MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlorobium luteolum DSM 273 chromosome

Total Repeats: 35178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007512	CAA	2	6	101	106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007512	GCT	2	6	161	166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007512	GAA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007512	AAG	3	9	208	216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007512	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007512	CCT	2	6	306	311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185893
7	NC_007512	ACC	2	6	728	733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185893
8	NC_007512	ATG	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185893
9	NC_007512	CAT	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185893
10	NC_007512	GGT	2	6	883	888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185893
11	NC_007512	TCC	2	6	912	917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185893
12	NC_007512	GCC	2	6	1007	1012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185893
13	NC_007512	TCA	3	9	1074	1082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185893
14	NC_007512	GAT	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185893
15	NC_007512	AGG	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185893
16	NC_007512	GTG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185893
17	NC_007512	GCT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185893
18	NC_007512	TGA	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185893
19	NC_007512	GAA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185893
20	NC_007512	AAC	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185893
21	NC_007512	CTG	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007512	ATG	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007512	CGA	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007512	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185894
25	NC_007512	GCT	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
26	NC_007512	TGC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
27	NC_007512	AGC	2	6	2033	2038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
28	NC_007512	CTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185894
29	NC_007512	CTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185894
30	NC_007512	TGC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
31	NC_007512	TTC	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185894
32	NC_007512	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185894
33	NC_007512	TGA	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185894
34	NC_007512	CTG	2	6	2368	2373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
35	NC_007512	CAG	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
36	NC_007512	CGA	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
37	NC_007512	ACG	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
38	NC_007512	GTT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185895
39	NC_007512	CTC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185895
40	NC_007512	GCT	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007512	CCT	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007512	AGC	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007512	CAT	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185896
44	NC_007512	GAA	2	6	3341	3346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185896
45	NC_007512	GAT	2	6	3395	3400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185896
46	NC_007512	TCT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185896
47	NC_007512	CGT	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185896
48	NC_007512	TCA	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185896
49	NC_007512	CTC	3	9	3842	3850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185896
50	NC_007512	GAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185896
51	NC_007512	ACA	2	6	4011	4016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185896
52	NC_007512	CTA	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185896
53	NC_007512	CTT	2	6	4178	4183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185896
54	NC_007512	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185896
55	NC_007512	GGA	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185896
56	NC_007512	TTC	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007512	TAC	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007512	CCT	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007512	AGG	2	6	4560	4565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185897
60	NC_007512	GTA	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
61	NC_007512	ATG	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
62	NC_007512	CTT	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
63	NC_007512	CAC	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185897
64	NC_007512	GAA	2	6	4943	4948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
65	NC_007512	TTC	2	6	5089	5094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
66	NC_007512	GGA	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185897
67	NC_007512	GAT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
68	NC_007512	TCA	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185897
69	NC_007512	GCC	2	6	5254	5259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185897
70	NC_007512	TGA	2	6	5289	5294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
71	NC_007512	TTC	2	6	5359	5364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
72	NC_007512	TGC	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
73	NC_007512	TGA	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
74	NC_007512	GCC	2	6	5633	5638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185897
75	NC_007512	GCT	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
76	NC_007512	AAG	2	6	5707	5712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
77	NC_007512	GTC	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
78	NC_007512	TGC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
79	NC_007512	TGT	2	6	6090	6095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185897
80	NC_007512	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
81	NC_007512	GAA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
82	NC_007512	ATG	3	9	6218	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
83	NC_007512	CTT	2	6	6253	6258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
84	NC_007512	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
85	NC_007512	GAA	2	6	6334	6339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
86	NC_007512	CAT	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185897
87	NC_007512	TCC	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185897
88	NC_007512	TAT	2	6	6438	6443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185897
89	NC_007512	CTT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
90	NC_007512	GAT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
91	NC_007512	AAG	2	6	6592	6597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
92	NC_007512	CTC	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185897
93	NC_007512	TCT	3	9	6793	6801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007512	TGC	2	6	6847	6852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007512	CCT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185898
96	NC_007512	TCA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185898
97	NC_007512	TCT	2	6	7243	7248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185898
98	NC_007512	TCA	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185898
99	NC_007512	GCG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185898
100	NC_007512	GGA	2	6	7716	7721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185898
101	NC_007512	CCT	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185898
102	NC_007512	CTC	2	6	8114	8119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185898
103	NC_007512	AGT	2	6	8128	8133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185898
104	NC_007512	CGG	2	6	8156	8161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185898
105	NC_007512	GAG	2	6	8345	8350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185898
106	NC_007512	CCT	3	9	8422	8430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185898
