MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. 383 chromosome 2

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007511	ACGCGA	2	12	33189	33200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007511	TATCGA	2	12	45955	45966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007511	CCGATC	2	12	65942	65953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007511	CCGACA	2	12	95819	95830	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007511	CGGGCG	2	12	99435	99446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007511	TCGGCT	2	12	120805	120816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007511	TCATCG	2	12	136262	136273	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007511	CGAGCG	2	12	173957	173968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007511	TCGCGC	2	12	174475	174486	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007511	TGTCGT	2	12	210448	210459	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007511	CCGGCA	2	12	224038	224049	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007511	AACCCG	2	12	252101	252112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007511	TTCACG	2	12	260115	260126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007511	TGCCGC	2	12	292166	292177	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007511	CGCCTG	2	12	296205	296216	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007511	GCTAGA	2	12	312382	312393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007511	CTGATG	2	12	355659	355670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007511	GCGCCG	2	12	355747	355758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007511	GTAGAA	2	12	416352	416363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007511	CGAGGC	2	12	421619	421630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007511	GTGAAC	2	12	424834	424845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007511	CTCGCG	2	12	433396	433407	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007511	TTGATG	2	12	474203	474214	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007511	CGGGCG	2	12	499023	499034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007511	TCCTGA	2	12	524442	524453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007511	ATGTCG	2	12	599417	599428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007511	TTTTTG	2	12	662628	662639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007511	TTTCCG	2	12	694117	694128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007511	TCGGAT	2	12	707016	707027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007511	GCCGAT	3	18	843944	843961	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007511	CCAGCG	2	12	847115	847126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007511	GCCTCG	2	12	850918	850929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007511	ATTGCA	2	12	851070	851081	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007511	AGGGGG	2	12	871015	871026	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007511	GTTCCC	2	12	874985	874996	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007511	GGAGCG	2	12	899685	899696	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007511	CGTTGC	2	12	900148	900159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007511	CGGCCG	2	12	902561	902572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007511	GCAATC	2	12	904708	904719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007511	GTGGCG	2	12	922753	922764	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007511	GGCGCG	2	12	932106	932117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007511	CGTCTG	2	12	936104	936115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007511	GCGCAT	2	12	950743	950754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007511	GATGCT	2	12	960820	960831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007511	TATGCA	2	12	991294	991305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007511	TCGTGC	2	12	1073706	1073717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007511	CCGGCG	2	12	1119797	1119808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007511	TTGCAA	2	12	1135031	1135042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007511	ATTGCA	2	12	1136759	1136770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007511	AACGAA	3	18	1139314	1139331	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007511	CGGCCC	3	18	1150382	1150399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007511	GGCAGG	2	12	1153097	1153108	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007511	CAGACG	2	12	1157863	1157874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007511	CGAATC	2	12	1160821	1160832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007511	CCTGAT	2	12	1161225	1161236	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007511	CGGTAT	2	12	1185497	1185508	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007511	TCGTGC	2	12	1219511	1219522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007511	GAAGCC	4	24	1271920	1271943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007511	AAAGCC	11	66	1271944	1272009	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007511	CGGGGC	2	12	1288728	1288739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007511	GGCGTG	2	12	1304282	1304293	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007511	GAAGGG	2	12	1350589	1350600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007511	CGGGTT	2	12	1352828	1352839	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007511	CCGGGC	2	12	1354571	1354582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007511	GCCGGC	2	12	1378686	1378697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007511	ATGCGG	3	18	1385824	1385841	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007511	CTGCCG	2	12	1394094	1394105	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007511	GCATCG	2	12	1406236	1406247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007511	TTCCAC	2	12	1417854	1417865	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007511	TGCACG	2	12	1480910	1480921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007511	CGGGCG	2	12	1499920	1499931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007511	ATCGGT	2	12	1563614	1563625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007511	GGCGCG	2	12	1565900	1565911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007511	CGCCCG	2	12	1602475	1602486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007511	GGTTGC	2	12	1660950	1660961	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007511	GGCGTC	2	12	1662488	1662499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007511	GGTGCC	2	12	1663401	1663412	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007511	ACGAGT	2	12	1667726	1667737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007511	GTGCGC	2	12	1715067	1715078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007511	TCCGCC	2	12	1741564	1741575	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007511	ATTCCG	2	12	1741903	1741914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007511	GGGATG	2	12	1746321	1746332	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007511	ATTGAC	2	12	1774584	1774595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007511	GCGGTC	2	12	1872767	1872778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007511	TTGCGC	2	12	1874579	1874590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007511	GGCCGC	2	12	1876870	1876881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007511	CGTTTC	2	12	1877726	1877737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007511	GCGCCA	