MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 plasmid 1

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007595	CTTGG	2	10	823	832	0 %	40 %	40 %	20 %	81230345
2	NC_007595	CAAAC	2	10	4305	4314	60 %	0 %	0 %	40 %	81230380
3	NC_007595	CCGTG	2	10	6595	6604	0 %	20 %	40 %	40 %	81230382
4	NC_007595	GCTGA	2	10	9399	9408	20 %	20 %	40 %	20 %	81230336
5	NC_007595	ACCGC	2	10	14554	14563	20 %	0 %	20 %	60 %	81230342
6	NC_007595	GCGGA	2	10	14718	14727	20 %	0 %	60 %	20 %	81230342
7	NC_007595	CTCGC	2	10	18573	18582	0 %	20 %	20 %	60 %	81230346
8	NC_007595	GAACT	2	10	21736	21745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007595	AATGC	2	10	22160	22169	40 %	20 %	20 %	20 %	81230350
10	NC_007595	ATCAA	2	10	24301	24310	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007595	AAGCG	2	10	25159	25168	40 %	0 %	40 %	20 %	81230352
12	NC_007595	CCTGA	2	10	25396	25405	20 %	20 %	20 %	40 %	81230352
13	NC_007595	CTGAC	2	10	26192	26201	20 %	20 %	20 %	40 %	81230352
14	NC_007595	GTTTG	2	10	26916	26925	0 %	60 %	40 %	0 %	81230352
15	NC_007595	AAAGC	2	10	29063	29072	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007595	AGATT	2	10	29097	29106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007595	CGCCC	2	10	29903	29912	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_007595	CGGTG	2	10	31291	31300	0 %	20 %	60 %	20 %	81230353
19	NC_007595	AAATC	2	10	33152	33161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007595	GGACT	2	10	34597	34606	20 %	20 %	40 %	20 %	81230357
21	NC_007595	ACCTG	2	10	37246	37255	20 %	20 %	20 %	40 %	81230361
22	NC_007595	CTTGC	2	10	37418	37427	0 %	40 %	20 %	40 %	81230361
23	NC_007595	GCTGC	2	10	41739	41748	0 %	20 %	40 %	40 %	81230365
24	NC_007595	ATCCA	2	10	42272	42281	40 %	20 %	0 %	40 %	81230366
25	NC_007595	TCGGC	2	10	43609	43618	0 %	20 %	40 %	40 %	81230369
26	NC_007595	GATGT	2	10	44017	44026	20 %	40 %	40 %	0 %	81230379
27	NC_007595	CAAGG	2	10	46259	46268	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.