MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007507	GA	3	6	1459	1464	50 %	0 %	50 %	0 %	78045310
2	NC_007507	GC	3	6	1907	1912	0 %	0 %	50 %	50 %	78045311
3	NC_007507	GC	3	6	2264	2269	0 %	0 %	50 %	50 %	78045311
4	NC_007507	TC	3	6	2516	2521	0 %	50 %	0 %	50 %	78045311
5	NC_007507	CG	3	6	3059	3064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007507	AG	3	6	4061	4066	50 %	0 %	50 %	0 %	78045312
7	NC_007507	AT	3	6	4780	4785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007507	GC	3	6	4800	4805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007507	GC	3	6	5321	5326	0 %	0 %	50 %	50 %	78045313
10	NC_007507	GC	3	6	5631	5636	0 %	0 %	50 %	50 %	78045313
11	NC_007507	CG	3	6	5736	5741	0 %	0 %	50 %	50 %	78045313
12	NC_007507	CA	3	6	6104	6109	50 %	0 %	0 %	50 %	78045313
13	NC_007507	CG	3	6	6373	6378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007507	AT	3	6	6433	6438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007507	GC	3	6	7166	7171	0 %	0 %	50 %	50 %	78045315
16	NC_007507	CG	3	6	7406	7411	0 %	0 %	50 %	50 %	78045315
17	NC_007507	CA	4	8	7779	7786	50 %	0 %	0 %	50 %	78045315
18	NC_007507	CG	3	6	7999	8004	0 %	0 %	50 %	50 %	78045316
19	NC_007507	CA	3	6	8643	8648	50 %	0 %	0 %	50 %	78045316
20	NC_007507	CG	3	6	8831	8836	0 %	0 %	50 %	50 %	78045316
21	NC_007507	CG	4	8	9099	9106	0 %	0 %	50 %	50 %	78045317
22	NC_007507	GA	3	6	9352	9357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007507	GC	3	6	9887	9892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007507	CG	4	8	10918	10925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007507	AG	3	6	10935	10940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007507	TC	3	6	11306	11311	0 %	50 %	0 %	50 %	78045320
27	NC_007507	GA	3	6	11911	11916	50 %	0 %	50 %	0 %	78045320
28	NC_007507	AC	3	6	13894	13899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007507	GC	3	6	13910	13915	0 %	0 %	50 %	50 %	78045322
30	NC_007507	GC	3	6	14553	14558	0 %	0 %	50 %	50 %	78045322
31	NC_007507	TG	3	6	15873	15878	0 %	50 %	50 %	0 %	78045323
32	NC_007507	CA	3	6	16855	16860	50 %	0 %	0 %	50 %	78045323
33	NC_007507	TC	3	6	17477	17482	0 %	50 %	0 %	50 %	78045324
34	NC_007507	GT	3	6	18042	18047	0 %	50 %	50 %	0 %	78045324
35	NC_007507	GC	3	6	19119	19124	0 %	0 %	50 %	50 %	78045325
36	NC_007507	CA	3	6	19279	19284	50 %	0 %	0 %	50 %	78045325
37	NC_007507	CG	3	6	19304	19309	0 %	0 %	50 %	50 %	78045325
38	NC_007507	TC	4	8	19748	19755	0 %	50 %	0 %	50 %	78045325
39	NC_007507	GC	3	6	20553	20558	0 %	0 %	50 %	50 %	78045326
40	NC_007507	GC	3	6	21457	21462	0 %	0 %	50 %	50 %	78045326
41	NC_007507	CG	3	6	22089	22094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007507	GC	3	6	22391	22396	0 %	0 %	50 %	50 %	78045327
43	NC_007507	TG	3	6	22522	22527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007507	GA	3	6	23130	23135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007507	CT	3	6	23223	23228	0 %	50 %	0 %	50 %	78045329
46	NC_007507	CG	3	6	24794	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	78045330
47	NC_007507	GC	3	6	24828	24833	0 %	0 %	50 %	50 %	78045330
48	NC_007507	GC	3	6	25250	25255	0 %	0 %	50 %	50 %	78045330
49	NC_007507	CG	3	6	25710	25715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007507	AT	3	6	25718	25723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007507	GC	3	6	26065	26070	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
