MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 35881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007516	GGT	2	6	236	241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211559
2	NC_007516	CCG	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211559
3	NC_007516	GCA	2	6	349	354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211559
4	NC_007516	GCC	2	6	408	413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211559
5	NC_007516	GAT	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211559
6	NC_007516	CGA	2	6	578	583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211559
7	NC_007516	TGG	2	6	601	606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211559
8	NC_007516	CAG	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211559
9	NC_007516	TGA	2	6	683	688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211559
10	NC_007516	TGA	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211559
11	NC_007516	GGT	2	6	938	943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211559
12	NC_007516	CGT	2	6	1050	1055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211559
13	NC_007516	CGC	2	6	1064	1069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211559
14	NC_007516	CAG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211559
15	NC_007516	GTT	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211559
16	NC_007516	CTG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211559
17	NC_007516	CAC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211559
18	NC_007516	GCT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211560
19	NC_007516	TCT	2	6	1422	1427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211560
20	NC_007516	CCG	2	6	1492	1497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211560
21	NC_007516	CGG	2	6	1616	1621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211560
22	NC_007516	CTG	2	6	1727	1732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211560
23	NC_007516	TTC	2	6	1742	1747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211560
24	NC_007516	CAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211560
25	NC_007516	GAT	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211560
26	NC_007516	GAC	2	6	1984	1989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211560
27	NC_007516	CGA	3	9	2034	2042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211560
28	NC_007516	GAA	2	6	2083	2088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211560
29	NC_007516	CCT	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211560
30	NC_007516	TCC	2	6	2192	2197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211561
31	NC_007516	CGG	2	6	2267	2272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211561
32	NC_007516	CTG	2	6	2332	2337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211561
33	NC_007516	TGG	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211561
34	NC_007516	ACC	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211561
35	NC_007516	CCG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211561
36	NC_007516	GGC	2	6	2519	2524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211561
37	NC_007516	GTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211561
38	NC_007516	CCT	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211561
39	NC_007516	GAG	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211561
40	NC_007516	GCA	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
41	NC_007516	GAT	2	6	2885	2890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211561
42	NC_007516	CCG	2	6	2895	2900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211561
43	NC_007516	GTG	2	6	2964	2969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211561
44	NC_007516	TGG	2	6	2973	2978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211561
45	NC_007516	TGT	2	6	3111	3116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211561
46	NC_007516	TGT	2	6	3135	3140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211561
47	NC_007516	GGA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211561
48	NC_007516	GGC	2	6	3202	3207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211561
49	NC_007516	CGC	2	6	3265	3270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211561
50	NC_007516	CTG	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211561
51	NC_007516	CCA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211561
52	NC_007516	CAG	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
53	NC_007516	GGT	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211561
54	NC_007516	CAG	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
55	NC_007516	GTG	2	6	3576	3581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211561
56	NC_007516	GCC	2	6	3584	3589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211561
57	NC_007516	GGC	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211561
58	NC_007516	AGC	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
59	NC_007516	CGG	2	6	3814	3819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211561
60	NC_007516	GAC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
61	NC_007516	CCG	2	6	3980	3985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211561
62	NC_007516	CAG	3	9	4031	4039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
63	NC_007516	GAC	2	6	4059	4064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
64	NC_007516	AGC	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
65	NC_007516	GGC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211561
66	NC_007516	GGC	2	6	4271	4276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211561
67	NC_007516	GCA	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211561
68	NC_007516	TGC	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211561
69	NC_007516	TCA	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211562
70	NC_007516	TGT	2	6	4573	4578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211562
71	NC_007516	CAG	2	6	4645	4650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211562
72	NC_007516	GTG	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211562
73	NC_007516	CTG	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211562
74	NC_007516	AGA	2	6	4799	4804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211562
75	NC_007516	TCG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211562
76	NC_007516	GTT	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211562
77	NC_007516	GAG	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211562
78	NC_007516	TGT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211562
79	NC_007516	TCA	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211562
80	NC_007516	AAG	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211562
81	NC_007516	GCT	2	6	5742	5747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211562
82	NC_007516	TGA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211562
83	NC_007516	TGT	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211562
84	NC_007516	CTG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211562
85	NC_007516	TTG	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211562
86	NC_007516	CGG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211562
87	NC_007516	ATT	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78211562
88	NC_007516	TGT	2	6	6120	6125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211563
89	NC_007516	TGC	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
90	NC_007516	GTG	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211563
91	NC_007516	CGA	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
92	NC_007516	TTC	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211563
93	NC_007516	TGG	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211563
94	NC_007516	CCA	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211563
95	NC_007516	GCT	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
96	NC_007516	CAG	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
97	NC_007516	CAG	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
98	NC_007516	GGT	3	9	6779	6787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211563
99	NC_007516	CTG	2	6	6943	6948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
100	NC_007516	GCA	2	6	6951	6956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
