MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV38

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007506	GC	3	6	1397	1402	0 %	0 %	50 %	50 %	78045266
2	NC_007506	GC	3	6	1673	1678	0 %	0 %	50 %	50 %	78045266
3	NC_007506	GC	4	8	2860	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	78045267
4	NC_007506	GT	3	6	3171	3176	0 %	50 %	50 %	0 %	78045268
5	NC_007506	GC	3	6	3212	3217	0 %	0 %	50 %	50 %	78045268
6	NC_007506	AC	3	6	4443	4448	50 %	0 %	0 %	50 %	78045270
7	NC_007506	GC	3	6	5806	5811	0 %	0 %	50 %	50 %	78045273
8	NC_007506	GC	3	6	5864	5869	0 %	0 %	50 %	50 %	78045273
9	NC_007506	GC	3	6	6281	6286	0 %	0 %	50 %	50 %	78045273
10	NC_007506	CA	3	6	6537	6542	50 %	0 %	0 %	50 %	78045273
11	NC_007506	GA	3	6	6741	6746	50 %	0 %	50 %	0 %	78045273
12	NC_007506	CA	3	6	7158	7163	50 %	0 %	0 %	50 %	78045274
13	NC_007506	CG	4	8	7503	7510	0 %	0 %	50 %	50 %	78045274
14	NC_007506	CG	3	6	9476	9481	0 %	0 %	50 %	50 %	78045276
15	NC_007506	CG	3	6	11128	11133	0 %	0 %	50 %	50 %	78045279
16	NC_007506	TC	3	6	12043	12048	0 %	50 %	0 %	50 %	78045280
17	NC_007506	GC	3	6	12152	12157	0 %	0 %	50 %	50 %	78045280
18	NC_007506	CG	3	6	12643	12648	0 %	0 %	50 %	50 %	78045281
19	NC_007506	CA	3	6	12943	12948	50 %	0 %	0 %	50 %	78045282
20	NC_007506	GC	3	6	12949	12954	0 %	0 %	50 %	50 %	78045282
21	NC_007506	GC	3	6	13484	13489	0 %	0 %	50 %	50 %	78045283
22	NC_007506	GC	3	6	13743	13748	0 %	0 %	50 %	50 %	78045284
23	NC_007506	CG	3	6	13791	13796	0 %	0 %	50 %	50 %	78045284
24	NC_007506	CG	4	8	14098	14105	0 %	0 %	50 %	50 %	78045284
25	NC_007506	GC	3	6	14136	14141	0 %	0 %	50 %	50 %	78045284
26	NC_007506	GT	3	6	14202	14207	0 %	50 %	50 %	0 %	78045284
27	NC_007506	CG	3	6	15340	15345	0 %	0 %	50 %	50 %	78045286
28	NC_007506	CG	3	6	16075	16080	0 %	0 %	50 %	50 %	78045286
29	NC_007506	CG	3	6	16452	16457	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
30	NC_007506	AC	3	6	16588	16593	50 %	0 %	0 %	50 %	78045287
31	NC_007506	GC	3	6	16621	16626	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
32	NC_007506	GC	3	6	16639	16644	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
33	NC_007506	CG	3	6	17204	17209	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
34	NC_007506	CG	3	6	18013	18018	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
35	NC_007506	GC	3	6	18532	18537	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
36	NC_007506	CG	3	6	18683	18688	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
37	NC_007506	GC	3	6	18750	18755	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
38	NC_007506	GC	3	6	18857	18862	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
39	NC_007506	CG	3	6	18901	18906	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
40	NC_007506	GT	3	6	19389	19394	0 %	50 %	50 %	0 %	78045288
41	NC_007506	GT	3	6	19611	19616	0 %	50 %	50 %	0 %	78045289
42	NC_007506	GC	3	6	21078	21083	0 %	0 %	50 %	50 %	78045291
43	NC_007506	AG	3	6	21291	21296	50 %	0 %	50 %	0 %	78045291
44	NC_007506	CG	3	6	22259	22264	0 %	0 %	50 %	50 %	78045293
45	NC_007506	CG	3	6	22408	22413	0 %	0 %	50 %	50 %	78045293
46	NC_007506	GC	3	6	22485	22490	0 %	0 %	50 %	50 %	78045293
47	NC_007506	CG	3	6	22639	22644	0 %	0 %	50 %	50 %	78045293
48	NC_007506	CG	4	8	22970	22977	0 %	0 %	50 %	50 %	78045294
49	NC_007506	CG	3	6	22988	22993	0 %	0 %	50 %	50 %	78045294
50	NC_007506	GC	3	6	23223	23228	0 %	0 %	50 %	50 %	78045294
51	NC_007506	CG	3	6	23424	23429	0 %	0 %	50 %	50 %	78045294
52	NC_007506	CG	3	6	24012	24017	0 %	0 %	50 %	50 %	78045295
53	NC_007506	GC	3	6	24633	24638	0 %	0 %	50 %	50 %	78045295
54	NC_007506	GC	3	6	25173	25178	0 %	0 %	50 %	50 %	78045296
55	NC_007506	GC	3	6	25386	25391	0 %	0 %	50 %	50 %	78045296
56	NC_007506	CG	3	6	26522	26527	0 %	0 %	50 %	50 %	78045297
57	NC_007506	AT	3	6	27325	27330	50 %	50 %	0 %	0 %	78045298
58	NC_007506	GC	3	6	27672	27677	0 %	0 %	50 %	50 %	78045299
59	NC_007506	GC	3	6	28332	28337	0 %	0 %	50 %	50 %	78045300
60	NC_007506	GC	3	6	29523	29528	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
61	NC_007506	GC	3	6	29708	29713	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
62	NC_007506	CG	3	6	29780	29785	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
63	NC_007506	CG	5	10	30645	30654	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
64	NC_007506	CG	3	6	30734	30739	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
65	NC_007506	GC	3	6	30744	30749	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
66	NC_007506	GC	3	6	30870	30875	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
67	NC_007506	CG	3	6	30905	30910	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
68	NC_007506	GC	3	6	31085	31090	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
69	NC_007506	GC	3	6	31583	31588	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
70	NC_007506	GC	3	6	32376	32381	0 %	0 %	50 %	50 %	78045302
71	NC_007506	TG	3	6	32431	32436	0 %	50 %	50 %	0 %	78045302
72	NC_007506	GC	3	6	32666	32671	0 %	0 %	50 %	50 %	78045303
73	NC_007506	GC	3	6	32995	33000	0 %	0 %	50 %	50 %	78045304
74	NC_007506	GC	3	6	33352	33357	0 %	0 %	50 %	50 %	78045305
75	NC_007506	CG	3	6	33365	33370	0 %	0 %	50 %	50 %	78045305
76	NC_007506	CG	3	6	33456	33461	0 %	0 %	50 %	50 %	78045305
77	NC_007506	CG	3	6	33723	33728	0 %	0 %	50 %	50 %	78045305
78	NC_007506	AG	3	6	34218	34223	50 %	0 %	50 %	0 %	78045305
79	NC_007506	GA	3	6	34549	34554	50 %	0 %	50 %	0 %	78045306
80	NC_007506	AC	3	6	35393	35398	50 %	0 %	0 %	50 %	78045306
81	NC_007506	CG	3	6	35891	35896	0 %	0 %	50 %	50 %	78045306
82	NC_007506	CG	3	6	36579	36584	0 %	0 %	50 %	50 %	78045306
83	NC_007506	CG	3	6	36700	36705	0 %	0 %	50 %	50 %	78045306
84	NC_007506	TG	3	6	37768	37773	0 %	50 %	50 %	0 %	78045308

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.