MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlorobium luteolum DSM 273 chromosome

Total Repeats: 1521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007512	ATTCA	2	10	1258	1267	40 %	40 %	0 %	20 %	78185893
2	NC_007512	ATGAA	2	10	3897	3906	60 %	20 %	20 %	0 %	78185896
3	NC_007512	GCGGA	2	10	4688	4697	20 %	0 %	60 %	20 %	78185897
4	NC_007512	GCCCT	2	10	8052	8061	0 %	20 %	20 %	60 %	78185898
5	NC_007512	TTCAA	2	10	10805	10814	40 %	40 %	0 %	20 %	78185900
6	NC_007512	GTTTC	2	10	10881	10890	0 %	60 %	20 %	20 %	78185900
7	NC_007512	GTTTT	2	10	13213	13222	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007512	GCTGA	2	10	16279	16288	20 %	20 %	40 %	20 %	78185904
9	NC_007512	ACGCT	2	10	17316	17325	20 %	20 %	20 %	40 %	78185904
10	NC_007512	ACTGA	2	10	17773	17782	40 %	20 %	20 %	20 %	78185904
11	NC_007512	GCATC	2	10	20097	20106	20 %	20 %	20 %	40 %	78185906
12	NC_007512	GGTTC	2	10	23351	23360	0 %	40 %	40 %	20 %	78185909
13	NC_007512	GCTCC	2	10	24289	24298	0 %	20 %	20 %	60 %	78185911
14	NC_007512	GGGGT	2	10	24769	24778	0 %	20 %	80 %	0 %	78185911
15	NC_007512	GTCGA	2	10	25907	25916	20 %	20 %	40 %	20 %	78185913
16	NC_007512	TCCTG	2	10	26082	26091	0 %	40 %	20 %	40 %	78185913
17	NC_007512	CGTTG	2	10	26617	26626	0 %	40 %	40 %	20 %	78185913
18	NC_007512	TCCGA	2	10	28154	28163	20 %	20 %	20 %	40 %	78185915
19	NC_007512	ATCGG	2	10	28442	28451	20 %	20 %	40 %	20 %	78185915
20	NC_007512	TACGG	2	10	30672	30681	20 %	20 %	40 %	20 %	78185916
21	NC_007512	GTTCG	2	10	32964	32973	0 %	40 %	40 %	20 %	78185918
22	NC_007512	GGCAC	2	10	34811	34820	20 %	0 %	40 %	40 %	78185919
23	NC_007512	CGATC	2	10	36220	36229	20 %	20 %	20 %	40 %	78185919
24	NC_007512	CTGCA	2	10	41384	41393	20 %	20 %	20 %	40 %	78185925
25	NC_007512	GCGGA	2	10	41651	41660	20 %	0 %	60 %	20 %	78185926
26	NC_007512	TGCGC	2	10	42118	42127	0 %	20 %	40 %	40 %	78185926
27	NC_007512	CGTCC	2	10	42812	42821	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_007512	AGGCC	2	10	43429	43438	20 %	0 %	40 %	40 %	78185927
29	NC_007512	CTCGG	2	10	44875	44884	0 %	20 %	40 %	40 %	78185928
30	NC_007512	TACCG	2	10	47301	47310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007512	GCCGG	2	10	50909	50918	0 %	0 %	60 %	40 %	78185937
32	NC_007512	GTGGA	2	10	51030	51039	20 %	20 %	60 %	0 %	78185937
33	NC_007512	GCCGA	2	10	51120	51129	20 %	0 %	40 %	40 %	78185937
34	NC_007512	GGCCT	2	10	52290	52299	0 %	20 %	40 %	40 %	78185938
35	NC_007512	CCATC	2	10	53661	53670	20 %	20 %	0 %	60 %	78185940
36	NC_007512	CCTGC	2	10	53875	53884	0 %	20 %	20 %	60 %	78185940
37	NC_007512	CGGCC	2	10	56175	56184	0 %	0 %	40 %	60 %	78185943
38	NC_007512	GGTGG	2	10	56802	56811	0 %	20 %	80 %	0 %	78185943
39	NC_007512	ACAGC	2	10	57454	57463	40 %	0 %	20 %	40 %	78185944
40	NC_007512	CTTCG	2	10	63343	63352	0 %	40 %	20 %	40 %	78185948
41	NC_007512	GGAGA	2	10	64254	64263	40 %	0 %	60 %	0 %	78185949
42	NC_007512	TTGCC	2	10	69121	69130	0 %	40 %	20 %	40 %	78185956
43	NC_007512	GGTCT	2	10	69330	69339	0 %	40 %	40 %	20 %	78185956
44	NC_007512	TCATG	2	10	70387	70396	20 %	40 %	20 %	20 %	78185956
45	NC_007512	CCTTT	2	10	70493	70502	0 %	60 %	0 %	40 %	78185957
46	NC_007512	GCCCC	2	10	70865	70874	0 %	0 %	20 %	80 %	78185957
47	NC_007512	CATGC	2	10	70882	70891	20 %	20 %	20 %	40 %	78185957
48	NC_007512	CCCCG	2	10	73948	73957	0 %	0 %	20 %	80 %	78185959
49	NC_007512	ACCCC	2	10	76760	76769	20 %	0 %	0 %	80 %	78185961
50	NC_007512	GCCTT	2	10	78429	78438	0 %	40 %	20 %	40 %	78185964
51	NC_007512	CTCCG	2	10	79257	79266	0 %	20 %	20 %	60 %	78185965
