MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 6031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007513	GTCT	2	8	62	69	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007513	CGAC	2	8	316	323	25 %	0 %	25 %	50 %	78183585
3	NC_007513	GGGT	2	8	1529	1536	0 %	25 %	75 %	0 %	78183586
4	NC_007513	TCGA	2	8	1692	1699	25 %	25 %	25 %	25 %	78183586
5	NC_007513	TCGG	2	8	2159	2166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007513	TCGG	2	8	2283	2290	0 %	25 %	50 %	25 %	78183587
7	NC_007513	GTGG	2	8	2687	2694	0 %	25 %	75 %	0 %	78183587
8	NC_007513	GGTG	2	8	2914	2921	0 %	25 %	75 %	0 %	78183587
9	NC_007513	GCTT	2	8	2951	2958	0 %	50 %	25 %	25 %	78183587
10	NC_007513	TCGT	2	8	3246	3253	0 %	50 %	25 %	25 %	78183587
11	NC_007513	GCTA	2	8	3490	3497	25 %	25 %	25 %	25 %	78183587
12	NC_007513	TTGG	2	8	3945	3952	0 %	50 %	50 %	0 %	78183587
13	NC_007513	GATT	2	8	4081	4088	25 %	50 %	25 %	0 %	78183587
14	NC_007513	GGTT	2	8	4113	4120	0 %	50 %	50 %	0 %	78183587
15	NC_007513	CGGT	2	8	4393	4400	0 %	25 %	50 %	25 %	78183587
16	NC_007513	TTAA	2	8	5509	5516	50 %	50 %	0 %	0 %	78183588
17	NC_007513	TGAT	2	8	5630	5637	25 %	50 %	25 %	0 %	78183588
18	NC_007513	ACCC	2	8	5737	5744	25 %	0 %	0 %	75 %	78183588
19	NC_007513	TCAC	2	8	6267	6274	25 %	25 %	0 %	50 %	78183589
20	NC_007513	TAGG	2	8	6649	6656	25 %	25 %	50 %	0 %	78183589
21	NC_007513	AGGT	2	8	7755	7762	25 %	25 %	50 %	0 %	78183589
22	NC_007513	AAGG	2	8	7958	7965	50 %	0 %	50 %	0 %	78183589
23	NC_007513	TCCA	2	8	8144	8151	25 %	25 %	0 %	50 %	78183589
24	NC_007513	GACT	2	8	9075	9082	25 %	25 %	25 %	25 %	78183590
25	NC_007513	TATT	2	8	9393	9400	25 %	75 %	0 %	0 %	78183591
26	NC_007513	CCAT	2	8	9854	9861	25 %	25 %	0 %	50 %	78183591
27	NC_007513	CAAC	2	8	9996	10003	50 %	0 %	0 %	50 %	78183591
28	NC_007513	TCCG	2	8	10234	10241	0 %	25 %	25 %	50 %	78183591
29	NC_007513	GAAG	2	8	10769	10776	50 %	0 %	50 %	0 %	78183592
30	NC_007513	GATT	2	8	10972	10979	25 %	50 %	25 %	0 %	78183592
31	NC_007513	CACT	2	8	11029	11036	25 %	25 %	0 %	50 %	78183592
32	NC_007513	GGTT	2	8	11059	11066	0 %	50 %	50 %	0 %	78183593
33	NC_007513	GTTC	2	8	12178	12185	0 %	50 %	25 %	25 %	78183594
34	NC_007513	ATCG	2	8	12289	12296	25 %	25 %	25 %	25 %	78183594
35	NC_007513	ACCC	2	8	12860	12867	25 %	0 %	0 %	75 %	78183595
36	NC_007513	CTTG	2	8	12890	12897	0 %	50 %	25 %	25 %	78183595
37	NC_007513	ATGA	2	8	13296	13303	50 %	25 %	25 %	0 %	78183595
38	NC_007513	GCCA	2	8	13806	13813	25 %	0 %	25 %	50 %	78183595
39	NC_007513	CCAG	2	8	14409	14416	25 %	0 %	25 %	50 %	78183596
40	NC_007513	CAAC	2	8	14991	14998	50 %	0 %	0 %	50 %	78183596
41	NC_007513	TGCC	2	8	15318	15325	0 %	25 %	25 %	50 %	78183596
42	NC_007513	TCGA	2	8	15374	15381	25 %	25 %	25 %	25 %	78183596
43	NC_007513	ATTG	2	8	15829	15836	25 %	50 %	25 %	0 %	78183597
44	NC_007513	TTTG	2	8	16044	16051	0 %	75 %	25 %	0 %	78183597
45	NC_007513	TTCG	2	8	16352	16359	0 %	50 %	25 %	25 %	78183597
46	NC_007513	GCAG	2	8	16840	16847	25 %	0 %	50 %	25 %	78183597
47	NC_007513	TTTG	2	8	18133	18140	0 %	75 %	25 %	0 %	78183599
48	NC_007513	GATT	2	8	18400	18407	25 %	50 %	25 %	0 %	78183599
