MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007507	CCCA	2	8	562	569	25 %	0 %	0 %	75 %	78045310
2	NC_007507	TGTC	2	8	1009	1016	0 %	50 %	25 %	25 %	78045310
3	NC_007507	AGCA	2	8	1748	1755	50 %	0 %	25 %	25 %	78045310
4	NC_007507	CCGG	2	8	1840	1847	0 %	0 %	50 %	50 %	78045311
5	NC_007507	GAGC	2	8	1876	1883	25 %	0 %	50 %	25 %	78045311
6	NC_007507	GAAG	2	8	2056	2063	50 %	0 %	50 %	0 %	78045311
7	NC_007507	CGCC	2	8	3891	3898	0 %	0 %	25 %	75 %	78045312
8	NC_007507	CTGC	2	8	3908	3915	0 %	25 %	25 %	50 %	78045312
9	NC_007507	CTCC	2	8	5008	5015	0 %	25 %	0 %	75 %	78045313
10	NC_007507	GTCT	2	8	5049	5056	0 %	50 %	25 %	25 %	78045313
11	NC_007507	CCCG	2	8	5617	5624	0 %	0 %	25 %	75 %	78045313
12	NC_007507	CAAG	2	8	6298	6305	50 %	0 %	25 %	25 %	78045313
13	NC_007507	GCTG	2	8	6635	6642	0 %	25 %	50 %	25 %	78045314
14	NC_007507	CGCA	2	8	6794	6801	25 %	0 %	25 %	50 %	78045314
15	NC_007507	AGCC	2	8	6852	6859	25 %	0 %	25 %	50 %	78045314
16	NC_007507	GGCA	2	8	6905	6912	25 %	0 %	50 %	25 %	78045314
17	NC_007507	CTGA	2	8	7332	7339	25 %	25 %	25 %	25 %	78045315
18	NC_007507	TTCA	2	8	7354	7361	25 %	50 %	0 %	25 %	78045315
19	NC_007507	ACCC	2	8	7483	7490	25 %	0 %	0 %	75 %	78045315
20	NC_007507	CGGC	2	8	8011	8018	0 %	0 %	50 %	50 %	78045316
21	NC_007507	AGCG	2	8	8822	8829	25 %	0 %	50 %	25 %	78045316
22	NC_007507	GCAC	2	8	8923	8930	25 %	0 %	25 %	50 %	78045316
23	NC_007507	GTGA	2	8	9033	9040	25 %	25 %	50 %	0 %	78045316
24	NC_007507	CGGG	2	8	9703	9710	0 %	0 %	75 %	25 %	78045318
25	NC_007507	GGAA	2	8	10309	10316	50 %	0 %	50 %	0 %	78045319
26	NC_007507	GCAG	2	8	10651	10658	25 %	0 %	50 %	25 %	78045319
27	NC_007507	TCGA	2	8	11376	11383	25 %	25 %	25 %	25 %	78045320
28	NC_007507	GTGG	2	8	11535	11542	0 %	25 %	75 %	0 %	78045320
29	NC_007507	GGAC	2	8	11707	11714	25 %	0 %	50 %	25 %	78045320
30	NC_007507	GCTT	2	8	12675	12682	0 %	50 %	25 %	25 %	78045321
31	NC_007507	AGCG	2	8	12722	12729	25 %	0 %	50 %	25 %	78045321
32	NC_007507	CCAA	2	8	12789	12796	50 %	0 %	0 %	50 %	78045321
33	NC_007507	GTCA	2	8	13288	13295	25 %	25 %	25 %	25 %	78045321
34	NC_007507	TCGC	2	8	13419	13426	0 %	25 %	25 %	50 %	78045321
35	NC_007507	ATCG	2	8	13921	13928	25 %	25 %	25 %	25 %	78045322
36	NC_007507	GGCT	2	8	14134	14141	0 %	25 %	50 %	25 %	78045322
37	NC_007507	GCGA	2	8	14198	14205	25 %	0 %	50 %	25 %	78045322
38	NC_007507	TTCT	2	8	14853	14860	0 %	75 %	0 %	25 %	78045322
39	NC_007507	GCGG	2	8	15169	15176	0 %	0 %	75 %	25 %	78045322
40	NC_007507	CAGT	2	8	15186	15193	25 %	25 %	25 %	25 %	78045322
41	NC_007507	CAGG	2	8	16086	16093	25 %	0 %	50 %	25 %	78045323
42	NC_007507	GCCA	2	8	16339	16346	25 %	0 %	25 %	50 %	78045323
43	NC_007507	GACG	2	8	16611	16618	25 %	0 %	50 %	25 %	78045323
44	NC_007507	TGGC	2	8	17963	17970	0 %	25 %	50 %	25 %	78045324
45	NC_007507	CCTG	2	8	19060	19067	0 %	25 %	25 %	50 %	78045325
46	NC_007507	ATCT	2	8	19076	19083	25 %	50 %	0 %	25 %	78045325
47	NC_007507	CAAG	2	8	19156	19163	50 %	0 %	25 %	25 %	78045325
48	NC_007507	TCGA	2	8	19594	19601	25 %	25 %	25 %	25 %	78045325
