MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007507	GCGCG	2	10	3995	4004	0 %	0 %	60 %	40 %	78045312
2	NC_007507	GGCTT	2	10	4895	4904	0 %	40 %	40 %	20 %	78045313
3	NC_007507	CCGGA	2	10	5437	5446	20 %	0 %	40 %	40 %	78045313
4	NC_007507	CAGAG	2	10	5607	5616	40 %	0 %	40 %	20 %	78045313
5	NC_007507	CTCGA	2	10	6003	6012	20 %	20 %	20 %	40 %	78045313
6	NC_007507	GTCCA	2	10	8765	8774	20 %	20 %	20 %	40 %	78045316
7	NC_007507	TGGCG	2	10	11688	11697	0 %	20 %	60 %	20 %	78045320
8	NC_007507	GCACT	2	10	18209	18218	20 %	20 %	20 %	40 %	78045324
9	NC_007507	CAGCA	2	10	18849	18858	40 %	0 %	20 %	40 %	78045325
10	NC_007507	CCTGT	2	10	21338	21347	0 %	40 %	20 %	40 %	78045326
11	NC_007507	ATCGC	2	10	33677	33686	20 %	20 %	20 %	40 %	78045336
12	NC_007507	GCGCA	2	10	36452	36461	20 %	0 %	40 %	40 %	78045339
13	NC_007507	TGCGA	2	10	37855	37864	20 %	20 %	40 %	20 %	78045340
14	NC_007507	CAGCT	2	10	38617	38626	20 %	20 %	20 %	40 %	78045341
15	NC_007507	CGGCG	2	10	41812	41821	0 %	0 %	60 %	40 %	78045345
16	NC_007507	GCTCA	2	10	43984	43993	20 %	20 %	20 %	40 %	78045347
17	NC_007507	GTTGA	2	10	44731	44740	20 %	40 %	40 %	0 %	78045347
18	NC_007507	GCAAA	2	10	46585	46594	60 %	0 %	20 %	20 %	78045350
19	NC_007507	CCAGC	2	10	46980	46989	20 %	0 %	20 %	60 %	78045350
20	NC_007507	GTTCC	2	10	48132	48141	0 %	40 %	20 %	40 %	78045352
21	NC_007507	CAGGA	2	10	49261	49270	40 %	0 %	40 %	20 %	78045352
22	NC_007507	CAGTG	2	10	49973	49982	20 %	20 %	40 %	20 %	78045352
23	NC_007507	GGGTT	2	10	50811	50820	0 %	40 %	60 %	0 %	78045353
24	NC_007507	GGGGT	2	10	51007	51016	0 %	20 %	80 %	0 %	78045353
25	NC_007507	CGATT	2	10	51210	51219	20 %	40 %	20 %	20 %	78045354
26	NC_007507	AATGG	2	10	54361	54370	40 %	20 %	40 %	0 %	78045357
27	NC_007507	GATGA	2	10	55366	55375	40 %	20 %	40 %	0 %	78045358
28	NC_007507	GTTTC	2	10	57276	57285	0 %	60 %	20 %	20 %	78045359
29	NC_007507	AGTTC	2	10	60074	60083	20 %	40 %	20 %	20 %	78045361
30	NC_007507	GCACG	2	10	60150	60159	20 %	0 %	40 %	40 %	78045361
31	NC_007507	CCGAG	2	10	60405	60414	20 %	0 %	40 %	40 %	78045361
32	NC_007507	GGCCG	2	10	66070	66079	0 %	0 %	60 %	40 %	78045364
33	NC_007507	ATCTC	2	10	69170	69179	20 %	40 %	0 %	40 %	78045368
34	NC_007507	TGCAG	2	10	69643	69652	20 %	20 %	40 %	20 %	78045369
35	NC_007507	GCGCG	2	10	72560	72569	0 %	0 %	60 %	40 %	78045370
36	NC_007507	GCTGC	2	10	72979	72988	0 %	20 %	40 %	40 %	78045372
37	NC_007507	TGTCC	2	10	73197	73206	0 %	40 %	20 %	40 %	78045372
38	NC_007507	CTGCA	2	10	73778	73787	20 %	20 %	20 %	40 %	78045373
39	NC_007507	GCAAG	2	10	74002	74011	40 %	0 %	40 %	20 %	78045373
40	NC_007507	TTCGG	2	10	74487	74496	0 %	40 %	40 %	20 %	78045374
41	NC_007507	GGCTT	2	10	76331	76340	0 %	40 %	40 %	20 %	78045378
42	NC_007507	CTGCC	2	10	77261	77270	0 %	20 %	20 %	60 %	78045379
43	NC_007507	GCCCT	2	10	78444	78453	0 %	20 %	20 %	60 %	78045380
44	NC_007507	GCGCG	2	10	80053	80062	0 %	0 %	60 %	40 %	78045381
45	NC_007507	CGGCA	2	10	81508	81517	20 %	0 %	40 %	40 %	78045382
46	NC_007507	GCGCG	2	10	83033	83042	0 %	0 %	60 %	40 %	78045383
47	NC_007507	GCCGA	2	10	84669	84678	20 %	0 %	40 %	40 %	78045384
48	NC_007507	CGCGA	2	10	85173	85182	20 %	0 %	40 %	40 %	78045384
49	NC_007507	CTGCG	2	10	85999	86008	0 %	20 %	40 %	40 %	78045386
50	NC_007507	TGCAG	2	10	89848	89857	20 %	20 %	40 %	20 %	78045388
51	NC_007507	CGCGC	2	10	89858	89867	0 %	0 %	40 %	60 %	78045388