52	NC_007507	CG	3	6	26295	26300	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
53	NC_007507	CG	3	6	26320	26325	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
54	NC_007507	CG	3	6	26664	26669	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
55	NC_007507	CG	3	6	26851	26856	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
56	NC_007507	AG	4	8	27214	27221	50 %	0 %	50 %	0 %	78045332
57	NC_007507	GC	3	6	27307	27312	0 %	0 %	50 %	50 %	78045332
58	NC_007507	GC	3	6	28251	28256	0 %	0 %	50 %	50 %	78045333
59	NC_007507	CA	3	6	28324	28329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007507	GA	3	6	29204	29209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007507	CG	3	6	29615	29620	0 %	0 %	50 %	50 %	78045335
62	NC_007507	GC	3	6	30038	30043	0 %	0 %	50 %	50 %	78045335
63	NC_007507	CG	3	6	30072	30077	0 %	0 %	50 %	50 %	78045335
64	NC_007507	AG	3	6	30506	30511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007507	TG	3	6	31519	31524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007507	TG	3	6	31832	31837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007507	GT	3	6	33606	33611	0 %	50 %	50 %	0 %	78045336
68	NC_007507	GC	3	6	33639	33644	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
69	NC_007507	GC	3	6	33935	33940	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
70	NC_007507	GC	3	6	33966	33971	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
71	NC_007507	GC	5	10	34749	34758	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
72	NC_007507	GC	3	6	35136	35141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007507	CG	3	6	35369	35374	0 %	0 %	50 %	50 %	78045337
74	NC_007507	CG	4	8	36002	36009	0 %	0 %	50 %	50 %	78045338
75	NC_007507	AG	3	6	37196	37201	50 %	0 %	50 %	0 %	78045339
76	NC_007507	TC	3	6	37203	37208	0 %	50 %	0 %	50 %	78045339
77	NC_007507	GC	3	6	37310	37315	0 %	0 %	50 %	50 %	78045339
78	NC_007507	CG	3	6	37965	37970	0 %	0 %	50 %	50 %	78045340
79	NC_007507	CA	3	6	38264	38269	50 %	0 %	0 %	50 %	78045341
80	NC_007507	GC	3	6	38805	38810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007507	AT	3	6	39303	39308	50 %	50 %	0 %	0 %	78045342
82	NC_007507	GT	3	6	40584	40589	0 %	50 %	50 %	0 %	78045343
83	NC_007507	GC	3	6	41453	41458	0 %	0 %	50 %	50 %	78045345
84	NC_007507	GC	3	6	42223	42228	0 %	0 %	50 %	50 %	78045345
85	NC_007507	CG	3	6	42720	42725	0 %	0 %	50 %	50 %	78045345
86	NC_007507	AG	3	6	43144	43149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007507	CT	3	6	43486	43491	0 %	50 %	0 %	50 %	78045346
88	NC_007507	AC	3	6	44220	44225	50 %	0 %	0 %	50 %	78045347
89	NC_007507	AG	3	6	44249	44254	50 %	0 %	50 %	0 %	78045347
90	NC_007507	TC	3	6	44460	44465	0 %	50 %	0 %	50 %	78045347
91	NC_007507	CG	3	6	44897	44902	0 %	0 %	50 %	50 %	78045348
92	NC_007507	GC	3	6	45003	45008	0 %	0 %	50 %	50 %	78045348
93	NC_007507	TG	3	6	45338	45343	0 %	50 %	50 %	0 %	78045349
94	NC_007507	GC	3	6	45464	45469	0 %	0 %	50 %	50 %	78045349
95	NC_007507	CG	3	6	46464	46469	0 %	0 %	50 %	50 %	78045350
96	NC_007507	TG	3	6	46964	46969	0 %	50 %	50 %	0 %	78045350
97	NC_007507	TG	3	6	46990	46995	0 %	50 %	50 %	0 %	78045350
98	NC_007507	GC	3	6	49680	49685	0 %	0 %	50 %	50 %	78045352
99	NC_007507	GT	3	6	49830	49835	0 %	50 %	50 %	0 %	78045352
