MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 6516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007516	CGCT	2	8	858	865	0 %	25 %	25 %	50 %	78211559
2	NC_007516	TGCT	2	8	1087	1094	0 %	50 %	25 %	25 %	78211559
3	NC_007516	CGTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	78211560
4	NC_007516	GATG	2	8	1659	1666	25 %	25 %	50 %	0 %	78211560
5	NC_007516	GTTG	2	8	1976	1983	0 %	50 %	50 %	0 %	78211560
6	NC_007516	GGTG	2	8	2677	2684	0 %	25 %	75 %	0 %	78211561
7	NC_007516	CCGG	2	8	2823	2830	0 %	0 %	50 %	50 %	78211561
8	NC_007516	AGCA	2	8	3443	3450	50 %	0 %	25 %	25 %	78211561
9	NC_007516	TGCC	2	8	3784	3791	0 %	25 %	25 %	50 %	78211561
10	NC_007516	TGGT	2	8	3897	3904	0 %	50 %	50 %	0 %	78211561
11	NC_007516	CTTG	2	8	3930	3937	0 %	50 %	25 %	25 %	78211561
12	NC_007516	TCAG	2	8	4494	4501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007516	CAAC	2	8	4592	4599	50 %	0 %	0 %	50 %	78211562
14	NC_007516	CAAA	2	8	4688	4695	75 %	0 %	0 %	25 %	78211562
15	NC_007516	CGTT	2	8	4766	4773	0 %	50 %	25 %	25 %	78211562
16	NC_007516	TCGT	2	8	5218	5225	0 %	50 %	25 %	25 %	78211562
17	NC_007516	GATT	2	8	5302	5309	25 %	50 %	25 %	0 %	78211562
18	NC_007516	CTGA	2	8	6301	6308	25 %	25 %	25 %	25 %	78211563
19	NC_007516	TGGC	2	8	6974	6981	0 %	25 %	50 %	25 %	78211563
20	NC_007516	AAGG	2	8	7414	7421	50 %	0 %	50 %	0 %	78211563
21	NC_007516	TCCA	2	8	7459	7466	25 %	25 %	0 %	50 %	78211563
22	NC_007516	AGGT	2	8	7790	7797	25 %	25 %	50 %	0 %	78211563
23	NC_007516	GCTC	2	8	8595	8602	0 %	25 %	25 %	50 %	78211564
24	NC_007516	GTCC	2	8	9260	9267	0 %	25 %	25 %	50 %	78211564
25	NC_007516	CCAC	2	8	9673	9680	25 %	0 %	0 %	75 %	78211565
26	NC_007516	GGCA	2	8	9796	9803	25 %	0 %	50 %	25 %	78211565
27	NC_007516	GCTT	2	8	10459	10466	0 %	50 %	25 %	25 %	78211566
28	NC_007516	GCTG	2	8	10519	10526	0 %	25 %	50 %	25 %	78211566
29	NC_007516	GCGG	2	8	10912	10919	0 %	0 %	75 %	25 %	78211566
30	NC_007516	GGCC	2	8	10978	10985	0 %	0 %	50 %	50 %	78211566
31	NC_007516	GCTG	2	8	11429	11436	0 %	25 %	50 %	25 %	78211567
32	NC_007516	CTGG	2	8	11473	11480	0 %	25 %	50 %	25 %	78211567
33	NC_007516	AGGG	2	8	11572	11579	25 %	0 %	75 %	0 %	78211567
34	NC_007516	TCCG	2	8	11716	11723	0 %	25 %	25 %	50 %	78211567
35	NC_007516	CGGC	2	8	11768	11775	0 %	0 %	50 %	50 %	78211567
36	NC_007516	CTCA	2	8	11995	12002	25 %	25 %	0 %	50 %	78211568
37	NC_007516	GATC	2	8	12327	12334	25 %	25 %	25 %	25 %	78211568
38	NC_007516	ATGA	2	8	13305	13312	50 %	25 %	25 %	0 %	78211569
39	NC_007516	GGAA	2	8	13976	13983	50 %	0 %	50 %	0 %	78211569
40	NC_007516	TGGT	2	8	14295	14302	0 %	50 %	50 %	0 %	78211570
41	NC_007516	TTTG	2	8	16577	16584	0 %	75 %	25 %	0 %	78211571
42	NC_007516	GGAA	2	8	16777	16784	50 %	0 %	50 %	0 %	78211571
43	NC_007516	CCAG	2	8	18066	18073	25 %	0 %	25 %	50 %	78211573
44	NC_007516	CCAG	2	8	18107	18114	25 %	0 %	25 %	50 %	78211573
45	NC_007516	AGGC	2	8	18257	18264	25 %	0 %	50 %	25 %	78211573
46	NC_007516	CTGG	2	8	18289	18296	0 %	25 %	50 %	25 %	78211573
47	NC_007516	CGGT	2	8	18530	18537	0 %	25 %	50 %	25 %	78211573
48	NC_007516	TCGA	2	8	18667	18674	25 %	25 %	25 %	25 %	78211574
49	NC_007516	TGGA	2	8	18972	18979	25 %	25 %	50 %	0 %	78211574
