MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV183

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007507	GA	3	6	1459	1464	50 %	0 %	50 %	0 %	78045310
2	NC_007507	GC	3	6	1907	1912	0 %	0 %	50 %	50 %	78045311
3	NC_007507	GC	3	6	2264	2269	0 %	0 %	50 %	50 %	78045311
4	NC_007507	TC	3	6	2516	2521	0 %	50 %	0 %	50 %	78045311
5	NC_007507	AG	3	6	4061	4066	50 %	0 %	50 %	0 %	78045312
6	NC_007507	GC	3	6	5321	5326	0 %	0 %	50 %	50 %	78045313
7	NC_007507	GC	3	6	5631	5636	0 %	0 %	50 %	50 %	78045313
8	NC_007507	CG	3	6	5736	5741	0 %	0 %	50 %	50 %	78045313
9	NC_007507	CA	3	6	6104	6109	50 %	0 %	0 %	50 %	78045313
10	NC_007507	GC	3	6	7166	7171	0 %	0 %	50 %	50 %	78045315
11	NC_007507	CG	3	6	7406	7411	0 %	0 %	50 %	50 %	78045315
12	NC_007507	CA	4	8	7779	7786	50 %	0 %	0 %	50 %	78045315
13	NC_007507	CG	3	6	7999	8004	0 %	0 %	50 %	50 %	78045316
14	NC_007507	CA	3	6	8643	8648	50 %	0 %	0 %	50 %	78045316
15	NC_007507	CG	3	6	8831	8836	0 %	0 %	50 %	50 %	78045316
16	NC_007507	CG	4	8	9099	9106	0 %	0 %	50 %	50 %	78045317
17	NC_007507	TC	3	6	11306	11311	0 %	50 %	0 %	50 %	78045320
18	NC_007507	GA	3	6	11911	11916	50 %	0 %	50 %	0 %	78045320
19	NC_007507	GC	3	6	13910	13915	0 %	0 %	50 %	50 %	78045322
20	NC_007507	GC	3	6	14553	14558	0 %	0 %	50 %	50 %	78045322
21	NC_007507	TG	3	6	15873	15878	0 %	50 %	50 %	0 %	78045323
22	NC_007507	CA	3	6	16855	16860	50 %	0 %	0 %	50 %	78045323
23	NC_007507	TC	3	6	17477	17482	0 %	50 %	0 %	50 %	78045324
24	NC_007507	GT	3	6	18042	18047	0 %	50 %	50 %	0 %	78045324
25	NC_007507	GC	3	6	19119	19124	0 %	0 %	50 %	50 %	78045325
26	NC_007507	CA	3	6	19279	19284	50 %	0 %	0 %	50 %	78045325
27	NC_007507	CG	3	6	19304	19309	0 %	0 %	50 %	50 %	78045325
28	NC_007507	TC	4	8	19748	19755	0 %	50 %	0 %	50 %	78045325
29	NC_007507	GC	3	6	20553	20558	0 %	0 %	50 %	50 %	78045326
30	NC_007507	GC	3	6	21457	21462	0 %	0 %	50 %	50 %	78045326
31	NC_007507	GC	3	6	22391	22396	0 %	0 %	50 %	50 %	78045327
32	NC_007507	CT	3	6	23223	23228	0 %	50 %	0 %	50 %	78045329
33	NC_007507	CG	3	6	24794	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	78045330
34	NC_007507	GC	3	6	24828	24833	0 %	0 %	50 %	50 %	78045330
35	NC_007507	GC	3	6	25250	25255	0 %	0 %	50 %	50 %	78045330
36	NC_007507	GC	3	6	26065	26070	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
37	NC_007507	CG	3	6	26295	26300	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
38	NC_007507	CG	3	6	26320	26325	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
39	NC_007507	CG	3	6	26664	26669	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
40	NC_007507	CG	3	6	26851	26856	0 %	0 %	50 %	50 %	78045331
41	NC_007507	AG	4	8	27214	27221	50 %	0 %	50 %	0 %	78045332
42	NC_007507	GC	3	6	27307	27312	0 %	0 %	50 %	50 %	78045332
43	NC_007507	GC	3	6	28251	28256	0 %	0 %	50 %	50 %	78045333
44	NC_007507	CG	3	6	29615	29620	0 %	0 %	50 %	50 %	78045335
45	NC_007507	GC	3	6	30038	30043	0 %	0 %	50 %	50 %	78045335
46	NC_007507	CG	3	6	30072	30077	0 %	0 %	50 %	50 %	78045335
47	NC_007507	GT	3	6	33606	33611	0 %	50 %	50 %	0 %	78045336
48	NC_007507	GC	3	6	33639	33644	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
