MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	TCATT	2	10	3745	3754	20 %	60 %	0 %	20 %	81427620
2	NC_007576	GCCAA	2	10	3858	3867	40 %	0 %	20 %	40 %	81427620
3	NC_007576	TTACG	2	10	7265	7274	20 %	40 %	20 %	20 %	81427622
4	NC_007576	ATTTG	2	10	7644	7653	20 %	60 %	20 %	0 %	81427622
5	NC_007576	CGAAG	2	10	8934	8943	40 %	0 %	40 %	20 %	81427622
6	NC_007576	AAAAT	2	10	10687	10696	80 %	20 %	0 %	0 %	81427626
7	NC_007576	CAAAA	2	10	11482	11491	80 %	0 %	0 %	20 %	81427626
8	NC_007576	TGAAG	2	10	12973	12982	40 %	20 %	40 %	0 %	81427627
9	NC_007576	CGTGG	2	10	14412	14421	0 %	20 %	60 %	20 %	81427628
10	NC_007576	CAATT	2	10	18850	18859	40 %	40 %	0 %	20 %	81427632
11	NC_007576	GATTA	2	10	20055	20064	40 %	40 %	20 %	0 %	81427633
12	NC_007576	CTTAG	2	10	20744	20753	20 %	40 %	20 %	20 %	81427635
13	NC_007576	CGCAA	2	10	21669	21678	40 %	0 %	20 %	40 %	81427636
14	NC_007576	AACGA	2	10	23475	23484	60 %	0 %	20 %	20 %	81427638
15	NC_007576	AATCA	2	10	27210	27219	60 %	20 %	0 %	20 %	81427644
16	NC_007576	GCGAT	2	10	29806	29815	20 %	20 %	40 %	20 %	81427646
17	NC_007576	AATAT	2	10	33428	33437	60 %	40 %	0 %	0 %	81427649
18	NC_007576	CGGGG	2	10	33703	33712	0 %	0 %	80 %	20 %	81427650
19	NC_007576	AAAAC	2	10	39868	39877	80 %	0 %	0 %	20 %	81427657
20	NC_007576	TGCGG	2	10	40095	40104	0 %	20 %	60 %	20 %	81427658
21	NC_007576	TTTTA	2	10	41145	41154	20 %	80 %	0 %	0 %	81427660
22	NC_007576	TGTAA	2	10	41623	41632	40 %	40 %	20 %	0 %	81427660
23	NC_007576	TTGTC	2	10	42952	42961	0 %	60 %	20 %	20 %	81427661
24	NC_007576	ACGTT	2	10	45299	45308	20 %	40 %	20 %	20 %	81427664
25	NC_007576	TGGTG	2	10	47723	47732	0 %	40 %	60 %	0 %	81427667
26	NC_007576	CCCAA	2	10	51409	51418	40 %	0 %	0 %	60 %	81427670
27	NC_007576	ATTGG	2	10	53019	53028	20 %	40 %	40 %	0 %	81427672
28	NC_007576	GTTGC	2	10	53275	53284	0 %	40 %	40 %	20 %	81427672
29	NC_007576	TAGGT	2	10	53345	53354	20 %	40 %	40 %	0 %	81427672
30	NC_007576	GGTTA	2	10	57338	57347	20 %	40 %	40 %	0 %	81427675
31	NC_007576	AATGG	2	10	58878	58887	40 %	20 %	40 %	0 %	81427676
32	NC_007576	AAAAC	2	10	59992	60001	80 %	0 %	0 %	20 %	81427677
33	NC_007576	ATCAA	2	10	64366	64375	60 %	20 %	0 %	20 %	81427681
34	NC_007576	GAAAA	2	10	64872	64881	80 %	0 %	20 %	0 %	81427682
35	NC_007576	ATGCA	2	10	67630	67639	40 %	20 %	20 %	20 %	81427685
36	NC_007576	TAAGT	2	10	75348	75357	40 %	40 %	20 %	0 %	81427692
37	NC_007576	TAGTT	2	10	78660	78669	20 %	60 %	20 %	0 %	81427695
38	NC_007576	TATTC	2	10	82628	82637	20 %	60 %	0 %	20 %	81427700
39	NC_007576	AAATC	2	10	86593	86602	60 %	20 %	0 %	20 %	81427702
40	NC_007576	TAATT	2	10	89185	89194	40 %	60 %	0 %	0 %	81427705
41	NC_007576	GCTGA	2	10	89219	89228	20 %	20 %	40 %	20 %	81427705
42	NC_007576	ATCGA	2	10	94116	94125	40 %	20 %	20 %	20 %	81427709
43	NC_007576	TGGCG	2	10	94220	94229	0 %	20 %	60 %	20 %	81427709
44	NC_007576	GATTT	2	10	96555	96564	20 %	60 %	20 %	0 %	81427712
45	NC_007576	TTTTA	2	10	97543	97552	20 %	80 %	0 %	0 %	81427714
46	NC_007576	ATTAC	2	10	97960	97969	40 %	40 %	0 %	20 %	81427714
