MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 plasmid 1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007595	GA	3	6	108	113	50 %	0 %	50 %	0 %	81230334
2	NC_007595	CG	3	6	1173	1178	0 %	0 %	50 %	50 %	81230345
3	NC_007595	CA	3	6	2098	2103	50 %	0 %	0 %	50 %	81230367
4	NC_007595	CT	3	6	2945	2950	0 %	50 %	0 %	50 %	81230373
5	NC_007595	GA	3	6	3768	3773	50 %	0 %	50 %	0 %	81230380
6	NC_007595	CA	3	6	6569	6574	50 %	0 %	0 %	50 %	81230382
7	NC_007595	GA	3	6	8516	8521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007595	TG	3	6	8887	8892	0 %	50 %	50 %	0 %	81230335
9	NC_007595	GA	3	6	9335	9340	50 %	0 %	50 %	0 %	81230336
10	NC_007595	CT	3	6	10192	10197	0 %	50 %	0 %	50 %	81230337
11	NC_007595	AG	3	6	12378	12383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007595	TC	3	6	12438	12443	0 %	50 %	0 %	50 %	81230340
13	NC_007595	TC	3	6	14147	14152	0 %	50 %	0 %	50 %	81230341
14	NC_007595	TC	3	6	15047	15052	0 %	50 %	0 %	50 %	81230342
15	NC_007595	TC	3	6	15140	15145	0 %	50 %	0 %	50 %	81230342
16	NC_007595	TC	3	6	15317	15322	0 %	50 %	0 %	50 %	81230342
17	NC_007595	CT	3	6	17723	17728	0 %	50 %	0 %	50 %	81230346
18	NC_007595	TC	3	6	18034	18039	0 %	50 %	0 %	50 %	81230346
19	NC_007595	CT	3	6	19534	19539	0 %	50 %	0 %	50 %	81230347
20	NC_007595	TG	3	6	20318	20323	0 %	50 %	50 %	0 %	81230348
21	NC_007595	TC	3	6	20440	20445	0 %	50 %	0 %	50 %	81230348
22	NC_007595	TA	3	6	21918	21923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007595	AG	3	6	23929	23934	50 %	0 %	50 %	0 %	81230351
24	NC_007595	GT	3	6	24746	24751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007595	TC	4	8	25330	25337	0 %	50 %	0 %	50 %	81230352
26	NC_007595	AC	3	6	27742	27747	50 %	0 %	0 %	50 %	81230352
27	NC_007595	AG	3	6	29562	29567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007595	GA	3	6	31345	31350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007595	CT	3	6	32043	32048	0 %	50 %	0 %	50 %	81230354
30	NC_007595	GA	3	6	32381	32386	50 %	0 %	50 %	0 %	81230354
31	NC_007595	GC	3	6	33048	33053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007595	GA	4	8	33759	33766	50 %	0 %	50 %	0 %	81230355
33	NC_007595	AG	3	6	33824	33829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007595	CA	4	8	34117	34124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007595	GA	4	8	34145	34152	50 %	0 %	50 %	0 %	81230377
36	NC_007595	CT	3	6	34576	34581	0 %	50 %	0 %	50 %	81230357
37	NC_007595	TC	4	8	35279	35286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007595	TC	3	6	36393	36398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007595	GA	3	6	36773	36778	50 %	0 %	50 %	0 %	81230361
40	NC_007595	CA	3	6	37143	37148	50 %	0 %	0 %	50 %	81230361
41	NC_007595	TC	3	6	37762	37767	0 %	50 %	0 %	50 %	81230362
42	NC_007595	TG	3	6	37896	37901	0 %	50 %	50 %	0 %	81230362
43	NC_007595	AG	3	6	38348	38353	50 %	0 %	50 %	0 %	81230362
44	NC_007595	CA	3	6	43710	43715	50 %	0 %	0 %	50 %	81230369
45	NC_007595	CT	3	6	45713	45718	0 %	50 %	0 %	50 %	81230370
46	NC_007595	GA	4	8	46338	46345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.