MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007513	TTTTGA	2	12	37184	37195	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007513	GCTGCG	2	12	69467	69478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007513	TTTTTA	2	12	104869	104880	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007513	CGTCAG	2	12	268237	268248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007513	GAAGGC	2	12	372797	372808	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007513	GTTTGA	2	12	372983	372994	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007513	TTAGAA	2	12	375404	375415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007513	AGAGAA	2	12	447921	447932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007513	AACACG	2	12	448010	448021	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007513	GTCCTT	2	12	454543	454554	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007513	TGGTTC	2	12	457866	457877	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007513	TTCAGC	2	12	458679	458690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007513	TGTATG	2	12	464564	464575	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007513	GTTGAA	2	12	488009	488020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007513	CAATGT	2	12	536176	536187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007513	GGAGGT	2	12	551204	551215	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007513	AATTTG	2	12	585596	585607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007513	CCATCC	2	12	605904	605915	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007513	GTGATT	2	12	655374	655385	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007513	ATATTT	2	12	715605	715616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007513	GGCTCT	2	12	720432	720443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007513	TGGCCT	2	12	749359	749370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007513	CATCGG	2	12	766575	766586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007513	TTGATT	2	12	773227	773238	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007513	TTCAAG	2	12	783992	784003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007513	AGTTTT	2	12	784076	784087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007513	CATTTG	2	12	814565	814576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007513	TTTTTA	2	12	817519	817530	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007513	TCAAAA	2	12	948843	948854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007513	CCAAAA	2	12	956335	956346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007513	CTCACC	2	12	961895	961906	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007513	ATTTAG	2	12	978034	978045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007513	AGAAAA	2	12	992388	992399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007513	TTCTAA	2	12	994811	994822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007513	GTGACG	2	12	1018032	1018043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007513	TGCTGA	2	12	1095304	1095315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007513	GAGGGC	2	12	1125635	1125646	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007513	CGATGT	2	12	1167349	1167360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007513	GTTGAT	2	12	1168260	1168271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007513	TCGACG	2	12	1169270	1169281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007513	TTTCAA	2	12	1214206	1214217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007513	TTGAGA	2	12	1303245	1303256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007513	ATCCAC	2	12	1306180	1306191	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007513	AAAAGC	2	12	1400498	1400509	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007513	GGCTCT	2	12	1401587	1401598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007513	ATTTAA	2	12	1406749	1406760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007513	TTTGGA	2	12	1420403	1420414	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007513	ACGGTG	2	12	1422537	1422548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007513	GCTGGA	2	12	1426552	1426563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007513	TCAGGA	2	12	1465250	1465261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007513	GCAATA	2	12	1505529	1505540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007513	AAAACC	2	12	1526506	1526517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007513	CCTTCT	2	12	1549233	1549244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007513	CGGAGG	2	12	1558054	1558065	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007513	TCGATC	2	12	1565183	1565194	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007513	TGAAGA	2	12	1649942	1649953	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007513	GATGCA	2	12	1764691	1764702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007513	CACGAG	2	12	1774380	1774391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007513	TTCTAA	2	12	1776654	1776665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007513	CTCAAA	2	12	1779074	1779085	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007513	GCCTTC	2	12	1779261	1779272	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007513	TGATTG	2	12	1793765	1793776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007513	AGGGGG	2	12	1823075	1823086	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007513	GCAGTG	2	12	1823201	1823212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007513	GAGCCA	2	12	1955352	1955363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007513	GGCCGT	2	12	2028485	2028496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007513	CAATTG	2	12	2066980	2066991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007513	CCAATT	2	12	2067622	2067633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007513	GTAAAC	2	12	2068004	2068015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007513	AGGTGA	2	12	2098320	2098331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007513	CAATAA	2	12	2107761	2107772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007513	CGCCAA	2	12	2143632	2143643	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007513	CTAAAA	2	12	2178212	2178223	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007513	ATATAG	2	12	2195705	2195716	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.