107	NC_007512	CCG	2	6	8610	8615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185898
108	NC_007512	GTT	2	6	8658	8663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185898
109	NC_007512	CAT	2	6	8743	8748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185898
110	NC_007512	AAT	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007512	TTC	2	6	8801	8806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007512	ATT	2	6	8842	8847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007512	CGC	2	6	8859	8864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007512	GCC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007512	GCG	2	6	8913	8918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007512	TCA	2	6	8989	8994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
117	NC_007512	CAG	2	6	9115	9120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185899
118	NC_007512	ATC	2	6	9475	9480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
119	NC_007512	GAT	2	6	9516	9521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185899
120	NC_007512	CAC	2	6	9522	9527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185899
121	NC_007512	ATC	3	9	9544	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
122	NC_007512	CCT	2	6	9591	9596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185899
123	NC_007512	TCA	2	6	9647	9652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
124	NC_007512	TGG	2	6	9759	9764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185899
125	NC_007512	TGC	2	6	9819	9824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185899
126	NC_007512	TCT	2	6	9834	9839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185899
127	NC_007512	ACG	2	6	9887	9892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185899
128	NC_007512	AAG	2	6	9922	9927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185899
129	NC_007512	CGG	2	6	9942	9947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185899
130	NC_007512	TCA	2	6	9950	9955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
131	NC_007512	TCA	2	6	10145	10150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
132	NC_007512	GAT	2	6	10293	10298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185899
133	NC_007512	CGG	2	6	10310	10315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185899
134	NC_007512	ATC	2	6	10330	10335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
135	NC_007512	TAC	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
136	NC_007512	GCA	2	6	10357	10362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185899
137	NC_007512	GAG	2	6	10510	10515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185899
138	NC_007512	GCC	2	6	10540	10545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185899
139	NC_007512	TCC	2	6	10573	10578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185899
140	NC_007512	CAC	2	6	10596	10601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185899
141	NC_007512	CGC	2	6	10605	10610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185899
142	NC_007512	TGA	2	6	10667	10672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185899
143	NC_007512	CGG	2	6	10679	10684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185899
144	NC_007512	TCG	2	6	10703	10708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185899
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147	NC_007512	GCG	2	6	11070	11075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185900
148	NC_007512	CTG	2	6	11196	11201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185900
149	NC_007512	GCC	2	6	11273	11278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185900
150	NC_007512	CTT	2	6	11330	11335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185900
151	NC_007512	GGC	2	6	11336	11341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185900
152	NC_007512	CAT	2	6	11377	11382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185900
153	NC_007512	TGC	2	6	11383	11388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185900
154	NC_007512	GTG	2	6	11429	11434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185900
155	NC_007512	CAG	2	6	11518	11523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185900
156	NC_007512	CAT	2	6	11527	11532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185900
157	NC_007512	CAC	2	6	11542	11547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185900
158	NC_007512	TCG	2	6	11642	11647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185900
159	NC_007512	TCG	2	6	11652	11657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185900
160	NC_007512	GCA	3	9	11715	11723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185900
161	NC_007512	TCA	2	6	11756	11761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_007512	TCA	2	6	11764	11769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_007512	GCC	2	6	11838	11843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185901
164	NC_007512	CTG	2	6	11852	11857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185901
165	NC_007512	GTG	2	6	11860	11865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185901
166	NC_007512	GCA	2	6	11981	11986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185901
167	NC_007512	ATC	2	6	12001	12006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185901
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172	NC_007512	GCC	2	6	12529	12534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185901
173	NC_007512	CAT	2	6	12591	12596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185901
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209	NC_007512	GGT	2	6	15062	15067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185902
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211	NC_007512	TAT	2	6	15255	15260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_007512	CCG	2	6	16064	16069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
226	NC_007512	CGG	2	6	16110	16115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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240	NC_007512	AGC	2	6	16616	16621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185904
241	NC_007512	TCA	2	6	16709	16714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185904
242	NC_007512	TGC	2	6	16874	16879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185904
243	NC_007512	ATC	2	6	16897	16902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185904
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251	NC_007512	CAT	3	9	17265	17273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185904
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254	NC_007512	GGT	2	6	17382	17387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185904
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257	NC_007512	AAG	2	6	17464	17469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185904
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259	NC_007512	CAT	2	6	17544	17549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185904
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261	NC_007512	GCA	2	6	17691	17696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185904
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263	NC_007512	CGA	2	6	17841	17846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185904
264	NC_007512	CAG	2	6	17871	17876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185904
265	NC_007512	CCG	2	6	17885	17890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185904
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267	NC_007512	ACG	2	6	17934	17939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185905
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386	NC_007512	CGA	2	6	25587	25592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185913
387	NC_007512	CGA	2	6	25707	25712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185913
388	NC_007512	TCG	2	6	25772	25777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185913
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484	NC_007512	ATA	2	6	31972	31977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_007512	GCT	2	6	33099	33104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185918
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500	NC_007512	GCC	2	6	33335	33340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185918

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