MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 342

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007513	TG	3	6	32978	32983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007513	GA	3	6	35477	35482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007513	TC	3	6	38813	38818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007513	TG	3	6	42442	42447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007513	GA	3	6	57063	57068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007513	CT	3	6	62078	62083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007513	GA	3	6	70978	70983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007513	TA	3	6	103383	103388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007513	TG	3	6	110371	110376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007513	CT	3	6	112828	112833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007513	TC	3	6	127130	127135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007513	AT	3	6	129617	129622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007513	AT	3	6	138475	138480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007513	TG	3	6	140393	140398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007513	TA	3	6	149666	149671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007513	CA	3	6	171945	171950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007513	GT	3	6	183202	183207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007513	GA	3	6	189601	189606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007513	CT	4	8	192563	192570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007513	TG	3	6	241177	241182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007513	CT	3	6	253205	253210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007513	GA	3	6	254000	254005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007513	AT	3	6	263356	263361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007513	CT	3	6	283781	283786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007513	CT	3	6	287024	287029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007513	GA	3	6	290510	290515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007513	TC	3	6	293122	293127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007513	AC	3	6	304417	304422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007513	CT	3	6	309291	309296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007513	TC	3	6	326377	326382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007513	CT	3	6	327786	327791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007513	TG	3	6	335916	335921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007513	TG	3	6	337675	337680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007513	TG	3	6	372363	372368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007513	GA	3	6	372768	372773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007513	GC	3	6	372777	372782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007513	TG	3	6	373261	373266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007513	GA	3	6	374273	374278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007513	AG	3	6	374405	374410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007513	AC	3	6	374479	374484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007513	AC	3	6	374648	374653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007513	CA	3	6	375610	375615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007513	TG	3	6	376031	376036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007513	TG	3	6	376518	376523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007513	CT	4	8	377227	377234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007513	GA	3	6	377540	377545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007513	GC	3	6	377822	377827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007513	TG	3	6	382010	382015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007513	GC	3	6	385165	385170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007513	GC	3	6	403722	403727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007513	AT	3	6	412578	412583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007513	TC	3	6	418556	418561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007513	CT	3	6	446847	446852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007513	AG	3	6	448415	448420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007513	GT	3	6	448498	448503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007513	AG	3	6	448598	448603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007513	AG	3	6	449093	449098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007513	AG	3	6	450023	450028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007513	GA	3	6	450031	450036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007513	GT	3	6	450037	450042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007513	AG	3	6	450340	450345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007513	AG	4	8	450887	450894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007513	CT	3	6	454694	454699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007513	TC	3	6	456287	456292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007513	TG	3	6	456423	456428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007513	TG	3	6	456866	456871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007513	AT	3	6	457598	457603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007513	CT	3	6	457799	457804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007513	GA	3	6	460479	460484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007513	TC	3	6	460797	460802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007513	TA	3	6	460846	460851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007513	CT	3	6	461961	461966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007513	TG	3	6	464015	464020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007513	GA	3	6	464231	464236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007513	AC	3	6	488539	488544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007513	CG	3	6	500681	500686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007513	CT	3	6	500710	500715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007513	GC	3	6	518641	518646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007513	GT	3	6	530343	530348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007513	GC	3	6	546657	546662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007513	CT	3	6	546699	546704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007513	GA	4	8	567238	567245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007513	GA	3	6	577926	577931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007513	GC	3	6	585233	585238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007513	GT	3	6	586630	586635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007513	AT	3	6	595527	595532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007513	GA	3	6	595762	595767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007513	CG	3	6	615968	615973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007513	AC	3	6	629562	629567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007513	TA	3	6	639128	639133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007513	GA	3	6	649254	649259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007513	AG	3	6	652269	652274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007513	CT	3	6	668189	668194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007513	GC	3	6	681098	681103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007513	TC	3	6	690374	690379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007513	GA	3	6	706900	706905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007513	AG	3	6	707739	707744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007513	AT	3	6	707911	707916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007513	AT	3	6	719301	719306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007513	GT	3	6	720657	720662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007513	CG	3	6	720821	720826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007513	TG	3	6	728281	728286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007513	CA	3	6	728299	728304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007513	GC	3	6	730174	730179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007513	TC	4	8	734238	734245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007513	TG	3	6	774009	774014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007513	AG	3	6	789513	789518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007513	GT	3	6	800713	800718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007513	GT	3	6	801084	801089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007513	TG	3	6	821772	821777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007513	CA	3	6	845012	845017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007513	TC	3	6	861517	861522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007513	GA	4	8	872365	872372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007513	GC	3	6	885130	885135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007513	CT	3	6	929030	929035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007513	TC	3	6	935148	935153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007513	AG	3	6	935494	935499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007513	TC	3	6	936894	936899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007513	GA	3	6	945043	945048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007513	AG	3	6	948911	948916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007513	GC	3	6	955868	955873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007513	CT	4	8	957105	957112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007513	TC	3	6	957155	957160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007513	AT	3	6	958727	958732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007513	GC	3	6	959177	959182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007513	GA	3	6	960017	960022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007513	TC	3	6	960585	960590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007513	TA	4	8	960820	960827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007513	CT	3	6	961868	961873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007513	TG	3	6	961940	961945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007513	TG	3	6	964562	964567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007513	GA	3	6	966337	966342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007513	CA	3	6	969649	969654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007513	TA	3	6	974772	974777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007513	GT	3	6	974865	974870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007513	TG	3	6	977126	977131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007513	AC	3	6	977606	977611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007513	TA	4	8	978315	978322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007513	AT	4	8	978424	978431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007513	TC	4	8	978458	978465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007513	TG	3	6	980611	980616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007513	GT	3	6	980620	980625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007513	AT	3	6	982167	982172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007513	GT	3	6	991905	991910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007513	GT	3	6	992346	992351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007513	GT	3	6	992697	992702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007513	GA	3	6	994632	994637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007513	GA	3	6	994879	994884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007513	TC	3	6	996473	996478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007513	TC	3	6	996490	996495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007513	TG	3	6	998744	998749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007513	AT	3	6	1001639	1001644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007513	TA	3	6	1001666	1001671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.