MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV19

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007505	ATCA	2	8	1156	1163	50 %	25 %	0 %	25 %	78045244
2	NC_007505	CGCA	2	8	1297	1304	25 %	0 %	25 %	50 %	78045244
3	NC_007505	AGCC	2	8	1692	1699	25 %	0 %	25 %	50 %	78045244
4	NC_007505	TCGC	2	8	1908	1915	0 %	25 %	25 %	50 %	78045244
5	NC_007505	GCTG	2	8	2025	2032	0 %	25 %	50 %	25 %	78045244
6	NC_007505	CGGG	2	8	2819	2826	0 %	0 %	75 %	25 %	78045244
7	NC_007505	TGGT	2	8	3521	3528	0 %	50 %	50 %	0 %	78045245
8	NC_007505	ATCG	2	8	4616	4623	25 %	25 %	25 %	25 %	78045247
9	NC_007505	CGCA	2	8	4767	4774	25 %	0 %	25 %	50 %	78045247
10	NC_007505	AGTC	2	8	4853	4860	25 %	25 %	25 %	25 %	78045247
11	NC_007505	GGCA	2	8	5161	5168	25 %	0 %	50 %	25 %	78045248
12	NC_007505	ATTG	2	8	5619	5626	25 %	50 %	25 %	0 %	78045250
13	NC_007505	TCGT	2	8	5718	5725	0 %	50 %	25 %	25 %	78045250
14	NC_007505	CCGA	3	12	7133	7144	25 %	0 %	25 %	50 %	78045250
15	NC_007505	TAGA	2	8	7876	7883	50 %	25 %	25 %	0 %	78045252
16	NC_007505	ACGG	2	8	8086	8093	25 %	0 %	50 %	25 %	78045253
17	NC_007505	TCCA	2	8	8193	8200	25 %	25 %	0 %	50 %	78045253
18	NC_007505	ACTG	2	8	8351	8358	25 %	25 %	25 %	25 %	78045253
19	NC_007505	GCTG	2	8	9166	9173	0 %	25 %	50 %	25 %	78045254
20	NC_007505	GGCG	2	8	9628	9635	0 %	0 %	75 %	25 %	78045255
21	NC_007505	GAGC	2	8	10467	10474	25 %	0 %	50 %	25 %	78045256
22	NC_007505	GCCA	2	8	10536	10543	25 %	0 %	25 %	50 %	78045256
23	NC_007505	GGTG	2	8	10719	10726	0 %	25 %	75 %	0 %	78045256
24	NC_007505	ACGC	2	8	10802	10809	25 %	0 %	25 %	50 %	78045256
25	NC_007505	GAGC	2	8	11848	11855	25 %	0 %	50 %	25 %	78045257
26	NC_007505	TCAG	2	8	12527	12534	25 %	25 %	25 %	25 %	78045257
27	NC_007505	AGCG	2	8	12818	12825	25 %	0 %	50 %	25 %	78045257
28	NC_007505	GGGC	2	8	13195	13202	0 %	0 %	75 %	25 %	78045257
29	NC_007505	CACG	2	8	13611	13618	25 %	0 %	25 %	50 %	78045257
30	NC_007505	CCAG	2	8	13866	13873	25 %	0 %	25 %	50 %	78045257
31	NC_007505	CGGA	2	8	14933	14940	25 %	0 %	50 %	25 %	78045259
32	NC_007505	CTCA	2	8	15406	15413	25 %	25 %	0 %	50 %	78045260
33	NC_007505	GTCG	2	8	15691	15698	0 %	25 %	50 %	25 %	78045260
34	NC_007505	ACAA	2	8	15780	15787	75 %	0 %	0 %	25 %	78045260
35	NC_007505	TCGA	2	8	15914	15921	25 %	25 %	25 %	25 %	78045260
36	NC_007505	GTAC	2	8	17512	17519	25 %	25 %	25 %	25 %	78045261
37	NC_007505	GCGT	2	8	17952	17959	0 %	25 %	50 %	25 %	78045262
38	NC_007505	CCGG	2	8	18534	18541	0 %	0 %	50 %	50 %	78045263

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.