MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 35231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007514	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78187985
2	NC_007514	TTA	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187985
3	NC_007514	TTC	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78187985
4	NC_007514	GAG	2	6	518	523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78187985
5	NC_007514	ATT	2	6	575	580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187985
6	NC_007514	GCA	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187985
7	NC_007514	GAG	2	6	748	753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78187985
8	NC_007514	GCA	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187985
9	NC_007514	ATG	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187985
10	NC_007514	TTA	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187985
11	NC_007514	TGA	2	6	1113	1118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187985
12	NC_007514	ATT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187985
13	NC_007514	ACC	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78187985
14	NC_007514	TAT	2	6	1323	1328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187985
15	NC_007514	TGA	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187985
16	NC_007514	ATT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187985
17	NC_007514	ACC	2	6	1519	1524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78187985
18	NC_007514	TCT	2	6	1561	1566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78187985
19	NC_007514	GTC	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187985
20	NC_007514	TGG	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78187985
21	NC_007514	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78187985
22	NC_007514	GTT	2	6	1840	1845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007514	CAA	2	6	1926	1931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007514	TAA	2	6	2004	2009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007514	CAA	4	12	2056	2067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007514	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007514	ATA	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007514	TGA	2	6	2111	2116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187986
29	NC_007514	ACG	2	6	2422	2427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187986
30	NC_007514	ATT	2	6	2523	2528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187986
31	NC_007514	ATG	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187986
32	NC_007514	ACC	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78187986
33	NC_007514	TCG	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187986
34	NC_007514	CGT	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187986
35	NC_007514	TGA	2	6	2952	2957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187986
36	NC_007514	AGC	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187986
37	NC_007514	AAG	2	6	3029	3034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78187986
38	NC_007514	GCT	2	6	3097	3102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187986
39	NC_007514	TGA	3	9	3114	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187986
40	NC_007514	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187986
41	NC_007514	AGA	2	6	3240	3245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007514	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187987
43	NC_007514	TCA	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187987
44	NC_007514	TCC	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78187987
45	NC_007514	CGT	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187987
46	NC_007514	ATC	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187987
47	NC_007514	TCG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187987
48	NC_007514	CAG	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187987
49	NC_007514	ACA	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78187987
50	NC_007514	CGC	2	6	3839	3844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78187987
51	NC_007514	TAT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187987
52	NC_007514	ATT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187987
53	NC_007514	TAC	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187987
54	NC_007514	TGA	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187987
55	NC_007514	AAC	2	6	4182	4187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78187987
56	NC_007514	TGA	2	6	4201	4206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187987
57	NC_007514	TTA	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187987
58	NC_007514	TTA	2	6	4278	4283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187987
59	NC_007514	AAT	2	6	4633	4638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78187988
60	NC_007514	ACC	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78187988
61	NC_007514	TCA	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187988
62	NC_007514	GCC	2	6	4744	4749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78187988
63	NC_007514	CCT	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78187988
64	NC_007514	TTG	2	6	4865	4870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78187988
65	NC_007514	CAG	2	6	4962	4967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187988
66	NC_007514	GCC	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78187988
67	NC_007514	AGC	2	6	5201	5206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187988
68	NC_007514	TTA	2	6	5274	5279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187988
69	NC_007514	ATT	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187988
70	NC_007514	ATT	2	6	5320	5325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187989
71	NC_007514	AAG	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78187989
72	NC_007514	CTT	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78187989
73	NC_007514	AAT	2	6	5591	5596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78187989
74	NC_007514	TCA	2	6	5613	5618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187989
75	NC_007514	CAG	3	9	5647	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187989
76	NC_007514	CAT	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187989
77	NC_007514	TGG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78187989
78	NC_007514	CAC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78187989
79	NC_007514	ATC	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187989
80	NC_007514	TAA	2	6	6133	6138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78187989
81	NC_007514	TTC	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78187989
82	NC_007514	ATA	2	6	6255	6260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78187989
83	NC_007514	TCA	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187989
84	NC_007514	GTT	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78187989
85	NC_007514	AAT	2	6	6851	6856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78187989
86	NC_007514	GGT	2	6	6913	6918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78187989
87	NC_007514	CAA	2	6	7138	7143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007514	ACA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007514	CTC	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78187990
90	NC_007514	TAA	2	6	7410	7415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78187990
91	NC_007514	GCC	2	6	7529	7534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78187990
92	NC_007514	CCA	2	6	7568	7573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78187990
93	NC_007514	CTC	2	6	7648	7653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78187990
94	NC_007514	TTC	2	6	7705	7710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78187990
95	NC_007514	TGC	2	6	7957	7962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187990
96	NC_007514	AAT	2	6	7972	7977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78187990
