MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	TCTT	2	8	150	157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007576	AAAT	2	8	2933	2940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007576	TAAT	2	8	3085	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007576	GACT	2	8	6510	6517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007576	AATT	2	8	10467	10474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007576	TTGG	2	8	10498	10505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007576	TAAA	2	8	14835	14842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007576	AATT	2	8	15039	15046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007576	ATTT	2	8	16437	16444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007576	CTTA	2	8	16576	16583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007576	ACTT	2	8	16686	16693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007576	TAGC	2	8	22950	22957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007576	GCTA	2	8	22981	22988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007576	CAAA	2	8	22997	23004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007576	CAGT	2	8	25160	25167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007576	CTTG	2	8	25207	25214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007576	GATA	2	8	26573	26580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007576	CACT	2	8	26602	26609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007576	TGCT	2	8	27083	27090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007576	TAAT	2	8	29515	29522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007576	CCTT	2	8	32248	32255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007576	AAAG	2	8	45520	45527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007576	ATTT	2	8	50479	50486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007576	GCTT	2	8	54906	54913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007576	AAAT	2	8	54947	54954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007576	GAAT	2	8	54955	54962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007576	CAGT	2	8	60895	60902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007576	GTGA	2	8	62389	62396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007576	ATTA	2	8	63777	63784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007576	TAAT	2	8	71086	71093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007576	AGTA	2	8	72300	72307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007576	AAAC	2	8	79435	79442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007576	TAAA	2	8	82420	82427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007576	TATT	2	8	87048	87055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007576	TAAT	2	8	87116	87123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007576	GCGT	2	8	90352	90359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007576	ATTT	2	8	90390	90397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007576	CTTT	2	8	90553	90560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007576	TAAA	2	8	91895	91902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007576	ATTG	2	8	91910	91917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007576	AATT	2	8	93533	93540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007576	CTGC	2	8	93602	93609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007576	CGAA	2	8	94688	94695	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007576	TTAA	2	8	100525	100532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007576	AATG	2	8	100533	100540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007576	GAAG	2	8	102189	102196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007576	GAAG	2	8	103772	103779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007576	AACG	2	8	108580	108587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007576	CGAA	2	8	110954	110961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007576	TTTA	2	8	113045	113052	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007576	ATTT	2	8	115343	115350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007576	AGGA	2	8	115388	115395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007576	CAAT	2	8	118396	118403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007576	TAAT	2	8	124511	124518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007576	ATAG	2	8	124530	124537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007576	GGAA	2	8	128440	128447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007576	TATT	2	8	129293	129300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007576	AGTT	2	8	131692	131699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007576	GAGT	2	8	132806	132813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007576	TTGG	2	8	136918	136925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007576	ATTA	2	8	136980	136987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007576	CTTT	2	8	140698	140705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007576	TAGT	2	8	141694	141701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007576	ATTA	2	8	141933	141940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007576	ATTA	2	8	142089	142096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007576	TGAG	2	8	146670	146677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007576	ATCA	2	8	146715	146722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007576	GTTG	2	8	149902	149909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007576	TTAT	2	8	151928	151935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007576	TAGT	2	8	153301	153308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007576	TCGT	2	8	155571	155578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007576	ATTT	2	8	159575	159582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007576	TTTA	2	8	163453	163460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007576	ATTT	2	8	163524	163531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007576	TATC	2	8	163696	163703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007576	CAAT	2	8	163764	163771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007576	GGGA	2	8	163802	163809	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007576	TTTA	2	8	171621	171628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007576	TGGG	2	8	175866	175873	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007576	AAAC	2	8	176443	176450	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007576	AAAC	2	8	178523	178530	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007576	TTGG	2	8	181245	181252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007576	TGCA	2	8	181262	181269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007576	AGCT	2	8	181339	181346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007576	ATTA	2	8	186202	186209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007576	GTTT	2	8	187609	187616	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007576	GTTT	2	8	187629	187636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007576	GGCG	2	8	189012	189019	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007576	TAGT	2	8	190530	190537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007576	ATTA	2	8	190734	190741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007576	TAGT	2	8	193040	193047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007576	TTAC	2	8	198747	198754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007576	GGTT	2	8	199455	199462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007576	TTAA	2	8	203301	203308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007576	AATT	2	8	203314	203321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007576	TTAT	2	8	203331	203338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007576	ATTA	2	8	204581	204588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007576	TGGG	2	8	209361	209368	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007576	GAAA	2	8	209373	209380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007576	ACAT	2	8	210428	210435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007576	TAAT	2	8	210598	210605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007576	CCAA	2	8	210660	210667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007576	GGGA	2	8	212026	212033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007576	AATT	2	8	213173	213180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007576	CCTA	2	8	213255	213262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007576	CTAA	2	8	213275	213282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007576	TTAA	2	8	214131	214138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007576	AAAT	2	8	215224	215231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007576	TAGT	2	8	215277	215284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007576	ACCA	2	8	215434	215441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007576	TTGA	2	8	215711	215718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007576	ATCT	2	8	215789	215796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007576	TAGC	2	8	219362	219369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007576	GATG	2	8	221011	221018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007576	AATT	2	8	226175	226182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007576	CTAA	2	8	226205	226212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007576	ACTA	2	8	226252	226259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007576	TGAA	2	8	228623	228630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007576	TCGT	2	8	228639	228646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007576	GCGT	2	8	228700	228707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007576	CAAT	2	8	233110	233117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007576	AAGG	2	8	234872	234879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007576	CCTC	2	8	236363	236370	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_007576	GATA	2	8	236531	236538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007576	TGAA	2	8	239903	239910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007576	GAAT	2	8	239971	239978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007576	AATA	2	8	241449	241456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007576	CTTT	2	8	245492	245499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007576	AGTA	2	8	249261	249268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007576	GTTG	2	8	252736	252743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007576	TGTT	2	8	260170	260177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007576	AGCT	2	8	269522	269529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007576	AATT	2	8	269629	269636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007576	ATCC	2	8	270727	270734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007576	TTGA	2	8	270931	270938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007576	TAAT	2	8	272603	272610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007576	AAAT	2	8	282602	282609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007576	ACAA	2	8	284027	284034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007576	ATTA	2	8	292971	292978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007576	CAAA	2	8	297595	297602	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007576	GAAA	2	8	302389	302396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007576	AAAT	2	8	305875	305882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007576	AAAT	2	8	306136	306143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007576	TGAT	2	8	306271	306278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007576	TGAG	2	8	306286	306293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007576	TTAG	2	8	306445	306452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007576	GTGA	2	8	306605	306612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007576	AGCG	2	8	306775	306782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007576	ATGG	2	8	307440	307447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007576	AGCC	2	8	307659	307666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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