MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. 383 chromosome 1

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007510	GCAGGC	2	12	20910	20921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007510	CAGTCT	2	12	28025	28036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007510	CGGTAC	2	12	32998	33009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007510	CGGGCT	2	12	33671	33682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007510	TTTTTC	2	12	35160	35171	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007510	CTGTGT	2	12	40322	40333	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007510	GAATCT	2	12	82586	82597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007510	CGTTTT	2	12	88472	88483	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007510	CCATGC	2	12	128303	128314	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007510	CTTTTT	2	12	136243	136254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007510	TTTGGC	2	12	161948	161959	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007510	GCTCCA	2	12	161970	161981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007510	GGCCCC	2	12	162118	162129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007510	GGCTCA	9	54	162130	162183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007510	CGGCGA	2	12	225735	225746	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007510	TGCCGA	2	12	225760	225771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007510	TTTTGT	2	12	252873	252884	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007510	GCGGGC	2	12	276032	276043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007510	GGTGAC	2	12	374545	374556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007510	AAGGGG	2	12	406831	406842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007510	GCCAGG	2	12	496597	496608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007510	GCGCTG	2	12	538820	538831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007510	CGGCCC	2	12	569424	569435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007510	GCAGGA	2	12	593975	593986	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007510	TCTGTC	2	12	622328	622339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007510	CGGCGA	2	12	659783	659794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007510	GATTCG	2	12	660526	660537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007510	GGCCGG	2	12	690598	690609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007510	GTAAAA	2	12	727748	727759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007510	CGCCAG	2	12	741350	741361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007510	TTTTTC	2	12	780967	780978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007510	CGGCCG	2	12	820756	820767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007510	ACACCG	5	30	821258	821287	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007510	CGATGC	2	12	848370	848381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007510	GGCCGG	2	12	872731	872742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007510	AATGAA	2	12	876999	877010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007510	CTTGCG	2	12	918692	918703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007510	AGTTTT	2	12	988255	988266	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007510	CGCAAT	2	12	1020128	1020139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007510	CGGATG	2	12	1063904	1063915	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007510	ACGGCA	2	12	1070533	1070544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007510	CGATTC	2	12	1082749	1082760	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007510	CGTCTT	2	12	1136677	1136688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007510	CTTGCG	2	12	1144742	1144753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007510	GCAGGC	2	12	1145752	1145763	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007510	TTGCGC	2	12	1161302	1161313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007510	TTTTGT	2	12	1171560	1171571	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007510	GCCGCA	2	12	1187529	1187540	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007510	TGCAGG	2	12	1192793	1192804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007510	GAACGC	2	12	1210776	1210787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007510	ACCCAA	2	12	1229422	1229433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007510	CGGAAA	2	12	1254308	1254319	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007510	GGCGAA	2	12	1256723	1256734	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007510	GCGTGC	2	12	1287384	1287395	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007510	CGCATC	2	12	1314718	1314729	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007510	CGGCCG	2	12	1314861	1314872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007510	GCGGGC	2	12	1368334	1368345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007510	GGCGCC	2	12	1379775	1379786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007510	TGGCAA	2	12	1421935	1421946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007510	TGTCGT	2	12	1436200	1436211	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007510	CTTGAC	2	12	1472793	1472804	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007510	CGTCAT	2	12	1499016	1499027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007510	GGCGGG	2	12	1522101	1522112	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007510	TCGATT	2	12	1555144	1555155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007510	TTGTCA	2	12	1593218	1593229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007510	GAGGGG	2	12	1617933	1617944	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007510	CCGCGC	2	12	1619362	1619373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007510	TATGGC	2	12	1704798	1704809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007510	GCGCGA	2	12	1715884	1715895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007510	TTGCCA	2	12	1850702	1850713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007510	CGGCAT	2	12	1886809	1886820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007510	CAGTGT	2	12	1911770	1911781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007510	GTCAGA	2	12	1927681	1927692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007510	TGGGGT	2	12	1988984	1988995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007510	CGTCAG	2	12	2005857	2005868	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007510	TCCGGC	2	12	2006052	2006063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007510	CGTTCG	2	12	2024397	2024408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007510	TCCGCA	2	12	2024555	2024566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007510	CCGCGT	2	12	2041883	2041894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007510	CCCGGC	2	12	2048887	2048898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007510	CGGCGC	2	12	2060557	2060568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007510	GTCCCG	2	12	2063208	2063219	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007510	TGCAGA	2	12	2080352	2080363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007510	GCACCG	2	12	2123733	2123744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007510	CGGGTC	2	12	2143316	2143327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007510	ACGCGC	2	12	2230265	2230276	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007510	CGGGCC	2	12	2255938	2255949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007510	ATGCCG	2	12	2271316	2271327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007510	GATCCG	2	12	2321878	2321889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007510	CACCGG	2	12	2327174	2327185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007510	CGAGTA	2	12	2442853	2442864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007510	GAAAAA	2	12	2445307	2445318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007510	CAATGA	2	12	2458181	2458192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007510	TGAAAA	2	12	2496646	2496657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007510	TCCGTT	2	12	2516204	2516215	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007510	TAATGA	2	12	2530960	2530971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007510	CGCACA	2	12	2560409	2560420	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007510	GCGCGG	2	12	2610072	2610083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007510	TTCTCA	2	12	2619673	2619684	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007510	CAGGAT	2	12	2677776	2677787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007510	GCCTTG	5	30	2742670	2742699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007510	GAAGCC	2	12	2742721	2742732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007510	CTTCCG	3	18	2759916	2759933	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007510	AACCGC	2	12	2777503	2777514	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007510	CCATCG	2	12	2778642	2778653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007510	ACCCAA	2	12	2786189	2786200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007510	ACTTGA	2	12	2792790	2792801	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007510	CAACCC	2	12	2799164	2799175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007510	GCGCTC	2	12	2841990	2842001	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_007510	GCGCCC	2	12	2902221	2902232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007510	CAGCGC	2	12	2952360	2952371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007510	CTTTTT	2	12	2977431	2977442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007510	CAACAG	2	12	3099312	3099323	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007510	TTCGAA	2	12	3138561	3138572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007510	TGCAGT	2	12	3140146	3140157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007510	AGCGCC	2	12	3164530	3164541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007510	CCGCAT	2	12	3223286	3223297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007510	CGAAGC	2	12	3243785	3243796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007510	TTTTTC	2	12	3278082	3278093	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007510	CGGCGT	3	18	3293197	3293214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007510	GCGTCA	2	12	3293223	3293234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007510	CCGCAG	3	18	3293245	3293262	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007510	CGTTTT	2	12	3296063	3296074	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007510	CGGCGC	2	12	3319701	3319712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007510	GCCTAG	2	12	3356485	3356496	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007510	GCTGAA	2	12	3366206	3366217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007510	GCGCAC	2	12	3404439	3404450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007510	AACAGA	2	12	3439997	3440008	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_007510	ACTCAC	2	12	3459029	3459040	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007510	CTGAAA	2	12	3464384	3464395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_007510	GCAGTA	2	12	3553206	3553217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_007510	CGGTCT	2	12	3559746	3559757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007510	CCTCGT	2	12	3563060	3563071	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007510	TTCCCG	2	12	3573850	3573861	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007510	CGCGCC	2	12	3601030	3601041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007510	TCACCC	2	12	3601155	3601166	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007510	CGGCCG	2	12	3606737	3606748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007510	TCCAGT	2	12	3617093	3617104	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007510	CGCCCG	2	12	3630302	3630313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_007510	GTCGGT	7	42	3679478	3679519	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.