97	NC_007514	CAA	2	6	7992	7997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78187990
98	NC_007514	TTA	2	6	8132	8137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007514	TGC	2	6	8183	8188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007514	TAT	2	6	8230	8235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007514	ATG	3	9	8240	8248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007514	GCA	2	6	8524	8529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187991
103	NC_007514	TGG	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78187991
104	NC_007514	CGA	2	6	8607	8612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187991
105	NC_007514	GCT	2	6	8625	8630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187991
106	NC_007514	ATT	2	6	8698	8703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187991
107	NC_007514	TGC	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187991
108	NC_007514	CGT	2	6	8743	8748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187991
109	NC_007514	GAA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78187991
110	NC_007514	TGA	2	6	8814	8819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187991
111	NC_007514	GTT	2	6	8884	8889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78187991
112	NC_007514	CCT	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78187991
113	NC_007514	ATC	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78187991
114	NC_007514	TGA	2	6	9135	9140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187991
115	NC_007514	ATG	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187991
116	NC_007514	ATG	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187991
117	NC_007514	TTG	2	6	9224	9229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78187991
118	NC_007514	GCA	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187991
119	NC_007514	TGG	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78187991
120	NC_007514	ACG	2	6	9413	9418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187991
121	NC_007514	TGC	2	6	9477	9482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187991
122	NC_007514	CGC	2	6	9508	9513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78187991
123	NC_007514	GAT	2	6	9657	9662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187991
124	NC_007514	CGT	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78187991
125	NC_007514	TGG	2	6	9801	9806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78187991
126	NC_007514	ACA	2	6	9887	9892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78187991
127	NC_007514	GAA	2	6	9985	9990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78187991
128	NC_007514	ATT	2	6	10024	10029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78187991
129	NC_007514	ATG	3	9	10187	10195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78187991
130	NC_007514	GTG	2	6	10246	10251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78187991
131	NC_007514	GAA	2	6	10327	10332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78187991
132	NC_007514	AGC	2	6	10361	10366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78187991
133	NC_007514	CCA	2	6	10393	10398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78187991
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137	NC_007514	TGA	2	6	10552	10557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007514	CAA	2	6	10576	10581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007514	TGG	2	6	10616	10621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_007514	CTT	2	6	10832	10837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_007514	GTT	2	6	18905	18910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188003
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258	NC_007514	ACT	2	6	19221	19226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188003
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260	NC_007514	TCA	2	6	19344	19349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188003
261	NC_007514	ATT	3	9	19394	19402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188003
262	NC_007514	ATT	2	6	19451	19456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188003
263	NC_007514	TTA	2	6	19524	19529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188003
264	NC_007514	CGA	2	6	19531	19536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188003
265	NC_007514	TTG	2	6	19665	19670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188003
266	NC_007514	CAA	2	6	19857	19862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188004
267	NC_007514	CAT	2	6	19868	19873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188004
268	NC_007514	TAC	2	6	19891	19896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188004
269	NC_007514	CTG	2	6	20067	20072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188004
270	NC_007514	TTG	2	6	20082	20087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188004
271	NC_007514	TGA	3	9	20101	20109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188004
272	NC_007514	ACA	3	9	20142	20150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188004
273	NC_007514	TTG	2	6	20154	20159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188004
274	NC_007514	GGC	2	6	20303	20308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188004
275	NC_007514	AGT	2	6	20383	20388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188004
276	NC_007514	TTG	2	6	20415	20420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188004
277	NC_007514	TTG	2	6	20568	20573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188004
278	NC_007514	TGA	2	6	20584	20589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188004
279	NC_007514	ATT	2	6	20732	20737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188004
280	NC_007514	TAG	2	6	20787	20792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188004
281	NC_007514	TTA	2	6	20865	20870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188004
282	NC_007514	TTG	2	6	20936	20941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188004
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288	NC_007514	TGT	2	6	21629	21634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188005
289	NC_007514	GCA	2	6	21687	21692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188005
290	NC_007514	TCG	2	6	21762	21767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188005
291	NC_007514	GAG	2	6	21769	21774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188005
292	NC_007514	GCA	2	6	21799	21804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188005
293	NC_007514	TGG	2	6	21815	21820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188005
294	NC_007514	TTG	2	6	21832	21837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188005
295	NC_007514	AAT	2	6	22033	22038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188005
296	NC_007514	TTG	2	6	22052	22057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188005
297	NC_007514	ATT	2	6	22126	22131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188005
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299	NC_007514	ATT	2	6	22196	22201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188005
300	NC_007514	TGT	2	6	22215	22220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188005
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305	NC_007514	ATT	2	6	22610	22615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188006
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349	NC_007514	ACC	2	6	26427	26432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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352	NC_007514	GTT	2	6	26536	26541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_007514	ATT	2	6	29139	29144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188011
385	NC_007514	GTG	2	6	29145	29150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188011
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