49	NC_007507	GC	3	6	33935	33940	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
50	NC_007507	GC	3	6	33966	33971	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
51	NC_007507	GC	5	10	34749	34758	0 %	0 %	50 %	50 %	78045336
52	NC_007507	CG	3	6	35369	35374	0 %	0 %	50 %	50 %	78045337
53	NC_007507	CG	4	8	36002	36009	0 %	0 %	50 %	50 %	78045338
54	NC_007507	AG	3	6	37196	37201	50 %	0 %	50 %	0 %	78045339
55	NC_007507	TC	3	6	37203	37208	0 %	50 %	0 %	50 %	78045339
56	NC_007507	GC	3	6	37310	37315	0 %	0 %	50 %	50 %	78045339
57	NC_007507	CG	3	6	37965	37970	0 %	0 %	50 %	50 %	78045340
58	NC_007507	CA	3	6	38264	38269	50 %	0 %	0 %	50 %	78045341
59	NC_007507	AT	3	6	39303	39308	50 %	50 %	0 %	0 %	78045342
60	NC_007507	GT	3	6	40584	40589	0 %	50 %	50 %	0 %	78045343
61	NC_007507	GC	3	6	41453	41458	0 %	0 %	50 %	50 %	78045345
62	NC_007507	GC	3	6	42223	42228	0 %	0 %	50 %	50 %	78045345
63	NC_007507	CG	3	6	42720	42725	0 %	0 %	50 %	50 %	78045345
64	NC_007507	CT	3	6	43486	43491	0 %	50 %	0 %	50 %	78045346
65	NC_007507	AC	3	6	44220	44225	50 %	0 %	0 %	50 %	78045347
66	NC_007507	AG	3	6	44249	44254	50 %	0 %	50 %	0 %	78045347
67	NC_007507	TC	3	6	44460	44465	0 %	50 %	0 %	50 %	78045347
68	NC_007507	CG	3	6	44897	44902	0 %	0 %	50 %	50 %	78045348
69	NC_007507	GC	3	6	45003	45008	0 %	0 %	50 %	50 %	78045348
70	NC_007507	TG	3	6	45338	45343	0 %	50 %	50 %	0 %	78045349
71	NC_007507	GC	3	6	45464	45469	0 %	0 %	50 %	50 %	78045349
72	NC_007507	CG	3	6	46464	46469	0 %	0 %	50 %	50 %	78045350
73	NC_007507	TG	3	6	46964	46969	0 %	50 %	50 %	0 %	78045350
74	NC_007507	TG	3	6	46990	46995	0 %	50 %	50 %	0 %	78045350
75	NC_007507	GC	3	6	49680	49685	0 %	0 %	50 %	50 %	78045352
76	NC_007507	GT	3	6	49830	49835	0 %	50 %	50 %	0 %	78045352
77	NC_007507	CG	3	6	50562	50567	0 %	0 %	50 %	50 %	78045353
78	NC_007507	GA	3	6	50742	50747	50 %	0 %	50 %	0 %	78045353
79	NC_007507	GC	3	6	51233	51238	0 %	0 %	50 %	50 %	78045354
80	NC_007507	CA	3	6	51398	51403	50 %	0 %	0 %	50 %	78045354
81	NC_007507	CT	3	6	51588	51593	0 %	50 %	0 %	50 %	78045354
82	NC_007507	TC	3	6	51911	51916	0 %	50 %	0 %	50 %	78045355
83	NC_007507	GC	3	6	53068	53073	0 %	0 %	50 %	50 %	78045356
84	NC_007507	AG	3	6	53151	53156	50 %	0 %	50 %	0 %	78045356
85	NC_007507	CG	3	6	53334	53339	0 %	0 %	50 %	50 %	78045356
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88	NC_007507	CG	3	6	55786	55791	0 %	0 %	50 %	50 %	78045358
89	NC_007507	CG	3	6	57509	57514	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
90	NC_007507	CG	3	6	57533	57538	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
91	NC_007507	AG	3	6	57758	57763	50 %	0 %	50 %	0 %	78045360
92	NC_007507	CG	4	8	57813	57820	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
93	NC_007507	GC	3	6	57827	57832	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
94	NC_007507	CG	3	6	57927	57932	0 %	0 %	50 %	50 %	78045360
95	NC_007507	CA	5	10	57984	57993	50 %	0 %	0 %	50 %	78045360
96	NC_007507	GA	3	6	58978	58983	50 %	0 %	50 %	0 %	78045361
97	NC_007507	AC	3	6	59875	59880	50 %	0 %	0 %	50 %	78045361
98	NC_007507	GC	3	6	60703	60708	0 %	0 %	50 %	50 %	78045361
