MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 4277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	GCTT	2	8	308	315	0 %	50 %	25 %	25 %	81427617
2	NC_007576	GCAA	2	8	695	702	50 %	0 %	25 %	25 %	81427617
3	NC_007576	AACG	2	8	734	741	50 %	0 %	25 %	25 %	81427617
4	NC_007576	CATG	2	8	1463	1470	25 %	25 %	25 %	25 %	81427617
5	NC_007576	AATT	2	8	3525	3532	50 %	50 %	0 %	0 %	81427620
6	NC_007576	TTTA	2	8	3876	3883	25 %	75 %	0 %	0 %	81427620
7	NC_007576	GCCA	2	8	6308	6315	25 %	0 %	25 %	50 %	81427621
8	NC_007576	CCAT	2	8	7124	7131	25 %	25 %	0 %	50 %	81427622
9	NC_007576	GATG	2	8	7170	7177	25 %	25 %	50 %	0 %	81427622
10	NC_007576	TGAT	2	8	7454	7461	25 %	50 %	25 %	0 %	81427622
11	NC_007576	ACAA	2	8	7796	7803	75 %	0 %	0 %	25 %	81427622
12	NC_007576	TCGT	2	8	7829	7836	0 %	50 %	25 %	25 %	81427622
13	NC_007576	ACGG	2	8	8415	8422	25 %	0 %	50 %	25 %	81427622
14	NC_007576	CGTT	2	8	8577	8584	0 %	50 %	25 %	25 %	81427622
15	NC_007576	TCAA	2	8	9353	9360	50 %	25 %	0 %	25 %	81427623
16	NC_007576	GTGC	2	8	11679	11686	0 %	25 %	50 %	25 %	81427626
17	NC_007576	ACCA	2	8	12151	12158	50 %	0 %	0 %	50 %	81427626
18	NC_007576	TTGA	2	8	12357	12364	25 %	50 %	25 %	0 %	81427626
19	NC_007576	TATG	2	8	12397	12404	25 %	50 %	25 %	0 %	81427626
20	NC_007576	ATTA	2	8	12712	12719	50 %	50 %	0 %	0 %	81427626
21	NC_007576	CAAA	2	8	13027	13034	75 %	0 %	0 %	25 %	81427627
22	NC_007576	CAAT	2	8	13553	13560	50 %	25 %	0 %	25 %	81427628
23	NC_007576	ATTG	2	8	14294	14301	25 %	50 %	25 %	0 %	81427628
24	NC_007576	CGAC	2	8	15579	15586	25 %	0 %	25 %	50 %	81427629
25	NC_007576	GATT	2	8	15614	15621	25 %	50 %	25 %	0 %	81427629
26	NC_007576	AGCT	2	8	15718	15725	25 %	25 %	25 %	25 %	81427629
27	NC_007576	TGAA	2	8	15810	15817	50 %	25 %	25 %	0 %	81427629
28	NC_007576	TAAT	2	8	15967	15974	50 %	50 %	0 %	0 %	81427629
29	NC_007576	ATTT	2	8	16855	16862	25 %	75 %	0 %	0 %	81427630
30	NC_007576	TTTA	2	8	16925	16932	25 %	75 %	0 %	0 %	81427630
31	NC_007576	TAAA	2	8	17087	17094	75 %	25 %	0 %	0 %	81427630
32	NC_007576	GTGG	2	8	17278	17285	0 %	25 %	75 %	0 %	81427630
33	NC_007576	TCAA	2	8	17439	17446	50 %	25 %	0 %	25 %	81427630
34	NC_007576	GATG	2	8	17804	17811	25 %	25 %	50 %	0 %	81427631
35	NC_007576	TTGA	2	8	17835	17842	25 %	50 %	25 %	0 %	81427631
36	NC_007576	AGCT	2	8	17924	17931	25 %	25 %	25 %	25 %	81427631
37	NC_007576	TCAA	2	8	18073	18080	50 %	25 %	0 %	25 %	81427631
38	NC_007576	AAGA	2	8	18264	18271	75 %	0 %	25 %	0 %	81427631
39	NC_007576	ATTG	2	8	18326	18333	25 %	50 %	25 %	0 %	81427631
40	NC_007576	GTTT	2	8	18500	18507	0 %	75 %	25 %	0 %	81427632
41	NC_007576	TTGA	2	8	18794	18801	25 %	50 %	25 %	0 %	81427632
42	NC_007576	ATCA	2	8	18826	18833	50 %	25 %	0 %	25 %	81427632
43	NC_007576	GGAT	2	8	20158	20165	25 %	25 %	50 %	0 %	81427634
44	NC_007576	GTTG	2	8	20243	20250	0 %	50 %	50 %	0 %	81427634
45	NC_007576	TTTA	2	8	20401	20408	25 %	75 %	0 %	0 %	81427635
46	NC_007576	GTTC	2	8	20882	20889	0 %	50 %	25 %	25 %	81427635
47	NC_007576	ATTC	2	8	21281	21288	25 %	50 %	0 %	25 %	81427635
