MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 5051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	TCTT	2	8	150	157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007576	GCTT	2	8	308	315	0 %	50 %	25 %	25 %	81427617
3	NC_007576	GCAA	2	8	695	702	50 %	0 %	25 %	25 %	81427617
4	NC_007576	AACG	2	8	734	741	50 %	0 %	25 %	25 %	81427617
5	NC_007576	CATG	2	8	1463	1470	25 %	25 %	25 %	25 %	81427617
6	NC_007576	AAAT	2	8	2933	2940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007576	TAAT	2	8	3085	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007576	AATT	2	8	3525	3532	50 %	50 %	0 %	0 %	81427620
9	NC_007576	TTTA	2	8	3876	3883	25 %	75 %	0 %	0 %	81427620
10	NC_007576	GCCA	2	8	6308	6315	25 %	0 %	25 %	50 %	81427621
11	NC_007576	GACT	2	8	6510	6517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007576	CCAT	2	8	7124	7131	25 %	25 %	0 %	50 %	81427622
13	NC_007576	GATG	2	8	7170	7177	25 %	25 %	50 %	0 %	81427622
14	NC_007576	TGAT	2	8	7454	7461	25 %	50 %	25 %	0 %	81427622
15	NC_007576	ACAA	2	8	7796	7803	75 %	0 %	0 %	25 %	81427622
16	NC_007576	TCGT	2	8	7829	7836	0 %	50 %	25 %	25 %	81427622
17	NC_007576	ACGG	2	8	8415	8422	25 %	0 %	50 %	25 %	81427622
18	NC_007576	CGTT	2	8	8577	8584	0 %	50 %	25 %	25 %	81427622
19	NC_007576	TCAA	2	8	9353	9360	50 %	25 %	0 %	25 %	81427623
20	NC_007576	AATT	2	8	10467	10474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007576	TTGG	2	8	10498	10505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007576	GTGC	2	8	11679	11686	0 %	25 %	50 %	25 %	81427626
23	NC_007576	ACCA	2	8	12151	12158	50 %	0 %	0 %	50 %	81427626
24	NC_007576	TTGA	2	8	12357	12364	25 %	50 %	25 %	0 %	81427626
25	NC_007576	TATG	2	8	12397	12404	25 %	50 %	25 %	0 %	81427626
26	NC_007576	ATTA	2	8	12712	12719	50 %	50 %	0 %	0 %	81427626
27	NC_007576	CAAA	2	8	13027	13034	75 %	0 %	0 %	25 %	81427627
28	NC_007576	CAAT	2	8	13553	13560	50 %	25 %	0 %	25 %	81427628
29	NC_007576	ATTG	2	8	14294	14301	25 %	50 %	25 %	0 %	81427628
30	NC_007576	TAAA	2	8	14835	14842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007576	AATT	2	8	15039	15046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007576	CGAC	2	8	15579	15586	25 %	0 %	25 %	50 %	81427629
33	NC_007576	GATT	2	8	15614	15621	25 %	50 %	25 %	0 %	81427629
34	NC_007576	AGCT	2	8	15718	15725	25 %	25 %	25 %	25 %	81427629
35	NC_007576	TGAA	2	8	15810	15817	50 %	25 %	25 %	0 %	81427629
36	NC_007576	TAAT	2	8	15967	15974	50 %	50 %	0 %	0 %	81427629
37	NC_007576	ATTT	2	8	16437	16444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007576	CTTA	2	8	16576	16583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007576	ACTT	2	8	16686	16693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007576	ATTT	2	8	16855	16862	25 %	75 %	0 %	0 %	81427630
41	NC_007576	TTTA	2	8	16925	16932	25 %	75 %	0 %	0 %	81427630
42	NC_007576	TAAA	2	8	17087	17094	75 %	25 %	0 %	0 %	81427630
43	NC_007576	GTGG	2	8	17278	17285	0 %	25 %	75 %	0 %	81427630
44	NC_007576	TCAA	2	8	17439	17446	50 %	25 %	0 %	25 %	81427630
45	NC_007576	GATG	2	8	17804	17811	25 %	25 %	50 %	0 %	81427631
46	NC_007576	TTGA	2	8	17835	17842	25 %	50 %	25 %	0 %	81427631
47	NC_007576	AGCT	2	8	17924	17931	25 %	25 %	25 %	25 %	81427631