99	NC_007507	GC	3	6	60958	60963	0 %	0 %	50 %	50 %	78045361
100	NC_007507	CT	3	6	61060	61065	0 %	50 %	0 %	50 %	78045361
101	NC_007507	CG	5	10	61315	61324	0 %	0 %	50 %	50 %	78045362
102	NC_007507	CG	3	6	61520	61525	0 %	0 %	50 %	50 %	78045362
103	NC_007507	GC	3	6	61651	61656	0 %	0 %	50 %	50 %	78045362
104	NC_007507	CG	3	6	63526	63531	0 %	0 %	50 %	50 %	78045363
105	NC_007507	AC	3	6	63833	63838	50 %	0 %	0 %	50 %	78045363
106	NC_007507	GA	3	6	66097	66102	50 %	0 %	50 %	0 %	78045364
107	NC_007507	CG	3	6	66855	66860	0 %	0 %	50 %	50 %	78045365
108	NC_007507	GC	3	6	66980	66985	0 %	0 %	50 %	50 %	78045365
109	NC_007507	CT	3	6	68709	68714	0 %	50 %	0 %	50 %	78045367
110	NC_007507	CT	3	6	68753	68758	0 %	50 %	0 %	50 %	78045367
111	NC_007507	TC	3	6	68794	68799	0 %	50 %	0 %	50 %	78045367
112	NC_007507	AG	3	6	68837	68842	50 %	0 %	50 %	0 %	78045367
113	NC_007507	GC	3	6	68909	68914	0 %	0 %	50 %	50 %	78045367
114	NC_007507	GC	3	6	69388	69393	0 %	0 %	50 %	50 %	78045369
115	NC_007507	CG	3	6	70467	70472	0 %	0 %	50 %	50 %	78045370
116	NC_007507	GC	3	6	70712	70717	0 %	0 %	50 %	50 %	78045370
117	NC_007507	CA	3	6	71069	71074	50 %	0 %	0 %	50 %	78045370
118	NC_007507	GC	3	6	72260	72265	0 %	0 %	50 %	50 %	78045370
119	NC_007507	CT	3	6	72386	72391	0 %	50 %	0 %	50 %	78045370
120	NC_007507	CT	3	6	72711	72716	0 %	50 %	0 %	50 %	78045371
121	NC_007507	GC	3	6	73829	73834	0 %	0 %	50 %	50 %	78045373
122	NC_007507	TG	3	6	73836	73841	0 %	50 %	50 %	0 %	78045373
123	NC_007507	GC	3	6	74900	74905	0 %	0 %	50 %	50 %	78045375
124	NC_007507	GC	3	6	76887	76892	0 %	0 %	50 %	50 %	78045379
125	NC_007507	GC	3	6	78491	78496	0 %	0 %	50 %	50 %	78045380
126	NC_007507	GA	3	6	79087	79092	50 %	0 %	50 %	0 %	78045381
127	NC_007507	CG	3	6	79152	79157	0 %	0 %	50 %	50 %	78045381
128	NC_007507	GC	4	8	79318	79325	0 %	0 %	50 %	50 %	78045381
129	NC_007507	GC	3	6	79979	79984	0 %	0 %	50 %	50 %	78045381
130	NC_007507	CG	3	6	79998	80003	0 %	0 %	50 %	50 %	78045381
131	NC_007507	AC	3	6	80227	80232	50 %	0 %	0 %	50 %	78045381
132	NC_007507	CA	3	6	80413	80418	50 %	0 %	0 %	50 %	78045382
133	NC_007507	CG	3	6	80963	80968	0 %	0 %	50 %	50 %	78045382
134	NC_007507	CG	3	6	81252	81257	0 %	0 %	50 %	50 %	78045382
135	NC_007507	CG	3	6	81631	81636	0 %	0 %	50 %	50 %	78045382
136	NC_007507	CG	3	6	82240	82245	0 %	0 %	50 %	50 %	78045383
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138	NC_007507	CG	3	6	83401	83406	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
139	NC_007507	CG	3	6	83444	83449	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
140	NC_007507	CG	3	6	83533	83538	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
141	NC_007507	CG	3	6	83933	83938	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
142	NC_007507	GC	3	6	84336	84341	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
143	NC_007507	GC	3	6	84490	84495	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
144	NC_007507	CG	3	6	84988	84993	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
145	NC_007507	CG	3	6	85041	85046	0 %	0 %	50 %	50 %	78045384
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.