MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 2722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007520	TC	3	6	2229	2234	0 %	50 %	0 %	50 %	78484348
2	NC_007520	AT	3	6	4577	4582	50 %	50 %	0 %	0 %	78484350
3	NC_007520	GA	3	6	4633	4638	50 %	0 %	50 %	0 %	78484350
4	NC_007520	CT	4	8	4679	4686	0 %	50 %	0 %	50 %	78484351
5	NC_007520	CT	3	6	7092	7097	0 %	50 %	0 %	50 %	78484352
6	NC_007520	AT	3	6	8065	8070	50 %	50 %	0 %	0 %	78484353
7	NC_007520	TC	4	8	9367	9374	0 %	50 %	0 %	50 %	78484354
8	NC_007520	CA	3	6	10631	10636	50 %	0 %	0 %	50 %	78484354
9	NC_007520	TC	3	6	12867	12872	0 %	50 %	0 %	50 %	78484357
10	NC_007520	TG	3	6	13066	13071	0 %	50 %	50 %	0 %	78484357
11	NC_007520	CA	3	6	13108	13113	50 %	0 %	0 %	50 %	78484357
12	NC_007520	AC	3	6	13230	13235	50 %	0 %	0 %	50 %	78484357
13	NC_007520	GT	3	6	14835	14840	0 %	50 %	50 %	0 %	78484358
14	NC_007520	CT	3	6	16439	16444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007520	AC	3	6	17511	17516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007520	TA	3	6	18122	18127	50 %	50 %	0 %	0 %	78484360
17	NC_007520	TG	3	6	18602	18607	0 %	50 %	50 %	0 %	78484360
18	NC_007520	CG	3	6	18725	18730	0 %	0 %	50 %	50 %	78484360
19	NC_007520	TC	3	6	19478	19483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007520	CG	3	6	20778	20783	0 %	0 %	50 %	50 %	78484362
21	NC_007520	CT	3	6	21666	21671	0 %	50 %	0 %	50 %	78484363
22	NC_007520	GA	3	6	21881	21886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007520	CA	3	6	22621	22626	50 %	0 %	0 %	50 %	78484364
24	NC_007520	CA	3	6	23266	23271	50 %	0 %	0 %	50 %	78484365
25	NC_007520	CA	3	6	24027	24032	50 %	0 %	0 %	50 %	78484366
26	NC_007520	AG	3	6	25526	25531	50 %	0 %	50 %	0 %	78484367
27	NC_007520	TA	3	6	26426	26431	50 %	50 %	0 %	0 %	118139509
28	NC_007520	CA	3	6	27466	27471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007520	GC	3	6	28756	28761	0 %	0 %	50 %	50 %	78484370
30	NC_007520	CA	3	6	30894	30899	50 %	0 %	0 %	50 %	78484372
31	NC_007520	GC	3	6	31390	31395	0 %	0 %	50 %	50 %	78484373
32	NC_007520	AC	3	6	33962	33967	50 %	0 %	0 %	50 %	78484373
33	NC_007520	CA	3	6	36233	36238	50 %	0 %	0 %	50 %	78484375
34	NC_007520	TA	3	6	37014	37019	50 %	50 %	0 %	0 %	78484376
35	NC_007520	CG	3	6	37653	37658	0 %	0 %	50 %	50 %	78484376
36	NC_007520	CA	3	6	40806	40811	50 %	0 %	0 %	50 %	78484379
37	NC_007520	AC	3	6	40930	40935	50 %	0 %	0 %	50 %	78484379
38	NC_007520	TG	3	6	41249	41254	0 %	50 %	50 %	0 %	78484379
39	NC_007520	GT	3	6	41255	41260	0 %	50 %	50 %	0 %	78484379
40	NC_007520	GA	3	6	42587	42592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007520	AT	3	6	42944	42949	50 %	50 %	0 %	0 %	78484381
42	NC_007520	CT	3	6	43355	43360	0 %	50 %	0 %	50 %	78484381
43	NC_007520	AG	3	6	44255	44260	50 %	0 %	50 %	0 %	78484381
44	NC_007520	TA	3	6	46188	46193	50 %	50 %	0 %	0 %	78484383
45	NC_007520	GC	3	6	46716	46721	0 %	0 %	50 %	50 %	78484383
46	NC_007520	AT	3	6	47441	47446	50 %	50 %	0 %	0 %	78484383
47	NC_007520	AG	3	6	47712	47717	50 %	0 %	50 %	0 %	78484384
48	NC_007520	AT	4	8	49384	49391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007520	GC	3	6	50226	50231	0 %	0 %	50 %	50 %	78484387
