MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007513	GTCT	2	8	62	69	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007513	TCGG	2	8	2159	2166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007513	TTGA	2	8	20490	20497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007513	TAAG	2	8	20516	20523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007513	TCAT	2	8	27563	27570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007513	TCAA	2	8	27571	27578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007513	CTTC	2	8	27581	27588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007513	ATCG	2	8	33416	33423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007513	TGAA	2	8	35289	35296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007513	GAAC	2	8	51129	51136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007513	AAGG	2	8	58465	58472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007513	AGTG	2	8	60605	60612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007513	TGAT	2	8	70751	70758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007513	TTAG	2	8	71018	71025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007513	TTTC	2	8	77280	77287	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007513	TTTA	2	8	82636	82643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007513	TGTT	2	8	82659	82666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007513	TTTA	2	8	104818	104825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007513	TCCT	2	8	110361	110368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007513	CCTT	2	8	110478	110485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007513	CGCT	2	8	110497	110504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007513	CTTT	2	8	112737	112744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007513	CACC	2	8	112819	112826	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_007513	CTTC	2	8	131114	131121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007513	TTCT	2	8	134896	134903	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007513	TTGA	2	8	135981	135988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007513	CTTT	2	8	136150	136157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007513	TTTA	2	8	138408	138415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007513	ATGA	2	8	140718	140725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007513	TGGC	2	8	172040	172047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007513	TTGA	2	8	173544	173551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007513	GCTT	2	8	183187	183194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007513	CCGT	2	8	183798	183805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007513	GGGT	2	8	185626	185633	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007513	TATC	2	8	185637	185644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007513	GCCA	2	8	185701	185708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007513	GGCG	2	8	186151	186158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007513	ATGG	2	8	187015	187022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007513	ATTG	2	8	201751	201758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007513	GGGA	2	8	217337	217344	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007513	GATT	2	8	218300	218307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007513	CAAC	2	8	221241	221248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007513	GAAT	2	8	241164	241171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007513	AACA	2	8	253118	253125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007513	ATCA	2	8	254103	254110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007513	CGTG	2	8	267799	267806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007513	TCTT	2	8	275264	275271	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007513	CCGG	2	8	288995	289002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007513	GCCT	2	8	290571	290578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007513	CTGG	2	8	304364	304371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007513	GGTT	2	8	309300	309307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007513	TGAT	2	8	311732	311739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007513	CGGG	2	8	326602	326609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007513	TGAT	2	8	333794	333801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007513	GCGT	2	8	335537	335544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007513	AAGA	2	8	337555	337562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007513	GGAA	2	8	347038	347045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007513	GTTT	2	8	366497	366504	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007513	CGGC	2	8	366942	366949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007513	TTGG	2	8	372536	372543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007513	AGTA	2	8	373241	373248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007513	CGAA	2	8	373374	373381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007513	ACGC	2	8	374147	374154	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007513	GGAT	2	8	374780	374787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007513	AGCT	2	8	376394	376401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007513	GAAG	2	8	377876	377883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007513	TATC	2	8	378540	378547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007513	ATCC	2	8	378579	378586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007513	GATG	2	8	381973	381980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007513	GTCA	2	8	385990	385997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007513	GGCG	2	8	387469	387476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007513	TGAT	2	8	400537	400544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007513	AATG	2	8	411483	411490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007513	ATCA	2	8	412600	412607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007513	GTCT	2	8	412732	412739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007513	TACT	2	8	412941	412948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007513	GATC	2	8	418456	418463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007513	GGGC	2	8	426452	426459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007513	TTGC	2	8	428687	428694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007513	CCGG	2	8	435328	435335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007513	TCAC	2	8	437235	437242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007513	TCAA	2	8	437257	437264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007513	GTTC	2	8	438421	438428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007513	CTTT	2	8	446162	446169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007513	TTAT	2	8	446752	446759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007513	GACT	2	8	448054	448061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007513	