MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007507	GTG	2	6	190	195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007507	GCG	2	6	307	312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007507	GAC	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007507	TTG	3	9	370	378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007507	GTG	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007507	GGC	2	6	3044	3049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007507	CCA	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_007507	CAT	2	6	3147	3152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007507	GCG	2	6	3298	3303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007507	TCA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007507	CGG	2	6	3437	3442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007507	ACC	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_007507	GTG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007507	CGG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007507	TGT	2	6	6537	6542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007507	TTG	2	6	9813	9818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007507	CGA	2	6	9823	9828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007507	CGC	2	6	9863	9868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007507	GCG	2	6	9909	9914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007507	GAC	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007507	GAC	2	6	10846	10851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007507	CCG	2	6	11032	11037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007507	TGA	2	6	11091	11096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007507	TCG	2	6	11161	11166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007507	AAT	2	6	11167	11172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007507	CAA	3	9	11182	11190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007507	GCG	2	6	11213	11218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007507	GCT	3	9	11235	11243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007507	GCG	2	6	11246	11251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007507	GCT	2	6	15356	15361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007507	GGT	2	6	15461	15466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007507	AGT	2	6	15539	15544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007507	GCC	2	6	15686	15691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007507	ATG	2	6	15708	15713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007507	GGT	2	6	15729	15734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007507	ACA	2	6	18490	18495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007507	CAG	2	6	18507	18512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007507	CGG	2	6	18695	18700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007507	TCA	2	6	21564	21569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007507	GCA	2	6	21598	21603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007507	CAA	2	6	21858	21863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007507	CGG	2	6	21877	21882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007507	AGT	2	6	21946	21951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007507	GGC	2	6	21973	21978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007507	TTC	2	6	22070	22075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007507	GGA	2	6	22563	22568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007507	TCC	2	6	22579	22584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007507	GAT	2	6	23121	23126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007507	ATT	2	6	23739	23744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007507	TGG	2	6	23746	23751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007507	CCA	2	6	23839	23844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007507	CCG	2	6	24021	24026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007507	GTT	2	6	24028	24033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007507	AGT	2	6	24078	24083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007507	AAC	2	6	24391	24396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007507	CAC	2	6	24398	24403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007507	TCC	2	6	25512	25517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007507	CGT	2	6	25551	25556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007507	GGT	2	6	25608	25613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007507	CGG	2	6	25664	25669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007507	CCA	3	9	25696	25704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007507	AGA	2	6	25751	25756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007507	CGA	2	6	25904	25909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007507	CGC	2	6	26981	26986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_007507	TTC	2	6	27034	27039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007507	CGG	2	6	27111	27116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007507	GAA	2	6	27124	27129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007507	TCA	2	6	28910	28915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007507	TTG	2	6	28919	28924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007507	AAC	2	6	28971	28976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007507	CAC	2	6	28978	28983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007507	GAG	2	6	29012	29017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007507	CAA	2	6	29044	29049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007507	CTT	2	6	29109	29114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007507	CCG	2	6	29159	29164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007507	GGA	2	6	29354	29359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007507	GTT	2	6	30475	30480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007507	TCT	2	6	30613	30618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007507	GCC	2	6	30645	30650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007507	GAC	2	6	30687	30692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007507	TCT	2	6	30703	30708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007507	AAG	2	6	30771	30776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007507	CAA	2	6	30812	30817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007507	AGC	2	6	30825	30830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007507	GAA	2	6	30854	30859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007507	GCA	2	6	30929	30934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007507	AAC	2	6	30954	30959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007507	AAC	2	6	31092	31097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007507	AAC	2	6	31102	31107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007507	AAG	2	6	31213	31218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007507	GCT	2	6	31644	31649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007507	AAG	2	6	31732	31737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007507	ATC	2	6	31901	31906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007507	GGC	2	6	31923	31928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007507	GGC	2	6	32027	32032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007507	GTT	2	6	32069	32074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007507	GTT	2	6	32128	32133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007507	CAG	2	6	32174	32179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007507	CGC	2	6	32199	32204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007507	ACG	2	6	32252	32257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007507	CAG	2	6	38793	38798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007507	CGC	2	6	42927	42932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007507	GTG	2	6	42934	42939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007507	CGT	2	6	43011	43016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007507	TCC	2	6	43221	43226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007507	ATA	2	6	53653	53658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007507	CGA	2	6	54565	54570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007507	CCT	2	6	56568	56573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007507	TAT	2	6	56613	56618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007507	AGC	2	6	62246	62251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007507	TGC	2	6	62268	62273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007507	ATG	2	6	62336	62341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007507	GCG	2	6	62514	62519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007507	AGC	2	6	62548	62553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007507	CAC	2	6	62585	62590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007507	CCA	2	6	62637	62642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_007507	TGC	2	6	64246	64251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007507	TGC	2	6	64485	64490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007507	CCT	2	6	64567	64572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007507	TCA	2	6	64623	64628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007507	TCT	2	6	64749	64754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007507	AAC	2	6	64826	64831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007507	TGC	2	6	64893	64898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007507	CGA	2	6	64909	64914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007507	CAA	2	6	64945	64950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007507	GCG	2	6	64975	64980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007507	GAA	2	6	64996	65001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007507	ACC	5	15	65008	65022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007507	CGA	2	6	65137	65142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007507	GAG	2	6	65149	65154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007507	GGC	2	6	65179	65184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007507	GGC	2	6	65190	65195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007507	GTG	2	6	65294	65299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007507	ACG	2	6	65401	65406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007507	CTG	2	6	65740	65745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007507	GTT	2	6	65816	65821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007507	TCC	2	6	66372	66377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007507	GAA	2	6	67264	67269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007507	AGC	2	6	67313	67318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007507	CGC	2	6	67338	67343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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275	NC_007507	ACC	2	6	172893	172898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_007507	CCG	2	6	176743	176748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_007507	AGT	2	6	176768	176773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_007507	GTC	2	6	176786	176791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_007507	TCG	2	6	176817	176822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_007507	GTT	3	9	176831	176839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007507	CAG	2	6	179923	179928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_007507	CTG	2	6	179929	179934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_007507	TCA	2	6	179991	179996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_007507	CGG	2	6	180070	180075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_007507	ATG	2	6	180129	180134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007507	GCA	2	6	180829	180834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_007507	CAA	2	6	180972	180977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_007507	GTG	2	6	180980	180985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_007507	TCC	2	6	181035	181040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_007507	CAG	2	6	182410	182415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_007507	TTG	2	6	182561	182566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.