MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. 383 chromosome 3

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007509	CAAACG	2	12	940	951	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007509	AGAAAA	2	12	24363	24374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007509	GTGCGC	2	12	30391	30402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007509	CCAATG	2	12	78788	78799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007509	CGAAAA	2	12	111057	111068	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007509	GGGGAT	2	12	128860	128871	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007509	CGCCGG	2	12	174386	174397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007509	CGGGCG	2	12	179868	179879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007509	GCCGGG	2	12	189725	189736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007509	CGTGAT	2	12	218754	218765	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007509	GGGCGA	2	12	234194	234205	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007509	CAATTT	2	12	248951	248962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007509	CAACGG	2	12	284885	284896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007509	CAACGA	2	12	318516	318527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007509	ACTTTC	2	12	328202	328213	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007509	CTGCGA	2	12	375125	375136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007509	TCGCGG	2	12	375320	375331	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007509	AAGCGG	2	12	378745	378756	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007509	TTGCCA	2	12	414005	414016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007509	CACCTC	2	12	466456	466467	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007509	TGAATA	2	12	476623	476634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007509	CGATCG	2	12	508049	508060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007509	CGCCGG	2	12	545425	545436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007509	CGAGGG	2	12	560374	560385	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007509	GGGCCC	2	12	562007	562018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007509	AAACGC	2	12	584397	584408	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007509	AGCGGT	2	12	676091	676102	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_007509	GGGTAA	2	12	703814	703825	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007509	CGGAAC	2	12	709793	709804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007509	TCCGCA	2	12	761945	761956	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007509	ATGCGG	3	18	836958	836975	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007509	CGCACG	2	12	841826	841837	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007509	GATCGA	2	12	884950	884961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007509	ATCGAT	2	12	901281	901292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007509	CCTCAT	2	12	908645	908656	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007509	GCCCAG	2	12	927843	927854	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007509	GCCTCT	14	84	942556	942639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007509	GCACGG	2	12	952410	952421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007509	TCGCGG	2	12	972230	972241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007509	CCGCGT	2	12	980910	980921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007509	TTTATG	2	12	1020748	1020759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007509	TTCGGA	2	12	1080708	1080719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007509	GGTTCA	2	12	1100800	1100811	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007509	TCCCCA	2	12	1130786	1130797	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007509	CCGCGG	2	12	1191753	1191764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007509	AAAATG	2	12	1193271	1193282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007509	CATCGC	2	12	1194551	1194562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007509	TCAAAT	2	12	1213858	1213869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007509	GCCGGC	2	12	1214748	1214759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007509	GCGGCT	4	24	1271768	1271791	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007509	CGCACA	2	12	1281731	1281742	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007509	GTGCGG	2	12	1283559	1283570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007509	GTTCGG	3	18	1298082	1298099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007509	GCGTTC	2	12	1310281	1310292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007509	CCGGTG	2	12	1328834	1328845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007509	GGTCCG	2	12	1331220	1331231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007509	CGACAA	2	12	1333599	1333610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007509	CGGCGC	2	12	1340336	1340347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007509	TCGCGT	2	12	1349090	1349101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007509	GCGGCA	2	12	1350479	1350490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007509	GGAACC	2	12	1359083	1359094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007509	CATCGA	2	12	1389633	1389644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.