MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium luteolum DSM 273 chromosome

Total Repeats: 753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007512	AAGC	2	8	3071	3078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007512	GTTA	2	8	8924	8931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007512	ATTC	2	8	11736	11743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007512	GCCA	2	8	13107	13114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007512	GCTT	2	8	15261	15268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007512	GTCC	2	8	16055	16062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007512	GCGG	2	8	27837	27844	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007512	GCTG	2	8	36878	36885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007512	GGTC	2	8	37433	37440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_007512	CCCT	2	8	38046	38053	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_007512	CTCC	2	8	40832	40839	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_007512	CAAA	2	8	41075	41082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007512	AACA	2	8	66641	66648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007512	TTGT	2	8	72739	72746	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007512	CGGG	2	8	72842	72849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007512	AGGC	2	8	77330	77337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007512	TTTC	2	8	77366	77373	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007512	GGTC	2	8	77499	77506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007512	GGCC	2	8	93726	93733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007512	CGGA	2	8	93770	93777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007512	TAAA	2	8	94353	94360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007512	TGCA	2	8	96143	96150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007512	TTCC	2	8	96161	96168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007512	GGAA	2	8	107356	107363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007512	GAAG	2	8	107417	107424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007512	CATG	2	8	108304	108311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007512	AGGG	2	8	108692	108699	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007512	AGGA	2	8	108850	108857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007512	TGGC	2	8	109206	109213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007512	AGGG	2	8	116334	116341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007512	GAAG	2	8	116392	116399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007512	GGTA	2	8	116916	116923	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007512	CATG	2	8	117277	117284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007512	AGGG	2	8	117665	117672	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007512	AGGA	2	8	117823	117830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007512	TGGC	2	8	118179	118186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007512	CCCT	2	8	123106	123113	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_007512	ATTG	2	8	123665	123672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007512	CATG	2	8	123752	123759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007512	TGGT	2	8	123773	123780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007512	GAGG	2	8	125943	125950	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007512	GATT	2	8	129440	129447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007512	AAAC	2	8	129460	129467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007512	GCAA	2	8	129966	129973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007512	TTCG	2	8	130804	130811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007512	CAGT	2	8	130859	130866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007512	TTCT	2	8	143780	143787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007512	CTGT	2	8	145578	145585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007512	TGGG	2	8	146594	146601	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007512	CAAG	2	8	146629	146636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007512	ATTG	2	8	149375	149382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007512	ACTG	2	8	149421	149428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007512	GTCT	2	8	149548	149555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007512	TTGT	2	8	155567	155574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007512	ATTC	2	8	156118	156125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007512	ATGG	2	8	161535	161542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007512	GGCA	2	8	161996	162003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007512	AGGT	2	8	172018	172025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007512	ATCG	2	8	189866	189873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007512	GGCA	2	8	190004	190011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007512	TGCG	2	8	190066	190073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007512	AGGC	2	8	190247	190254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007512	AGGT	2	8	190335	190342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007512	TTAC	2	8	192692	192699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007512	CAAT	2	8	200110	200117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007512	GTCA	2	8	225965	225972	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007512	ATTT	2	8	228430	228437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007512	AATT	2	8	231531	231538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007512	GCCG	2	8	239429	239436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007512	TTTC	2	8	244653	244660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007512	GTTC	2	8	249548	249555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007512	GATG	2	8	253955	253962	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007512	TGCC	2	8	253984	253991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007512	AGCC	2	8	257926	257933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007512	TTTC	2	8	261943	261950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007512	CCCT	2	8	263344	263351	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_007512	GGTT	2	8	267456	267463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007512	TAAT	2	8	268993	269000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007512	CATC	2	8	269101	269108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007512	AGTA	2	8	270945	270952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007512	TTTC	2	8	271248	271255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_007512	TCAT	2	8	271353	271360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007512	TTTC	2	8	274432	274439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007512	GCGG	3	12	276846	276857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007512	GTTC	2	8	286723	286730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007512	GTAT	2	8	291716	291723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007512	AAAT	2	8	293981	293988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007512	GGAC	2	8	294508	294515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007512	CCCT	2	8	298121	298128	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_007512	AAGT	2	8	307408	307415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007512	TCCC	2	8	309956	309963	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_007512	GCCT	2	8	326183	326190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007512	CCCT	2	8	332772	332779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_007512	CAGG	2	8	345985	345992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007512	GTAG	2	8	346038	346045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007512	TAAG	2	8	350136	350143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007512	CCAT	2	8	356413	356420	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007512	GTCG	2	8	358838	358845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007512	TTTG	2	8	358851	358858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007512	CCAA	2	8	358904	358911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007512	GAAG	2	8	363572	363579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007512	AGTA	2	8	364959	364966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007512	ATCG	2	8	365982	365989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007512	GGGA	2	8	374564	374571	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007512	TCCT	2	8	374603	374610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007512	CATT	2	8	376149	376156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007512	GGGC	2	8	378566	378573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007512	TGCC	2	8	414928	414935	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007512	AGGC	2	8	444576	444583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007512	GTCG	2	8	444586	444593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007512	GCCG	2	8	458265	458272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007512	TTAA	2	8	464432	464439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007512	TTGT	2	8	469053	469060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007512	AGAA	2	8	471286	471293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007512	CGCC	2	8	471428	471435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_007512	ATTT	2	8	483722	483729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007512	TCAA	2	8	490376	490383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007512	TCCG	2	8	491767	491774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007512	CCAT	2	8	494357	494364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007512	CCGG	2	8	497113	497120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007512	GCGG	2	8	503376	503383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007512	TTTC	2	8	503619	503626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007512	GGCA	2	8	520145	520152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007512	GGAT	2	8	533444	533451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007512	CCGG	2	8	533511	533518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007512	AACC	2	8	538353	538360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007512	ATTT	2	8	548620	548627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007512	GCAG	2	8	551063	551070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007512	GTTC	2	8	556109	556116	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007512	CTTC	2	8	560736	560743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007512	CAGA	2	8	566320	566327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007512	GCAT	2	8	566371	566378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007512	GGTT	2	8	568398	568405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007512	ATAC	2	8	570584	570591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007512	GCCG	2	8	571241	571248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007512	TACA	2	8	571267	571274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007512	ATTT	2	8	572625	572632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007512	ATGG	2	8	581691	581698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007512	TTGA	2	8	581699	581706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007512	GCCG	2	8	586166	586173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007512	TAAT	2	8	586283	586290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007512	CATC	2	8	593423	593430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007512	TATT	2	8	598208	598215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007512	CTGA	2	8	599097	599104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007512	TGAC	2	8	599629	599636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007512	TACG	2	8	601737	601744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007512	TGCC	2	8	602014	602021	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007512	CGCC	2	8	608743	608750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_007512	TTCA	2	8	608836	608843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007512	GCCG	2	8	608953	608960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007512	GTTC	2	8	610221	610228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_007512	GCCG	2	8	612302	612309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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476	NC_007512	GCCG	2	8	1450296	1450303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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487	NC_007512	CGAG	2	8	1473251	1473258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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490	NC_007512	ATGT	2	8	1476639	1476646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_007512	GACT	2	8	1476676	1476683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_007512	CTGC	2	8	1479105	1479112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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496	NC_007512	AAAT	2	8	1491503	1491510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_007512	CATT	2	8	1491916	1491923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_007512	CGGC	2	8	1496500	1496507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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