MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV38

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007506	GACC	2	8	188	195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007506	CAAT	2	8	375	382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007506	CCGC	2	8	432	439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_007506	ACCG	2	8	1283	1290	25 %	0 %	25 %	50 %	78045266
5	NC_007506	GCCG	2	8	1357	1364	0 %	0 %	50 %	50 %	78045266
6	NC_007506	GCTC	2	8	1684	1691	0 %	25 %	25 %	50 %	78045266
7	NC_007506	GGCG	2	8	1784	1791	0 %	0 %	75 %	25 %	78045266
8	NC_007506	GTAT	2	8	3498	3505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007506	CAGC	2	8	3617	3624	25 %	0 %	25 %	50 %	78045269
10	NC_007506	GCGG	2	8	3688	3695	0 %	0 %	75 %	25 %	78045269
11	NC_007506	ACCG	2	8	4133	4140	25 %	0 %	25 %	50 %	78045270
12	NC_007506	TTGC	2	8	4238	4245	0 %	50 %	25 %	25 %	78045270
13	NC_007506	CTAT	2	8	4468	4475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007506	CCTA	2	8	4564	4571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007506	CAAA	2	8	4911	4918	75 %	0 %	0 %	25 %	78045271
16	NC_007506	GGCT	2	8	5219	5226	0 %	25 %	50 %	25 %	78045272
17	NC_007506	CGCC	2	8	5581	5588	0 %	0 %	25 %	75 %	78045272
18	NC_007506	TTTG	2	8	5677	5684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007506	AAAC	2	8	5742	5749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007506	GCCG	2	8	5961	5968	0 %	0 %	50 %	50 %	78045273
21	NC_007506	GTTC	2	8	6705	6712	0 %	50 %	25 %	25 %	78045273
22	NC_007506	CAGG	2	8	7113	7120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007506	CGGC	2	8	7337	7344	0 %	0 %	50 %	50 %	78045274
24	NC_007506	GAAG	2	8	7749	7756	50 %	0 %	50 %	0 %	78045274
25	NC_007506	TGGC	2	8	7768	7775	0 %	25 %	50 %	25 %	78045274
26	NC_007506	TCAA	2	8	8422	8429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007506	CCAG	2	8	8844	8851	25 %	0 %	25 %	50 %	78045275
28	NC_007506	TCAG	2	8	8964	8971	25 %	25 %	25 %	25 %	78045275
29	NC_007506	GCCG	2	8	9032	9039	0 %	0 %	50 %	50 %	78045275
30	NC_007506	TGCT	2	8	9083	9090	0 %	50 %	25 %	25 %	78045275
31	NC_007506	TTGG	2	8	9810	9817	0 %	50 %	50 %	0 %	78045277
32	NC_007506	CTTT	2	8	11098	11105	0 %	75 %	0 %	25 %	78045279
33	NC_007506	CCGA	2	8	12098	12105	25 %	0 %	25 %	50 %	78045280
34	NC_007506	GCCG	2	8	12252	12259	0 %	0 %	50 %	50 %	78045280
35	NC_007506	TCGC	2	8	12579	12586	0 %	25 %	25 %	50 %	78045281
36	NC_007506	GATG	2	8	12777	12784	25 %	25 %	50 %	0 %	78045282
37	NC_007506	GCTG	2	8	14584	14591	0 %	25 %	50 %	25 %	78045286
38	NC_007506	GATC	2	8	15201	15208	25 %	25 %	25 %	25 %	78045286
39	NC_007506	TCGT	2	8	15676	15683	0 %	50 %	25 %	25 %	78045286
