MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 1459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007514	ACCTT	2	10	3785	3794	20 %	40 %	0 %	40 %	78187987
2	NC_007514	CCCAA	2	10	6600	6609	40 %	0 %	0 %	60 %	78187989
3	NC_007514	GCAAT	2	10	7045	7054	40 %	20 %	20 %	20 %	78187989
4	NC_007514	GCTGG	2	10	8848	8857	0 %	20 %	60 %	20 %	78187991
5	NC_007514	TGGCA	2	10	13100	13109	20 %	20 %	40 %	20 %	78187993
6	NC_007514	CTTTT	2	10	13323	13332	0 %	80 %	0 %	20 %	78187993
7	NC_007514	TGCAG	2	10	20475	20484	20 %	20 %	40 %	20 %	78188004
8	NC_007514	GCACG	2	10	21500	21509	20 %	0 %	40 %	40 %	78188005
9	NC_007514	GATAC	2	10	25708	25717	40 %	20 %	20 %	20 %	78188009
10	NC_007514	AGCGT	2	10	28009	28018	20 %	20 %	40 %	20 %	78188010
11	NC_007514	TGAAG	2	10	29093	29102	40 %	20 %	40 %	0 %	78188011
12	NC_007514	CCGCA	2	10	29734	29743	20 %	0 %	20 %	60 %	78188012
13	NC_007514	CTTTG	2	10	32111	32120	0 %	60 %	20 %	20 %	78188013
14	NC_007514	ATTCA	2	10	35223	35232	40 %	40 %	0 %	20 %	78188017
15	NC_007514	CGGTG	2	10	42856	42865	0 %	20 %	60 %	20 %	78188023
16	NC_007514	ATGTA	2	10	43444	43453	40 %	40 %	20 %	0 %	78188023
17	NC_007514	GGAGA	2	10	45161	45170	40 %	0 %	60 %	0 %	78188024
18	NC_007514	TGCCA	2	10	45474	45483	20 %	20 %	20 %	40 %	78188025
19	NC_007514	GCAAG	2	10	45956	45965	40 %	0 %	40 %	20 %	78188025
20	NC_007514	TGTTT	2	10	46706	46715	0 %	80 %	20 %	0 %	78188025
21	NC_007514	GACAC	2	10	47081	47090	40 %	0 %	20 %	40 %	78188026
22	NC_007514	ATCCA	2	10	47106	47115	40 %	20 %	0 %	40 %	78188026
23	NC_007514	AATTA	2	10	50207	50216	60 %	40 %	0 %	0 %	78188028
24	NC_007514	TGCCA	2	10	50810	50819	20 %	20 %	20 %	40 %	78188028
25	NC_007514	GGAGG	2	10	50954	50963	20 %	0 %	80 %	0 %	78188028
26	NC_007514	GCATT	2	10	56442	56451	20 %	40 %	20 %	20 %	78188034
27	NC_007514	CGTTA	2	10	58253	58262	20 %	40 %	20 %	20 %	78188035
28	NC_007514	ATTGC	2	10	60503	60512	20 %	40 %	20 %	20 %	78188036
29	NC_007514	CTCTT	2	10	60830	60839	0 %	60 %	0 %	40 %	78188037
30	NC_007514	GCGAA	2	10	63646	63655	40 %	0 %	40 %	20 %	78188039
31	NC_007514	AAGTG	2	10	63796	63805	40 %	20 %	40 %	0 %	78188039
32	NC_007514	CTACG	2	10	64234	64243	20 %	20 %	20 %	40 %	78188039
33	NC_007514	GAAAA	2	10	67741	67750	80 %	0 %	20 %	0 %	78188042
34	NC_007514	CAAGG	2	10	68539	68548	40 %	0 %	40 %	20 %	78188043
35	NC_007514	GCACA	2	10	71448	71457	40 %	0 %	20 %	40 %	78188045
36	NC_007514	GTAAC	2	10	71980	71989	40 %	20 %	20 %	20 %	78188045
37	NC_007514	TTACC	2	10	76964	76973	20 %	40 %	0 %	40 %	78188053
38	NC_007514	TCATT	2	10	77028	77037	20 %	60 %	0 %	20 %	78188053
39	NC_007514	AGCGG	2	10	78981	78990	20 %	0 %	60 %	20 %	78188054
40	NC_007514	GTTTT	2	10	79082	79091	0 %	80 %	20 %	0 %	78188055
41	NC_007514	GCATT	2	10	79208	79217	20 %	40 %	20 %	20 %	78188055
42	NC_007514	AAATA	2	10	79879	79888	80 %	20 %	0 %	0 %	78188056
43	NC_007514	GTGGC	2	10	83811	83820	0 %	20 %	60 %	20 %	78188059
44	NC_007514	GCGTT	2	10	85988	85997	0 %	40 %	40 %	20 %	78188060
45	NC_007514	TGCAA	2	10	87026	87035	40 %	20 %	20 %	20 %	78188060