52	NC_007512	CAGTT	2	10	82929	82938	20 %	40 %	20 %	20 %	78185968
53	NC_007512	TGCGA	2	10	83791	83800	20 %	20 %	40 %	20 %	78185968
54	NC_007512	CATAT	2	10	85104	85113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007512	GAATT	2	10	86106	86115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007512	GCAGT	2	10	88553	88562	20 %	20 %	40 %	20 %	78185972
57	NC_007512	GAGCT	2	10	88781	88790	20 %	20 %	40 %	20 %	78185972
58	NC_007512	GTTTC	2	10	93650	93659	0 %	60 %	20 %	20 %	78185977
59	NC_007512	TGGTT	2	10	95148	95157	0 %	60 %	40 %	0 %	78185979
60	NC_007512	GCCCT	2	10	98694	98703	0 %	20 %	20 %	60 %	78185984
61	NC_007512	CGGAG	2	10	98867	98876	20 %	0 %	60 %	20 %	78185984
62	NC_007512	TCCGC	2	10	99952	99961	0 %	20 %	20 %	60 %	78185985
63	NC_007512	TGAAC	2	10	101127	101136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007512	CACCT	2	10	105012	105021	20 %	20 %	0 %	60 %	78185990
65	NC_007512	GAAAA	2	10	107527	107536	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007512	TCGTG	2	10	108743	108752	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007512	GAAAA	2	10	109893	109902	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007512	ACCGT	2	10	111338	111347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007512	GAGCG	2	10	113236	113245	20 %	0 %	60 %	20 %	78185992
70	NC_007512	CGTTC	2	10	113973	113982	0 %	40 %	20 %	40 %	78185992
71	NC_007512	GACGG	2	10	115697	115706	20 %	0 %	60 %	20 %	78185993
72	NC_007512	TGCGT	2	10	115978	115987	0 %	40 %	40 %	20 %	78185994
73	NC_007512	TGTGG	2	10	116342	116351	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007512	GAAAA	2	10	116502	116511	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007512	TCGTG	2	10	117716	117725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007512	GAAAA	2	10	118866	118875	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007512	ACCGT	2	10	120311	120320	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007512	TTCAT	2	10	122243	122252	20 %	60 %	0 %	20 %	78185995
79	NC_007512	CGGTC	2	10	122440	122449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_007512	AACAA	2	10	122753	122762	80 %	0 %	0 %	20 %	78185996
81	NC_007512	CCGGC	2	10	123375	123384	0 %	0 %	40 %	60 %	78185997
82	NC_007512	GGAGG	2	10	127637	127646	20 %	0 %	80 %	0 %	78186002
83	NC_007512	GCTGA	2	10	132296	132305	20 %	20 %	40 %	20 %	78186009
84	NC_007512	TGGTT	2	10	133615	133624	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007512	AGCAT	2	10	133853	133862	40 %	20 %	20 %	20 %	78186013
86	NC_007512	GGAAG	2	10	136882	136891	40 %	0 %	60 %	0 %	78186014
87	NC_007512	TGGTG	2	10	137261	137270	0 %	40 %	60 %	0 %	78186015
88	NC_007512	CGGAA	2	10	138232	138241	40 %	0 %	40 %	20 %	78186015
89	NC_007512	GGCAG	2	10	138915	138924	20 %	0 %	60 %	20 %	78186015
90	NC_007512	GCATT	2	10	139257	139266	20 %	40 %	20 %	20 %	78186016
91	NC_007512	ATCAC	2	10	143860	143869	40 %	20 %	0 %	40 %	78186021
92	NC_007512	TGGCC	2	10	144145	144154	0 %	20 %	40 %	40 %	78186021
93	NC_007512	TTGCC	2	10	147005	147014	0 %	40 %	20 %	40 %	78186024
94	NC_007512	GGGTG	2	10	150805	150814	0 %	20 %	80 %	0 %	78186028
95	NC_007512	GCGAA	2	10	154472	154481	40 %	0 %	40 %	20 %	78186033
96	NC_007512	GCGGT	2	10	155372	155381	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007512	TGCAA	2	10	155619	155628	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007512	CGATT	2	10	158123	158132	20 %	40 %	20 %	20 %	78186038
99	NC_007512	GGGCA	2	10	158397	158406	20 %	0 %	60 %	20 %	78186038
100	NC_007512	GGCCG	2	10	160079	160088	0 %	0 %	60 %	40 %	78186040
