MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 52103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007519	GGT	2	6	250	255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355048
2	NC_007519	CAC	2	6	392	397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355048
3	NC_007519	GCT	2	6	415	420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355048
4	NC_007519	GCC	2	6	446	451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355048
5	NC_007519	GCC	2	6	453	458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355048
6	NC_007519	CAA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355048
7	NC_007519	CTG	2	6	633	638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355048
8	NC_007519	CAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355048
9	NC_007519	CTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355048
10	NC_007519	GAC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355048
11	NC_007519	CAG	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355048
12	NC_007519	AAT	2	6	1220	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78355048
13	NC_007519	GCC	2	6	1253	1258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355048
14	NC_007519	CCA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355048
15	NC_007519	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355048
16	NC_007519	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355048
17	NC_007519	AGC	2	6	1689	1694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355049
18	NC_007519	CAT	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355049
19	NC_007519	CGC	2	6	1948	1953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355049
20	NC_007519	CCA	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355049
21	NC_007519	CGA	2	6	2082	2087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355049
22	NC_007519	CCA	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355049
23	NC_007519	GCT	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355049
24	NC_007519	GAA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355049
25	NC_007519	ACA	2	6	2303	2308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355049
26	NC_007519	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355049
27	NC_007519	ATG	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355049
28	NC_007519	ACA	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355049
29	NC_007519	AGG	2	6	2552	2557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78355049
30	NC_007519	ACG	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355049
31	NC_007519	TAC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355049
32	NC_007519	GAA	2	6	2785	2790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355049
33	NC_007519	ACG	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355050
34	NC_007519	GCA	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355050
35	NC_007519	GTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355050
36	NC_007519	CGA	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355050
37	NC_007519	AAG	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
38	NC_007519	TGC	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
39	NC_007519	CGG	2	6	3108	3113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355050
40	NC_007519	CGT	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
41	NC_007519	ATC	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
42	NC_007519	CAC	2	6	3300	3305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355050
43	NC_007519	GAA	2	6	3325	3330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
44	NC_007519	GAG	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78355050
45	NC_007519	GAA	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
46	NC_007519	CAT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
47	NC_007519	TGG	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355050
48	NC_007519	CAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
49	NC_007519	CAA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
50	NC_007519	TGA	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355050
51	NC_007519	GCC	2	6	3934	3939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355050
52	NC_007519	CGC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355050
53	NC_007519	CAA	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
54	NC_007519	TCA	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
55	NC_007519	GAA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355050
56	NC_007519	TCA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
57	NC_007519	TGC	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
58	NC_007519	TTC	2	6	4339	4344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355050
59	NC_007519	GCC	2	6	4395	4400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355050
60	NC_007519	ACA	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355050
61	NC_007519	CTG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
62	NC_007519	CGT	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
63	NC_007519	CTG	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
64	NC_007519	TCA	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355050
65	NC_007519	TTC	2	6	4813	4818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355050
66	NC_007519	GCG	2	6	4874	4879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355050
67	NC_007519	TGG	2	6	4892	4897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355050
68	NC_007519	CTG	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
69	NC_007519	TGC	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
70	NC_007519	ACC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355050
71	NC_007519	TGC	3	9	5057	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355050
72	NC_007519	AAG	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355051
73	NC_007519	TTA	2	6	5276	5281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78355051
74	NC_007519	CAT	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355051
75	NC_007519	ACC	2	6	5423	5428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
76	NC_007519	TGC	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
77	NC_007519	CCA	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
78	NC_007519	CTG	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
79	NC_007519	CCA	2	6	5729	5734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
80	NC_007519	CCG	2	6	5740	5745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355051
81	NC_007519	CTG	3	9	5773	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
82	NC_007519	CGG	2	6	5850	5855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
83	NC_007519	TGG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355051
84	NC_007519	GCT	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
85	NC_007519	GCA	2	6	6255	6260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
86	NC_007519	CGA	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
87	NC_007519	CCG	2	6	6397	6402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355051
