007606	ATGC	2	8	37813	37820	25 %	25 %	25 %	25 %	82775422
91	NC_007606	AAGC	2	8	38010	38017	50 %	0 %	25 %	25 %	82775422
92	NC_007606	AGTT	2	8	38381	38388	25 %	50 %	25 %	0 %	82775422
93	NC_007606	GGGA	2	8	38469	38476	25 %	0 %	75 %	0 %	82775422
94	NC_007606	GCTG	2	8	38954	38961	0 %	25 %	50 %	25 %	82775424
95	NC_007606	TGGC	2	8	39087	39094	0 %	25 %	50 %	25 %	82775424
96	NC_007606	CATA	2	8	40213	40220	50 %	25 %	0 %	25 %	82775427
97	NC_007606	GCGT	2	8	40677	40684	0 %	25 %	50 %	25 %	82775427
98	NC_007606	CCGC	2	8	41100	41107	0 %	0 %	25 %	75 %	82775427
99	NC_007606	CTGG	2	8	41457	41464	0 %	25 %	50 %	25 %	82775428
100	NC_007606	CTGC	2	8	41918	41925	0 %	25 %	25 %	50 %	82775428
101	NC_007606	TGCG	2	8	42468	42475	0 %	25 %	50 %	25 %	82775428
102	NC_007606	TGGT	2	8	42880	42887	0 %	50 %	50 %	0 %	82775428
103	NC_007606	GTGG	2	8	43673	43680	0 %	25 %	75 %	0 %	82775428
104	NC_007606	GCTG	2	8	44027	44034	0 %	25 %	50 %	25 %	82775429
105	NC_007606	ATGG	2	8	44887	44894	25 %	25 %	50 %	0 %	82775430
106	NC_007606	TTGA	2	8	45758	45765	25 %	50 %	25 %	0 %	82775431
107	NC_007606	TGGC	2	8	46301	46308	0 %	25 %	50 %	25 %	82775432
108	NC_007606	CTGG	2	8	46761	46768	0 %	25 %	50 %	25 %	82775432
109	NC_007606	TCAT	2	8	46985	46992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007606	TCCC	2	8	47015	47022	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_007606	TGGC	2	8	47056	47063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007606	GCTG	2	8	47278	47285	0 %	25 %	50 %	25 %	82775433
113	NC_007606	CGTG	2	8	47755	47762	0 %	25 %	50 %	25 %	82775433
114	NC_007606	CATG	2	8	48227	48234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007606	AGTG	2	8	48377	48384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007606	TCCT	2	8	48539	48546	0 %	50 %	0 %	50 %	82775434
117	NC_007606	CTTA	2	8	48567	48574	25 %	50 %	0 %	25 %	82775434
118	NC_007606	AGCC	2	8	49469	49476	25 %	0 %	25 %	50 %	82775434
119	NC_007606	GACC	2	8	49735	49742	25 %	0 %	25 %	50 %	82775435
120	NC_007606	TGAT	2	8	50184	50191	25 %	50 %	25 %	0 %	82775435
121	NC_007606	CGCA	2	8	50735	50742	25 %	0 %	25 %	50 %	82775435
122	NC_007606	CTGT	2	8	50909	50916	0 %	50 %	25 %	25 %	82775435
123	NC_007606	GGCG	2	8	51085	51092	0 %	0 %	75 %	25 %	82775435
124	NC_007606	ACCG	2	8	51239	51246	25 %	0 %	25 %	50 %	82775435
125	NC_007606	CGTC	2	8	51713	51720	0 %	25 %	25 %	50 %	82775435
126	NC_007606	GGCG	2	8	51922	51929	0 %	0 %	75 %	25 %	82775435
127	NC_007606	TGGC	2	8	52176	52183	0 %	25 %	50 %	25 %	82775435
128	NC_007606	GCTG	2	8	52189	52196	0 %	25 %	50 %	25 %	82775435
129	NC_007606	GGTG	2	8	53120	53127	0 %	25 %	75 %	0 %	161950170
130	NC_007606	AAGA	2	8	53355	53362	75 %	0 %	25 %	0 %	161950170
131	NC_007606	CCAT	2	8	53808	53815	25 %	25 %	0 %	50 %	82775437
132	NC_007606	ATTT	2	8	55022	55029	25 %	75 %	0 %	0 %	82775438
133	NC_007606	TTCT	2	8	55034	55041	0 %	75 %	0 %	25 %	82775439
134	NC_007606	TTCA	2	8	55165	55172	25 %	50 %	0 %	25 %	82775439
135	NC_007606	CAGC	2	8	55378	55385	25 %	0 %	25 %	50 %	82775439
136	NC_007606	CCCG	2	8	55541	55548	0 %	0 %	25 %	75 %	82775439
137	NC_007606	TCGG	2	8	56013	56020	0 %	25 %	50 %	25 %	82775439
138	NC_007606	GGCG	2	8	56292	56299	0 %	0 %	75 %	25 %	82775439
139	NC_007606	GGGC	2	8	56611	56618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007606	CCAT	2	8	56826	56833	25 %	25 %	0 %	50 %	82775440
141	NC_007606	TGAT	2	8	56848	56855	25 %	50 %	25 %	0 %	82775440
142	NC_007606	CCGA	2	8	58465	58472	25 %	0 %	25 %	50 %	82775441
143	NC_007606	CCCG	2	8	58861	58868	0 %	0 %	25 %	75 %	82775441
144	NC_007606	TCCA	2	8	58913	58920	25 %	25 %	0 %	50 %	82775441
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