MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 plasmid 1

Total Repeats: 561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007595	CAA	2	6	3	8	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007595	TGC	2	6	68	73	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230334
3	NC_007595	CCG	2	6	100	105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230334
4	NC_007595	CTC	2	6	143	148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230334
5	NC_007595	GCT	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230334
6	NC_007595	ATA	2	6	450	455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007595	CGG	2	6	840	845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230345
8	NC_007595	CAG	2	6	863	868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230345
9	NC_007595	GGC	2	6	944	949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230345
10	NC_007595	ACC	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230345
11	NC_007595	CCA	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230345
12	NC_007595	CAC	2	6	1180	1185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230345
13	NC_007595	CGG	2	6	1240	1245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230345
14	NC_007595	TGC	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
15	NC_007595	TTG	2	6	1363	1368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230356
16	NC_007595	GCT	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
17	NC_007595	CAC	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230356
18	NC_007595	GCT	2	6	1646	1651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
19	NC_007595	GCG	2	6	1780	1785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230356
20	NC_007595	GCT	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230356
21	NC_007595	ACC	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007595	CGC	2	6	2138	2143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230367
23	NC_007595	CTG	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230367
24	NC_007595	CGT	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230367
25	NC_007595	TGA	2	6	2206	2211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230367
26	NC_007595	ACC	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230378
27	NC_007595	GCA	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230378
28	NC_007595	CAA	3	9	2583	2591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81230378
29	NC_007595	TCC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230373
30	NC_007595	AAC	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81230373
31	NC_007595	CAG	2	6	2797	2802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230373
32	NC_007595	CAC	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230373
33	NC_007595	TTC	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230373
34	NC_007595	AGC	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230373
35	NC_007595	TTG	2	6	3008	3013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230373
36	NC_007595	CTC	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230373
37	NC_007595	CAT	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007595	CGC	2	6	3196	3201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230380
39	NC_007595	CTC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230380
40	NC_007595	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230380
41	NC_007595	CTG	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
42	NC_007595	AGC	2	6	3440	3445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230380
43	NC_007595	GCT	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
44	NC_007595	CCA	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230380
45	NC_007595	AGC	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230380
46	NC_007595	ATC	2	6	3943	3948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230380
47	NC_007595	GAC	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230380
48	NC_007595	CTT	2	6	4050	4055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230380
49	NC_007595	GGT	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230380
50	NC_007595	GTC	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
51	NC_007595	CCG	2	6	4357	4362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230380
52	NC_007595	TGA	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230380
53	NC_007595	TCA	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230380
54	NC_007595	CTG	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
55	NC_007595	TGA	2	6	4580	4585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230380
56	NC_007595	CGG	2	6	4651	4656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230380
57	NC_007595	GGA	2	6	4796	4801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230380
58	NC_007595	CTG	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230380
59	NC_007595	GTT	2	6	4953	4958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230380
60	NC_007595	CTC	2	6	5244	5249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007595	TGA	2	6	5571	5576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230381
62	NC_007595	GAG	2	6	5579	5584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230381
63	NC_007595	CTC	2	6	5613	5618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230381
64	NC_007595	ATC	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230381
65	NC_007595	ATT	2	6	5767	5772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230381
66	NC_007595	CAG	2	6	5773	5778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230381
67	NC_007595	GCA	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230381
68	NC_007595	GCC	2	6	6383	6388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230382
69	NC_007595	CAC	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230382
70	NC_007595	TCA	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230382
71	NC_007595	CAC	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230382
72	NC_007595	CCG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230382
73	NC_007595	AGC	2	6	6693	6698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230382
74	NC_007595	TGC	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230382
75	NC_007595	CAG	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230382
76	NC_007595	TGG	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230382
77	NC_007595	GCA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230383
78	NC_007595	CTT	2	6	7458	7463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230383