47	NC_007576	AAGGT	2	10	98384	98393	40 %	20 %	40 %	0 %	81427714
48	NC_007576	TAAAG	2	10	98724	98733	60 %	20 %	20 %	0 %	81427715
49	NC_007576	CGATG	2	10	99194	99203	20 %	20 %	40 %	20 %	81427715
50	NC_007576	GTTTT	2	10	103030	103039	0 %	80 %	20 %	0 %	81427721
51	NC_007576	GACTA	2	10	105400	105409	40 %	20 %	20 %	20 %	81427725
52	NC_007576	TTCAA	2	10	105565	105574	40 %	40 %	0 %	20 %	81427725
53	NC_007576	GAAAA	2	10	106707	106716	80 %	0 %	20 %	0 %	81427727
54	NC_007576	TGAAT	2	10	106738	106747	40 %	40 %	20 %	0 %	81427727
55	NC_007576	ATTAA	2	10	110136	110145	60 %	40 %	0 %	0 %	81427730
56	NC_007576	AGAAA	2	10	116724	116733	80 %	0 %	20 %	0 %	81427735
57	NC_007576	GTGAA	2	10	118648	118657	40 %	20 %	40 %	0 %	81427737
58	NC_007576	TGGCA	2	10	119374	119383	20 %	20 %	40 %	20 %	81427738
59	NC_007576	CCACG	2	10	122494	122503	20 %	0 %	20 %	60 %	81427739
60	NC_007576	GGCAG	2	10	123087	123096	20 %	0 %	60 %	20 %	81427740
61	NC_007576	CGTCA	2	10	123918	123927	20 %	20 %	20 %	40 %	81427741
62	NC_007576	GGCGA	2	10	126913	126922	20 %	0 %	60 %	20 %	81427744
63	NC_007576	AGGTC	2	10	127017	127026	20 %	20 %	40 %	20 %	81427744
64	NC_007576	GCTTT	2	10	128508	128517	0 %	60 %	20 %	20 %	81427745
65	NC_007576	AGAAA	2	10	133713	133722	80 %	0 %	20 %	0 %	81427749
66	NC_007576	AAATT	2	10	137465	137474	60 %	40 %	0 %	0 %	81427752
67	NC_007576	AAAGT	2	10	137738	137747	60 %	20 %	20 %	0 %	81427752
68	NC_007576	TGATT	2	10	138870	138879	20 %	60 %	20 %	0 %	81427753
69	NC_007576	ATTTG	2	10	138952	138961	20 %	60 %	20 %	0 %	81427753
70	NC_007576	GCTAC	2	10	139564	139573	20 %	20 %	20 %	40 %	81427754
71	NC_007576	ACCCA	2	10	141353	141362	40 %	0 %	0 %	60 %	81427756
72	NC_007576	TTTAT	2	10	142167	142176	20 %	80 %	0 %	0 %	81427757
73	NC_007576	GAAAT	2	10	143795	143804	60 %	20 %	20 %	0 %	81427757
74	NC_007576	AAGTT	2	10	144268	144277	40 %	40 %	20 %	0 %	81427758
75	NC_007576	TGAAG	2	10	149474	149483	40 %	20 %	40 %	0 %	81427763
76	NC_007576	ATTTA	2	10	150557	150566	40 %	60 %	0 %	0 %	81427765
77	NC_007576	AAAGA	2	10	151467	151476	80 %	0 %	20 %	0 %	81427766
78	NC_007576	AACAT	2	10	157363	157372	60 %	20 %	0 %	20 %	81427772
79	NC_007576	AATTG	2	10	157656	157665	40 %	40 %	20 %	0 %	81427773
80	NC_007576	AAAAC	2	10	157953	157962	80 %	0 %	0 %	20 %	81427774
81	NC_007576	TAAAG	2	10	159959	159968	60 %	20 %	20 %	0 %	81427776
82	NC_007576	AAAGT	2	10	160521	160530	60 %	20 %	20 %	0 %	81427777
83	NC_007576	TAGAT	2	10	166128	166137	40 %	40 %	20 %	0 %	81427782
84	NC_007576	GTGAG	2	10	166310	166319	20 %	20 %	60 %	0 %	81427782
85	NC_007576	ACTAG	2	10	167020	167029	40 %	20 %	20 %	20 %	81427782
86	NC_007576	TTAAT	2	10	167555	167564	40 %	60 %	0 %	0 %	81427782
87	NC_007576	TTAAA	2	10	168991	169000	60 %	40 %	0 %	0 %	81427785
88	NC_007576	CCGAT	2	10	169456	169465	20 %	20 %	20 %	40 %	81427785
89	NC_007576	CATAT	2	10	171239	171248	40 %	40 %	0 %	20 %	81427788
90	NC_007576	TGGCA	2	10	172217	172226	20 %	20 %	40 %	20 %	81427789
91	NC_007576	ATTTG	2	10	172850	172859	20 %	60 %	20 %	0 %	81427789
92	NC_007576	GCGAT	2	10	174132	174141	20 %	20 %	40 %	20 %	81427791