100	NC_007507	CG	3	6	50562	50567	0 %	0 %	50 %	50 %	78045353
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102	NC_007507	GC	3	6	51233	51238	0 %	0 %	50 %	50 %	78045354
103	NC_007507	CA	3	6	51398	51403	50 %	0 %	0 %	50 %	78045354
104	NC_007507	CT	3	6	51588	51593	0 %	50 %	0 %	50 %	78045354
105	NC_007507	TC	3	6	51911	51916	0 %	50 %	0 %	50 %	78045355
106	NC_007507	GC	3	6	53068	53073	0 %	0 %	50 %	50 %	78045356
107	NC_007507	AG	3	6	53151	53156	50 %	0 %	50 %	0 %	78045356
108	NC_007507	CG	3	6	53334	53339	0 %	0 %	50 %	50 %	78045356
109	NC_007507	CG	3	6	54398	54403	0 %	0 %	50 %	50 %	78045357
110	NC_007507	CA	3	6	55255	55260	50 %	0 %	0 %	50 %	78045358
111	NC_007507	CG	3	6	55786	55791	0 %	0 %	50 %	50 %	78045358
112	NC_007507	AT	3	6	56602	56607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007507	CG	3	6	57509	57514	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
114	NC_007507	CG	3	6	57533	57538	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
115	NC_007507	AG	3	6	57758	57763	50 %	0 %	50 %	0 %	78045360
116	NC_007507	CG	4	8	57813	57820	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
117	NC_007507	GC	3	6	57827	57832	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
118	NC_007507	CG	3	6	57927	57932	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
119	NC_007507	CA	5	10	57984	57993	50 %	0 %	0 %	50 %	78045360
120	NC_007507	GA	3	6	58978	58983	50 %	0 %	50 %	0 %	78045361
121	NC_007507	AC	3	6	59875	59880	50 %	0 %	0 %	50 %	78045361
122	NC_007507	GC	3	6	60703	60708	0 %	0 %	50 %	50 %	78045361
123	NC_007507	GC	3	6	60958	60963	0 %	0 %	50 %	50 %	78045361
124	NC_007507	CT	3	6	61060	61065	0 %	50 %	0 %	50 %	78045361
125	NC_007507	CG	5	10	61315	61324	0 %	0 %	50 %	50 %	78045362
126	NC_007507	CG	3	6	61520	61525	0 %	0 %	50 %	50 %	78045362
127	NC_007507	GC	3	6	61651	61656	0 %	0 %	50 %	50 %	78045362
128	NC_007507	CG	3	6	62218	62223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007507	CA	3	6	62370	62375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007507	CA	3	6	62608	62613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007507	CG	3	6	63526	63531	0 %	0 %	50 %	50 %	78045363
132	NC_007507	AC	3	6	63833	63838	50 %	0 %	0 %	50 %	78045363
133	NC_007507	CG	3	6	64558	64563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007507	GA	3	6	66097	66102	50 %	0 %	50 %	0 %	78045364
135	NC_007507	CG	3	6	66855	66860	0 %	0 %	50 %	50 %	78045365
136	NC_007507	GC	3	6	66980	66985	0 %	0 %	50 %	50 %	78045365
137	NC_007507	GA	3	6	67413	67418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007507	AG	4	8	67464	67471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007507	TC	3	6	67575	67580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007507	CT	3	6	67936	67941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_007507	CT	3	6	68709	68714	0 %	50 %	0 %	50 %	78045367
142	NC_007507	CT	3	6	68753	68758	0 %	50 %	0 %	50 %	78045367
143	NC_007507	TC	3	6	68794	68799	0 %	50 %	0 %	50 %	78045367
144	NC_007507	AG	3	6	68837	68842	50 %	0 %	50 %	0 %	78045367
145	NC_007507	GC	3	6	68909	68914	0 %	0 %	50 %	50 %	78045367
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147	NC_007507	CG	3	6	70467	70472	0 %	0 %	50 %	50 %	78045370
148	NC_007507	GC	3	6	70712	70717	0 %	0 %	50 %	50 %	78045370
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.