2	12	1877792	1877803	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007511	GCCACC	2	12	1881406	1881417	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007511	CGGAGC	2	12	1926971	1926982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007511	GCCCCT	2	12	1940118	1940129	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007511	CCGCGC	2	12	2005991	2006002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007511	CCCCTT	2	12	2011111	2011122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007511	CGTGCG	2	12	2044355	2044366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007511	GCACCG	2	12	2059975	2059986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007511	TTCTGC	2	12	2084420	2084431	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007511	CGACAC	2	12	2084916	2084927	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007511	AATTTC	2	12	2106577	2106588	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007511	GGAGAC	2	12	2106630	2106641	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007511	CGCGGG	2	12	2108154	2108165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007511	GTTTCG	2	12	2137687	2137698	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007511	ATTCGA	2	12	2141862	2141873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007511	TCGGCG	2	12	2162948	2162959	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007511	CGAATA	2	12	2202681	2202692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007511	CGTTTG	2	12	2217281	2217292	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007511	ATATTC	2	12	2217776	2217787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007511	ACATTC	2	12	2255402	2255413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007511	TGTCGC	2	12	2266446	2266457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007511	GCGCCG	2	12	2269315	2269326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007511	AACCGG	2	12	2369298	2369309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007511	GAACCA	2	12	2371094	2371105	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007511	TTCATT	2	12	2393969	2393980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007511	GCCGGC	2	12	2402016	2402027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007511	CCGCAA	2	12	2408916	2408927	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007511	AAACAG	2	12	2409038	2409049	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007511	CGGACG	7	42	2414278	2414319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007511	CGCAAA	2	12	2414793	2414804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007511	TCGATT	2	12	2424608	2424619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007511	AATAAA	2	12	2441861	2441872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007511	CGCCAG	2	12	2446984	2446995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007511	GAACAA	2	12	2466015	2466026	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007511	CAACGA	2	12	2496110	2496121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007511	CGGGCC	2	12	2531467	2531478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007511	GCACCG	2	12	2533638	2533649	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007511	GCGCAA	2	12	2539204	2539215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007511	CAATTT	2	12	2586738	2586749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007511	CGGATC	2	12	2626342	2626353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007511	GCGTCG	2	12	2704282	2704293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007511	CCCGCG	2	12	2727345	2727356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007511	CGATCA	2	12	2763663	2763674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007511	GGAGCG	2	12	2777336	2777347	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_007511	CCGGCA	2	12	2788321	2788332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007511	GCCGTT	7	42	2801690	2801731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007511	GCCCTT	14	84	2801732	2801815	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007511	GCCTTC	5	30	2801816	2801845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007511	GCCCTC	4	24	2801846	2801869	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007511	CCTCGC	2	12	2801878	2801889	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007511	GCGCGG	2	12	2805288	2805299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007511	TCACCT	2	12	2844283	2844294	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007511	ATATCG	2	12	2883938	2883949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_007511	CGCATC	2	12	2917786	2917797	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007511	GCCGGT	2	12	2925104	2925115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007511	ACGGTC	2	12	2948973	2948984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007511	CGACAC	2	12	2965147	2965158	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007511	GTGCGC	2	12	2971083	2971094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007511	CAAACG	2	12	3011781	3011792	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007511	GACGCT	2	12	3018422	3018433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_007511	TGAGGG	2	12	3053834	3053845	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007511	CGCAGG	2	12	3057396	3057407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007511	TCGTCA	2	12	3061821	3061832	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_007511	GAAGCG	2	12	3098652	3098663	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_007511	TACCGC	2	12	3144507	3144518	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
153	NC_007511	GAAGCG	2	12	3148678	3148689	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_007511	CACCGG	2	12	3192000	3192011	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007511	CCCGCG	2	12	3202393	3202404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_007511	CGTTCC	2	12	3222147	3222158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_007511	GCGCAG	2	12	3228030	3228041	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007511	CTCGGT	2	12	3257273	3257284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007511	GTTCCG	2	12	3261346	3261357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_007511	GTTTCC	2	12	3300722	3300733	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_007511	ATCGGA	2	12	3310155	3310166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_007511	CATCGT	3	18	3321860	3321877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_007511	CGCCCG	2	12	3337394	3337405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_007511	CGGCTA	2	12	3342105	3342116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_007511	CATCGC	2	12	3358689	3358700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
166	NC_007511	GGCTCG	2	12	3362912	3362923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_007511	CGCTCA	2	12	3364105	3364116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
168	NC_007511	AGCCGG	2	12	3391411	3391422	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_007511	CTGTTC	2	12	3442555	3442566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_007511	CGCCGG	2	12	3445143	3445154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_007511	GGCGCA	2	12	3464010	3464021	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_007511	CGTTGC	2	12	3513960	3513971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_007511	TGCATG	4	24	3539250	3539273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_007511	GATGCC	2	12	3580295	3580306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.