79	NC_007595	CGC	2	6	7716	7721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230383
80	NC_007595	TCC	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230383
81	NC_007595	GTC	2	6	7748	7753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230383
82	NC_007595	CTG	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230383
83	NC_007595	CGC	2	6	7841	7846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230383
84	NC_007595	GCC	2	6	7901	7906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230383
85	NC_007595	GCT	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230383
86	NC_007595	TAT	2	6	8202	8207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230383
87	NC_007595	GTT	2	6	8251	8256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007595	CAA	2	6	8378	8383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007595	TAA	2	6	8393	8398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007595	ATG	3	9	8691	8699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
91	NC_007595	GAT	2	6	8702	8707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
92	NC_007595	GCG	2	6	8806	8811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230335
93	NC_007595	ATG	3	9	8826	8834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
94	NC_007595	ATG	2	6	8838	8843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
95	NC_007595	ATG	3	9	8880	8888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
96	NC_007595	TGC	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230335
97	NC_007595	GAT	2	6	8973	8978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
98	NC_007595	ATG	3	9	8982	8990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230335
99	NC_007595	GAT	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007595	TCT	2	6	9242	9247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007595	ATT	2	6	9267	9272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007595	TGA	2	6	9331	9336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230336
103	NC_007595	GAT	2	6	9519	9524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230336
104	NC_007595	GCT	3	9	9554	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230336
105	NC_007595	GGT	2	6	9666	9671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230336
106	NC_007595	TGG	2	6	9710	9715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230336
107	NC_007595	GAG	2	6	10034	10039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230337
108	NC_007595	GCT	2	6	10090	10095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230337
109	NC_007595	CTA	2	6	10186	10191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230337
110	NC_007595	GGA	2	6	10198	10203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230337
111	NC_007595	CAG	2	6	10208	10213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230337
112	NC_007595	TGG	2	6	10254	10259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230337
113	NC_007595	GTT	2	6	10267	10272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230337
114	NC_007595	GCT	2	6	10286	10291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230337
115	NC_007595	TCG	2	6	10387	10392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007595	TGC	2	6	10427	10432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007595	CAG	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007595	ACG	2	6	10582	10587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007595	GCC	2	6	10642	10647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230338
120	NC_007595	TGA	2	6	10797	10802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230338
121	NC_007595	TCA	2	6	10863	10868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230338
122	NC_007595	TTC	2	6	10888	10893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230338
123	NC_007595	CTG	2	6	11159	11164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230338
124	NC_007595	CTA	2	6	11216	11221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230339
125	NC_007595	TCC	2	6	11259	11264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230339
126	NC_007595	TTG	2	6	11335	11340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230339
127	NC_007595	TGT	2	6	11546	11551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230339
128	NC_007595	AGG	2	6	11570	11575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230339
129	NC_007595	CTT	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230339
130	NC_007595	ACA	2	6	11742	11747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81230339
131	NC_007595	TAA	2	6	11828	11833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81230339
132	NC_007595	CTT	2	6	11990	11995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230339
133	NC_007595	GCT	2	6	12147	12152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230339
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142	NC_007595	GGA	2	6	12933	12938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230340
143	NC_007595	CGA	2	6	12939	12944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230340
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145	NC_007595	TAA	2	6	13033	13038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007595	ATC	2	6	13050	13055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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240	NC_007595	AGC	2	6	20134	20139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230348
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244	NC_007595	CTG	2	6	20314	20319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230348
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249	NC_007595	CGT	2	6	20777	20782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230348
250	NC_007595	AAG	2	6	20784	20789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81230348
251	NC_007595	GCA	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230349
252	NC_007595	CTG	2	6	21000	21005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230349
253	NC_007595	CAG	2	6	21275	21280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230349
254	NC_007595	TTA	2	6	21528	21533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230349
255	NC_007595	CAT	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230349
256	NC_007595	GGC	2	6	21672	21677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_007595	TCA	2	6	21705	21710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_007595	GTC	2	6	21772	21777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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