MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geobacter metallireducens GS-15 plasmid unnamed

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007515	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
2	NC_007515	GCC	2	6	1171	1176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
3	NC_007515	TCT	2	6	1297	1302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494837
4	NC_007515	CAC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494837
5	NC_007515	CAC	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494837
6	NC_007515	GCC	2	6	1366	1371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
7	NC_007515	TGT	2	6	1415	1420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494837
8	NC_007515	CAG	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494837
9	NC_007515	TGT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494837
10	NC_007515	CGG	2	6	1546	1551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494837
11	NC_007515	ATA	2	6	1674	1679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494837
12	NC_007515	CAA	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494837
13	NC_007515	GCC	2	6	1951	1956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494837
14	NC_007515	TCT	2	6	1979	1984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494837
15	NC_007515	AAG	2	6	2126	2131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404494838
16	NC_007515	CTT	3	9	2183	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494838
17	NC_007515	AAT	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494838
18	NC_007515	CTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494839
19	NC_007515	CCA	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494839
20	NC_007515	GCT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494839
21	NC_007515	GTT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494839
22	NC_007515	GAA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404494839
23	NC_007515	CCG	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494839
24	NC_007515	GCT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494839
25	NC_007515	CAC	2	6	3331	3336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494839
26	NC_007515	TGG	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494839
27	NC_007515	CTT	2	6	3458	3463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494839
28	NC_007515	GTT	2	6	3532	3537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494839
29	NC_007515	GGC	3	9	3934	3942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494840
30	NC_007515	TTC	2	6	3982	3987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494840
31	NC_007515	GCG	2	6	3992	3997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494840
32	NC_007515	CCT	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404494841
33	NC_007515	CAA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494841
34	NC_007515	TTC	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494842
35	NC_007515	CGG	2	6	4800	4805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494843
36	NC_007515	TCT	2	6	4842	4847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494843
37	NC_007515	TGA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494843
38	NC_007515	CTT	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494843
39	NC_007515	GCG	2	6	5022	5027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494843
40	NC_007515	TCA	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494844
41	NC_007515	CTT	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494844
42	NC_007515	GTC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494844
43	NC_007515	CAA	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494844
44	NC_007515	GGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404494845
45	NC_007515	CGG	2	6	5506	5511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
46	NC_007515	TCA	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494845
47	NC_007515	CGG	2	6	5674	5679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
48	NC_007515	GAC	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494845
49	NC_007515	GGC	2	6	5780	5785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494845
50	NC_007515	CTT	2	6	6014	6019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494846
51	NC_007515	GTA	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494846
52	NC_007515	CCG	2	6	6103	6108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494846
53	NC_007515	TTG	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494846
54	NC_007515	AAC	2	6	6158	6163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404494846
55	NC_007515	ATA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404494846
56	NC_007515	CGG	2	6	6320	6325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
57	NC_007515	GGC	2	6	6330	6335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
58	NC_007515	TTG	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
59	NC_007515	CTG	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
60	NC_007515	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
61	NC_007515	CCA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494847
62	NC_007515	GCG	2	6	6433	6438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
63	NC_007515	GCG	2	6	6466	6471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
64	NC_007515	GCG	2	6	6502	6507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
65	NC_007515	GCT	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
66	NC_007515	GGC	2	6	6573	6578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
67	NC_007515	GCG	2	6	6583	6588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
68	NC_007515	GGC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
69	NC_007515	TCT	2	6	6686	6691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494847
70	NC_007515	CGG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494847
71	NC_007515	CTG	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494847
72	NC_007515	TTG	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494847
73	NC_007515	GTT	2	6	7039	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
74	NC_007515	CTG	2	6	7112	7117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
75	NC_007515	GCT	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
76	NC_007515	CGG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
77	NC_007515	GCT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
78	NC_007515	CCG	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494848
79	NC_007515	GGT	2	6	7259	7264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494848
80	NC_007515	GGT	2	6	7310	7315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494848
81	NC_007515	CTG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
82	NC_007515	CTG	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
83	NC_007515	GCT	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
84	NC_007515	CGG	2	6	7387	7392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
85	NC_007515	GCT	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
86	NC_007515	CGG	2	6	7450	7455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
87	NC_007515	GGC	2	6	7475	7480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
88	NC_007515	CTG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
89	NC_007515	GCT	3	9	7554	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
90	NC_007515	CTG	2	6	7594	7599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
91	NC_007515	GCG	2	6	7620	7625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
92	NC_007515	TGC	3	9	7637	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494848
93	NC_007515	GCG	2	6	7650	7655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
94	NC_007515	CGG	3	9	7672	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
95	NC_007515	CGG	2	6	7684	7689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
96	NC_007515	CGG	2	6	7714	7719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494848
97	NC_007515	TCA	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494848
98	NC_007515	CCA	2	6	7849	7854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404494848
99	NC_007515	ATT	2	6	7890	7895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404494848
100	NC_007515	GAT	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494848
101	NC_007515	GAC	2	6	8018	8023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494848
102	NC_007515	TGT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
103	NC_007515	CAG	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494848
104	NC_007515	CCG	2	6	8134	8139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404494848
105	NC_007515	GAT	2	6	8222	8227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494848
106	NC_007515	TGT	2	6	8314	8319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494848
107	NC_007515	CTG	3	9	8623	8631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
108	NC_007515	CGG	2	6	8709	8714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
109	NC_007515	TCT	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
110	NC_007515	GAG	2	6	9130	9135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404494849
111	NC_007515	CTG	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
112	NC_007515	CTT	2	6	9172	9177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
113	NC_007515	GCT	2	6	9242	9247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
114	NC_007515	AGG	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404494849
115	NC_007515	TTC	2	6	9344	9349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
116	NC_007515	GTA	2	6	9464	9469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404494849
117	NC_007515	CTT	2	6	9492	9497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
118	NC_007515	TTG	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494849
119	NC_007515	CTT	2	6	9616	9621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
120	NC_007515	GGC	2	6	9643	9648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
121	NC_007515	TCT	2	6	9668	9673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
122	NC_007515	GGC	2	6	9691	9696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
123	NC_007515	TTC	2	6	9776	9781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
124	NC_007515	TTC	2	6	9798	9803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
125	NC_007515	CGG	2	6	9816	9821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
126	NC_007515	CTC	2	6	9835	9840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404494849
127	NC_007515	GTG	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404494849
128	NC_007515	TCC	2	6	9857	9862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404494849
129	NC_007515	GCT	2	6	9888	9893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
130	NC_007515	ATC	2	6	9914	9919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494849
131	NC_007515	TGC	3	9	10132	10140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404494849
132	NC_007515	GCG	2	6	10175	10180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
133	NC_007515	TGT	2	6	10358	10363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404494849
134	NC_007515	TCT	2	6	10559	10564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
135	NC_007515	GGC	2	6	10609	10614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494849
136	NC_007515	TTC	2	6	10651	10656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404494849
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139	NC_007515	ATC	2	6	10799	10804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404494849
140	NC_007515	CGG	2	6	10854	10859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404494850
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153	NC_007515	GCA	2	6	12459	12464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404494852
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.