101	NC_007512	TGGCC	2	10	162673	162682	0 %	20 %	40 %	40 %	78186044
102	NC_007512	CGTGC	2	10	163859	163868	0 %	20 %	40 %	40 %	78186045
103	NC_007512	TGGTC	2	10	164800	164809	0 %	40 %	40 %	20 %	78186046
104	NC_007512	CTGCG	2	10	170829	170838	0 %	20 %	40 %	40 %	78186053
105	NC_007512	AAGGC	2	10	171631	171640	40 %	0 %	40 %	20 %	78186053
106	NC_007512	GGACG	2	10	171739	171748	20 %	0 %	60 %	20 %	78186054
107	NC_007512	CGTGC	2	10	172298	172307	0 %	20 %	40 %	40 %	78186055
108	NC_007512	GTTCC	2	10	173967	173976	0 %	40 %	20 %	40 %	78186058
109	NC_007512	CCGGC	2	10	175439	175448	0 %	0 %	40 %	60 %	78186059
110	NC_007512	AGGGG	2	10	177729	177738	20 %	0 %	80 %	0 %	78186061
111	NC_007512	TCTGC	2	10	177933	177942	0 %	40 %	20 %	40 %	78186062
112	NC_007512	GCTCC	2	10	179900	179909	0 %	20 %	20 %	60 %	78186063
113	NC_007512	GTCCG	2	10	181117	181126	0 %	20 %	40 %	40 %	78186063
114	NC_007512	TGCTC	2	10	182283	182292	0 %	40 %	20 %	40 %	78186064
115	NC_007512	GTTTT	2	10	183173	183182	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007512	CGGTG	2	10	187398	187407	0 %	20 %	60 %	20 %	78186068
117	NC_007512	ACGCA	2	10	189755	189764	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007512	GGACT	2	10	191255	191264	20 %	20 %	40 %	20 %	78186075
119	NC_007512	GTCTC	2	10	193476	193485	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007512	TTTTC	2	10	197932	197941	0 %	80 %	0 %	20 %	78186089
121	NC_007512	CTTTC	2	10	198337	198346	0 %	60 %	0 %	40 %	78186089
122	NC_007512	CCGGC	2	10	198530	198539	0 %	0 %	40 %	60 %	78186089
123	NC_007512	GGCGG	2	10	199494	199503	0 %	0 %	80 %	20 %	78186090
124	NC_007512	TTACA	2	10	199917	199926	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007512	GCCCT	2	10	203989	203998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_007512	AAGAA	2	10	204914	204923	80 %	0 %	20 %	0 %	78186098
127	NC_007512	ACTGC	2	10	206243	206252	20 %	20 %	20 %	40 %	78186099
128	NC_007512	ATCGG	2	10	206479	206488	20 %	20 %	40 %	20 %	78186099
129	NC_007512	GGTGC	2	10	216613	216622	0 %	20 %	60 %	20 %	78186108
130	NC_007512	CGCTT	2	10	217581	217590	0 %	40 %	20 %	40 %	78186109
131	NC_007512	GGCTG	2	10	219657	219666	0 %	20 %	60 %	20 %	78186111
132	NC_007512	CCCGA	2	10	220983	220992	20 %	0 %	20 %	60 %	78186111
133	NC_007512	GCGCT	2	10	221158	221167	0 %	20 %	40 %	40 %	78186111
134	NC_007512	CCTCT	2	10	223476	223485	0 %	40 %	0 %	60 %	78186114
135	NC_007512	CGGTT	2	10	223523	223532	0 %	40 %	40 %	20 %	78186114
136	NC_007512	GCAGT	2	10	225903	225912	20 %	20 %	40 %	20 %	78186116
137	NC_007512	ACTGC	2	10	225922	225931	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_007512	GCTGC	2	10	230506	230515	0 %	20 %	40 %	40 %	78186120
139	NC_007512	GGAGA	2	10	232226	232235	40 %	0 %	60 %	0 %	78186122
140	NC_007512	GTCCG	2	10	234926	234935	0 %	20 %	40 %	40 %	78186125
141	NC_007512	GTCCG	2	10	236999	237008	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_007512	GCCTT	2	10	237525	237534	0 %	40 %	20 %	40 %	78186127
143	NC_007512	CTTCT	2	10	239471	239480	0 %	60 %	0 %	40 %	78186130
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146	NC_007512	CGGAC	2	10	242095	242104	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_007512	CCTTT	2	10	242616	242625	0 %	60 %	0 %	40 %	78186133
148	NC_007512	CATCG	2	10	246765	246774	20 %	20 %	20 %	40 %	78186138
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157	NC_007512	AACGG	2	10	263785	263794	40 %	0 %	40 %	20 %	78186147
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161	NC_007512	GTCGA	2	10	271210	271219	20 %	20 %	40 %	20 %	78186153