49	NC_007507	ATCT	2	8	19622	19629	25 %	50 %	0 %	25 %	78045325
50	NC_007507	GCAG	2	8	19660	19667	25 %	0 %	50 %	25 %	78045325
51	NC_007507	ATGG	2	8	22210	22217	25 %	25 %	50 %	0 %	78045327
52	NC_007507	TCGA	2	8	22295	22302	25 %	25 %	25 %	25 %	78045327
53	NC_007507	CTCA	2	8	22606	22613	25 %	25 %	0 %	50 %	78045328
54	NC_007507	TCAA	2	8	22815	22822	50 %	25 %	0 %	25 %	78045328
55	NC_007507	GTTG	2	8	22903	22910	0 %	50 %	50 %	0 %	78045328
56	NC_007507	AGGC	2	8	23405	23412	25 %	0 %	50 %	25 %	78045329
57	NC_007507	ATGG	2	8	23577	23584	25 %	25 %	50 %	0 %	78045329
58	NC_007507	GGCC	2	8	24582	24589	0 %	0 %	50 %	50 %	78045330
59	NC_007507	ACGC	2	8	25056	25063	25 %	0 %	25 %	50 %	78045330
60	NC_007507	GGTC	2	8	26021	26028	0 %	25 %	50 %	25 %	78045331
61	NC_007507	CTGG	2	8	26163	26170	0 %	25 %	50 %	25 %	78045331
62	NC_007507	CGAG	2	8	27208	27215	25 %	0 %	50 %	25 %	78045332
63	NC_007507	AGAC	2	8	27781	27788	50 %	0 %	25 %	25 %	78045333
64	NC_007507	CCTG	2	8	27904	27911	0 %	25 %	25 %	50 %	78045333
65	NC_007507	GATC	2	8	27919	27926	25 %	25 %	25 %	25 %	78045333
66	NC_007507	TGCG	2	8	27954	27961	0 %	25 %	50 %	25 %	78045333
67	NC_007507	TCGC	2	8	27975	27982	0 %	25 %	25 %	50 %	78045333
68	NC_007507	GCCA	2	8	28203	28210	25 %	0 %	25 %	50 %	78045333
69	NC_007507	CAAG	2	8	28228	28235	50 %	0 %	25 %	25 %	78045333
70	NC_007507	TGCG	2	8	29807	29814	0 %	25 %	50 %	25 %	78045335
71	NC_007507	GGCC	2	8	30282	30289	0 %	0 %	50 %	50 %	78045335
72	NC_007507	ATGT	2	8	32915	32922	25 %	50 %	25 %	0 %	78045336
73	NC_007507	AAGG	2	8	33214	33221	50 %	0 %	50 %	0 %	78045336
74	NC_007507	TGAT	2	8	33425	33432	25 %	50 %	25 %	0 %	78045336
75	NC_007507	GCCA	2	8	33433	33440	25 %	0 %	25 %	50 %	78045336
76	NC_007507	CAGA	2	8	34475	34482	50 %	0 %	25 %	25 %	78045336
77	NC_007507	CCTG	2	8	35095	35102	0 %	25 %	25 %	50 %	78045336
78	NC_007507	TTGG	2	8	35452	35459	0 %	50 %	50 %	0 %	78045337
79	NC_007507	ATAA	2	8	36175	36182	75 %	25 %	0 %	0 %	78045338
80	NC_007507	GCAC	2	8	36953	36960	25 %	0 %	25 %	50 %	78045339
81	NC_007507	TCAA	2	8	36981	36988	50 %	25 %	0 %	25 %	78045339
82	NC_007507	GCAC	2	8	36998	37005	25 %	0 %	25 %	50 %	78045339
83	NC_007507	TGGA	2	8	37184	37191	25 %	25 %	50 %	0 %	78045339
84	NC_007507	GCTC	2	8	37289	37296	0 %	25 %	25 %	50 %	78045339
85	NC_007507	AGCA	2	8	37564	37571	50 %	0 %	25 %	25 %	78045340
86	NC_007507	AGCG	2	8	38556	38563	25 %	0 %	50 %	25 %	78045341
87	NC_007507	GGGT	2	8	39095	39102	0 %	25 %	75 %	0 %	78045342
88	NC_007507	GAAG	2	8	39235	39242	50 %	0 %	50 %	0 %	78045342
89	NC_007507	CGCC	2	8	39989	39996	0 %	0 %	25 %	75 %	78045343
90	NC_007507	GCTT	2	8	40288	40295	0 %	50 %	25 %	25 %	78045343
91	NC_007507	CGTC	2	8	40766	40773	0 %	25 %	25 %	50 %	78045343
92	NC_007507	CGAG	2	8	40819	40826	25 %	0 %	50 %	25 %	78045343
93	NC_007507	CGAG	2	8	41304	41311	25 %	0 %	50 %	25 %	78045344
94	NC_007507	TCCA	2	8	41517	41524	25 %	25 %	0 %	50 %	78045345
95	NC_007507	TGCG	2	8	41755	41762	0 %	25 %	50 %	25 %	78045345
96	NC_007507	GAAC	2	8	42125	42132	50 %	0 %	25 %	25 %	78045345