93	NC_007576	ATCGA	2	10	175022	175031	40 %	20 %	20 %	20 %	81427792
94	NC_007576	ATTAA	2	10	178217	178226	60 %	40 %	0 %	0 %	81427795
95	NC_007576	TGAAT	2	10	179598	179607	40 %	40 %	20 %	0 %	81427796
96	NC_007576	TTTTA	2	10	182066	182075	20 %	80 %	0 %	0 %	81427799
97	NC_007576	TTTTG	2	10	182747	182756	0 %	80 %	20 %	0 %	81427799
98	NC_007576	GACGA	2	10	184212	184221	40 %	0 %	40 %	20 %	81427800
99	NC_007576	GGTTA	2	10	185652	185661	20 %	40 %	40 %	0 %	81427803
100	NC_007576	GCTTG	2	10	186813	186822	0 %	40 %	40 %	20 %	81427804
101	NC_007576	GGTTG	2	10	186903	186912	0 %	40 %	60 %	0 %	81427804
102	NC_007576	TAAGT	2	10	187167	187176	40 %	40 %	20 %	0 %	81427804
103	NC_007576	GTTTT	2	10	193825	193834	0 %	80 %	20 %	0 %	81427810
104	NC_007576	AAAAG	2	10	193883	193892	80 %	0 %	20 %	0 %	81427810
105	NC_007576	AATTC	2	10	195285	195294	40 %	40 %	0 %	20 %	81427812
106	NC_007576	GGTTG	2	10	198820	198829	0 %	40 %	60 %	0 %	81427816
107	NC_007576	TCAGA	2	10	212289	212298	40 %	20 %	20 %	20 %	81427828
108	NC_007576	ACAAT	2	10	213864	213873	60 %	20 %	0 %	20 %	81427830
109	NC_007576	TATAA	2	10	213960	213969	60 %	40 %	0 %	0 %	81427830
110	NC_007576	AGATA	2	10	214601	214610	60 %	20 %	20 %	0 %	81427831
111	NC_007576	GTAGC	2	10	216979	216988	20 %	20 %	40 %	20 %	81427833
112	NC_007576	ATTAA	2	10	217083	217092	60 %	40 %	0 %	0 %	81427834
113	NC_007576	TTCTT	2	10	217911	217920	0 %	80 %	0 %	20 %	81427834
114	NC_007576	TTTGA	2	10	217940	217949	20 %	60 %	20 %	0 %	81427834
115	NC_007576	AAGAT	2	10	219116	219125	60 %	20 %	20 %	0 %	81427836
116	NC_007576	TCGGT	2	10	220259	220268	0 %	40 %	40 %	20 %	81427838
117	NC_007576	CAATG	2	10	221986	221995	40 %	20 %	20 %	20 %	81427839
118	NC_007576	GGATT	2	10	223355	223364	20 %	40 %	40 %	0 %	81427839
119	NC_007576	AAAAG	2	10	223577	223586	80 %	0 %	20 %	0 %	81427839
120	NC_007576	TAACT	2	10	228131	228140	40 %	40 %	0 %	20 %	81427845
121	NC_007576	TAAAG	2	10	231612	231621	60 %	20 %	20 %	0 %	81427848
122	NC_007576	TTATT	2	10	233427	233436	20 %	80 %	0 %	0 %	81427850
123	NC_007576	GTGTT	2	10	235483	235492	0 %	60 %	40 %	0 %	81427853
124	NC_007576	TTTAA	2	10	235660	235669	40 %	60 %	0 %	0 %	81427853
125	NC_007576	AAAAT	2	10	236653	236662	80 %	20 %	0 %	0 %	81427855
126	NC_007576	AAATG	2	10	240135	240144	60 %	20 %	20 %	0 %	81427857
127	NC_007576	TTGGT	2	10	244848	244857	0 %	60 %	40 %	0 %	81427862
128	NC_007576	TTTAT	2	10	245913	245922	20 %	80 %	0 %	0 %	81427863
129	NC_007576	GTTAC	2	10	246823	246832	20 %	40 %	20 %	20 %	81427864
130	NC_007576	GCTAC	2	10	251510	251519	20 %	20 %	20 %	40 %	81427870
131	NC_007576	GGCCC	2	10	255806	255815	0 %	0 %	40 %	60 %	81427875
132	NC_007576	GTTTT	2	10	256594	256603	0 %	80 %	20 %	0 %	81427876
133	NC_007576	AAAAT	2	10	258785	258794	80 %	20 %	0 %	0 %	81427879
134	NC_007576	TTCAA	2	10	258847	258856	40 %	40 %	0 %	20 %	81427879
135	NC_007576	TAGCG	2	10	259757	259766	20 %	20 %	40 %	20 %	81427879
136	NC_007576	TTTTA	2	10	264175	264184	20 %	80 %	0 %	0 %	81427885
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