MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 1870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007520	TCAAA	2	10	171	180	60 %	20 %	0 %	20 %	78484347
2	NC_007520	GAAGG	2	10	427	436	40 %	0 %	60 %	0 %	78484347
3	NC_007520	CGGCA	2	10	458	467	20 %	0 %	40 %	40 %	78484347
4	NC_007520	TTACC	2	10	1782	1791	20 %	40 %	0 %	40 %	78484348
5	NC_007520	TTACT	2	10	5156	5165	20 %	60 %	0 %	20 %	78484351
6	NC_007520	CAAAC	2	10	6244	6253	60 %	0 %	0 %	40 %	78484352
7	NC_007520	ATTTG	2	10	6599	6608	20 %	60 %	20 %	0 %	78484352
8	NC_007520	TAAAT	2	10	7211	7220	60 %	40 %	0 %	0 %	78484352
9	NC_007520	CCTTT	2	10	7319	7328	0 %	60 %	0 %	40 %	78484353
10	NC_007520	TCAAA	2	10	7861	7870	60 %	20 %	0 %	20 %	78484353
11	NC_007520	CGCGA	2	10	8216	8225	20 %	0 %	40 %	40 %	78484353
12	NC_007520	AGTTT	2	10	12526	12535	20 %	60 %	20 %	0 %	78484356
13	NC_007520	TTGAT	2	10	17599	17608	20 %	60 %	20 %	0 %	78484360
14	NC_007520	AAATG	2	10	17824	17833	60 %	20 %	20 %	0 %	78484360
15	NC_007520	GATAA	2	10	18166	18175	60 %	20 %	20 %	0 %	78484360
16	NC_007520	AACAA	2	10	19716	19725	80 %	0 %	0 %	20 %	78484361
17	NC_007520	AAATC	2	10	21370	21379	60 %	20 %	0 %	20 %	78484363
18	NC_007520	CTCAA	2	10	23678	23687	40 %	20 %	0 %	40 %	78484366
19	NC_007520	TAAAA	2	10	26794	26803	80 %	20 %	0 %	0 %	118139509
20	NC_007520	ATAAA	2	10	30129	30138	80 %	20 %	0 %	0 %	78484372
21	NC_007520	AACCC	2	10	33095	33104	40 %	0 %	0 %	60 %	78484373
22	NC_007520	ATTTA	2	10	33636	33645	40 %	60 %	0 %	0 %	78484373
23	NC_007520	TTTTA	2	10	37906	37915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007520	AAAAC	2	10	38909	38918	80 %	0 %	0 %	20 %	78484377
25	NC_007520	AACCG	2	10	40115	40124	40 %	0 %	20 %	40 %	78484378
26	NC_007520	AATTT	2	10	40812	40821	40 %	60 %	0 %	0 %	78484379
27	NC_007520	CAAAC	2	10	41074	41083	60 %	0 %	0 %	40 %	78484379
28	NC_007520	GACAA	2	10	43654	43663	60 %	0 %	20 %	20 %	78484381
29	NC_007520	ATACC	2	10	44090	44099	40 %	20 %	0 %	40 %	78484381
30	NC_007520	TTCAG	2	10	46619	46628	20 %	40 %	20 %	20 %	78484383
31	NC_007520	AATAA	2	10	47867	47876	80 %	20 %	0 %	0 %	78484384
32	NC_007520	CAAGG	2	10	48140	48149	40 %	0 %	40 %	20 %	78484384
33	NC_007520	CCTAC	2	10	49901	49910	20 %	20 %	0 %	60 %	78484386
34	NC_007520	TCAAC	2	10	50256	50265	40 %	20 %	0 %	40 %	78484387
35	NC_007520	ATCAA	2	10	50282	50291	60 %	20 %	0 %	20 %	78484387
36	NC_007520	CCAAC	2	10	50635	50644	40 %	0 %	0 %	60 %	78484387
37	NC_007520	CGATT	2	10	52113	52122	20 %	40 %	20 %	20 %	78484389
38	NC_007520	CATGC	2	10	52782	52791	20 %	20 %	20 %	40 %	78484390
39	NC_007520	AAACC	2	10	57530	57539	60 %	0 %	0 %	40 %	78484392
40	NC_007520	GTCCA	2	10	57998	58007	20 %	20 %	20 %	40 %	78484393
41	NC_007520	ATTTA	2	10	58488	58497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007520	ATTAT	2	10	58659	58668	40 %	60 %	0 %	0 %	78484394
43	NC_007520	CCAAA	2	10	61311	61320	60 %	0 %	0 %	40 %	78484395
44	NC_007520	GCTTT	2	10	61400	61409	0 %	60 %	20 %	20 %	78484395
45	NC_007520	TTGAA	2	10	67737	67746	40 %	40 %	20 %	0 %	78484402
46	NC_007520	GAATT	2	10	69101	69110	40 %	40 %	20 %	0 %	78484403
47	NC_007520	GGATC	2	10	69411	69420	20 %	20 %	40 %	20 %	78484403