97	NC_007507	TCAA	2	8	42472	42479	50 %	25 %	0 %	25 %	78045345
98	NC_007507	AGGT	2	8	43859	43866	25 %	25 %	50 %	0 %	78045347
99	NC_007507	ACCG	2	8	43974	43981	25 %	0 %	25 %	50 %	78045347
100	NC_007507	TGGC	2	8	44117	44124	0 %	25 %	50 %	25 %	78045347
101	NC_007507	ACGC	2	8	44949	44956	25 %	0 %	25 %	50 %	78045348
102	NC_007507	GCAG	2	8	45430	45437	25 %	0 %	50 %	25 %	78045349
103	NC_007507	TGGA	2	8	46281	46288	25 %	25 %	50 %	0 %	78045350
104	NC_007507	TCGA	2	8	46773	46780	25 %	25 %	25 %	25 %	78045350
105	NC_007507	GTTG	2	8	46925	46932	0 %	50 %	50 %	0 %	78045350
106	NC_007507	CGTC	2	8	47151	47158	0 %	25 %	25 %	50 %	78045351
107	NC_007507	CCAA	2	8	47335	47342	50 %	0 %	0 %	50 %	78045351
108	NC_007507	CAGG	2	8	47843	47850	25 %	0 %	50 %	25 %	78045351
109	NC_007507	AGTA	2	8	47889	47896	50 %	25 %	25 %	0 %	78045351
110	NC_007507	GCCA	2	8	47897	47904	25 %	0 %	25 %	50 %	78045352
111	NC_007507	TGCT	2	8	48078	48085	0 %	50 %	25 %	25 %	78045352
112	NC_007507	CGGG	2	8	48595	48602	0 %	0 %	75 %	25 %	78045352
113	NC_007507	CCGG	2	8	49028	49035	0 %	0 %	50 %	50 %	78045352
114	NC_007507	GAAG	2	8	49295	49302	50 %	0 %	50 %	0 %	78045352
115	NC_007507	GGAA	2	8	49463	49470	50 %	0 %	50 %	0 %	78045352
116	NC_007507	CGTC	2	8	49471	49478	0 %	25 %	25 %	50 %	78045352
117	NC_007507	ACGC	2	8	50253	50260	25 %	0 %	25 %	50 %	78045352
118	NC_007507	GATG	2	8	50417	50424	25 %	25 %	50 %	0 %	78045352
119	NC_007507	TGCT	2	8	50679	50686	0 %	50 %	25 %	25 %	78045353
120	NC_007507	GGAG	2	8	50895	50902	25 %	0 %	75 %	0 %	78045353
121	NC_007507	TCTA	2	8	51017	51024	25 %	50 %	0 %	25 %	78045353
122	NC_007507	GGTA	2	8	51092	51099	25 %	25 %	50 %	0 %	78045354
123	NC_007507	GTTG	2	8	51568	51575	0 %	50 %	50 %	0 %	78045354
124	NC_007507	GCAA	2	8	51644	51651	50 %	0 %	25 %	25 %	78045354
125	NC_007507	AAGC	2	8	52740	52747	50 %	0 %	25 %	25 %	78045356
126	NC_007507	CTGA	2	8	53053	53060	25 %	25 %	25 %	25 %	78045356
127	NC_007507	GAGT	2	8	53583	53590	25 %	25 %	50 %	0 %	78045356
128	NC_007507	GTCG	2	8	53773	53780	0 %	25 %	50 %	25 %	78045357
129	NC_007507	CATT	2	8	54202	54209	25 %	50 %	0 %	25 %	78045357
130	NC_007507	CTCG	2	8	55472	55479	0 %	25 %	25 %	50 %	78045358
131	NC_007507	CTAC	2	8	55746	55753	25 %	25 %	0 %	50 %	78045358
132	NC_007507	AGGC	2	8	57177	57184	25 %	0 %	50 %	25 %	78045359
133	NC_007507	CGAG	2	8	57606	57613	25 %	0 %	50 %	25 %	78045360
134	NC_007507	ATTC	2	8	57678	57685	25 %	50 %	0 %	25 %	78045360
135	NC_007507	CGCC	2	8	57885	57892	0 %	0 %	25 %	75 %	78045360
136	NC_007507	CCAG	2	8	58139	58146	25 %	0 %	25 %	50 %	78045360
137	NC_007507	GCCG	2	8	58659	58666	0 %	0 %	50 %	50 %	78045361
138	NC_007507	AATC	2	8	59293	59300	50 %	25 %	0 %	25 %	78045361
139	NC_007507	CTCC	2	8	59360	59367	0 %	25 %	0 %	75 %	78045361
140	NC_007507	ATCA	2	8	59962	59969	50 %	25 %	0 %	25 %	78045361
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414	NC_007507	GAAG	2	8	181399	181406	50 %	0 %	50 %	0 %	78045481
415	NC_007507	GTGA	2	8	182085	182092	25 %	25 %	50 %	0 %	78045481

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.