MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007507	GGTTCC	2	12	1826	1837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045311
2	NC_007507	TTCGAG	2	12	2138	2149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78045311
3	NC_007507	AGCACC	2	12	3399	3410	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007507	CGACTT	2	12	5595	5606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78045313
5	NC_007507	CGCGGG	2	12	9937	9948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007507	CGGTGG	5	30	12847	12876	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78045321
7	NC_007507	GTGGCG	2	12	12879	12890	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78045321
8	NC_007507	CGGTGA	2	12	13056	13067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78045321
9	NC_007507	CCACCT	2	12	14675	14686	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	78045322
10	NC_007507	CCGGTA	2	12	21753	21764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007507	GCAAGC	2	12	24478	24489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045330
12	NC_007507	GCTTGC	2	12	30382	30393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045335
13	NC_007507	AGCGGA	2	12	31148	31159	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007507	ATGGGA	2	12	34872	34883	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78045336
15	NC_007507	TGCTGG	2	12	36222	36233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78045339
16	NC_007507	TGGCGG	3	18	40489	40506	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78045343
17	NC_007507	GGCAAG	2	12	41027	41038	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78045343
18	NC_007507	ACTGCC	2	12	45646	45657	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78045349
19	NC_007507	CGCTGC	2	12	47746	47757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78045351
20	NC_007507	CAGCCG	6	36	49920	49955	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78045352
21	NC_007507	AGGAAA	2	12	52925	52936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045356
22	NC_007507	TGGCGC	2	12	54212	54223	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78045357
23	NC_007507	CAATAT	2	12	56912	56923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	78045359
24	NC_007507	GCTTCC	2	12	69612	69623	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78045369
25	NC_007507	CCGGCG	2	12	70678	70689	0 %	0 %	50 %	50 %	78045370
26	NC_007507	GGCGCC	2	12	71895	71906	0 %	0 %	50 %	50 %	78045370
27	NC_007507	GCTCGC	2	12	72301	72312	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78045370
28	NC_007507	GCTTTC	2	12	73052	73063	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78045372
29	NC_007507	GGCGAA	2	12	79656	79667	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78045381
30	NC_007507	CCGGCC	2	12	84607	84618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045384
31	NC_007507	ACCCGA	2	12	85947	85958	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78045386
32	NC_007507	CGACGT	2	12	89194	89205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78045388
33	NC_007507	CGCTTG	2	12	89531	89542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045388
34	NC_007507	TGCACC	2	12	90952	90963	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78045389
35	NC_007507	CAGCGA	2	12	91976	91987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045391
36	NC_007507	CGATGC	2	12	92176	92187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78045392
37	NC_007507	TCGCGC	2	12	101126	101137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78045401
38	NC_007507	GGCGCT	2	12	103067	103078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78045403
39	NC_007507	TCGCGC	2	12	103198	103209	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78045403
40	NC_007507	GCCAAC	2	12	104974	104985	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78045405
41	NC_007507	CTGACG	2	12	105282	105293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78045406
42	NC_007507	CTGTCA	2	12	114902	114913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78045414
43	NC_007507	CAGGCC	2	12	116703	116714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78045416
44	NC_007507	AGGCCA	2	12	117030	117041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045417
45	NC_007507	TACCTG	2	12	117119	117130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78045417
46	NC_007507	GAGTTG	2	12	117185	117196	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	78045417
47	NC_007507	TGATCC	2	12	122970	122981	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78045422
48	NC_007507	GCCAAC	2	12	124035	124046	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	78045423
49	NC_007507	CTGACG	2	12	124343	124354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78045424
50	NC_007507	TCAAGC	2	12	124938	124949	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78045424
51	NC_007507	GGCTGT	2	12	127393	127404	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007507	CAACAC	2	12	127962	127973	50 %	0 %	0 %	50 %	78045425
53	NC_007507	TCAAGA	2	12	128702	128713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	78045425
54	NC_007507	GGACGA	2	12	133984	133995	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78045432
55	NC_007507	AAAGCG	2	12	134206	134217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	78045433
56	NC_007507	ACCGCG	2	12	134722	134733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78045433
57	NC_007507	TCACCA	2	12	137295	137306	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	78045435
58	NC_007507	CACTTG	2	12	137846	137857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78045436
59	NC_007507	TCTCTA	2	12	138361	138372	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007507	CGCTGG	2	12	142465	142476	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78045442
61	NC_007507	AGCGCA	2	12	142984	142995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045443
62	NC_007507	ACCGTG	2	12	144381	144392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78045446
63	NC_007507	CTGCGC	2	12	149503	149514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78045450
64	NC_007507	CGGCGC	2	12	149876	149887	0 %	0 %	50 %	50 %	78045451
65	NC_007507	TCGAAG	2	12	150591	150602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78045452
66	NC_007507	ACCATC	2	12	156013	156024	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007507	AGATCC	2	12	161258	161269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78045464
68	NC_007507	CAGATC	2	12	163693	163704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78045464
69	NC_007507	ACCAGA	2	12	164159	164170	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78045464
70	NC_007507	TTCCGG	2	12	165406	165417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045465
71	NC_007507	TTTTCG	2	12	167947	167958	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	78045467
72	NC_007507	CATCAC	2	12	167987	167998	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007507	CTGTCG	2	12	168191	168202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045468
74	NC_007507	CTGTGC	2	12	169547	169558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045470
75	NC_007507	CGCATC	2	12	170998	171009	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78045471
76	NC_007507	TGGCAT	2	12	177779	177790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78045477
77	NC_007507	ATGCCA	2	12	179068	179079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78045479
78	NC_007507	TCGGGG	2	12	180759	180770	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.