50	NC_007520	AC	3	6	51093	51098	50 %	0 %	0 %	50 %	78484388
51	NC_007520	TC	3	6	51763	51768	0 %	50 %	0 %	50 %	78484389
52	NC_007520	AG	3	6	52546	52551	50 %	0 %	50 %	0 %	78484389
53	NC_007520	GT	3	6	53206	53211	0 %	50 %	50 %	0 %	78484390
54	NC_007520	TA	3	6	54295	54300	50 %	50 %	0 %	0 %	78484390
55	NC_007520	CT	3	6	56862	56867	0 %	50 %	0 %	50 %	78484391
56	NC_007520	TA	3	6	58450	58455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007520	TA	3	6	64181	64186	50 %	50 %	0 %	0 %	78484398
58	NC_007520	AC	3	6	64242	64247	50 %	0 %	0 %	50 %	78484398
59	NC_007520	CA	3	6	64568	64573	50 %	0 %	0 %	50 %	78484399
60	NC_007520	AC	3	6	65221	65226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007520	AT	5	10	65323	65332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007520	AT	4	8	65335	65342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007520	CT	3	6	66046	66051	0 %	50 %	0 %	50 %	78484400
64	NC_007520	AT	3	6	66064	66069	50 %	50 %	0 %	0 %	78484400
65	NC_007520	AT	3	6	67165	67170	50 %	50 %	0 %	0 %	78484402
66	NC_007520	TA	3	6	68695	68700	50 %	50 %	0 %	0 %	78484403
67	NC_007520	AT	3	6	68814	68819	50 %	50 %	0 %	0 %	78484403
68	NC_007520	AG	3	6	71381	71386	50 %	0 %	50 %	0 %	78484404
69	NC_007520	GT	3	6	71710	71715	0 %	50 %	50 %	0 %	78484405
70	NC_007520	AC	3	6	72154	72159	50 %	0 %	0 %	50 %	78484406
71	NC_007520	AC	3	6	73292	73297	50 %	0 %	0 %	50 %	78484407
72	NC_007520	GC	3	6	73304	73309	0 %	0 %	50 %	50 %	78484407
73	NC_007520	AC	3	6	74191	74196	50 %	0 %	0 %	50 %	78484408
74	NC_007520	TG	3	6	75967	75972	0 %	50 %	50 %	0 %	78484409
75	NC_007520	AT	3	6	75977	75982	50 %	50 %	0 %	0 %	78484409
76	NC_007520	GC	3	6	76294	76299	0 %	0 %	50 %	50 %	78484409
77	NC_007520	TG	3	6	79165	79170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007520	GT	3	6	79303	79308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007520	GT	3	6	80395	80400	0 %	50 %	50 %	0 %	78484412
80	NC_007520	AT	3	6	80420	80425	50 %	50 %	0 %	0 %	78484412
81	NC_007520	GT	3	6	81412	81417	0 %	50 %	50 %	0 %	78484412
82	NC_007520	CG	3	6	81774	81779	0 %	0 %	50 %	50 %	78484412
83	NC_007520	TG	3	6	83828	83833	0 %	50 %	50 %	0 %	78484413
84	NC_007520	AC	3	6	85415	85420	50 %	0 %	0 %	50 %	78484414
85	NC_007520	GA	3	6	87233	87238	50 %	0 %	50 %	0 %	78484415
86	NC_007520	TG	4	8	87983	87990	0 %	50 %	50 %	0 %	78484416
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88	NC_007520	TG	3	6	91078	91083	0 %	50 %	50 %	0 %	78484417
89	NC_007520	AG	3	6	92001	92006	50 %	0 %	50 %	0 %	78484418
90	NC_007520	TG	3	6	92405	92410	0 %	50 %	50 %	0 %	78484418
91	NC_007520	GT	3	6	94887	94892	0 %	50 %	50 %	0 %	78484421
92	NC_007520	TG	3	6	95423	95428	0 %	50 %	50 %	0 %	78484421
93	NC_007520	GA	3	6	95802	95807	50 %	0 %	50 %	0 %	78484422
94	NC_007520	GA	3	6	95833	95838	50 %	0 %	50 %	0 %	78484422
95	NC_007520	CG	3	6	97616	97621	0 %	0 %	50 %	50 %	78484423
96	NC_007520	GT	3	6	98985	98990	0 %	50 %	50 %	0 %	78484423
97	NC_007520	GT	3	6	99291	99296	0 %	50 %	50 %	0 %	78484423
98	NC_007520	GT	3	6	99326	99331	0 %	50 %	50 %	0 %	78484423