40	NC_007506	GCCG	2	8	15684	15691	0 %	0 %	50 %	50 %	78045286
41	NC_007506	GCGA	2	8	15850	15857	25 %	0 %	50 %	25 %	78045286
42	NC_007506	CGAC	2	8	16332	16339	25 %	0 %	25 %	50 %	78045287
43	NC_007506	AGGC	2	8	17022	17029	25 %	0 %	50 %	25 %	78045287
44	NC_007506	GCCG	2	8	17431	17438	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
45	NC_007506	CTTG	2	8	17932	17939	0 %	50 %	25 %	25 %	78045287
46	NC_007506	GTCG	2	8	18544	18551	0 %	25 %	50 %	25 %	78045287
47	NC_007506	GCCG	2	8	18889	18896	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
48	NC_007506	GAAA	2	8	19056	19063	75 %	0 %	25 %	0 %	78045287
49	NC_007506	CCAT	2	8	19496	19503	25 %	25 %	0 %	50 %	78045289
50	NC_007506	TGGA	2	8	20238	20245	25 %	25 %	50 %	0 %	78045290
51	NC_007506	TCGC	2	8	20397	20404	0 %	25 %	25 %	50 %	78045290
52	NC_007506	GGCC	2	8	21262	21269	0 %	0 %	50 %	50 %	78045291
53	NC_007506	CCGA	2	8	21486	21493	25 %	0 %	25 %	50 %	78045292
54	NC_007506	CTCG	2	8	22078	22085	0 %	25 %	25 %	50 %	78045293
55	NC_007506	CGAC	2	8	22177	22184	25 %	0 %	25 %	50 %	78045293
56	NC_007506	CGGC	2	8	22312	22319	0 %	0 %	50 %	50 %	78045293
57	NC_007506	CGGC	2	8	23042	23049	0 %	0 %	50 %	50 %	78045294
58	NC_007506	TCTT	2	8	23785	23792	0 %	75 %	0 %	25 %	78045294
59	NC_007506	GCCG	2	8	24019	24026	0 %	0 %	50 %	50 %	78045295
60	NC_007506	GCCG	2	8	24241	24248	0 %	0 %	50 %	50 %	78045295
61	NC_007506	CCGG	2	8	24297	24304	0 %	0 %	50 %	50 %	78045295
62	NC_007506	CGGC	2	8	24840	24847	0 %	0 %	50 %	50 %	78045295
63	NC_007506	CTTG	2	8	26536	26543	0 %	50 %	25 %	25 %	78045297
64	NC_007506	CCGC	2	8	26684	26691	0 %	0 %	25 %	75 %	78045298
65	NC_007506	CCGC	2	8	27612	27619	0 %	0 %	25 %	75 %	78045299
66	NC_007506	CGCA	2	8	27918	27925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007506	GGCG	2	8	28981	28988	0 %	0 %	75 %	25 %	78045301
68	NC_007506	GAGC	2	8	29982	29989	25 %	0 %	50 %	25 %	78045302
69	NC_007506	TCAG	2	8	30661	30668	25 %	25 %	25 %	25 %	78045302
70	NC_007506	AGCG	2	8	30952	30959	25 %	0 %	50 %	25 %	78045302
71	NC_007506	GGGC	2	8	31329	31336	0 %	0 %	75 %	25 %	78045302
72	NC_007506	CACG	2	8	31745	31752	25 %	0 %	25 %	50 %	78045302
73	NC_007506	CCAG	2	8	32000	32007	25 %	0 %	25 %	50 %	78045302
74	NC_007506	CGGA	2	8	33067	33074	25 %	0 %	50 %	25 %	78045304
75	NC_007506	CTCA	2	8	33540	33547	25 %	25 %	0 %	50 %	78045305
76	NC_007506	GTCG	2	8	33825	33832	0 %	25 %	50 %	25 %	78045305
77	NC_007506	ACAA	2	8	33914	33921	75 %	0 %	0 %	25 %	78045305
78	NC_007506	TCGA	2	8	34048	34055	25 %	25 %	25 %	25 %	78045305
79	NC_007506	CACG	2	8	34622	34629	25 %	0 %	25 %	50 %	78045306
80	NC_007506	CGGT	2	8	36010	36017	0 %	25 %	50 %	25 %	78045306

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.