48	NC_007576	TAAG	2	8	21533	21540	50 %	25 %	25 %	0 %	81427636
49	NC_007576	TATT	2	8	21553	21560	25 %	75 %	0 %	0 %	81427636
50	NC_007576	TGCT	2	8	21617	21624	0 %	50 %	25 %	25 %	81427636
51	NC_007576	CAAG	2	8	21827	21834	50 %	0 %	25 %	25 %	81427636
52	NC_007576	ATGA	2	8	22176	22183	50 %	25 %	25 %	0 %	81427637
53	NC_007576	GGAA	2	8	22295	22302	50 %	0 %	50 %	0 %	81427637
54	NC_007576	TGGG	2	8	22529	22536	0 %	25 %	75 %	0 %	81427637
55	NC_007576	AATT	2	8	23446	23453	50 %	50 %	0 %	0 %	81427638
56	NC_007576	TGGT	2	8	23821	23828	0 %	50 %	50 %	0 %	81427638
57	NC_007576	CAAA	2	8	23855	23862	75 %	0 %	0 %	25 %	81427638
58	NC_007576	CCAT	2	8	25618	25625	25 %	25 %	0 %	50 %	81427641
59	NC_007576	GATC	2	8	25991	25998	25 %	25 %	25 %	25 %	81427641
60	NC_007576	TGAT	2	8	26524	26531	25 %	50 %	25 %	0 %	81427642
61	NC_007576	GGTT	2	8	26782	26789	0 %	50 %	50 %	0 %	81427643
62	NC_007576	CGTG	2	8	27837	27844	0 %	25 %	50 %	25 %	81427644
63	NC_007576	CAAT	2	8	28104	28111	50 %	25 %	0 %	25 %	81427645
64	NC_007576	GTTT	2	8	28449	28456	0 %	75 %	25 %	0 %	81427645
65	NC_007576	GAAT	2	8	29271	29278	50 %	25 %	25 %	0 %	81427645
66	NC_007576	AGAA	2	8	29346	29353	75 %	0 %	25 %	0 %	81427645
67	NC_007576	GTTG	2	8	31487	31494	0 %	50 %	50 %	0 %	81427647
68	NC_007576	CAAG	2	8	32371	32378	50 %	0 %	25 %	25 %	81427649
69	NC_007576	AACA	2	8	32407	32414	75 %	0 %	0 %	25 %	81427649
70	NC_007576	CAAG	2	8	32436	32443	50 %	0 %	25 %	25 %	81427649
71	NC_007576	TTGG	2	8	32546	32553	0 %	50 %	50 %	0 %	81427649
72	NC_007576	TTTG	2	8	34029	34036	0 %	75 %	25 %	0 %	81427650
73	NC_007576	AAGA	2	8	34045	34052	75 %	0 %	25 %	0 %	81427650
74	NC_007576	TTGG	2	8	34133	34140	0 %	50 %	50 %	0 %	81427650
75	NC_007576	TTGG	2	8	34461	34468	0 %	50 %	50 %	0 %	81427650
76	NC_007576	AAGC	2	8	34471	34478	50 %	0 %	25 %	25 %	81427650
77	NC_007576	GCTT	2	8	35115	35122	0 %	50 %	25 %	25 %	81427651
78	NC_007576	TGAT	2	8	35133	35140	25 %	50 %	25 %	0 %	81427651
79	NC_007576	AGCA	2	8	35718	35725	50 %	0 %	25 %	25 %	81427652
80	NC_007576	TTGG	2	8	36534	36541	0 %	50 %	50 %	0 %	81427652
81	NC_007576	GATG	2	8	38095	38102	25 %	25 %	50 %	0 %	81427655
82	NC_007576	GCAA	2	8	38350	38357	50 %	0 %	25 %	25 %	81427655
83	NC_007576	GTTT	2	8	38835	38842	0 %	75 %	25 %	0 %	81427656
84	NC_007576	TCGG	2	8	39157	39164	0 %	25 %	50 %	25 %	81427656
85	NC_007576	CCCA	2	8	39285	39292	25 %	0 %	0 %	75 %	81427656
86	NC_007576	ATCA	2	8	39674	39681	50 %	25 %	0 %	25 %	81427657
87	NC_007576	CAAT	2	8	40108	40115	50 %	25 %	0 %	25 %	81427658
88	NC_007576	AACC	2	8	40135	40142	50 %	0 %	0 %	50 %	81427658
89	NC_007576	GGGC	2	8	40282	40289	0 %	0 %	75 %	25 %	81427658
90	NC_007576	GCCA	2	8	40345	40352	25 %	0 %	25 %	50 %	81427658
91	NC_007576	TACT	2	8	40428	40435	25 %	50 %	0 %	25 %	81427658
92	NC_007576	TGGC	2	8	40552	40559	0 %	25 %	50 %	25 %	81427658
93	NC_007576	GTTG	2	8	41903	41910	0 %	50 %	50 %	0 %	81427660
94	NC_007576	CGAA	2	8	42529	42536	50 %	0 %	25 %	25 %	81427661