52	NC_007507	GGCCA	2	10	90169	90178	20 %	0 %	40 %	40 %	78045388
53	NC_007507	CCGCG	2	10	94475	94484	0 %	0 %	40 %	60 %	78045394
54	NC_007507	AGTCG	2	10	95138	95147	20 %	20 %	40 %	20 %	78045395
55	NC_007507	AGCAG	2	10	96057	96066	40 %	0 %	40 %	20 %	78045395
56	NC_007507	CCGCA	2	10	103095	103104	20 %	0 %	20 %	60 %	78045403
57	NC_007507	CTCGC	2	10	103582	103591	0 %	20 %	20 %	60 %	78045403
58	NC_007507	GCCAC	2	10	104470	104479	20 %	0 %	20 %	60 %	78045405
59	NC_007507	CGATG	2	10	108653	108662	20 %	20 %	40 %	20 %	78045407
60	NC_007507	GGTAG	2	10	109509	109518	20 %	20 %	60 %	0 %	78045407
61	NC_007507	GGCGC	2	10	111219	111228	0 %	0 %	60 %	40 %	78045409
62	NC_007507	TCGGC	2	10	111281	111290	0 %	20 %	40 %	40 %	78045409
63	NC_007507	AAATT	2	10	113467	113476	60 %	40 %	0 %	0 %	78045413
64	NC_007507	GGCAT	2	10	117513	117522	20 %	20 %	40 %	20 %	78045417
65	NC_007507	CCGCA	2	10	117779	117788	20 %	0 %	20 %	60 %	78045418
66	NC_007507	GCGAC	2	10	119646	119655	20 %	0 %	40 %	40 %	78045421
67	NC_007507	CTTGG	2	10	122731	122740	0 %	40 %	40 %	20 %	78045422
68	NC_007507	GCCAC	2	10	123531	123540	20 %	0 %	20 %	60 %	78045423
69	NC_007507	AGGTC	2	10	123557	123566	20 %	20 %	40 %	20 %	78045423
70	NC_007507	GTGGG	2	10	123899	123908	0 %	20 %	80 %	0 %	78045423
71	NC_007507	CGAGG	2	10	125546	125555	20 %	0 %	60 %	20 %	78045424
72	NC_007507	CCCGG	2	10	128028	128037	0 %	0 %	40 %	60 %	78045425
73	NC_007507	CATGT	2	10	131319	131328	20 %	40 %	20 %	20 %	78045429
74	NC_007507	GCAGC	3	15	131706	131720	20 %	0 %	40 %	40 %	78045429
75	NC_007507	CGATC	2	10	132662	132671	20 %	20 %	20 %	40 %	78045431
76	NC_007507	AATGG	2	10	141239	141248	40 %	20 %	40 %	0 %	78045441
77	NC_007507	ATGAG	2	10	143588	143597	40 %	20 %	40 %	0 %	78045443
78	NC_007507	GACCT	2	10	146780	146789	20 %	20 %	20 %	40 %	78045448
79	NC_007507	AATGC	2	10	147530	147539	40 %	20 %	20 %	20 %	78045449
80	NC_007507	CACGC	2	10	147559	147568	20 %	0 %	20 %	60 %	78045449
81	NC_007507	GCAAA	2	10	148022	148031	60 %	0 %	20 %	20 %	78045450
82	NC_007507	ATCGG	2	10	149698	149707	20 %	20 %	40 %	20 %	78045450
83	NC_007507	ACCGT	2	10	151538	151547	20 %	20 %	20 %	40 %	78045453
84	NC_007507	CGACT	2	10	152053	152062	20 %	20 %	20 %	40 %	78045454
85	NC_007507	CTGCC	2	10	153107	153116	0 %	20 %	20 %	60 %	78045454
86	NC_007507	TTTGA	2	10	161270	161279	20 %	60 %	20 %	0 %	78045464
87	NC_007507	GTCGA	2	10	161458	161467	20 %	20 %	40 %	20 %	78045464
88	NC_007507	GGCCA	2	10	165724	165733	20 %	0 %	40 %	40 %	78045465
89	NC_007507	CGTGC	2	10	166072	166081	0 %	20 %	40 %	40 %	78045465
90	NC_007507	ACCAC	2	10	169072	169081	40 %	0 %	0 %	60 %	78045469
91	NC_007507	TGGGG	2	10	169521	169530	0 %	20 %	80 %	0 %	78045470
92	NC_007507	TCAGC	2	10	170054	170063	20 %	20 %	20 %	40 %	78045471
93	NC_007507	GCGCT	2	10	170646	170655	0 %	20 %	40 %	40 %	78045471
94	NC_007507	CCCTG	2	10	173409	173418	0 %	20 %	20 %	60 %	78045472
95	NC_007507	GAGAT	2	10	173434	173443	40 %	20 %	40 %	0 %	78045472
96	NC_007507	CGAAC	2	10	174134	174143	40 %	0 %	20 %	40 %	78045472
97	NC_007507	GATCG	2	10	174265	174274	20 %	20 %	40 %	20 %	78045473
98	NC_007507	CGTTC	2	10	175936	175945	0 %	40 %	20 %	40 %	78045476
99	NC_007507	CGCGG	2	10	176187	176196	0 %	0 %	60 %	40 %	78045476
100	NC_007507	GTGAA	2	10	177258	177267	40 %	20 %	40 %	0 %	78045477
101	NC_007507	GGCCG	2	10	177769	177778	0 %	0 %	60 %	40 %	78045477

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.