99	NC_007520	TA	4	8	99667	99674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007520	CG	3	6	100944	100949	0 %	0 %	50 %	50 %	78484425
101	NC_007520	GC	3	6	101251	101256	0 %	0 %	50 %	50 %	78484425
102	NC_007520	GC	3	6	103565	103570	0 %	0 %	50 %	50 %	78484427
103	NC_007520	TA	3	6	104048	104053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007520	AT	3	6	104567	104572	50 %	50 %	0 %	0 %	78484428
105	NC_007520	AG	3	6	104584	104589	50 %	0 %	50 %	0 %	78484428
106	NC_007520	AG	3	6	104996	105001	50 %	0 %	50 %	0 %	78484428
107	NC_007520	TA	3	6	106890	106895	50 %	50 %	0 %	0 %	78484428
108	NC_007520	CT	3	6	109363	109368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007520	GT	3	6	109485	109490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007520	AC	3	6	110358	110363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007520	AT	3	6	110599	110604	50 %	50 %	0 %	0 %	78484430
112	NC_007520	AT	3	6	111542	111547	50 %	50 %	0 %	0 %	78484431
113	NC_007520	AG	3	6	112322	112327	50 %	0 %	50 %	0 %	78484431
114	NC_007520	TC	3	6	113894	113899	0 %	50 %	0 %	50 %	78484432
115	NC_007520	CT	3	6	114329	114334	0 %	50 %	0 %	50 %	78484432
116	NC_007520	TC	3	6	114396	114401	0 %	50 %	0 %	50 %	78484432
117	NC_007520	TC	3	6	114868	114873	0 %	50 %	0 %	50 %	78484433
118	NC_007520	TG	3	6	115043	115048	0 %	50 %	50 %	0 %	78484433
119	NC_007520	GT	3	6	116636	116641	0 %	50 %	50 %	0 %	78484434
120	NC_007520	GA	3	6	118024	118029	50 %	0 %	50 %	0 %	78484435
121	NC_007520	TG	3	6	118929	118934	0 %	50 %	50 %	0 %	78484436
122	NC_007520	GT	3	6	119219	119224	0 %	50 %	50 %	0 %	78484436
123	NC_007520	TG	3	6	120527	120532	0 %	50 %	50 %	0 %	78484438
124	NC_007520	TC	3	6	121601	121606	0 %	50 %	0 %	50 %	78484439
125	NC_007520	TG	3	6	121741	121746	0 %	50 %	50 %	0 %	78484439
126	NC_007520	TC	3	6	123322	123327	0 %	50 %	0 %	50 %	78484441
127	NC_007520	CT	3	6	123713	123718	0 %	50 %	0 %	50 %	78484441
128	NC_007520	CA	3	6	124475	124480	50 %	0 %	0 %	50 %	78484442
129	NC_007520	AG	3	6	125549	125554	50 %	0 %	50 %	0 %	78484443
130	NC_007520	GT	3	6	126127	126132	0 %	50 %	50 %	0 %	78484444
131	NC_007520	TC	3	6	126251	126256	0 %	50 %	0 %	50 %	78484444
132	NC_007520	GT	3	6	126806	126811	0 %	50 %	50 %	0 %	78484444
133	NC_007520	CA	3	6	127740	127745	50 %	0 %	0 %	50 %	78484444
134	NC_007520	AG	3	6	129050	129055	50 %	0 %	50 %	0 %	78484445
135	NC_007520	AC	3	6	129559	129564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007520	TA	3	6	130024	130029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007520	GC	4	8	130375	130382	0 %	0 %	50 %	50 %	78484448
138	NC_007520	GA	3	6	130443	130448	50 %	0 %	50 %	0 %	78484448
139	NC_007520	GT	3	6	132026	132031	0 %	50 %	50 %	0 %	78484450
140	NC_007520	AC	3	6	132092	132097	50 %	0 %	0 %	50 %	78484450
141	NC_007520	GT	3	6	132305	132310	0 %	50 %	50 %	0 %	78484450
142	NC_007520	AC	3	6	132371	132376	50 %	0 %	0 %	50 %	78484450
143	NC_007520	GT	3	6	132584	132589	0 %	50 %	50 %	0 %	78484450
144	NC_007520	AC	3	6	132650	132655	50 %	0 %	0 %	50 %	78484450
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