MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 chromosome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007508	GAAACG	2	12	19982	19993	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007508	AGCAAC	3	18	19998	20015	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007508	ATCGCA	2	12	31479	31490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007508	ATCCAC	2	12	38265	38276	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007508	ATCGCC	2	12	54460	54471	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007508	TGGGAT	3	18	81870	81887	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007508	AACGCC	2	12	82499	82510	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007508	GTGCGG	2	12	92275	92286	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007508	GGCGCA	2	12	112087	112098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007508	CTCCGG	2	12	114028	114039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007508	AGGAGC	2	12	133791	133802	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007508	AAGGAA	2	12	149429	149440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007508	ATTTAC	2	12	188884	188895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007508	GTGCCT	2	12	188986	188997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007508	AAGCGC	2	12	195454	195465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007508	CGCTTG	2	12	210899	210910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007508	ACCGCC	2	12	217970	217981	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007508	CTGACC	2	12	240871	240882	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007508	TCGTGG	2	12	286724	286735	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_007508	GCAGCG	2	12	324732	324743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007508	TGGCGC	2	12	339501	339512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007508	GGGGCG	2	12	354942	354953	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007508	TGGCGC	2	12	376739	376750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007508	CGCGCC	2	12	412228	412239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007508	GGAAAA	2	12	446974	446985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007508	TGGGGC	2	12	449152	449163	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007508	CAAAGC	3	18	487071	487088	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007508	CGAAGC	3	18	487089	487106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007508	CAAAGC	3	18	487107	487124	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007508	AAGCCA	2	12	487139	487150	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007508	ATCGAG	2	12	490835	490846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007508	GCAAGG	2	12	543501	543512	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007508	GCGCTT	2	12	583282	583293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007508	GAGTCA	2	12	590694	590705	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007508	GCACCG	2	12	600678	600689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007508	CTGGCG	2	12	625872	625883	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007508	GTGCAG	2	12	649389	649400	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007508	CACCAA	2	12	660445	660456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007508	TGCCGA	2	12	663472	663483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007508	CGCCAT	2	12	670016	670027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007508	GCGGCA	2	12	743297	743308	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007508	AGCGCC	2	12	752968	752979	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007508	GTGCGC	2	12	772555	772566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007508	GCCGGT	2	12	782679	782690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007508	CGCCTG	2	12	782747	782758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007508	GGTGCG	2	12	831791	831802	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007508	GTGGGC	2	12	889905	889916	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007508	TGGCAG	2	12	893292	893303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007508	GCTGGC	2	12	895799	895810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007508	AGAGCA	3	18	951735	951752	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007508	TCGCTG	2	12	966566	966577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007508	GCTGAT	2	12	971491	971502	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007508	GCGGAT	2	12	973369	973380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007508	GCGCCG	2	12	1034069	1034080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007508	TCGGCG	2	12	1038970	1038981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007508	GAGTGC	2	12	1046615	1046626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007508	GCCTGC	2	12	1077731	1077742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007508	GCTGCG	2	12	1077754	1077765	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007508	GCAGGC	2	12	1090355	1090366	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007508	GGCGCA	2	12	1095293	1095304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007508	GCCCGT	2	12	1179973	1179984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007508	GCGCAA	2	12	1187067	1187078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007508	GGCCTC	2	12	1215807	1215818	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007508	GCGGAT	2	12	1241526	1241537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007508	AGCAAG	2	12	1252157	1252168	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007508	ATTGCC	2	12	1353281	1353292	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007508	CGGCAG	2	12	1357118	1357129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007508	TTGCCG	2	12	1381775	1381786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007508	TCTTCC	2	12	1384821	1384832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007508	TCGTCT	2	12	1386449	1386460	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007508	CGGCAG	2	12	1399523	1399534	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007508	ATGCCG	2	12	1425157	1425168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007508	CGCATG	2	12	1435150	1435161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007508	GCAGGC	2	12	1443213	1443224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007508	GGGGCG	2	12	1453419	1453430	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007508	GTGCAG	2	12	1464248	1464259	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007508	GTCCCG	2	12	1504550	1504561	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007508	GTGCCC	2	12	1506184	1506195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007508	TCCTGT	2	12	1580518	1580529	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007508	AGGTGG	2	12	1588025	1588036	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007508	GCATGC	2	12	1617291	1617302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007508	CAGCGG	2	12	1631723	1631734	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007508	TGCTGT	2	12	1646334	1646345	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007508	GCCGGT	2	12	1714066	1714077	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007508	CTTGTG	