162	NC_007512	GGAAA	2	10	275489	275498	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_007512	GCTTT	2	10	278520	278529	0 %	60 %	20 %	20 %	78186161
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167	NC_007512	ATGCC	2	10	288281	288290	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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169	NC_007512	CGCTG	2	10	290784	290793	0 %	20 %	40 %	40 %	78186173
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171	NC_007512	CGGGT	2	10	292493	292502	0 %	20 %	60 %	20 %	78186175
172	NC_007512	TCCAG	2	10	292678	292687	20 %	20 %	20 %	40 %	78186175
173	NC_007512	TTCAG	2	10	298504	298513	20 %	40 %	20 %	20 %	78186182
174	NC_007512	GCTAC	2	10	299795	299804	20 %	20 %	20 %	40 %	78186183
175	NC_007512	AGCCC	2	10	301319	301328	20 %	0 %	20 %	60 %	78186185
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178	NC_007512	TCCCT	2	10	306364	306373	0 %	40 %	0 %	60 %	78186188
179	NC_007512	GCGGT	2	10	306637	306646	0 %	20 %	60 %	20 %	78186189
180	NC_007512	GCGGA	2	10	308065	308074	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
181	NC_007512	AGGAA	2	10	308236	308245	60 %	0 %	40 %	0 %	78186191
182	NC_007512	CCATG	2	10	308884	308893	20 %	20 %	20 %	40 %	78186192
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184	NC_007512	AGGAT	2	10	311412	311421	40 %	20 %	40 %	0 %	78186193
185	NC_007512	CGATT	2	10	311422	311431	20 %	40 %	20 %	20 %	78186193
186	NC_007512	CAATG	2	10	312349	312358	40 %	20 %	20 %	20 %	78186193
187	NC_007512	TGAGC	2	10	312727	312736	20 %	20 %	40 %	20 %	78186193
188	NC_007512	CCTGC	2	10	314225	314234	0 %	20 %	20 %	60 %	78186195
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220	NC_007512	CTCGT	2	10	358993	359002	0 %	40 %	20 %	40 %	78186238
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249	NC_007512	GAAAT	2	10	412942	412951	60 %	20 %	20 %	0 %	78186262
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251	NC_007512	TCCGG	2	10	414903	414912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
252	NC_007512	TGCGC	2	10	416747	416756	0 %	20 %	40 %	40 %	78186263
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258	NC_007512	CAGCA	2	10	421489	421498	40 %	0 %	20 %	40 %	78186266
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264	NC_007512	ACGGC	2	10	424870	424879	20 %	0 %	40 %	40 %	78186267
265	NC_007512	ACGGC	2	10	425158	425167	20 %	0 %	40 %	40 %	78186267
266	NC_007512	ACGGT	2	10	429427	429436	20 %	20 %	40 %	20 %	78186267
267	NC_007512	CCACG	2	10	429449	429458	20 %	0 %	20 %	60 %	78186267
268	NC_007512	GTTCA	2	10	430379	430388	20 %	40 %	20 %	20 %	78186267
269	NC_007512	TGAAC	2	10	433583	433592	40 %	20 %	20 %	20 %	78186267
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271	NC_007512	GACGG	2	10	446564	446573	20 %	0 %	60 %	20 %	78186268
272	NC_007512	TGCGC	2	10	446950	446959	0 %	20 %	40 %	40 %	78186268
273	NC_007512	CCGAG	2	10	447901	447910	20 %	0 %	40 %	40 %	78186268
274	NC_007512	GACCG	2	10	448199	448208	20 %	0 %	40 %	40 %	78186268
275	NC_007512	GCTCC	2	10	450220	450229	0 %	20 %	20 %	60 %	78186269
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281	NC_007512	TTCCG	2	10	461598	461607	0 %	40 %	20 %	40 %	78186278
282	NC_007512	CGTGC	2	10	462748	462757	0 %	20 %	40 %	40 %	78186278
283	NC_007512	TGGTT	2	10	463291	463300	0 %	60 %	40 %	0 %	78186278
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285	NC_007512	TTGTT	2	10	466723	466732	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007512	TGCGC	2	10	471210	471219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_007512	TGACT	2	10	473954	473963	20 %	40 %	20 %	20 %	78186285