46	NC_007514	CAGCG	2	10	87091	87100	20 %	0 %	40 %	40 %	78188060
47	NC_007514	ATTGA	2	10	87484	87493	40 %	40 %	20 %	0 %	78188060
48	NC_007514	GCTAT	2	10	87734	87743	20 %	40 %	20 %	20 %	78188061
49	NC_007514	GCACG	2	10	91014	91023	20 %	0 %	40 %	40 %	78188064
50	NC_007514	TGGTA	2	10	96278	96287	20 %	40 %	40 %	0 %	78188070
51	NC_007514	AATGC	2	10	101582	101591	40 %	20 %	20 %	20 %	78188073
52	NC_007514	AGCAA	2	10	108666	108675	60 %	0 %	20 %	20 %	78188075
53	NC_007514	AAAAG	2	10	110106	110115	80 %	0 %	20 %	0 %	78188077
54	NC_007514	TTCCT	2	10	112943	112952	0 %	60 %	0 %	40 %	78188082
55	NC_007514	TGGAT	2	10	113173	113182	20 %	40 %	40 %	0 %	78188082
56	NC_007514	TGGTA	2	10	113784	113793	20 %	40 %	40 %	0 %	78188082
57	NC_007514	ACGCG	2	10	114433	114442	20 %	0 %	40 %	40 %	78188083
58	NC_007514	GCAGG	2	10	114543	114552	20 %	0 %	60 %	20 %	78188083
59	NC_007514	GGATA	2	10	116047	116056	40 %	20 %	40 %	0 %	78188084
60	NC_007514	GCAGG	2	10	116798	116807	20 %	0 %	60 %	20 %	78188084
61	NC_007514	GTTTT	2	10	117223	117232	0 %	80 %	20 %	0 %	78188085
62	NC_007514	ACGGG	2	10	119290	119299	20 %	0 %	60 %	20 %	78188087
63	NC_007514	CGGTT	2	10	120210	120219	0 %	40 %	40 %	20 %	78188088
64	NC_007514	TTTTC	2	10	122893	122902	0 %	80 %	0 %	20 %	78188091
65	NC_007514	GCGTC	2	10	124697	124706	0 %	20 %	40 %	40 %	78188094
66	NC_007514	CTGAT	2	10	126177	126186	20 %	40 %	20 %	20 %	78188095
67	NC_007514	ATGGC	2	10	126555	126564	20 %	20 %	40 %	20 %	78188096
68	NC_007514	AAAAG	2	10	127975	127984	80 %	0 %	20 %	0 %	78188097
69	NC_007514	AATGG	2	10	128827	128836	40 %	20 %	40 %	0 %	78188097
70	NC_007514	TGCTT	2	10	131089	131098	0 %	60 %	20 %	20 %	78188099
71	NC_007514	ATTTC	2	10	135477	135486	20 %	60 %	0 %	20 %	78188103
72	NC_007514	CTTAA	2	10	135489	135498	40 %	40 %	0 %	20 %	78188103
73	NC_007514	TATGC	2	10	140160	140169	20 %	40 %	20 %	20 %	78188106
74	NC_007514	GAAAA	2	10	140769	140778	80 %	0 %	20 %	0 %	78188106
75	NC_007514	GCTTT	2	10	140996	141005	0 %	60 %	20 %	20 %	78188107
76	NC_007514	CCTGC	2	10	141362	141371	0 %	20 %	20 %	60 %	78188108
77	NC_007514	TTGCG	2	10	143314	143323	0 %	40 %	40 %	20 %	78188110
78	NC_007514	TTGAT	2	10	145954	145963	20 %	60 %	20 %	0 %	78188112
79	NC_007514	AAAGC	2	10	147154	147163	60 %	0 %	20 %	20 %	78188113
80	NC_007514	ATGTT	2	10	147686	147695	20 %	60 %	20 %	0 %	78188114
81	NC_007514	TGAAA	2	10	148116	148125	60 %	20 %	20 %	0 %	78188114
82	NC_007514	GGGAA	2	10	150413	150422	40 %	0 %	60 %	0 %	78188117
83	NC_007514	ACCAT	2	10	150733	150742	40 %	20 %	0 %	40 %	78188118
84	NC_007514	CTTAT	2	10	150759	150768	20 %	60 %	0 %	20 %	78188118
85	NC_007514	GTGGG	2	10	152703	152712	0 %	20 %	80 %	0 %	78188121
86	NC_007514	ATGGT	2	10	153442	153451	20 %	40 %	40 %	0 %	78188122
87	NC_007514	CAAAA	2	10	153482	153491	80 %	0 %	0 %	20 %	78188122
88	NC_007514	GAGCC	2	10	153526	153535	20 %	0 %	40 %	40 %	78188122
89	NC_007514	AATGA	2	10	158473	158482	60 %	20 %	20 %	0 %	78188125
90	NC_007514	GCAAA	2	10	158556	158565	60 %	0 %	20 %	20 %	78188125
91	NC_007514	TGGCA	2	10	158913	158922	20 %	20 %	40 %	20 %	78188125