50	NC_007516	CGGG	2	8	19802	19809	0 %	0 %	75 %	25 %	78211575
51	NC_007516	GTTG	2	8	20323	20330	0 %	50 %	50 %	0 %	78211575
52	NC_007516	CCGA	2	8	21257	21264	25 %	0 %	25 %	50 %	78211577
53	NC_007516	CACC	2	8	21490	21497	25 %	0 %	0 %	75 %	78211577
54	NC_007516	TGAT	2	8	21654	21661	25 %	50 %	25 %	0 %	78211577
55	NC_007516	GCAG	2	8	21811	21818	25 %	0 %	50 %	25 %	78211577
56	NC_007516	GCTG	2	8	21922	21929	0 %	25 %	50 %	25 %	78211577
57	NC_007516	GGTC	2	8	21978	21985	0 %	25 %	50 %	25 %	78211577
58	NC_007516	TCAT	2	8	22548	22555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007516	CGGC	2	8	22557	22564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007516	CAGA	2	8	23102	23109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007516	CGTC	2	8	23184	23191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007516	TGCT	2	8	23551	23558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007516	TGGC	2	8	23593	23600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007516	GATC	2	8	23707	23714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007516	CTGG	2	8	23741	23748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007516	ATGG	2	8	23964	23971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007516	CGAG	2	8	24379	24386	25 %	0 %	50 %	25 %	78211578
68	NC_007516	GGAT	2	8	24495	24502	25 %	25 %	50 %	0 %	78211578
69	NC_007516	TGGT	2	8	24504	24511	0 %	50 %	50 %	0 %	78211578
70	NC_007516	GCAG	2	8	25116	25123	25 %	0 %	50 %	25 %	78211579
71	NC_007516	CCGC	2	8	25799	25806	0 %	0 %	25 %	75 %	78211579
72	NC_007516	GCAA	2	8	25808	25815	50 %	0 %	25 %	25 %	78211579
73	NC_007516	GTCT	2	8	25968	25975	0 %	50 %	25 %	25 %	78211580
74	NC_007516	GATG	2	8	26173	26180	25 %	25 %	50 %	0 %	78211581
75	NC_007516	AGAC	2	8	26468	26475	50 %	0 %	25 %	25 %	78211581
76	NC_007516	CTGC	2	8	26883	26890	0 %	25 %	25 %	50 %	78211581
77	NC_007516	ACTG	2	8	26920	26927	25 %	25 %	25 %	25 %	78211581
78	NC_007516	CAGA	2	8	28016	28023	50 %	0 %	25 %	25 %	78211583
79	NC_007516	GCCA	2	8	28152	28159	25 %	0 %	25 %	50 %	78211583
80	NC_007516	GGCA	2	8	28764	28771	25 %	0 %	50 %	25 %	78211584
81	NC_007516	AGTC	2	8	29677	29684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007516	GGAT	2	8	29867	29874	25 %	25 %	50 %	0 %	78211585
83	NC_007516	CAGC	2	8	30784	30791	25 %	0 %	25 %	50 %	78211585
84	NC_007516	TCCC	2	8	30858	30865	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_007516	GGGA	2	8	30871	30878	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007516	GCTT	2	8	31022	31029	0 %	50 %	25 %	25 %	78211586
87	NC_007516	GGGC	2	8	31456	31463	0 %	0 %	75 %	25 %	78211586
88	NC_007516	AGCC	2	8	31857	31864	25 %	0 %	25 %	50 %	78211586
89	NC_007516	TCAG	2	8	31882	31889	25 %	25 %	25 %	25 %	78211586
90	NC_007516	ATCC	2	8	31996	32003	25 %	25 %	0 %	50 %	78211587
91	NC_007516	CAGG	2	8	32907	32914	25 %	0 %	50 %	25 %	78211587
92	NC_007516	GCCC	2	8	33758	33765	0 %	0 %	25 %	75 %	78211589
93	NC_007516	CCTG	2	8	34304	34311	0 %	25 %	25 %	50 %	78211590
94	NC_007516	CAGC	2	8	34689	34696	25 %	0 %	25 %	50 %	78211590
95	NC_007516	GGCC	2	8	34722	34729	0 %	0 %	50 %	50 %	78211590
96	NC_007516	CCTG	2	8	35227	35234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007516	GCCC	2	8	35889	35896	0 %	0 %	25 %	75 %	78211591