2	12	1745596	1745607	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007508	GCAGCG	2	12	1774532	1774543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007508	GCGTTT	2	12	1791296	1791307	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007508	AACAGC	2	12	1797634	1797645	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007508	GCCGGG	2	12	1816423	1816434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007508	CTCACA	2	12	1825294	1825305	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007508	CCGCGG	2	12	1845638	1845649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007508	CGTGGC	2	12	1859493	1859504	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007508	GATGCC	2	12	1862202	1862213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007508	TCGGCG	2	12	1864317	1864328	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007508	CGCAGG	2	12	1868627	1868638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007508	CGGCCG	2	12	1881673	1881684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007508	TGAGGC	2	12	1915506	1915517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007508	CGCGTG	2	12	1936364	1936375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007508	AGGAAG	2	12	1971739	1971750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007508	GGCGTG	2	12	1974894	1974905	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007508	CTGCAG	2	12	2010669	2010680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007508	TGGGGT	2	12	2129703	2129714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007508	CACAAA	2	12	2129887	2129898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007508	GGGCAG	2	12	2142329	2142340	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007508	GCCGGG	2	12	2143493	2143504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007508	GCCGGA	2	12	2195751	2195762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007508	CTGGCG	2	12	2206543	2206554	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007508	CGCTGT	2	12	2243524	2243535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007508	TCGCTG	11	66	2268784	2268849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007508	ACGTCG	2	12	2284610	2284621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007508	TGCAGC	2	12	2294243	2294254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007508	CCCAAT	2	12	2320086	2320097	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007508	TCCACT	2	12	2327454	2327465	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007508	CGCTTG	2	12	2349410	2349421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007508	CAGGCG	2	12	2349590	2349601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007508	GCGAAC	2	12	2377174	2377185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007508	GACGAG	2	12	2528296	2528307	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007508	TCAATC	2	12	2597038	2597049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007508	GCTGCC	2	12	2612313	2612324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007508	GGATGC	2	12	2619085	2619096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007508	GGGGAC	2	12	2722382	2722393	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_007508	ACGGCC	2	12	2796672	2796683	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007508	TCGACA	2	12	2842683	2842694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007508	GCATTT	2	12	2896305	2896316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007508	TGCACG	2	12	2938783	2938794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007508	CATCGC	2	12	3017237	3017248	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007508	GCTTGC	2	12	3056397	3056408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007508	CTGCGG	2	12	3133949	3133960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007508	GCGCAC	2	12	3140120	3140131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007508	GTGCTC	2	12	3151220	3151231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007508	CCTTGC	2	12	3173807	3173818	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007508	CTGCCA	2	12	3217092	3217103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007508	GTGACC	2	12	3321201	3321212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007508	GGCGCC	2	12	3345410	3345421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007508	TTGCGC	2	12	3419389	3419400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007508	TGCGCT	2	12	3429674	3429685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007508	ATTCCG	2	12	3453910	3453921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007508	AGGAGA	2	12	3459376	3459387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007508	GTGCCA	2	12	3584859	3584870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007508	GATACG	2	12	3634139	3634150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_007508	GCTTCG	2	12	3636180	3636191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007508	GCATCT	2	12	3722702	3722713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007508	CGCAAC	2	12	3750255	3750266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007508	CGCAGG	3	18	3777708	3777725	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007508	GTTGCA	2	12	3812874	3812885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_007508	GCTGAT	2	12	3898655	3898666	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_007508	CGATGG	2	12	3907867	3907878	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_007508	ATGCGA	2	12	3927474	3927485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_007508	CGCATC	2	12	3958797	3958808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007508	GGAATG	2	12	3969214	3969225	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007508	GGTATC	3	18	3990967	3990984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_007508	CGACGG	2	12	4005519	4005530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_007508	GCAGCG	2	12	4005548	4005559	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007508	CGGCGC	2	12	4007757	4007768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007508	CGAAAA	2	12	4024628	4024639	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_007508	ATGCAG	4	24	4038207	4038230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_007508	CAGCGC	2	12	4052641	4052652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
158	NC_007508	AAGGCA	2	12	4130772	4130783	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_007508	CGTGCG	2	12	4156927	4156938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_007508	ATTGGG	2	12	4222489	4222500	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007508	GGCCGC	2	12	4245263	4245274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_007508	CGCATG	2	12	4245658	4245669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_007508	GGCATG	2	12	4246845	4246856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_007508	CCTGCG	2	12	4255800	4255811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
166	NC_007508	CGATGC	2	12	4312634	4312645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_007508	GGTGCC	2	12	4312794	4312805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_007508	AACACA	2	12	4335266	4335277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_007508	GCCGCG	3	18	4748505	4748522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.