49	NC_007513	CCAC	2	8	18468	18475	25 %	0 %	0 %	75 %	78183599
50	NC_007513	ATTG	2	8	19103	19110	25 %	50 %	25 %	0 %	78183600
51	NC_007513	GTGG	2	8	19690	19697	0 %	25 %	75 %	0 %	78183601
52	NC_007513	CACC	2	8	19938	19945	25 %	0 %	0 %	75 %	78183601
53	NC_007513	GGCA	2	8	20156	20163	25 %	0 %	50 %	25 %	78183601
54	NC_007513	GTTG	2	8	20444	20451	0 %	50 %	50 %	0 %	78183601
55	NC_007513	TTGA	2	8	20490	20497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007513	TAAG	2	8	20516	20523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007513	ATCA	2	8	20539	20546	50 %	25 %	0 %	25 %	78183602
58	NC_007513	CCGT	2	8	20630	20637	0 %	25 %	25 %	50 %	78183602
59	NC_007513	TCCT	2	8	21114	21121	0 %	50 %	0 %	50 %	78183603
60	NC_007513	GATT	2	8	21843	21850	25 %	50 %	25 %	0 %	78183604
61	NC_007513	GCAA	2	8	22349	22356	50 %	0 %	25 %	25 %	78183604
62	NC_007513	GTCG	2	8	22931	22938	0 %	25 %	50 %	25 %	78183606
63	NC_007513	GCCT	2	8	23112	23119	0 %	25 %	25 %	50 %	78183606
64	NC_007513	GACG	2	8	23860	23867	25 %	0 %	50 %	25 %	78183607
65	NC_007513	GTTG	2	8	23878	23885	0 %	50 %	50 %	0 %	78183607
66	NC_007513	TTTC	2	8	24364	24371	0 %	75 %	0 %	25 %	78183608
67	NC_007513	CCAG	2	8	24684	24691	25 %	0 %	25 %	50 %	78183608
68	NC_007513	CCAC	2	8	24841	24848	25 %	0 %	0 %	75 %	78183608
69	NC_007513	GCCA	2	8	24879	24886	25 %	0 %	25 %	50 %	78183608
70	NC_007513	TTGT	2	8	25149	25156	0 %	75 %	25 %	0 %	78183609
71	NC_007513	ATCG	2	8	25590	25597	25 %	25 %	25 %	25 %	78183609
72	NC_007513	CGAT	2	8	26053	26060	25 %	25 %	25 %	25 %	78183609
73	NC_007513	GCAT	2	8	26862	26869	25 %	25 %	25 %	25 %	78183610
74	NC_007513	CAGC	2	8	27502	27509	25 %	0 %	25 %	50 %	78183610
75	NC_007513	TCAT	2	8	27563	27570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007513	TCAA	2	8	27571	27578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007513	CTTC	2	8	27581	27588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007513	CACT	2	8	27880	27887	25 %	25 %	0 %	50 %	78183611
79	NC_007513	GCTG	2	8	28217	28224	0 %	25 %	50 %	25 %	78183611
80	NC_007513	TCCA	2	8	28724	28731	25 %	25 %	0 %	50 %	78183612
81	NC_007513	GGCT	2	8	29288	29295	0 %	25 %	50 %	25 %	78183612
82	NC_007513	CAGG	2	8	29601	29608	25 %	0 %	50 %	25 %	78183612
83	NC_007513	TCGA	2	8	29776	29783	25 %	25 %	25 %	25 %	78183613
84	NC_007513	GCTT	2	8	30337	30344	0 %	50 %	25 %	25 %	78183614
85	NC_007513	GCCG	2	8	30509	30516	0 %	0 %	50 %	50 %	78183614
86	NC_007513	CTGG	2	8	30988	30995	0 %	25 %	50 %	25 %	78183615
87	NC_007513	GTTT	2	8	31761	31768	0 %	75 %	25 %	0 %	78183615
88	NC_007513	CGAT	2	8	32148	32155	25 %	25 %	25 %	25 %	78183616
89	NC_007513	GATC	2	8	32184	32191	25 %	25 %	25 %	25 %	78183616
90	NC_007513	GCCC	2	8	32476	32483	0 %	0 %	25 %	75 %	78183616
91	NC_007513	GGGA	2	8	32551	32558	25 %	0 %	75 %	0 %	78183616
92	NC_007513	AATA	2	8	33306	33313	75 %	25 %	0 %	0 %	78183617
93	NC_007513	ATCG	2	8	33416	33423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007513	TGGC	2	8	33795	33802	0 %	25 %	50 %	25 %	78183618
95	NC_007513	CGAT	2	8	34318	34325	25 %	25 %	25 %	25 %	78183618
96	NC_007513	CGTG	2	8	35151	35158	0 %	25 %	50 %	25 %	78183618