48	NC_007520	CCAGA	2	10	70091	70100	40 %	0 %	20 %	40 %	78484403
49	NC_007520	TAGGG	2	10	70350	70359	20 %	20 %	60 %	0 %	78484403
50	NC_007520	GATCA	2	10	70429	70438	40 %	20 %	20 %	20 %	78484403
51	NC_007520	TTCCA	2	10	70716	70725	20 %	40 %	0 %	40 %	78484403
52	NC_007520	AAAAC	2	10	72530	72539	80 %	0 %	0 %	20 %	78484407
53	NC_007520	GGCCG	2	10	72738	72747	0 %	0 %	60 %	40 %	78484407
54	NC_007520	CCGTG	2	10	73052	73061	0 %	20 %	40 %	40 %	78484407
55	NC_007520	AATGG	2	10	76389	76398	40 %	20 %	40 %	0 %	78484409
56	NC_007520	AGCAA	2	10	76820	76829	60 %	0 %	20 %	20 %	78484409
57	NC_007520	TTGGG	2	10	77885	77894	0 %	40 %	60 %	0 %	78484410
58	NC_007520	TTAAT	2	10	77963	77972	40 %	60 %	0 %	0 %	78484410
59	NC_007520	ATGAT	2	10	79249	79258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007520	TTACC	2	10	81275	81284	20 %	40 %	0 %	40 %	78484412
61	NC_007520	GGGTT	2	10	81429	81438	0 %	40 %	60 %	0 %	78484412
62	NC_007520	GGCTG	2	10	86094	86103	0 %	20 %	60 %	20 %	78484415
63	NC_007520	ATTAA	2	10	86209	86218	60 %	40 %	0 %	0 %	78484415
64	NC_007520	TTGCT	2	10	86498	86507	0 %	60 %	20 %	20 %	78484415
65	NC_007520	AACAA	2	10	86905	86914	80 %	0 %	0 %	20 %	78484415
66	NC_007520	GCGAG	2	10	90254	90263	20 %	0 %	60 %	20 %	78484417
67	NC_007520	ATTTT	2	10	90766	90775	20 %	80 %	0 %	0 %	78484417
68	NC_007520	GTTTC	2	10	91551	91560	0 %	60 %	20 %	20 %	78484418
69	NC_007520	TCAGC	2	10	93434	93443	20 %	20 %	20 %	40 %	78484419
70	NC_007520	TGATC	2	10	97329	97338	20 %	40 %	20 %	20 %	78484423
71	NC_007520	CTCGA	2	10	98053	98062	20 %	20 %	20 %	40 %	78484423
72	NC_007520	AGTAA	2	10	99575	99584	60 %	20 %	20 %	0 %	78484423
73	NC_007520	TGCAA	2	10	101867	101876	40 %	20 %	20 %	20 %	78484426
74	NC_007520	TTTGG	2	10	102993	103002	0 %	60 %	40 %	0 %	78484427
75	NC_007520	CAGAA	2	10	105526	105535	60 %	0 %	20 %	20 %	78484428
76	NC_007520	TTTTC	2	10	106502	106511	0 %	80 %	0 %	20 %	78484428
77	NC_007520	CCTTC	2	10	106839	106848	0 %	40 %	0 %	60 %	78484428
78	NC_007520	TACTT	2	10	107335	107344	20 %	60 %	0 %	20 %	78484428
79	NC_007520	TAAAA	2	10	107641	107650	80 %	20 %	0 %	0 %	78484428
80	NC_007520	ATCGA	2	10	107695	107704	40 %	20 %	20 %	20 %	78484428
81	NC_007520	GACCA	2	10	111573	111582	40 %	0 %	20 %	40 %	78484431
82	NC_007520	TTGTC	2	10	113148	113157	0 %	60 %	20 %	20 %	78484431
83	NC_007520	TCTAT	2	10	115864	115873	20 %	60 %	0 %	20 %	78484433
84	NC_007520	ATAAA	2	10	116178	116187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007520	TACAA	2	10	116853	116862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007520	CTGGA	2	10	117237	117246	20 %	20 %	40 %	20 %	78484435
87	NC_007520	TGAAA	2	10	117877	117886	60 %	20 %	20 %	0 %	78484435
88	NC_007520	AAACG	2	10	118201	118210	60 %	0 %	20 %	20 %	78484435
89	NC_007520	AACAT	2	10	120697	120706	60 %	20 %	0 %	20 %	78484438
90	NC_007520	TTGGC	2	10	120958	120967	0 %	40 %	40 %	20 %	78484439
91	NC_007520	CCTTG	2	10	121414	121423	0 %	40 %	20 %	40 %	78484439
92	NC_007520	GACGG	2	10	122191	122200	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007520	GCTTG	2	10	123020	123029	0 %	40 %	40 %	20 %	78484440
94	NC_007520	CAGAC	2	10	125607	125616	40 %	0 %	20 %	40 %	78484443