101	NC_007516	CCA	2	6	7014	7019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211563
102	NC_007516	CGC	2	6	7028	7033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211563
103	NC_007516	CAG	2	6	7084	7089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
104	NC_007516	GGC	2	6	7267	7272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211563
105	NC_007516	CCT	2	6	7281	7286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211563
106	NC_007516	GCA	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
107	NC_007516	GCT	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
108	NC_007516	CAG	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
109	NC_007516	CCA	3	9	7563	7571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211563
110	NC_007516	TCG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
111	NC_007516	CCG	2	6	7616	7621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211563
112	NC_007516	CGT	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
113	NC_007516	CGC	2	6	7758	7763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211563
114	NC_007516	TGC	2	6	7773	7778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
115	NC_007516	CCG	2	6	7829	7834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211563
116	NC_007516	CAG	2	6	7864	7869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
117	NC_007516	GAG	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211563
118	NC_007516	AGC	2	6	7977	7982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
119	NC_007516	CAG	3	9	7987	7995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211563
120	NC_007516	GAA	2	6	8013	8018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211563
121	NC_007516	CGC	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211563
122	NC_007516	GTC	3	9	8149	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
123	NC_007516	GGT	2	6	8259	8264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211563
124	NC_007516	CGT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211563
125	NC_007516	CTC	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211563
126	NC_007516	GAT	2	6	8528	8533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211564
127	NC_007516	GTT	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211564
128	NC_007516	GCG	2	6	8794	8799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211564
129	NC_007516	CGT	2	6	8804	8809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211564
130	NC_007516	CCT	2	6	8814	8819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211564
131	NC_007516	GTT	2	6	8854	8859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211564
132	NC_007516	CGC	2	6	9049	9054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211564
133	NC_007516	GCT	2	6	9090	9095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211564
134	NC_007516	GTT	3	9	9130	9138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211564
135	NC_007516	AGC	2	6	9245	9250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211564
136	NC_007516	CGA	2	6	9277	9282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211564
137	NC_007516	CTC	2	6	9292	9297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211564
138	NC_007516	GCC	2	6	9377	9382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211564
139	NC_007516	CGA	2	6	9404	9409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211564
140	NC_007516	TGC	2	6	9461	9466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211565
141	NC_007516	GCG	2	6	9468	9473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211565
142	NC_007516	TCC	2	6	9561	9566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211565
143	NC_007516	CAG	2	6	9578	9583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211565
144	NC_007516	GGT	2	6	9631	9636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211565
145	NC_007516	GCG	2	6	9690	9695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211565
146	NC_007516	CCA	2	6	9763	9768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211565
147	NC_007516	TGG	2	6	9842	9847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211565
148	NC_007516	GTT	2	6	9867	9872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211565
149	NC_007516	CAG	2	6	9974	9979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211565
150	NC_007516	GTT	2	6	10021	10026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211565
151	NC_007516	GTA	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211565
152	NC_007516	TGA	2	6	10236	10241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211565
153	NC_007516	GCG	2	6	10338	10343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211565
154	NC_007516	TTG	2	6	10373	10378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211565
155	NC_007516	TGC	2	6	10470	10475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211566
156	NC_007516	GTG	2	6	10496	10501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211566
157	NC_007516	TTG	2	6	10584	10589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211566
158	NC_007516	CTC	2	6	10596	10601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211566
159	NC_007516	TTG	2	6	10616	10621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211566
160	NC_007516	ATC	2	6	10647	10652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211566
161	NC_007516	CAG	2	6	10658	10663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211566
162	NC_007516	CAG	2	6	10772	10777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211566
163	NC_007516	GAC	2	6	10901	10906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211566
164	NC_007516	TGG	2	6	10929	10934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211566
165	NC_007516	CAG	2	6	11000	11005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211566
166	NC_007516	TGG	2	6	11219	11224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211567
167	NC_007516	TCA	2	6	11318	11323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211567
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170	NC_007516	CTC	2	6	11532	11537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211567
171	NC_007516	CGT	2	6	11545	11550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211567
172	NC_007516	CAC	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211567
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174	NC_007516	GAT	2	6	11788	11793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211567
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179	NC_007516	CTG	2	6	12140	12145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211568
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243	NC_007516	GGT	2	6	15540	15545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211571
244	NC_007516	CTT	2	6	15633	15638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211571
245	NC_007516	AGG	2	6	15640	15645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211571
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248	NC_007516	CGA	2	6	15785	15790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211571
249	NC_007516	AAG	2	6	15846	15851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211571
250	NC_007516	GCG	2	6	15908	15913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211571
251	NC_007516	CTG	2	6	15960	15965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211571
252	NC_007516	CGC	2	6	15984	15989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211571
253	NC_007516	GCT	2	6	16134	16139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211571
254	NC_007516	AGA	2	6	16304	16309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211571
255	NC_007516	GCA	2	6	16372	16377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211571
256	NC_007516	AGA	3	9	16390	16398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211571
257	NC_007516	ACA	2	6	16495	16500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211571
258	NC_007516	AGG	2	6	16519	16524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211571
259	NC_007516	TGT	2	6	16835	16840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211571
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500	NC_007516	GTG	2	6	33193	33198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211588

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