98	NC_007516	GGCC	2	8	36113	36120	0 %	0 %	50 %	50 %	78211591
99	NC_007516	CCAT	2	8	36510	36517	25 %	25 %	0 %	50 %	78211592
100	NC_007516	TTGT	2	8	36950	36957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007516	GTCA	2	8	38528	38535	25 %	25 %	25 %	25 %	78211593
102	NC_007516	TGCT	2	8	38845	38852	0 %	50 %	25 %	25 %	78211594
103	NC_007516	CAGC	2	8	38857	38864	25 %	0 %	25 %	50 %	78211594
104	NC_007516	CAAG	2	8	39514	39521	50 %	0 %	25 %	25 %	78211596
105	NC_007516	CCAG	2	8	39771	39778	25 %	0 %	25 %	50 %	78211596
106	NC_007516	AAGG	2	8	39858	39865	50 %	0 %	50 %	0 %	78211596
107	NC_007516	AAAG	2	8	40301	40308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007516	CCTG	2	8	41300	41307	0 %	25 %	25 %	50 %	78211599
109	NC_007516	CCTT	2	8	41354	41361	0 %	50 %	0 %	50 %	78211599
110	NC_007516	GTGG	2	8	42224	42231	0 %	25 %	75 %	0 %	78211600
111	NC_007516	TTAA	2	8	45062	45069	50 %	50 %	0 %	0 %	78211602
112	NC_007516	AATT	2	8	45264	45271	50 %	50 %	0 %	0 %	78211602
113	NC_007516	TCTG	2	8	45328	45335	0 %	50 %	25 %	25 %	78211602
114	NC_007516	AGAT	2	8	45348	45355	50 %	25 %	25 %	0 %	78211602
115	NC_007516	TGGG	2	8	46118	46125	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007516	ATCT	2	8	46283	46290	25 %	50 %	0 %	25 %	78211603
117	NC_007516	CTTT	2	8	46297	46304	0 %	75 %	0 %	25 %	78211603
118	NC_007516	GCTG	2	8	46335	46342	0 %	25 %	50 %	25 %	78211603
119	NC_007516	CTTC	2	8	46787	46794	0 %	50 %	0 %	50 %	78211603
120	NC_007516	GGTT	2	8	48625	48632	0 %	50 %	50 %	0 %	78211605
121	NC_007516	GGTC	2	8	48926	48933	0 %	25 %	50 %	25 %	78211605
122	NC_007516	CGCC	2	8	49549	49556	0 %	0 %	25 %	75 %	78211606
123	NC_007516	GGTG	2	8	49784	49791	0 %	25 %	75 %	0 %	78211606
124	NC_007516	ATCG	2	8	49896	49903	25 %	25 %	25 %	25 %	78211606
125	NC_007516	CTTC	2	8	50256	50263	0 %	50 %	0 %	50 %	78211607
126	NC_007516	CGGT	2	8	50657	50664	0 %	25 %	50 %	25 %	78211607
127	NC_007516	TGCC	2	8	51638	51645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007516	CGCC	2	8	51823	51830	0 %	0 %	25 %	75 %	78211609
129	NC_007516	GCAA	2	8	52047	52054	50 %	0 %	25 %	25 %	78211609
130	NC_007516	CAAT	2	8	52296	52303	50 %	25 %	0 %	25 %	78211609
131	NC_007516	ATGG	2	8	52410	52417	25 %	25 %	50 %	0 %	78211609
132	NC_007516	CGCC	2	8	52458	52465	0 %	0 %	25 %	75 %	78211609
133	NC_007516	GTGG	2	8	53036	53043	0 %	25 %	75 %	0 %	78211610
134	NC_007516	CTTT	2	8	53172	53179	0 %	75 %	0 %	25 %	78211611
135	NC_007516	GCTC	2	8	54278	54285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007516	GACC	2	8	54659	54666	25 %	0 %	25 %	50 %	78211614
137	NC_007516	CGTG	2	8	54829	54836	0 %	25 %	50 %	25 %	78211614
138	NC_007516	TTGC	2	8	55439	55446	0 %	50 %	25 %	25 %	78211614
139	NC_007516	GCTG	2	8	55728	55735	0 %	25 %	50 %	25 %	78211614
140	NC_007516	TGGC	2	8	55804	55811	0 %	25 %	50 %	25 %	78211614
141	NC_007516	TCCG	2	8	56227	56234	0 %	25 %	25 %	50 %	78211615
142	NC_007516	GCCA	2	8	56303	56310	25 %	0 %	25 %	50 %	78211615
143	NC_007516	CATC	2	8	56329	56336	25 %	25 %	0 %	50 %	78211615
144	NC_007516	GGCA	2	8	57414	57421	25 %	0 %	50 %	25 %	78211616
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