MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV38

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007506	GGTTC	2	10	2881	2890	0 %	40 %	40 %	20 %	78045267
2	NC_007506	GCGCT	2	10	3669	3678	0 %	20 %	40 %	40 %	78045269
3	NC_007506	GTGGC	2	10	3707	3716	0 %	20 %	60 %	20 %	78045269
4	NC_007506	CCGAG	2	10	5929	5938	20 %	0 %	40 %	40 %	78045273
5	NC_007506	GCTGC	2	10	8905	8914	0 %	20 %	40 %	40 %	78045275
6	NC_007506	CGGGT	2	10	11154	11163	0 %	20 %	60 %	20 %	78045279
7	NC_007506	GGTCA	2	10	13229	13238	20 %	20 %	40 %	20 %	78045283
8	NC_007506	GCGAT	2	10	14148	14157	20 %	20 %	40 %	20 %	78045284
9	NC_007506	CCACA	2	10	20816	20825	40 %	0 %	0 %	60 %	78045291
10	NC_007506	TCACG	2	10	22876	22885	20 %	20 %	20 %	40 %	78045293
11	NC_007506	GATTT	2	10	24532	24541	20 %	60 %	20 %	0 %	78045295
12	NC_007506	CGCCA	2	10	24553	24562	20 %	0 %	20 %	60 %	78045295
13	NC_007506	TCGCG	2	10	25275	25284	0 %	20 %	40 %	40 %	78045296
14	NC_007506	TGCGC	2	10	25468	25477	0 %	20 %	40 %	40 %	78045296
15	NC_007506	AATCG	2	10	25679	25688	40 %	20 %	20 %	20 %	78045296
16	NC_007506	ATCGC	2	10	26825	26834	20 %	20 %	20 %	40 %	78045298
17	NC_007506	TTTGC	2	10	27875	27884	0 %	60 %	20 %	20 %	78045299
18	NC_007506	CCAAG	2	10	29237	29246	40 %	0 %	20 %	40 %	78045301
19	NC_007506	TGCGG	2	10	34189	34198	0 %	20 %	60 %	20 %	78045305
20	NC_007506	CGATG	2	10	34907	34916	20 %	20 %	40 %	20 %	78045306
21	NC_007506	GCCGA	2	10	34949	34958	20 %	0 %	40 %	40 %	78045306

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.