MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 1448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007519	GCAG	2	8	51	58	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007519	CAGG	2	8	10118	10125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007519	TGCA	2	8	13572	13579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007519	ATTG	2	8	15304	15311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007519	CTGC	2	8	22131	22138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007519	GGAT	2	8	22604	22611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007519	CGGA	2	8	27364	27371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007519	CGGG	2	8	28906	28913	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007519	GAAA	2	8	30511	30518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007519	TGCC	2	8	33383	33390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007519	GCGG	2	8	37484	37491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007519	CTGC	2	8	37554	37561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007519	GGCA	2	8	39636	39643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007519	GCTG	2	8	42154	42161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007519	TGTT	2	8	42304	42311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007519	GTGA	2	8	45373	45380	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007519	GTGC	2	8	45509	45516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007519	CGGG	2	8	45665	45672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007519	GCGG	2	8	47721	47728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007519	GTCT	2	8	47815	47822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007519	TTCC	2	8	47908	47915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007519	TCCG	2	8	49940	49947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007519	ACAG	2	8	50981	50988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007519	TGTC	2	8	53386	53393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007519	GCGT	2	8	55882	55889	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007519	CCGG	2	8	56917	56924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007519	TCCG	2	8	59841	59848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007519	TATG	2	8	60088	60095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007519	TTTC	2	8	60761	60768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007519	CCGG	2	8	62140	62147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007519	CCTG	2	8	67855	67862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007519	AGTA	2	8	68268	68275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007519	CCTC	2	8	69570	69577	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_007519	AGCG	2	8	69757	69764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007519	AAAG	2	8	72954	72961	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007519	GGTG	2	8	73483	73490	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007519	AGAC	2	8	74213	74220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007519	GCCT	2	8	74627	74634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007519	TTAA	2	8	74788	74795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007519	AGCC	2	8	74937	74944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007519	CCTG	2	8	77649	77656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007519	ATTA	2	8	79526	79533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007519	CCGG	2	8	86415	86422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007519	CTGT	2	8	90871	90878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007519	AATT	2	8	91052	91059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007519	TAGT	2	8	91097	91104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007519	CAAC	2	8	93641	93648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007519	CATG	2	8	95128	95135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007519	CGGA	2	8	97646	97653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007519	CGAG	2	8	98757	98764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007519	GCAA	2	8	103702	103709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007519	CCGG	2	8	104324	104331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007519	CCGG	2	8	104339	104346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007519	CCGG	2	8	108468	108475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007519	GGGC	2	8	110278	110285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007519	CAGA	2	8	110328	110335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007519	GAAG	2	8	111539	111546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007519	CTGC	2	8	111573	111580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007519	GCGT	2	8	111600	111607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007519	CAGG	2	8	112699	112706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007519	GCAA	2	8	114481	114488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007519	CAGA	2	8	117604	117611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007519	CGGA	2	8	118446	118453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007519	AGGC	2	8	121959	121966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007519	AACA	2	8	124477	124484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007519	CTGA	2	8	124661	124668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007519	CTGT	2	8	125368	125375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007519	TGCC	2	8	128692	128699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007519	CGGA	2	8	133340	133347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007519	CAAA	2	8	133697	133704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007519	GTCT	2	8	133766	133773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007519	TGCG	2	8	138699	138706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007519	CCGC	2	8	140681	140688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_007519	GCGG	2	8	140716	140723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007519	CGGT	2	8	143208	143215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007519	CCGG	2	8	146218	146225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007519	GTCC	2	8	146263	146270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007519	CTGT	2	8	149872	149879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007519	TGCG	2	8	153780	153787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007519	GACG	2	8	159506	159513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007519	GATT	2	8	159529	159536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007519	CCGG	2	8	159678	159685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007519	TGCC	2	8	163885	163892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007519	TGCG	2	8	171408	171415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007519	CCGT	2	8	171431	171438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007519	CCGG	2	8	171595	171602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007519	GGCA	2	8	172632	172639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007519	GCGG	2	8	173404	173411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007519	CTGC	2	8	175741	175748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007519	CAGT	2	8	175795	175802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007519	TCTT	2	8	175851	175858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007519	AGGC	2	8	176071	176078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007519	CAGG	2	8	176146	176153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007519	CCGG	2	8	176206	176213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007519	AGAA	2	8	176915	176922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007519	TCAG	2	8	177129	177136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007519	CGGG	2	8	177142	177149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007519	GCAG	2	8	177214	177221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007519	GCGG	2	8	179581	179588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007519	GCCG	2	8	179912	179919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007519	GCAG	2	8	183406	183413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007519	CCTG	2	8	186469	186476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007519	CATG	2	8	188536	188543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007519	CTGC	2	8	188577	188584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007519	ATGC	2	8	188587	188594	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007519	TTCC	2	8	189205	189212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007519	GCGG	2	8	191028	191035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007519	GCGG	2	8	198232	198239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007519	CCGG	2	8	200738	200745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007519	CCGG	2	8	200767	200774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007519	TGTT	2	8	200780	200787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007519	ATCC	2	8	200844	200851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007519	CGGG	2	8	204257	204264	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007519	GTTG	2	8	204840	204847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007519	GGCG	2	8	206921	206928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007519	TCCA	2	8	207566	207573	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007519	GCAT	2	8	207901	207908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007519	CGGG	2	8	217376	217383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007519	GTTT	2	8	219748	219755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007519	TAAA	2	8	219781	219788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007519	TACC	2	8	219815	219822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007519	GCGG	2	8	220661	220668	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007519	TCAG	2	8	223042	223049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007519	CGCT	2	8	223098	223105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007519	GCAG	2	8	224968	224975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007519	GACA	2	8	227367	227374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007519	CCGC	2	8	231000	231007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_007519	GGGC	2	8	238587	238594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007519	TGCC	2	8	239702	239709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007519	TAAT	2	8	242278	242285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007519	TCTG	2	8	242366	242373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007519	ACGG	2	8	243670	243677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007519	GCGG	2	8	243833	243840	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007519	CGGC	2	8	243892	243899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007519	GCAC	2	8	247349	247356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007519	GCCC	2	8	251392	251399	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_007519	CGGG	2	8	251415	251422	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007519	GCCG	2	8	256501	256508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007519	GGAA	2	8	269119	269126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007519	GTAC	2	8	272051	272058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007519	TGCT	2	8	272257	272264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007519	CTGC	2	8	277199	277206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007519	AAAC	2	8	279287	279294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007519	GCGG	2	8	283422	283429	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007519	GATA	2	8	283513	283520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007519	TGTA	2	8	286211	286218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007519	CCCG	2	8	286231	286238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_007519	CCGG	2	8	286327	286334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007519	CCGG	2	8	286346	286353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007519	CATA	2	8	287407	287414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007519	GGCA	2	8	287541	287548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_007519	GCGG	2	8	287619	287626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_007519	TGCA	2	8	306711	306718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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163	NC_007519	GGCA	2	8	311514	311521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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297	NC_007519	TTGA	2	8	639365	639372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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