MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium luteolum DSM 273 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007512	TCCGCA	2	12	27869	27880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007512	CAAACG	2	12	27922	27933	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007512	CACAAC	2	12	29940	29951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007512	GCCGCA	2	12	36591	36602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007512	CATCGT	2	12	36992	37003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007512	GTGGTT	2	12	65546	65557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007512	CCGTTC	2	12	66655	66666	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007512	AAGCGA	2	12	110359	110370	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007512	GGTGAA	2	12	110939	110950	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007512	TGCAGC	2	12	116228	116239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007512	AAGCGA	2	12	119332	119343	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007512	GGTGAA	2	12	119912	119923	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007512	CGGGTG	2	12	122529	122540	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007512	TATGAT	2	12	148853	148864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007512	TTGGTG	2	12	189958	189969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007512	CTGCCG	2	12	231472	231483	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007512	ACATTA	2	12	241762	241773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007512	ATTTTT	2	12	262005	262016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007512	GGGTCC	2	12	276900	276911	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007512	GCTCGA	2	12	376174	376185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007512	ATATTA	2	12	380600	380611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007512	CCCCTT	2	12	542784	542795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007512	GCCGCA	2	12	608820	608831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007512	GGTGAT	2	12	609094	609105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007512	GCTGAA	2	12	652817	652828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007512	CTGTTG	2	12	663660	663671	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007512	TTTCGG	2	12	697835	697846	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007512	TCAGGT	2	12	701303	701314	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_007512	GTATAT	2	12	717519	717530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007512	CTAAAT	2	12	722050	722061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007512	CATCAC	2	12	749167	749178	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007512	TTGATA	2	12	780847	780858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007512	GTTTGT	2	12	832107	832118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007512	TATTGC	2	12	871424	871435	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007512	GCTGTG	2	12	947644	947655	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007512	GGGGTT	2	12	948546	948557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007512	TTTTGC	2	12	950545	950556	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007512	AAGATC	2	12	950761	950772	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007512	ACGGAA	2	12	965716	965727	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007512	CAATTC	2	12	990354	990365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007512	TCCCGC	2	12	1012458	1012469	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007512	CATCTT	2	12	1023978	1023989	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007512	GCCGGC	2	12	1058064	1058075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007512	TTCCTT	2	12	1116412	1116423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007512	ATGCAG	2	12	1117216	1117227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007512	GGAGCG	2	12	1178557	1178568	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007512	ATTGCA	2	12	1225697	1225708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007512	CATTTT	2	12	1244701	1244712	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007512	CACAGC	2	12	1298389	1298400	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007512	GAACAG	2	12	1333595	1333606	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007512	AAAGTA	2	12	1392539	1392550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007512	TGCCTG	2	12	1430877	1430888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007512	TATGTT	2	12	1465053	1465064	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007512	TTTGTT	2	12	1525335	1525346	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007512	CATGAC	2	12	1542251	1542262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007512	CCCGCT	2	12	1647569	1647580	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007512	CATACG	2	12	1669441	1669452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007512	ATCATT	2	12	1680268	1680279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007512	ATCCCG	2	12	1713420	1713431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007512	GAAAAA	2	12	1928186	1928197	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007512	CGTTTG	2	12	2027593	2027604	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007512	CGCAAC	2	12	2047857	2047868	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007512	CTCCCG	2	12	2048970	2048981	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_007512	ATCAGC	2	12	2070437	2070448	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007512	GGGAGT	2	12	2087424	2087435	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007512	TCCCCC	2	12	2087713	2087724	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_007512	GCCGCA	2	12	2102499	2102510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007512	TGCCGC	2	12	2146585	2146596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007512	ACAACC	2	12	2162415	2162426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007512	GCCCCT	2	12	2183879	2183890	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007512	CATTTT	2	12	2268164	2268175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007512	TTTATC	2	12	2322841	2322852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007512	TAAATT	2	12	2332649	2332660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007512	GTTTTT	2	12	2354647	2354658	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.