MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007503	TGAAAA	2	12	220	231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	78043997
2	NC_007503	AGTTAA	2	12	4808	4819	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78043339
3	NC_007503	AAAGAA	2	12	4939	4950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	78043339
4	NC_007503	TGAAAA	2	12	5731	5742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	78044839
5	NC_007503	TCCGGA	2	12	9023	9034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78044965
6	NC_007503	ATGGCT	2	12	10359	10370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78043356
7	NC_007503	TGCTTC	2	12	12336	12347	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78042797
8	NC_007503	AAATTG	2	12	12666	12677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78043590
9	NC_007503	TTTTTA	2	12	17351	17362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	78045219
10	NC_007503	GGCGGT	2	12	19078	19089	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78043016
11	NC_007503	AAATAT	2	12	22381	22392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044067
12	NC_007503	AGTTTA	2	12	26109	26120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	78045203
13	NC_007503	TTTATC	2	12	27824	27835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	78043206
14	NC_007503	AAAGTT	2	12	41921	41932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78043743
15	NC_007503	TTTAAA	2	12	42226	42237	50 %	50 %	0 %	0 %	78043743
16	NC_007503	AGAGTT	2	12	45812	45823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043675
17	NC_007503	AATTCC	2	12	48050	48061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007503	AAGAGC	2	12	49235	49246	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007503	TATGAA	2	12	52920	52931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78044723
20	NC_007503	AACAAA	2	12	56882	56893	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	78043041
21	NC_007503	TTTTAA	2	12	59576	59587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044612
22	NC_007503	ATAATT	2	12	60631	60642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007503	AATTAT	2	12	65693	65704	50 %	50 %	0 %	0 %	78043036
24	NC_007503	TTATAA	2	12	66658	66669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007503	TAAAGC	2	12	71015	71026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	78042741
26	NC_007503	GCACCG	2	12	72583	72594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78044574
27	NC_007503	ATTTAT	2	12	87729	87740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044501
28	NC_007503	TAGCCT	2	12	88254	88265	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78043709
29	NC_007503	TTTTGG	2	12	88278	88289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043709
30	NC_007503	CCTGGA	2	12	89160	89171	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78044936
31	NC_007503	GGCAAA	2	12	91993	92004	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	78042874
32	NC_007503	GAGGCG	2	12	93589	93600	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78042762
33	NC_007503	AGCGGT	2	12	93723	93734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78042762
34	NC_007503	TTCCCG	2	12	94002	94013	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78042762
35	NC_007503	TAACCG	2	12	94937	94948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78042700
36	NC_007503	GCTTAT	2	12	95095	95106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	78043371
37	NC_007503	AGAGGT	2	12	100566	100577	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	78044391
38	NC_007503	GAAAAC	2	12	101058	101069	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	78045189
39	NC_007503	TCATTT	2	12	101369	101380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	78045189
40	NC_007503	AGAGAA	2	12	102501	102512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044039
41	NC_007503	GCTGGT	2	12	104090	104101	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78043951
42	NC_007503	CCCATA	2	12	104290	104301	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	78043951
43	NC_007503	AACTTA	2	12	104866	104877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	78043951
44	NC_007503	ATGCCC	2	12	107916	107927	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78043915
45	NC_007503	GACCTT	2	12	108555	108566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78044367
46	NC_007503	CACCGG	2	12	109725	109736	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	78044367
47	NC_007503	GCGGAA	2	12	111232	111243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78043057
48	NC_007503	GCGGCA	2	12	114383	114394	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78044660
49	NC_007503	AGCGGA	2	12	117900	117911	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78043440
50	NC_007503	GCGATA	2	12	117932	117943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78043440
51	NC_007503	CTTGGT	2	12	120179	120190	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	78043882
52	NC_007503	TGGTAA	2	12	123211	123222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78042726
53	NC_007503	CGGTGG	2	12	125045	125056	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78043023
54	NC_007503	ACGATG	2	12	126010	126021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78042713
55	NC_007503	GTTAGA	2	12	130922	130933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007503	CCGAGC	2	12	132173	132184	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007503	GAACTG	2	12	133574	133585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78043869
58	NC_007503	TCCCTG	2	12	136961	136972	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78044472
59	NC_007503	GGAAGA	2	12	137289	137300	50 %	0 %	50 %	0 %	78044242
60	NC_007503	GCGGGA	2	12	137428	137439	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78044242
61	NC_007503	TTTAAA	2	12	138525	138536	50 %	50 %	0 %	0 %	78042996
62	NC_007503	GGACCG	2	12	139186	139197	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78044530
63	NC_007503	TAAAGG	2	12	139726	139737	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	78044530
64	NC_007503	TTAACC	2	12	142375	142386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78043403
65	NC_007503	GGAAGA	2	12	143134	143145	50 %	0 %	50 %	0 %	78043269
66	NC_007503	CGGCAG	2	12	143171	143182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78043269
67	NC_007503	TTTGGT	2	12	145057	145068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044822
