MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 36320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007604	ATC	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298812
2	NC_007604	GCT	2	6	331	336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298812
3	NC_007604	GCG	2	6	398	403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298812
4	NC_007604	AAG	2	6	486	491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298812
5	NC_007604	GCA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298812
6	NC_007604	GAT	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298812
7	NC_007604	CTG	2	6	911	916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298812
8	NC_007604	AAG	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298812
9	NC_007604	ATC	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298812
10	NC_007604	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298813
11	NC_007604	GTG	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298813
12	NC_007604	AGC	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298813
13	NC_007604	CTC	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298813
14	NC_007604	TTG	2	6	1590	1595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298813
15	NC_007604	TGG	2	6	1728	1733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298813
16	NC_007604	AAG	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298813
17	NC_007604	CAG	2	6	1940	1945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298813
18	NC_007604	GGA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298813
19	NC_007604	GCG	2	6	2015	2020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298813
20	NC_007604	GAC	4	12	2111	2122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298813
21	NC_007604	GAC	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007604	GAG	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298814
23	NC_007604	TCG	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
24	NC_007604	CAA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298814
25	NC_007604	TTG	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298814
26	NC_007604	GCT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
27	NC_007604	CTG	2	6	2476	2481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
28	NC_007604	GCA	2	6	2499	2504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298814
29	NC_007604	CGA	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298814
30	NC_007604	GAT	2	6	2880	2885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298814
31	NC_007604	TGT	2	6	2966	2971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298814
32	NC_007604	TGC	2	6	2972	2977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
33	NC_007604	GCG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298814
34	NC_007604	GGC	2	6	3023	3028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298814
35	NC_007604	GGT	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298814
36	NC_007604	GTC	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
37	NC_007604	ATC	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298814
38	NC_007604	ACA	2	6	3292	3297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298814
39	NC_007604	CGA	2	6	3323	3328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298814
40	NC_007604	TGC	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
41	NC_007604	CTG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
42	NC_007604	ACC	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298814
43	NC_007604	AAC	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298814
44	NC_007604	GCA	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298814
45	NC_007604	GCT	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
46	NC_007604	CAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298814
47	NC_007604	CCA	2	6	3604	3609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298814
48	NC_007604	AGC	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298814
49	NC_007604	GGC	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298814
50	NC_007604	GGC	2	6	3831	3836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298814
51	NC_007604	GGT	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298814
52	NC_007604	GCC	2	6	4076	4081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298814
53	NC_007604	GCG	2	6	4103	4108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298814
54	NC_007604	GTC	2	6	4123	4128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
55	NC_007604	GGC	2	6	4176	4181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298814
56	NC_007604	CGC	2	6	4418	4423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298814
57	NC_007604	CAG	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298814
58	NC_007604	CGT	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298814
59	NC_007604	CCG	2	6	4618	4623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298815
60	NC_007604	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298815
61	NC_007604	GAA	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298815
62	NC_007604	CTG	2	6	4765	4770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298815
63	NC_007604	GCA	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298815
64	NC_007604	CCA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298815
65	NC_007604	GCT	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298815
66	NC_007604	GAC	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298815
67	NC_007604	CAC	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298815
68	NC_007604	CGC	2	6	5133	5138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298815
69	NC_007604	TCT	2	6	5265	5270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298815
70	NC_007604	CAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298815
71	NC_007604	GAT	2	6	5408	5413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298815
72	NC_007604	CGC	3	9	5466	5474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298815
73	NC_007604	CGG	2	6	5503	5508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298815
74	NC_007604	CAT	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298815
75	NC_007604	AAC	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298815
76	NC_007604	TTC	2	6	5810	5815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298815
77	NC_007604	TGC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298815
78	NC_007604	GAG	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298815
79	NC_007604	GCG	2	6	6151	6156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298816
80	NC_007604	AGC	2	6	6175	6180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298816
81	NC_007604	CTG	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298816
82	NC_007604	GCC	2	6	6307	6312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298816
83	NC_007604	CAA	2	6	6354	6359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298816
84	NC_007604	CGG	2	6	6548	6553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298816
85	NC_007604	GTT	2	6	6571	6576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298816
86	NC_007604	TGC	2	6	6792	6797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298816
87	NC_007604	TCG	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298816
88	NC_007604	GCT	2	6	6856	6861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298816
89	NC_007604	CGA	2	6	6890	6895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298816
90	NC_007604	CCG	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298816
91	NC_007604	CGA	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298816
92	NC_007604	AGC	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298816
93	NC_007604	GCC	2	6	7330	7335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298816
94	NC_007604	CTT	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298816
95	NC_007604	GCA	2	6	7397	7402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298816
96	NC_007604	AAG	2	6	7408	7413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298816
97	NC_007604	CCT	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298816
98	NC_007604	GTA	2	6	7509	7514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298816
99	NC_007604	CAG	2	6	7614	7619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298816
100	NC_007604	CTG	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007604	TTG	2	6	7816	7821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298817
102	NC_007604	GCG	2	6	7834	7839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298817
103	NC_007604	GGC	2	6	7854	7859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298817
104	NC_007604	TGG	2	6	8037	8042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298817
105	NC_007604	TAA	2	6	8154	8159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81298817
106	NC_007604	CCG	2	6	8239	8244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298818
107	NC_007604	TCG	3	9	8248	8256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298818
108	NC_007604	GCC	2	6	8277	8282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298818
109	NC_007604	CAG	2	6	8389	8394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298818
110	NC_007604	GAA	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298818
111	NC_007604	GAG	2	6	8455	8460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298818
112	NC_007604	CTG	2	6	8623	8628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298819
113	NC_007604	GCC	2	6	8681	8686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298819
114	NC_007604	CGC	2	6	8753	8758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298819
115	NC_007604	CTT	2	6	8899	8904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007604	ATA	2	6	8927	8932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007604	GGT	2	6	8981	8986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298820
118	NC_007604	AGG	2	6	8999	9004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298820
119	NC_007604	CTG	2	6	9163	9168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298820
120	NC_007604	AGC	3	9	9281	9289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298820
121	NC_007604	GCA	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298820
122	NC_007604	AGA	2	6	9563	9568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298820
123	NC_007604	CAA	2	6	9693	9698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298820
124	NC_007604	CTG	2	6	9798	9803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298820
125	NC_007604	CCA	2	6	9818	9823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298820
126	NC_007604	AGC	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298820
127	NC_007604	GTC	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298820
128	NC_007604	AGG	2	6	10191	10196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007604	GAT	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007604	CAC	3	9	10294	10302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298821
131	NC_007604	CAC	2	6	10369	10374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298821
132	NC_007604	AGA	2	6	10440	10445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298821
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251	NC_007604	CTG	2	6	18625	18630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298830
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257	NC_007604	GCG	2	6	19024	19029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298830
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259	NC_007604	GTG	2	6	19183	19188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298830
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262	NC_007604	GGC	2	6	19407	19412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298830
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378	NC_007604	GCT	2	6	28063	28068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_007604	GGA	2	6	28222	28227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298838
380	NC_007604	CAG	2	6	28330	28335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298838
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