95	NC_007520	CAGAT	2	10	126542	126551	40 %	20 %	20 %	20 %	78484444
96	NC_007520	TATTT	2	10	127169	127178	20 %	80 %	0 %	0 %	78484444
97	NC_007520	AATCG	2	10	127922	127931	40 %	20 %	20 %	20 %	78484445
98	NC_007520	AGGCC	2	10	129023	129032	20 %	0 %	40 %	40 %	78484445
99	NC_007520	GTCAT	2	10	131248	131257	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007520	TGAAT	2	10	133911	133920	40 %	40 %	20 %	0 %	78484450
101	NC_007520	ACGCA	2	10	134609	134618	40 %	0 %	20 %	40 %	78484450
102	NC_007520	CTTGT	2	10	138662	138671	0 %	60 %	20 %	20 %	78484453
103	NC_007520	TCAGT	2	10	141331	141340	20 %	40 %	20 %	20 %	78484455
104	NC_007520	GCATC	2	10	141782	141791	20 %	20 %	20 %	40 %	78484456
105	NC_007520	AGCTG	2	10	144563	144572	20 %	20 %	40 %	20 %	78484459
106	NC_007520	TTGGT	2	10	146121	146130	0 %	60 %	40 %	0 %	78484460
107	NC_007520	GCTGA	2	10	146492	146501	20 %	20 %	40 %	20 %	78484460
108	NC_007520	ATTAA	2	10	148540	148549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007520	CCGTT	2	10	148637	148646	0 %	40 %	20 %	40 %	78484462
110	NC_007520	ATTGG	2	10	149404	149413	20 %	40 %	40 %	0 %	78484462
111	NC_007520	TGAAT	2	10	150830	150839	40 %	40 %	20 %	0 %	78484463
112	NC_007520	GATTT	2	10	151171	151180	20 %	60 %	20 %	0 %	78484463
113	NC_007520	GGCTA	2	10	153221	153230	20 %	20 %	40 %	20 %	78484465
114	NC_007520	CAGCG	2	10	154325	154334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007520	GAATT	2	10	155516	155525	40 %	40 %	20 %	0 %	78484467
116	NC_007520	TCCAA	2	10	156053	156062	40 %	20 %	0 %	40 %	78484468
117	NC_007520	CAGTT	2	10	157007	157016	20 %	40 %	20 %	20 %	78484469
118	NC_007520	AGTTA	2	10	157549	157558	40 %	40 %	20 %	0 %	78484469
119	NC_007520	GCTTT	2	10	159059	159068	0 %	60 %	20 %	20 %	78484471
120	NC_007520	AATTG	2	10	159836	159845	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007520	TTAGC	2	10	160084	160093	20 %	40 %	20 %	20 %	78484472
122	NC_007520	GGGTT	2	10	164777	164786	0 %	40 %	60 %	0 %	78484475
123	NC_007520	CCAGG	2	10	168307	168316	20 %	0 %	40 %	40 %	78484479
124	NC_007520	ATTGG	2	10	168701	168710	20 %	40 %	40 %	0 %	78484479
125	NC_007520	GGACG	2	10	170347	170356	20 %	0 %	60 %	20 %	78484482
126	NC_007520	AGGTG	2	10	171809	171818	20 %	20 %	60 %	0 %	78484483
127	NC_007520	GTCAC	2	10	172766	172775	20 %	20 %	20 %	40 %	78484484
128	NC_007520	AACAG	2	10	173497	173506	60 %	0 %	20 %	20 %	78484485
129	NC_007520	AACCG	2	10	173809	173818	40 %	0 %	20 %	40 %	78484485
130	NC_007520	CAGGC	2	10	173925	173934	20 %	0 %	40 %	40 %	78484485
131	NC_007520	TCTTT	2	10	174472	174481	0 %	80 %	0 %	20 %	78484486
132	NC_007520	GTTGA	2	10	176934	176943	20 %	40 %	40 %	0 %	78484489
133	NC_007520	TTGGG	2	10	177333	177342	0 %	40 %	60 %	0 %	78484490
134	NC_007520	GCCGA	2	10	177926	177935	20 %	0 %	40 %	40 %	78484490
135	NC_007520	TTAAG	2	10	178243	178252	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007520	CAGGT	2	10	180355	180364	20 %	20 %	40 %	20 %	78484493
137	NC_007520	ATAAA	2	10	181640	181649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007520	ATGGA	2	10	182029	182038	40 %	20 %	40 %	0 %	78484494
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