48	NC_007576	TCAA	2	8	18073	18080	50 %	25 %	0 %	25 %	81427631
49	NC_007576	AAGA	2	8	18264	18271	75 %	0 %	25 %	0 %	81427631
50	NC_007576	ATTG	2	8	18326	18333	25 %	50 %	25 %	0 %	81427631
51	NC_007576	GTTT	2	8	18500	18507	0 %	75 %	25 %	0 %	81427632
52	NC_007576	TTGA	2	8	18794	18801	25 %	50 %	25 %	0 %	81427632
53	NC_007576	ATCA	2	8	18826	18833	50 %	25 %	0 %	25 %	81427632
54	NC_007576	GGAT	2	8	20158	20165	25 %	25 %	50 %	0 %	81427634
55	NC_007576	GTTG	2	8	20243	20250	0 %	50 %	50 %	0 %	81427634
56	NC_007576	TTTA	2	8	20401	20408	25 %	75 %	0 %	0 %	81427635
57	NC_007576	GTTC	2	8	20882	20889	0 %	50 %	25 %	25 %	81427635
58	NC_007576	ATTC	2	8	21281	21288	25 %	50 %	0 %	25 %	81427635
59	NC_007576	TAAG	2	8	21533	21540	50 %	25 %	25 %	0 %	81427636
60	NC_007576	TATT	2	8	21553	21560	25 %	75 %	0 %	0 %	81427636
61	NC_007576	TGCT	2	8	21617	21624	0 %	50 %	25 %	25 %	81427636
62	NC_007576	CAAG	2	8	21827	21834	50 %	0 %	25 %	25 %	81427636
63	NC_007576	ATGA	2	8	22176	22183	50 %	25 %	25 %	0 %	81427637
64	NC_007576	GGAA	2	8	22295	22302	50 %	0 %	50 %	0 %	81427637
65	NC_007576	TGGG	2	8	22529	22536	0 %	25 %	75 %	0 %	81427637
66	NC_007576	TAGC	2	8	22950	22957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007576	GCTA	2	8	22981	22988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007576	CAAA	2	8	22997	23004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007576	AATT	2	8	23446	23453	50 %	50 %	0 %	0 %	81427638
70	NC_007576	TGGT	2	8	23821	23828	0 %	50 %	50 %	0 %	81427638
71	NC_007576	CAAA	2	8	23855	23862	75 %	0 %	0 %	25 %	81427638
72	NC_007576	CAGT	2	8	25160	25167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007576	CTTG	2	8	25207	25214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007576	CCAT	2	8	25618	25625	25 %	25 %	0 %	50 %	81427641
75	NC_007576	GATC	2	8	25991	25998	25 %	25 %	25 %	25 %	81427641
76	NC_007576	TGAT	2	8	26524	26531	25 %	50 %	25 %	0 %	81427642
77	NC_007576	GATA	2	8	26573	26580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007576	CACT	2	8	26602	26609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007576	GGTT	2	8	26782	26789	0 %	50 %	50 %	0 %	81427643
80	NC_007576	TGCT	2	8	27083	27090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007576	CGTG	2	8	27837	27844	0 %	25 %	50 %	25 %	81427644
82	NC_007576	CAAT	2	8	28104	28111	50 %	25 %	0 %	25 %	81427645
83	NC_007576	GTTT	2	8	28449	28456	0 %	75 %	25 %	0 %	81427645
84	NC_007576	GAAT	2	8	29271	29278	50 %	25 %	25 %	0 %	81427645
85	NC_007576	AGAA	2	8	29346	29353	75 %	0 %	25 %	0 %	81427645
86	NC_007576	TAAT	2	8	29515	29522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007576	GTTG	2	8	31487	31494	0 %	50 %	50 %	0 %	81427647
88	NC_007576	CCTT	2	8	32248	32255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007576	CAAG	2	8	32371	32378	50 %	0 %	25 %	25 %	81427649
90	NC_007576	AACA	2	8	32407	32414	75 %	0 %	0 %	25 %	81427649
91	NC_007576	CAAG	2	8	32436	32443	50 %	0 %	25 %	25 %	81427649
92	NC_007576	TTGG	2	8	32546	32553	0 %	50 %	50 %	0 %	81427649
93	NC_007576	TTTG	2	8	34029	34036	0 %	75 %	25 %	0 %	81427650
94	NC_007576	AAGA	2	8	34045	34052	75 %	0 %	25 %	0 %	81427650
95	NC_007576	TTGG	2	8	34133	34140	0 %	50 %	50 %	0 %	81427650