95	NC_007576	GTTC	2	8	42588	42595	0 %	50 %	25 %	25 %	81427661
96	NC_007576	AAAC	2	8	42768	42775	75 %	0 %	0 %	25 %	81427661
97	NC_007576	GACC	2	8	42878	42885	25 %	0 %	25 %	50 %	81427661
98	NC_007576	GTGG	2	8	43278	43285	0 %	25 %	75 %	0 %	81427661
99	NC_007576	TAAA	2	8	44065	44072	75 %	25 %	0 %	0 %	81427663
100	NC_007576	ATTC	2	8	45210	45217	25 %	50 %	0 %	25 %	81427664
101	NC_007576	TTTG	2	8	45254	45261	0 %	75 %	25 %	0 %	81427664
102	NC_007576	CCGC	2	8	45320	45327	0 %	0 %	25 %	75 %	81427664
103	NC_007576	GCAT	2	8	46288	46295	25 %	25 %	25 %	25 %	81427666
104	NC_007576	TGAA	2	8	47362	47369	50 %	25 %	25 %	0 %	81427667
105	NC_007576	TATC	2	8	48140	48147	25 %	50 %	0 %	25 %	81427667
106	NC_007576	AAAC	2	8	48533	48540	75 %	0 %	0 %	25 %	81427668
107	NC_007576	CTGG	2	8	50932	50939	0 %	25 %	50 %	25 %	81427669
108	NC_007576	GCAA	2	8	51846	51853	50 %	0 %	25 %	25 %	81427670
109	NC_007576	AGCC	2	8	51929	51936	25 %	0 %	25 %	50 %	81427670
110	NC_007576	AATT	2	8	52029	52036	50 %	50 %	0 %	0 %	81427670
111	NC_007576	GGTT	2	8	52325	52332	0 %	50 %	50 %	0 %	81427671
112	NC_007576	TGAA	2	8	53040	53047	50 %	25 %	25 %	0 %	81427672
113	NC_007576	TAGC	2	8	53089	53096	25 %	25 %	25 %	25 %	81427672
114	NC_007576	GCGA	2	8	53562	53569	25 %	0 %	50 %	25 %	81427672
115	NC_007576	ACTG	2	8	54285	54292	25 %	25 %	25 %	25 %	81427673
116	NC_007576	TTAC	2	8	54983	54990	25 %	50 %	0 %	25 %	81427674
117	NC_007576	TTTG	2	8	55488	55495	0 %	75 %	25 %	0 %	81427674
118	NC_007576	TCAT	2	8	55890	55897	25 %	50 %	0 %	25 %	81427674
119	NC_007576	TGCA	2	8	55924	55931	25 %	25 %	25 %	25 %	81427674
120	NC_007576	CCAA	2	8	56041	56048	50 %	0 %	0 %	50 %	81427674
121	NC_007576	AACC	2	8	56325	56332	50 %	0 %	0 %	50 %	81427674
122	NC_007576	ATTG	2	8	56567	56574	25 %	50 %	25 %	0 %	81427674
123	NC_007576	TAAA	2	8	56987	56994	75 %	25 %	0 %	0 %	81427674
124	NC_007576	TGAA	2	8	57102	57109	50 %	25 %	25 %	0 %	81427675
125	NC_007576	TGAT	2	8	57485	57492	25 %	50 %	25 %	0 %	81427675
126	NC_007576	AGCG	2	8	57533	57540	25 %	0 %	50 %	25 %	81427675
127	NC_007576	TAGG	2	8	58330	58337	25 %	25 %	50 %	0 %	81427676
128	NC_007576	AATT	2	8	59670	59677	50 %	50 %	0 %	0 %	81427677
129	NC_007576	ATTT	2	8	59973	59980	25 %	75 %	0 %	0 %	81427677
130	NC_007576	TTGG	2	8	60426	60433	0 %	50 %	50 %	0 %	81427677
131	NC_007576	TGGC	2	8	60468	60475	0 %	25 %	50 %	25 %	81427677
132	NC_007576	ATCG	2	8	60566	60573	25 %	25 %	25 %	25 %	81427677
133	NC_007576	CAAA	2	8	60764	60771	75 %	0 %	0 %	25 %	81427677
134	NC_007576	GGAT	2	8	61100	61107	25 %	25 %	50 %	0 %	81427678
135	NC_007576	TTAA	2	8	61597	61604	50 %	50 %	0 %	0 %	81427678
136	NC_007576	TTGG	2	8	61753	61760	0 %	50 %	50 %	0 %	81427678
137	NC_007576	TGGT	2	8	62530	62537	0 %	50 %	50 %	0 %	81427679
138	NC_007576	TTGA	2	8	62758	62765	25 %	50 %	25 %	0 %	81427679
139	NC_007576	ATTT	2	8	62810	62817	25 %	75 %	0 %	0 %	81427679
140	NC_007576	TCAT	2	8	63326	63333	25 %	50 %	0 %	25 %	81427680
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