68	NC_007503	TAGCCA	2	12	147928	147939	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78043001
69	NC_007503	ACCGGG	2	12	155722	155733	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	78043003
70	NC_007503	GGGGTG	2	12	156381	156392	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	78042988
71	NC_007503	CTACCG	2	12	156403	156414	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78042988
72	NC_007503	AATTTA	2	12	156873	156884	50 %	50 %	0 %	0 %	78044899
73	NC_007503	TTTAAA	2	12	157232	157243	50 %	50 %	0 %	0 %	78044899
74	NC_007503	GTTGAT	2	12	158824	158835	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	78042945
75	NC_007503	AGGAGC	2	12	159735	159746	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78043335
76	NC_007503	CCCGGG	2	12	162103	162114	0 %	0 %	50 %	50 %	78044887
77	NC_007503	CGGTGG	2	12	163307	163318	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78042985
78	NC_007503	GAAGAG	2	12	163744	163755	50 %	0 %	50 %	0 %	78042985
79	NC_007503	TGCTTA	2	12	167727	167738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	78043233
80	NC_007503	AAAAGA	2	12	170883	170894	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	78043488
81	NC_007503	TTCGGC	2	12	173499	173510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78042798
82	NC_007503	GTAATT	2	12	175254	175265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	78043729
83	NC_007503	TTACCC	2	12	175975	175986	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	78043933
84	NC_007503	GAAAAA	2	12	177589	177600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	78042785
85	NC_007503	TTCTTT	2	12	180395	180406	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	78043977
86	NC_007503	TAAAAA	2	12	182743	182754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	78042845
87	NC_007503	AGATGA	2	12	183768	183779	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	78043239
88	NC_007503	AAAACC	2	12	185920	185931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043917
89	NC_007503	ATTTAA	2	12	187607	187618	50 %	50 %	0 %	0 %	78043165
90	NC_007503	TTTTAT	2	12	187753	187764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	78043165
91	NC_007503	TTGATT	2	12	189034	189045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	78043165
92	NC_007503	TGGCGG	2	12	192648	192659	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78045198
93	NC_007503	GGACGG	2	12	192799	192810	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78045198
94	NC_007503	GGGAAA	2	12	195050	195061	50 %	0 %	50 %	0 %	78044707
95	NC_007503	AATTAA	2	12	196247	196258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044939
96	NC_007503	ACCGGA	2	12	196852	196863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78042906
97	NC_007503	CGGAAA	2	12	197375	197386	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	78042906
98	NC_007503	TGGCCG	2	12	203569	203580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78043512
99	NC_007503	CCAAAG	2	12	205191	205202	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78043502
100	NC_007503	TGGCTC	2	12	209094	209105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78042886
101	NC_007503	CCGGGT	2	12	222353	222364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78044591
102	NC_007503	TCCGGT	2	12	223749	223760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044591
103	NC_007503	ACTATA	2	12	226756	226767	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007503	GGCTAA	2	12	227043	227054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78043707
105	NC_007503	CTTTCC	2	12	227247	227258	0 %	50 %	0 %	50 %	78043707
106	NC_007503	TTACCG	2	12	227972	227983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78043707
107	NC_007503	TTGCTT	2	12	232778	232789	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	78042837
108	NC_007503	CTTTTT	2	12	234938	234949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	78043283
109	NC_007503	CATACC	2	12	237609	237620	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	78045190
110	NC_007503	GATATT	2	12	237849	237860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	78045190
111	NC_007503	TAAAAC	2	12	241626	241637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	78044140
112	NC_007503	TTGAAG	2	12	241685	241696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044140
113	NC_007503	GGAGCG	2	12	243734	243745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78042659
114	NC_007503	GAAATT	2	12	244618	244629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78044494
115	NC_007503	GAAATT	2	12	246245	246256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78043763
116	NC_007503	AAAAAG	2	12	259227	259238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007503	GATATA	2	12	264760	264771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78043927
118	NC_007503	CAATGA	2	12	267889	267900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	78044166
119	NC_007503	AGCTAT	2	12	270384	270395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	78044948
120	NC_007503	AGGAAA	2	12	271075	271086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044948
121	NC_007503	CCGGGC	2	12	277559	277570	0 %	0 %	50 %	50 %	78043192
122	NC_007503	GATATT	2	12	280851	280862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	78043074
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238	NC_007503	GTAAAG	2	12	577859	577870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	78043971
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241	NC_007503	CATTAA	2	12	579585	579596	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
242	NC_007503	ATTAAA	2	12	580064	580075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78042901
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352	NC_007503	TGGCGA	2	12	865582	865593	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78044837
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355	NC_007503	AAATGA	2	12	869261	869272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	78043710
356	NC_007503	TTTGCT	2	12	869538	869549	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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472	NC_007503	TGTCCA	2	12	1135544	1135555	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78043099
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498	NC_007503	ATTTCC	2	12	1201676	1201687	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_007503	TTACGA	2	12	1205751	1205762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	78043171
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