92	NC_007514	AGCGC	2	10	159793	159802	20 %	0 %	40 %	40 %	78188126
93	NC_007514	GCAGT	2	10	159953	159962	20 %	20 %	40 %	20 %	78188126
94	NC_007514	ATGCC	2	10	160244	160253	20 %	20 %	20 %	40 %	78188126
95	NC_007514	GAAAT	2	10	162467	162476	60 %	20 %	20 %	0 %	78188127
96	NC_007514	TTGAT	2	10	162770	162779	20 %	60 %	20 %	0 %	78188127
97	NC_007514	GCTTT	2	10	163053	163062	0 %	60 %	20 %	20 %	78188128
98	NC_007514	GCTTG	2	10	163205	163214	0 %	40 %	40 %	20 %	78188128
99	NC_007514	CAAGC	2	10	163927	163936	40 %	0 %	20 %	40 %	78188128
100	NC_007514	TTTGA	2	10	163965	163974	20 %	60 %	20 %	0 %	78188128
101	NC_007514	AGGCA	2	10	166629	166638	40 %	0 %	40 %	20 %	78188131
102	NC_007514	AAAAG	2	10	170086	170095	80 %	0 %	20 %	0 %	78188136
103	NC_007514	GCGGA	2	10	172256	172265	20 %	0 %	60 %	20 %	78188137
104	NC_007514	CAAGC	2	10	174966	174975	40 %	0 %	20 %	40 %	78188138
105	NC_007514	CGCCT	2	10	175743	175752	0 %	20 %	20 %	60 %	78188138
106	NC_007514	CATGC	2	10	179738	179747	20 %	20 %	20 %	40 %	78188142
107	NC_007514	TTGCG	2	10	181927	181936	0 %	40 %	40 %	20 %	78188144
108	NC_007514	CATAG	2	10	185100	185109	40 %	20 %	20 %	20 %	78188146
109	NC_007514	TTTGC	2	10	187495	187504	0 %	60 %	20 %	20 %	78188149
110	NC_007514	TGCGT	2	10	192519	192528	0 %	40 %	40 %	20 %	78188154
111	NC_007514	CGTGC	2	10	193535	193544	0 %	20 %	40 %	40 %	78188156
112	NC_007514	TTCGC	2	10	197096	197105	0 %	40 %	20 %	40 %	78188159
113	NC_007514	CTTTG	2	10	197791	197800	0 %	60 %	20 %	20 %	78188159
114	NC_007514	GTTGC	2	10	198517	198526	0 %	40 %	40 %	20 %	78188159
115	NC_007514	CGGCT	2	10	201256	201265	0 %	20 %	40 %	40 %	78188162
116	NC_007514	CAGCT	2	10	201691	201700	20 %	20 %	20 %	40 %	78188162
117	NC_007514	GGGCA	2	10	209063	209072	20 %	0 %	60 %	20 %	78188168
118	NC_007514	TGTAA	2	10	212867	212876	40 %	40 %	20 %	0 %	78188169
119	NC_007514	AGCAC	2	10	212907	212916	40 %	0 %	20 %	40 %	78188169
120	NC_007514	GTTTT	2	10	214152	214161	0 %	80 %	20 %	0 %	78188170
121	NC_007514	CTCTT	2	10	216772	216781	0 %	60 %	0 %	40 %	78188172
122	NC_007514	GCTCT	2	10	216939	216948	0 %	40 %	20 %	40 %	78188172
123	NC_007514	GAGTA	2	10	219015	219024	40 %	20 %	40 %	0 %	78188175
124	NC_007514	TGCGT	2	10	219388	219397	0 %	40 %	40 %	20 %	78188175
125	NC_007514	TTTGA	2	10	219731	219740	20 %	60 %	20 %	0 %	78188175
126	NC_007514	GGTGA	2	10	220069	220078	20 %	20 %	60 %	0 %	78188176
127	NC_007514	TGCAA	2	10	220819	220828	40 %	20 %	20 %	20 %	78188176
128	NC_007514	TGTGG	2	10	224716	224725	0 %	40 %	60 %	0 %	78188180
129	NC_007514	GCAAT	2	10	225816	225825	40 %	20 %	20 %	20 %	78188180
130	NC_007514	GGGCA	2	10	228119	228128	20 %	0 %	60 %	20 %	78188182
131	NC_007514	TCGCC	2	10	228406	228415	0 %	20 %	20 %	60 %	78188182
132	NC_007514	TTGCG	2	10	229745	229754	0 %	40 %	40 %	20 %	78188184
133	NC_007514	TGGTA	2	10	231483	231492	20 %	40 %	40 %	0 %	78188185
134	NC_007514	TGCTT	2	10	234191	234200	0 %	60 %	20 %	20 %	78188188
135	NC_007514	TTGTG	2	10	236966	236975	0 %	60 %	40 %	0 %	78188191
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