97	NC_007513	TGAA	2	8	35289	35296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007513	GATG	2	8	35592	35599	25 %	25 %	50 %	0 %	78183619
99	NC_007513	CAAG	2	8	36172	36179	50 %	0 %	25 %	25 %	78183620
100	NC_007513	GAGG	2	8	36269	36276	25 %	0 %	75 %	0 %	78183620
101	NC_007513	CGTG	2	8	36326	36333	0 %	25 %	50 %	25 %	78183620
102	NC_007513	ACCG	2	8	36361	36368	25 %	0 %	25 %	50 %	78183620
103	NC_007513	AAAG	2	8	36902	36909	75 %	0 %	25 %	0 %	78183622
104	NC_007513	AGCC	2	8	36959	36966	25 %	0 %	25 %	50 %	78183622
105	NC_007513	GGGC	2	8	37014	37021	0 %	0 %	75 %	25 %	78183622
106	NC_007513	GGTC	2	8	38714	38721	0 %	25 %	50 %	25 %	78183624
107	NC_007513	GACG	2	8	39610	39617	25 %	0 %	50 %	25 %	78183625
108	NC_007513	TTTG	2	8	39840	39847	0 %	75 %	25 %	0 %	78183625
109	NC_007513	ATTC	2	8	40880	40887	25 %	50 %	0 %	25 %	78183626
110	NC_007513	GTTC	2	8	41316	41323	0 %	50 %	25 %	25 %	78183626
111	NC_007513	GCAG	2	8	41966	41973	25 %	0 %	50 %	25 %	78183627
112	NC_007513	ACCG	2	8	43442	43449	25 %	0 %	25 %	50 %	78183629
113	NC_007513	GTGA	2	8	44579	44586	25 %	25 %	50 %	0 %	78183631
114	NC_007513	TGGC	2	8	45303	45310	0 %	25 %	50 %	25 %	78183631
115	NC_007513	TTGG	2	8	45733	45740	0 %	50 %	50 %	0 %	78183631
116	NC_007513	GATT	2	8	45766	45773	25 %	50 %	25 %	0 %	78183631
117	NC_007513	TCAA	2	8	46266	46273	50 %	25 %	0 %	25 %	78183632
118	NC_007513	CGAC	2	8	46632	46639	25 %	0 %	25 %	50 %	78183632
119	NC_007513	CGGA	2	8	46712	46719	25 %	0 %	50 %	25 %	78183632
120	NC_007513	ATGA	2	8	46991	46998	50 %	25 %	25 %	0 %	78183632
121	NC_007513	AGCG	2	8	47101	47108	25 %	0 %	50 %	25 %	78183632
122	NC_007513	CACC	2	8	47535	47542	25 %	0 %	0 %	75 %	78183633
123	NC_007513	GCAC	2	8	47616	47623	25 %	0 %	25 %	50 %	78183633
124	NC_007513	TGAA	2	8	47642	47649	50 %	25 %	25 %	0 %	78183633
125	NC_007513	ATGG	2	8	48919	48926	25 %	25 %	50 %	0 %	78183635
126	NC_007513	GCCA	2	8	49305	49312	25 %	0 %	25 %	50 %	78183635
127	NC_007513	GATG	2	8	49518	49525	25 %	25 %	50 %	0 %	78183635
128	NC_007513	TCAA	2	8	50470	50477	50 %	25 %	0 %	25 %	78183637
129	NC_007513	GAAC	2	8	51129	51136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007513	GCGA	2	8	51715	51722	25 %	0 %	50 %	25 %	78183640
131	NC_007513	GCTT	2	8	52008	52015	0 %	50 %	25 %	25 %	78183640
132	NC_007513	TTGT	2	8	52769	52776	0 %	75 %	25 %	0 %	78183640
133	NC_007513	CCGC	2	8	53085	53092	0 %	0 %	25 %	75 %	78183641
134	NC_007513	TGAC	2	8	53772	53779	25 %	25 %	25 %	25 %	78183641
135	NC_007513	ATCG	2	8	54085	54092	25 %	25 %	25 %	25 %	78183641
136	NC_007513	CCTA	2	8	54117	54124	25 %	25 %	0 %	50 %	78183641
137	NC_007513	GGGC	2	8	55220	55227	0 %	0 %	75 %	25 %	78183642
138	NC_007513	TGGC	2	8	56559	56566	0 %	25 %	50 %	25 %	78183643
139	NC_007513	GGCG	2	8	56656	56663	0 %	0 %	75 %	25 %	78183643
140	NC_007513	CGAT	2	8	56664	56671	25 %	25 %	25 %	25 %	78183643
141	NC_007513	ACCC	2	8	57223	57230	25 %	0 %	0 %	75 %	78183644
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143	NC_007513	GATT	2	8	57291	57298	25 %	50 %	25 %	0 %	78183644
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