88	NC_007519	GCT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
89	NC_007519	GAA	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355051
90	NC_007519	TGC	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
91	NC_007519	GCG	2	6	6584	6589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
92	NC_007519	CGG	2	6	6637	6642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
93	NC_007519	CGA	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
94	NC_007519	TCA	2	6	6710	6715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355051
95	NC_007519	CAG	3	9	6763	6771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
96	NC_007519	CGC	2	6	6772	6777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355051
97	NC_007519	ACC	2	6	6848	6853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
98	NC_007519	CTG	3	9	6859	6867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
99	NC_007519	CAA	2	6	6873	6878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355051
100	NC_007519	CAA	2	6	6948	6953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355051
101	NC_007519	CTG	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
102	NC_007519	GAA	2	6	6967	6972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355051
103	NC_007519	GAA	2	6	7015	7020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78355051
104	NC_007519	CGT	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355051
105	NC_007519	GTT	2	6	7171	7176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78355051
106	NC_007519	ACC	2	6	7180	7185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
107	NC_007519	GCG	2	6	7214	7219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
108	NC_007519	GAC	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355051
109	NC_007519	GTG	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355051
110	NC_007519	AAT	2	6	7326	7331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78355051
111	NC_007519	CGG	2	6	7395	7400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355051
112	NC_007519	TCA	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355051
113	NC_007519	GTA	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78355051
114	NC_007519	CCA	2	6	7496	7501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355051
115	NC_007519	ATG	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347359723
116	NC_007519	GCG	2	6	7918	7923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347359723
117	NC_007519	AAC	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347359723
118	NC_007519	TGC	2	6	8345	8350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347359723
119	NC_007519	CTG	2	6	9457	9462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355056
120	NC_007519	GCT	2	6	9501	9506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355056
121	NC_007519	GCC	2	6	9601	9606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355056
122	NC_007519	GCT	2	6	9730	9735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355056
123	NC_007519	GAG	2	6	9739	9744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78355056
124	NC_007519	GCG	2	6	9757	9762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355056
125	NC_007519	GTG	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355056
126	NC_007519	TAT	2	6	9802	9807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78355056
127	NC_007519	GGC	2	6	9852	9857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355056
128	NC_007519	TGC	2	6	9890	9895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355056
129	NC_007519	TAA	2	6	9909	9914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78355056
130	NC_007519	TGT	2	6	9948	9953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78355056
131	NC_007519	GTG	2	6	10534	10539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78355058
132	NC_007519	TCA	2	6	10728	10733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355058
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257	NC_007519	AGC	2	6	21085	21090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355070
258	NC_007519	GCT	2	6	21161	21166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355070
259	NC_007519	GCC	2	6	21169	21174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355070
260	NC_007519	GCC	2	6	21266	21271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355070
261	NC_007519	ACA	2	6	21314	21319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78355070
262	NC_007519	GGA	2	6	21566	21571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78355071
263	NC_007519	GCA	2	6	21606	21611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355071
264	NC_007519	TGC	2	6	21661	21666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355071
265	NC_007519	CTT	2	6	22702	22707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355075
266	NC_007519	AGG	2	6	22715	22720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78355075
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270	NC_007519	CAG	2	6	22946	22951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355075
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273	NC_007519	GGC	2	6	23138	23143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78355075
274	NC_007519	CAT	2	6	23224	23229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355075
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277	NC_007519	TGC	2	6	23426	23431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355075
278	NC_007519	TGC	2	6	23434	23439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355075
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282	NC_007519	CGA	2	6	23617	23622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78355075
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288	NC_007519	CTG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355076
289	NC_007519	TCG	2	6	23985	23990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355076
290	NC_007519	TGC	2	6	24008	24013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355076
291	NC_007519	CTG	2	6	24086	24091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355076
292	NC_007519	TGC	2	6	24092	24097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355076
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352	NC_007519	CGC	3	9	29399	29407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355084
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361	NC_007519	GCC	2	6	30053	30058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78355084
362	NC_007519	CAC	2	6	30170	30175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78355084
363	NC_007519	CTG	2	6	30730	30735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78355085
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377	NC_007519	CAT	2	6	31373	31378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78355085
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379	NC_007519	TTC	2	6	31499	31504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78355086
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