96	NC_007576	TTGG	2	8	34461	34468	0 %	50 %	50 %	0 %	81427650
97	NC_007576	AAGC	2	8	34471	34478	50 %	0 %	25 %	25 %	81427650
98	NC_007576	GCTT	2	8	35115	35122	0 %	50 %	25 %	25 %	81427651
99	NC_007576	TGAT	2	8	35133	35140	25 %	50 %	25 %	0 %	81427651
100	NC_007576	AGCA	2	8	35718	35725	50 %	0 %	25 %	25 %	81427652
101	NC_007576	TTGG	2	8	36534	36541	0 %	50 %	50 %	0 %	81427652
102	NC_007576	GATG	2	8	38095	38102	25 %	25 %	50 %	0 %	81427655
103	NC_007576	GCAA	2	8	38350	38357	50 %	0 %	25 %	25 %	81427655
104	NC_007576	GTTT	2	8	38835	38842	0 %	75 %	25 %	0 %	81427656
105	NC_007576	TCGG	2	8	39157	39164	0 %	25 %	50 %	25 %	81427656
106	NC_007576	CCCA	2	8	39285	39292	25 %	0 %	0 %	75 %	81427656
107	NC_007576	ATCA	2	8	39674	39681	50 %	25 %	0 %	25 %	81427657
108	NC_007576	CAAT	2	8	40108	40115	50 %	25 %	0 %	25 %	81427658
109	NC_007576	AACC	2	8	40135	40142	50 %	0 %	0 %	50 %	81427658
110	NC_007576	GGGC	2	8	40282	40289	0 %	0 %	75 %	25 %	81427658
111	NC_007576	GCCA	2	8	40345	40352	25 %	0 %	25 %	50 %	81427658
112	NC_007576	TACT	2	8	40428	40435	25 %	50 %	0 %	25 %	81427658
113	NC_007576	TGGC	2	8	40552	40559	0 %	25 %	50 %	25 %	81427658
114	NC_007576	GTTG	2	8	41903	41910	0 %	50 %	50 %	0 %	81427660
115	NC_007576	CGAA	2	8	42529	42536	50 %	0 %	25 %	25 %	81427661
116	NC_007576	GTTC	2	8	42588	42595	0 %	50 %	25 %	25 %	81427661
117	NC_007576	AAAC	2	8	42768	42775	75 %	0 %	0 %	25 %	81427661
118	NC_007576	GACC	2	8	42878	42885	25 %	0 %	25 %	50 %	81427661
119	NC_007576	GTGG	2	8	43278	43285	0 %	25 %	75 %	0 %	81427661
120	NC_007576	TAAA	2	8	44065	44072	75 %	25 %	0 %	0 %	81427663
121	NC_007576	ATTC	2	8	45210	45217	25 %	50 %	0 %	25 %	81427664
122	NC_007576	TTTG	2	8	45254	45261	0 %	75 %	25 %	0 %	81427664
123	NC_007576	CCGC	2	8	45320	45327	0 %	0 %	25 %	75 %	81427664
124	NC_007576	AAAG	2	8	45520	45527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007576	GCAT	2	8	46288	46295	25 %	25 %	25 %	25 %	81427666
126	NC_007576	TGAA	2	8	47362	47369	50 %	25 %	25 %	0 %	81427667
127	NC_007576	TATC	2	8	48140	48147	25 %	50 %	0 %	25 %	81427667
128	NC_007576	AAAC	2	8	48533	48540	75 %	0 %	0 %	25 %	81427668
129	NC_007576	ATTT	2	8	50479	50486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007576	CTGG	2	8	50932	50939	0 %	25 %	50 %	25 %	81427669
131	NC_007576	GCAA	2	8	51846	51853	50 %	0 %	25 %	25 %	81427670
132	NC_007576	AGCC	2	8	51929	51936	25 %	0 %	25 %	50 %	81427670
133	NC_007576	AATT	2	8	52029	52036	50 %	50 %	0 %	0 %	81427670
134	NC_007576	GGTT	2	8	52325	52332	0 %	50 %	50 %	0 %	81427671
135	NC_007576	TGAA	2	8	53040	53047	50 %	25 %	25 %	0 %	81427672
136	NC_007576	TAGC	2	8	53089	53096	25 %	25 %	25 %	25 %	81427672
137	NC_007576	GCGA	2	8	53562	53569	25 %	0 %	50 %	25 %	81427672
138	NC_007576	ACTG	2	8	54285	54292	25 %	25 %	25 %	25 %	81427673
139	NC_007576	GCTT	2	8	54906	54913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007576	AAAT	2	8	54947	54954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007576	GAAT	2	8	54955	54962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007576	TTAC	2	8	54983	54990	25 %	50 %	0 %	25 %	81427674
143	NC_007576	TTTG	2	8	55488	55495	0 %	75 %	25 %	0 %	81427674
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