MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV38

Total Repeats: 515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007506	CAG	2	6	1246	1251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045266
2	NC_007506	AAG	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045266
3	NC_007506	GAA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045266
4	NC_007506	GTT	2	6	1520	1525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045266
5	NC_007506	GCT	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045266
6	NC_007506	GCG	2	6	1594	1599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
7	NC_007506	AGC	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045266
8	NC_007506	ATG	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045266
9	NC_007506	CCA	2	6	1723	1728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045266
10	NC_007506	GCG	2	6	1736	1741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
11	NC_007506	GGC	2	6	1761	1766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
12	NC_007506	TGG	2	6	1825	1830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045266
13	NC_007506	CAC	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045266
14	NC_007506	GCG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
15	NC_007506	CAG	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045267
16	NC_007506	TCA	2	6	2781	2786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045267
17	NC_007506	GGC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045267
18	NC_007506	CCA	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045267
19	NC_007506	ACG	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045267
20	NC_007506	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045268
21	NC_007506	GGC	2	6	3699	3704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045269
22	NC_007506	GGC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045269
23	NC_007506	CCT	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045270
24	NC_007506	GAA	2	6	3851	3856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045270
25	NC_007506	GGC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045270
26	NC_007506	CAG	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
27	NC_007506	ACG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
28	NC_007506	GGT	3	9	4277	4285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045270
29	NC_007506	ACG	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
30	NC_007506	TGC	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045270
31	NC_007506	CAG	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
32	NC_007506	CGG	2	6	4405	4410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045270
33	NC_007506	CGC	2	6	4426	4431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045270
34	NC_007506	GAT	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045271
35	NC_007506	CTC	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045271
36	NC_007506	CAG	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045271
37	NC_007506	GCC	2	6	4752	4757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045271
38	NC_007506	CTG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045271
39	NC_007506	CCG	2	6	4804	4809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045271
40	NC_007506	CCG	2	6	4831	4836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045271
41	NC_007506	GTT	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045271
42	NC_007506	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78045271
43	NC_007506	TAT	3	9	4899	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78045271
44	NC_007506	GGC	2	6	5039	5044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045272
45	NC_007506	ACG	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
46	NC_007506	GGC	2	6	5086	5091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045272
47	NC_007506	CAG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
48	NC_007506	TGG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045272
49	NC_007506	CAG	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
50	NC_007506	GCC	2	6	5178	5183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
51	NC_007506	CGC	2	6	5189	5194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
52	NC_007506	GCC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
53	NC_007506	CAG	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
54	NC_007506	GCA	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
55	NC_007506	GCC	2	6	5367	5372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
56	NC_007506	TGG	2	6	5407	5412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045272
57	NC_007506	CAG	2	6	5418	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
58	NC_007506	CGC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
59	NC_007506	AGC	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
60	NC_007506	CGC	2	6	5531	5536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
61	NC_007506	GCC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
62	NC_007506	ACC	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045273
63	NC_007506	ACT	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045273
64	NC_007506	CGA	2	6	6087	6092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045273
65	NC_007506	GCA	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045273
66	NC_007506	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045273
67	NC_007506	GCC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045273
68	NC_007506	GCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045273
69	NC_007506	GTG	2	6	6332	6337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045273
70	NC_007506	GCA	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045273
71	NC_007506	GGC	3	9	6427	6435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045273
72	NC_007506	GGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045273
73	NC_007506	CGA	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045273
74	NC_007506	AGC	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045273
75	NC_007506	GGC	2	6	6728	6733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045273
76	NC_007506	CGA	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045274
77	NC_007506	GCT	2	6	7179	7184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045274
78	NC_007506	AGC	2	6	7186	7191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045274
79	NC_007506	AGC	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045274
80	NC_007506	TGG	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045274
81	NC_007506	GGA	2	6	7542	7547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045274
82	NC_007506	GTC	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045274
83	NC_007506	GAG	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045274
84	NC_007506	GCG	2	6	7742	7747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045274
85	NC_007506	ACC	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045274
86	NC_007506	CGC	2	6	7972	7977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045274
87	NC_007506	GCC	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045274
88	NC_007506	GAG	2	6	8026	8031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045274
89	NC_007506	GGC	2	6	8099	8104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045274
90	NC_007506	TTC	2	6	8128	8133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045274
91	NC_007506	CGA	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045274
92	NC_007506	TGA	2	6	8249	8254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045274
93	NC_007506	GCC	2	6	8813	8818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045275
94	NC_007506	CAC	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045275
95	NC_007506	CAG	3	9	8849	8857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045275
96	NC_007506	CCG	2	6	8864	8869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045275
97	NC_007506	CGA	2	6	8899	8904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045275
98	NC_007506	GGC	2	6	9014	9019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045275
99	NC_007506	GTT	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045275
100	NC_007506	GCA	2	6	9121	9126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045275
101	NC_007506	GAA	2	6	9320	9325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045276
102	NC_007506	ATC	2	6	9348	9353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045276
103	NC_007506	GCA	2	6	9442	9447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045276
104	NC_007506	CGG	2	6	9452	9457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045276
105	NC_007506	GGA	3	9	9494	9502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045276
106	NC_007506	CCG	2	6	9506	9511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045276
107	NC_007506	AAG	2	6	9516	9521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045276
108	NC_007506	CTG	2	6	9552	9557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045276
109	NC_007506	CGG	2	6	9615	9620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045277
110	NC_007506	GAC	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045277
111	NC_007506	GAA	2	6	9877	9882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045277
112	NC_007506	CGA	2	6	10006	10011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045277
113	NC_007506	ATC	2	6	10088	10093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045277
114	NC_007506	CCG	2	6	10110	10115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045277
115	NC_007506	CAG	2	6	10217	10222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045277
116	NC_007506	CGG	2	6	10363	10368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045277
117	NC_007506	CCG	2	6	10443	10448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045278
118	NC_007506	TTC	2	6	10624	10629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045278
119	NC_007506	ATC	2	6	10643	10648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045278
120	NC_007506	CGT	2	6	10665	10670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045278
121	NC_007506	TTG	2	6	10691	10696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045278
122	NC_007506	TGC	2	6	10769	10774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045278
123	NC_007506	TTC	2	6	10775	10780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045278
124	NC_007506	ACG	2	6	10796	10801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045278
125	NC_007506	TAG	2	6	10802	10807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045278
126	NC_007506	TGA	2	6	10848	10853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045278
127	NC_007506	TCA	2	6	10902	10907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045278
128	NC_007506	CCG	2	6	10922	10927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045278
129	NC_007506	TGA	2	6	10966	10971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045278
130	NC_007506	TCA	2	6	11165	11170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045279
131	NC_007506	CGA	2	6	11220	11225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045279
132	NC_007506	TCG	2	6	11248	11253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045279
133	NC_007506	GAT	2	6	11260	11265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045279
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136	NC_007506	CTG	2	6	11435	11440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045279
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