MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	AT	5	10	1698	1707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007576	GA	3	6	13264	13269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007576	TA	3	6	24482	24487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007576	AT	3	6	29493	29498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007576	AG	4	8	29620	29627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007576	CA	3	6	37862	37867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007576	GT	3	6	41127	41132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007576	CA	3	6	41138	41143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007576	TG	3	6	57037	57042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007576	AC	3	6	60908	60913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007576	GA	3	6	68355	68360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007576	CG	3	6	79459	79464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007576	CG	3	6	79481	79486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007576	TA	3	6	80546	80551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007576	GC	3	6	81267	81272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007576	AC	3	6	85820	85825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007576	TA	3	6	89466	89471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007576	TA	3	6	90447	90452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007576	CT	3	6	90513	90518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007576	TA	3	6	90544	90549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007576	CT	3	6	91812	91817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007576	TC	3	6	94756	94761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007576	GT	3	6	103242	103247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007576	CG	3	6	121159	121164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007576	AT	4	8	124622	124629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007576	TA	3	6	139294	139299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007576	AT	3	6	141885	141890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007576	TA	3	6	143936	143941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007576	CA	3	6	155644	155649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007576	AG	3	6	157854	157859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007576	AC	3	6	163199	163204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007576	AC	3	6	163493	163498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007576	CT	3	6	163629	163634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007576	AT	3	6	163683	163688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007576	TA	3	6	163748	163753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007576	GT	3	6	170105	170110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007576	TA	3	6	170111	170116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007576	AT	3	6	181773	181778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007576	AT	3	6	185265	185270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007576	AT	3	6	188901	188906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007576	AT	3	6	212721	212726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007576	AT	4	8	213292	213299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007576	AT	4	8	213340	213347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007576	TA	3	6	213978	213983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007576	AT	3	6	213989	213994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007576	GA	4	8	214021	214028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007576	GC	3	6	219434	219439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007576	CG	3	6	233071	233076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007576	TA	3	6	236608	236613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007576	GA	3	6	239864	239869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007576	GT	4	8	241463	241470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007576	AC	3	6	258058	258063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007576	AT	3	6	261564	261569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007576	GC	3	6	269563	269568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007576	AG	3	6	299120	299125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007576	AT	3	6	301537	301542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007576	AT	3	6	303968	303973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007576	TA	3	6	305728	305733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007576	AT	3	6	306905	306910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007576	AC	3	6	307426	307431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007576	AC	3	6	307595	307600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007576	AT	3	6	307852	307857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007576	AC	3	6	308733	308738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007576	TC	3	6	308826	308831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007576	TG	3	6	309478	309483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007576	GA	3	6	309990	309995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007576	TC	3	6	310282	310287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007576	AG	3	6	310326	310331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007576	GA	3	6	310942	310947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007576	TA	3	6	320772	320777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007576	GT	3	6	339970	339975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007576	GA	3	6	343977	343982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007576	GT	3	6	347453	347458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007576	AT	3	6	348847	348852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007576	GT	3	6	352053	352058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007576	GT	3	6	352178	352183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007576	GT	3	6	360337	360342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007576	AT	3	6	369876	369881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007576	GA	3	6	394839	394844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007576	TA	3	6	403807	403812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007576	AT	3	6	422096	422101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007576	TA	3	6	425776	425781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007576	AT	3	6	435242	435247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007576	AT	3	6	445228	445233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007576	AT	3	6	445373	445378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007576	AT	3	6	446263	446268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007576	AC	3	6	446784	446789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007576	AC	3	6	446953	446958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007576	AT	3	6	447210	447215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007576	AC	3	6	448091	448096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007576	TC	3	6	448184	448189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007576	TG	3	6	448836	448841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007576	GA	3	6	449348	449353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007576	TC	3	6	449640	449645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007576	AG	3	6	449684	449689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007576	GA	3	6	450300	450305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007576	TA	3	6	450685	450690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007576	TC	3	6	452105	452110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007576	AC	3	6	452625	452630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007576	CG	3	6	452895	452900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007576	AG	3	6	457774	457779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007576	GT	3	6	463629	463634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007576	GA	4	8	470036	470043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007576	AT	3	6	478728	478733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007576	AT	3	6	479618	479623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007576	AC	3	6	480139	480144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007576	AC	3	6	480308	480313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007576	AT	3	6	480565	480570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007576	AC	3	6	481446	481451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007576	TC	3	6	481539	481544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007576	TG	3	6	482191	482196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007576	GA	3	6	482703	482708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007576	TC	3	6	482995	483000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007576	AG	3	6	483039	483044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007576	GA	3	6	483654	483659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007576	TA	3	6	483991	483996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007576	CA	3	6	485193	485198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007576	AT	3	6	485225	485230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007576	AC	3	6	492330	492335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007576	AG	3	6	504887	504892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007576	TA	4	8	511985	511992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007576	AT	3	6	537223	537228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007576	AC	3	6	545559	545564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007576	TA	3	6	550482	550487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007576	GA	3	6	565643	565648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007576	TG	3	6	569496	569501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007576	TA	4	8	576338	576345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007576	AT	3	6	579998	580003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007576	TA	3	6	582317	582322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007576	AG	3	6	586554	586559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007576	GC	3	6	589013	589018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007576	AT	3	6	595763	595768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007576	TA	3	6	595829	595834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007576	AT	3	6	598488	598493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007576	AT	3	6	602588	602593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007576	GT	3	6	603155	603160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007576	TA	3	6	604581	604586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007576	TA	3	6	604777	604782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007576	AT	3	6	605214	605219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007576	AT	3	6	605362	605367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007576	GA	3	6	605446	605451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007576	AG	3	6	639212	639217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007576	GT	3	6	641512	641517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007576	GA	3	6	650769	650774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007576	AT	3	6	675014	675019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007576	GT	3	6	697149	697154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007576	GT	3	6	697271	697276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007576	GT	3	6	697393	697398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007576	GA	3	6	701462	701467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007576	TA	3	6	714647	714652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007576	TA	3	6	714681	714686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007576	AC	3	6	717162	717167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007576	GT	3	6	717178	717183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.