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292	NC_007512	CGCAG	2	10	479885	479894	20 %	0 %	40 %	40 %	78186291
293	NC_007512	CGAGG	2	10	482105	482114	20 %	0 %	60 %	20 %	78186294
294	NC_007512	ATTTA	2	10	483665	483674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_007512	GGTTC	2	10	485107	485116	0 %	40 %	40 %	20 %	78186298
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302	NC_007512	TCGGG	2	10	498571	498580	0 %	20 %	60 %	20 %	78186311
303	NC_007512	CGGGG	2	10	501102	501111	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
304	NC_007512	TTGAA	2	10	502590	502599	40 %	40 %	20 %	0 %	78186313
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320	NC_007512	TTTCC	2	10	521857	521866	0 %	60 %	0 %	40 %	78186332
321	NC_007512	ACGAG	2	10	523602	523611	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
322	NC_007512	AGGGC	2	10	525933	525942	20 %	0 %	60 %	20 %	78186335
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326	NC_007512	ATGCC	2	10	528610	528619	20 %	20 %	20 %	40 %	78186338
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364	NC_007512	GATTG	2	10	599118	599127	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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375	NC_007512	TCTGC	2	10	617758	617767	0 %	40 %	20 %	40 %	78186409
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377	NC_007512	TTCAG	2	10	619500	619509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
378	NC_007512	GTTGC	2	10	621813	621822	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
379	NC_007512	CGGCT	2	10	632223	632232	0 %	20 %	40 %	40 %	78186423
380	NC_007512	CAACA	2	10	633465	633474	60 %	0 %	0 %	40 %	78186423
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382	NC_007512	GAAGA	2	10	634191	634200	60 %	0 %	40 %	0 %	78186425
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384	NC_007512	ACGGC	2	10	637654	637663	20 %	0 %	40 %	40 %	78186429
385	NC_007512	CGGCG	2	10	638996	639005	0 %	0 %	60 %	40 %	78186430
386	NC_007512	CGCTC	2	10	639120	639129	0 %	20 %	20 %	60 %	78186430
387	NC_007512	TAGGA	2	10	640682	640691	40 %	20 %	40 %	0 %	78186432
388	NC_007512	CCATG	2	10	641786	641795	20 %	20 %	20 %	40 %	78186433
389	NC_007512	CCGTT	2	10	643357	643366	0 %	40 %	20 %	40 %	78186434
390	NC_007512	GAGAG	2	10	643843	643852	40 %	0 %	60 %	0 %	78186435
391	NC_007512	CCATG	2	10	645366	645375	20 %	20 %	20 %	40 %	78186436
392	NC_007512	GGGCT	2	10	645670	645679	0 %	20 %	60 %	20 %	78186436
393	NC_007512	CAGGC	2	10	646141	646150	20 %	0 %	40 %	40 %	78186436
394	NC_007512	GAAAA	2	10	646215	646224	80 %	0 %	20 %	0 %	78186436
395	NC_007512	TATTT	2	10	647431	647440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_007512	ACGGC	2	10	648677	648686	20 %	0 %	40 %	40 %	78186438
397	NC_007512	CGGTA	2	10	648956	648965	20 %	20 %	40 %	20 %	78186439
398	NC_007512	CCGCA	2	10	650269	650278	20 %	0 %	20 %	60 %	78186440
399	NC_007512	CCGAT	2	10	653413	653422	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
400	NC_007512	TGCAG	2	10	654094	654103	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
401	NC_007512	GCAAA	2	10	656892	656901	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
402	NC_007512	ATGGG	2	10	657423	657432	20 %	20 %	60 %	0 %	78186444
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404	NC_007512	GCTGA	2	10	659500	659509	20 %	20 %	40 %	20 %	78186445
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