TCGA	2	8	448819	448826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007513	GATT	2	8	449275	449282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007513	CTGC	2	8	449307	449314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007513	GGAT	2	8	449344	449351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007513	CGTT	2	8	449525	449532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007513	CCTT	2	8	449571	449578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007513	AGAA	2	8	449930	449937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007513	CATG	2	8	450261	450268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007513	TAAC	2	8	451068	451075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007513	ATGC	2	8	451671	451678	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007513	GTAA	2	8	451737	451744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007513	GTTT	2	8	451915	451922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007513	GTTA	2	8	454139	454146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007513	GACA	2	8	454156	454163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007513	AATT	2	8	454445	454452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007513	GAAT	2	8	454616	454623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007513	AAAT	2	8	454675	454682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007513	ATTG	2	8	455349	455356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007513	CTTT	2	8	455387	455394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007513	TTTG	2	8	455440	455447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007513	CATG	2	8	456193	456200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007513	TTCT	2	8	456843	456850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007513	CTTC	2	8	457445	457452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007513	CCAT	2	8	458553	458560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007513	ATTG	2	8	458931	458938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007513	TATT	2	8	458960	458967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007513	GTTA	2	8	459471	459478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007513	TCAC	2	8	459553	459560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007513	CCAA	2	8	459604	459611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007513	CCCT	2	8	459917	459924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_007513	CGTT	2	8	460034	460041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007513	CAGT	2	8	460486	460493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007513	AGCA	2	8	460687	460694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007513	ATGT	2	8	460914	460921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007513	TTGC	2	8	460935	460942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007513	CGTG	2	8	462818	462825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007513	GTAA	2	8	463793	463800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007513	GTTC	2	8	463930	463937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007513	GCCA	2	8	464374	464381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007513	ACAA	2	8	464613	464620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007513	TCTT	2	8	466175	466182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007513	TTCT	2	8	467537	467544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007513	CTTC	2	8	468631	468638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007513	CAAC	2	8	468851	468858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007513	ATTT	2	8	469186	469193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007513	ATTG	2	8	469568	469575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007513	GCTC	2	8	487945	487952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007513	TCCA	2	8	488029	488036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007513	GTTG	2	8	488097	488104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007513	GATT	2	8	488605	488612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007513	CAAA	2	8	493583	493590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007513	GTGA	2	8	493629	493636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007513	AAGC	2	8	494871	494878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007513	CCTT	2	8	495137	495144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007513	CCCA	2	8	500793	500800	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_007513	TTCC	2	8	501096	501103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007513	TTGC	2	8	512588	512595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007513	TCAG	2	8	513755	513762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007513	GGGT	2	8	518756	518763	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007513	CGTG	2	8	525566	525573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007513	TTGA	2	8	525586	525593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007513	AAGG	2	8	526713	526720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007513	GGAC	2	8	530384	530391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007513	TGAT	2	8	532997	533004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007513	TGGG	2	8	537620	537627	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007513	GCAG	2	8	537648	537655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_007513	ATCA	2	8	540290	540297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_007513	GGTT	2	8	541228	541235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_007513	CTGG	2	8	542938	542945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_007513	CTCA	2	8	546445	546452	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_007513	CTGG	2	8	548478	548485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_007513	AACG	2	8	571624	571631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_007513	TGAT	2	8	577431	577438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007513	AGTT	2	8	577746	577753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_007513	TGTC	2	8	586661	586668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_007513	GTTG	3	12	591946	591957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NC_007513	TTCG	2	8	594111	594118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_007513	ATGT	2	8	595013	595020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_007513	AACG	2	8	613972	613979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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184	NC_007513	TCGT	2	8	649260	649267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
185	NC_007513	GTTG	2	8	668179	668186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007513	CTTT	2	8	688016	688023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_007513	TGCA	2	8	688219	688226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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196	NC_007513	TGCA	2	8	718770	718777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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