MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 chromosome

Total Repeats: 86387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007508	TCG	2	6	134	139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
2	NC_007508	GCG	3	9	259	267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
3	NC_007508	TCG	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
4	NC_007508	GCA	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
5	NC_007508	GCC	2	6	376	381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
6	NC_007508	GGC	2	6	390	395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
7	NC_007508	TGC	2	6	428	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
8	NC_007508	GCA	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
9	NC_007508	GCC	2	6	508	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
10	NC_007508	TTC	2	6	541	546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045557
11	NC_007508	GAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045557
12	NC_007508	CAG	2	6	604	609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
13	NC_007508	GCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
14	NC_007508	CGA	2	6	627	632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
15	NC_007508	TTC	2	6	640	645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045557
16	NC_007508	TTC	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045557
17	NC_007508	GCC	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
18	NC_007508	ATC	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045557
19	NC_007508	CCG	2	6	811	816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045557
20	NC_007508	GCG	2	6	863	868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
21	NC_007508	CGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045557
22	NC_007508	AAG	2	6	904	909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045557
23	NC_007508	TGG	2	6	953	958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045557
24	NC_007508	TGC	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
25	NC_007508	AGA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045557
26	NC_007508	TAC	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045557
27	NC_007508	CTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
28	NC_007508	GCG	2	6	1116	1121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045557
29	NC_007508	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045557
30	NC_007508	GGT	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007508	CAC	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007508	TGG	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045558
33	NC_007508	CGT	2	6	1983	1988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045558
34	NC_007508	CAG	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045558
35	NC_007508	CTA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045558
36	NC_007508	TGT	2	6	2075	2080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045558
37	NC_007508	TGC	2	6	2099	2104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045558
38	NC_007508	CGG	2	6	2163	2168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045558
39	NC_007508	ATC	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045558
40	NC_007508	CTG	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045558
41	NC_007508	GCG	2	6	2285	2290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045558
42	NC_007508	CGA	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045558
43	NC_007508	GTG	2	6	2611	2616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045558
44	NC_007508	CAG	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045558
45	NC_007508	TTG	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007508	GTC	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007508	TCG	2	6	3232	3237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007508	GTT	2	6	3656	3661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007508	CTG	2	6	3828	3833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045559
50	NC_007508	CAA	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045559
51	NC_007508	GTG	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045559
52	NC_007508	CGC	3	9	4155	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045559
53	NC_007508	CTG	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045559
54	NC_007508	GGA	2	6	4625	4630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045559
55	NC_007508	GAT	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045559
56	NC_007508	TGC	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045559
57	NC_007508	TCA	2	6	4750	4755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045559
58	NC_007508	GCA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045559
59	NC_007508	CGA	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
60	NC_007508	TGC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
61	NC_007508	GGT	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045560
62	NC_007508	CGA	2	6	5144	5149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
63	NC_007508	GAC	2	6	5169	5174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
64	NC_007508	GTG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045560
65	NC_007508	GCG	2	6	5227	5232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
66	NC_007508	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045560
67	NC_007508	CGG	2	6	5266	5271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
68	NC_007508	TGC	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
69	NC_007508	CGG	2	6	5300	5305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
70	NC_007508	CGA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
71	NC_007508	CGG	2	6	5336	5341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
72	NC_007508	GGT	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045560
73	NC_007508	CAG	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
74	NC_007508	AGC	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
75	NC_007508	CAC	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045560
76	NC_007508	CGA	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
77	NC_007508	GCG	2	6	5623	5628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
78	NC_007508	CGA	2	6	5639	5644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
79	NC_007508	GGC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
80	NC_007508	CGC	2	6	5701	5706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
81	NC_007508	CAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045560
82	NC_007508	CAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045560
83	NC_007508	CGG	2	6	5831	5836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
84	NC_007508	GCG	2	6	5859	5864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
85	NC_007508	CGG	2	6	6040	6045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
86	NC_007508	TCG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
87	NC_007508	GCC	2	6	6150	6155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
88	NC_007508	CGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
89	NC_007508	TCG	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
90	NC_007508	CGG	2	6	6280	6285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
91	NC_007508	TGC	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
92	NC_007508	CGA	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
93	NC_007508	ACC	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045560
94	NC_007508	CAT	2	6	6476	6481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045560
95	NC_007508	TGA	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045560
96	NC_007508	CTG	3	9	6525	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
97	NC_007508	CTT	2	6	6536	6541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045560
98	NC_007508	GCC	2	6	6593	6598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
99	NC_007508	GAC	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
100	NC_007508	GCG	2	6	6648	6653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
101	NC_007508	GCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
102	NC_007508	CGA	2	6	6710	6715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
103	NC_007508	CCG	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
104	NC_007508	TTG	2	6	6747	6752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045560
105	NC_007508	GCC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
106	NC_007508	TGG	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045560
107	NC_007508	CCG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
108	NC_007508	TGC	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045560
109	NC_007508	GCG	2	6	7051	7056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045560
110	NC_007508	CAA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78045560
111	NC_007508	AAG	2	6	7191	7196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045560
112	NC_007508	GCC	2	6	7198	7203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
113	NC_007508	AGC	2	6	7243	7248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045560
114	NC_007508	GCC	2	6	7314	7319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
115	NC_007508	CGC	2	6	7362	7367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045560
116	NC_007508	GTG	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007508	TGA	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045561
118	NC_007508	CAC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045561
119	NC_007508	GCC	2	6	7534	7539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045561
120	NC_007508	TGC	2	6	7542	7547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045561
121	NC_007508	CGC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045561
122	NC_007508	CTG	2	6	7592	7597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045561
123	NC_007508	GGC	2	6	7660	7665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045561
124	NC_007508	GCC	2	6	7706	7711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045561
125	NC_007508	GCT	2	6	7738	7743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045561
126	NC_007508	GCT	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045561
127	NC_007508	TAC	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045561
128	NC_007508	GCC	2	6	7794	7799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045561
129	NC_007508	CGC	3	9	7876	7884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045561
130	NC_007508	GGC	2	6	7915	7920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045561
131	NC_007508	CCA	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045561
132	NC_007508	CAG	2	6	7979	7984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045561
133	NC_007508	GGT	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045561
134	NC_007508	GAA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045561
135	NC_007508	CTG	2	6	8039	8044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045561
136	NC_007508	TCG	2	6	8047	8052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045561
137	NC_007508	GCA	2	6	8196	8201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045561
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140	NC_007508	GCG	2	6	8356	8361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_007508	GCC	2	6	8577	8582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045562
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154	NC_007508	TGC	2	6	9311	9316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_007508	TGT	2	6	9616	9621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045563
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242	NC_007508	GCA	2	6	13330	13335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045567
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252	NC_007508	AGT	2	6	13989	13994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045568
253	NC_007508	CAA	2	6	14038	14043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_007508	GTT	2	6	14113	14118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_007508	GCA	2	6	14127	14132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_007508	TCG	2	6	14156	14161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_007508	CCA	2	6	14181	14186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_007508	ATC	2	6	14219	14224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_007508	CGA	2	6	14586	14591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045569
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