MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 5833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007503	AGAT	2	8	203	210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007503	ACCA	2	8	238	245	50 %	0 %	0 %	50 %	78043997
3	NC_007503	GGCG	2	8	300	307	0 %	0 %	75 %	25 %	78043997
4	NC_007503	TTTC	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	78045102
5	NC_007503	GTAA	2	8	567	574	50 %	25 %	25 %	0 %	78045102
6	NC_007503	TCGA	2	8	759	766	25 %	25 %	25 %	25 %	78045102
7	NC_007503	CCAA	2	8	1491	1498	50 %	0 %	0 %	50 %	78043134
8	NC_007503	TCAA	2	8	1617	1624	50 %	25 %	0 %	25 %	78043134
9	NC_007503	GATC	2	8	1734	1741	25 %	25 %	25 %	25 %	78045166
10	NC_007503	TTAA	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	78045166
11	NC_007503	TAAT	2	8	3332	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	78044593
12	NC_007503	AGGA	2	8	3512	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	78044593
13	NC_007503	ATGT	2	8	4672	4679	25 %	50 %	25 %	0 %	78043339
14	NC_007503	TGAT	2	8	4991	4998	25 %	50 %	25 %	0 %	78043339
15	NC_007503	ATTT	2	8	5599	5606	25 %	75 %	0 %	0 %	78043339
16	NC_007503	AACG	2	8	5980	5987	50 %	0 %	25 %	25 %	78044839
17	NC_007503	CCAA	2	8	6505	6512	50 %	0 %	0 %	50 %	78043660
18	NC_007503	AAGG	2	8	6639	6646	50 %	0 %	50 %	0 %	78043660
19	NC_007503	TTAC	2	8	7023	7030	25 %	50 %	0 %	25 %	78043660
20	NC_007503	GAAA	2	8	7230	7237	75 %	0 %	25 %	0 %	78043660
21	NC_007503	AAAT	2	8	7292	7299	75 %	25 %	0 %	0 %	78043063
22	NC_007503	ACGT	2	8	7702	7709	25 %	25 %	25 %	25 %	78043063
23	NC_007503	ATTT	2	8	8196	8203	25 %	75 %	0 %	0 %	78044965
24	NC_007503	GAAG	2	8	8801	8808	50 %	0 %	50 %	0 %	78044965
25	NC_007503	GTTT	2	8	8921	8928	0 %	75 %	25 %	0 %	78044965
26	NC_007503	ATAA	2	8	9495	9502	75 %	25 %	0 %	0 %	78043356
27	NC_007503	GGTA	2	8	9959	9966	25 %	25 %	50 %	0 %	78043356
28	NC_007503	GGTG	2	8	10430	10437	0 %	25 %	75 %	0 %	78043356
29	NC_007503	GCAG	2	8	11160	11167	25 %	0 %	50 %	25 %	78044734
30	NC_007503	AAAT	2	8	11858	11865	75 %	25 %	0 %	0 %	78042797
31	NC_007503	TCCG	2	8	13253	13260	0 %	25 %	25 %	50 %	78043590
32	NC_007503	TTCA	2	8	13411	13418	25 %	50 %	0 %	25 %	78043673
33	NC_007503	AAGT	2	8	14166	14173	50 %	25 %	25 %	0 %	78043673
34	NC_007503	CGGG	2	8	14657	14664	0 %	0 %	75 %	25 %	78043587
35	NC_007503	CCGG	2	8	15354	15361	0 %	0 %	50 %	50 %	78042838
36	NC_007503	CCCT	2	8	16213	16220	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_007503	AATT	2	8	16506	16513	50 %	50 %	0 %	0 %	78044479
38	NC_007503	TTGT	2	8	17266	17273	0 %	75 %	25 %	0 %	78044479
39	NC_007503	GGAA	2	8	17380	17387	50 %	0 %	50 %	0 %	78045219
40	NC_007503	TTTA	2	8	18705	18712	25 %	75 %	0 %	0 %	78043016
41	NC_007503	AAGT	2	8	18756	18763	50 %	25 %	25 %	0 %	78043016
42	NC_007503	ATTA	2	8	18925	18932	50 %	50 %	0 %	0 %	78043016
43	NC_007503	ATTT	2	8	19019	19026	25 %	75 %	0 %	0 %	78043016
44	NC_007503	AGGA	2	8	19031	19038	50 %	0 %	50 %	0 %	78043016
45	NC_007503	GGTC	2	8	19279	19286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007503	TTTA	2	8	20458	20465	25 %	75 %	0 %	0 %	78045025
47	NC_007503	GTAC	2	8	21085	21092	25 %	25 %	25 %	25 %	78042960
48	NC_007503	AAAG	2	8	21336	21343	75 %	0 %	25 %	0 %	78042960
49	NC_007503	AATT	2	8	21368	21375	50 %	50 %	0 %	0 %	78042960
50	NC_007503	ATTT	2	8	22372	22379	25 %	75 %	0 %	0 %	78044067
51	NC_007503	GAAA	2	8	22415	22422	75 %	0 %	25 %	0 %	78044067
52	NC_007503	GGCT	2	8	23034	23041	0 %	25 %	50 %	25 %	78044623
53	NC_007503	CCGG	2	8	23075	23082	0 %	0 %	50 %	50 %	78044623
54	NC_007503	TGGT	2	8	23184	23191	0 %	50 %	50 %	0 %	78044623
55	NC_007503	TTAC	2	8	23525	23532	25 %	50 %	0 %	25 %	78044623
56	NC_007503	AAGC	2	8	23593	23600	50 %	0 %	25 %	25 %	78044623
57	NC_007503	TTCC	2	8	23984	23991	0 %	50 %	0 %	50 %	78044617
58	NC_007503	CTCG	2	8	24080	24087	0 %	25 %	25 %	50 %	78044617
59	NC_007503	TTTA	2	8	24219	24226	25 %	75 %	0 %	0 %	78044617
60	NC_007503	CCGC	2	8	24584	24591	0 %	0 %	25 %	75 %	78044617
61	NC_007503	CGGG	2	8	24658	24665	0 %	0 %	75 %	25 %	78044617
62	NC_007503	TAAA	2	8	24968	24975	75 %	25 %	0 %	0 %	78044617
63	NC_007503	TAAT	2	8	25037	25044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007503	TAAA	2	8	25922	25929	75 %	25 %	0 %	0 %	78045203
65	NC_007503	AAAG	2	8	26628	26635	75 %	0 %	25 %	0 %	78043206
66	NC_007503	TTAA	2	8	26772	26779	50 %	50 %	0 %	0 %	78043206
67	NC_007503	GTTT	2	8	26995	27002	0 %	75 %	25 %	0 %	78043206
68	NC_007503	CCGG	2	8	27636	27643	0 %	0 %	50 %	50 %	78043206
69	NC_007503	TACC	2	8	28183	28190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007503	GTAA	2	8	28345	28352	50 %	25 %	25 %	0 %	78042831
71	NC_007503	TTTA	2	8	29698	29705	25 %	75 %	0 %	0 %	78044007
72	NC_007503	AACC	2	8	29757	29764	50 %	0 %	0 %	50 %	78044007
73	NC_007503	CGGG	2	8	29860	29867	0 %	0 %	75 %	25 %	78044007
74	NC_007503	TCCC	2	8	31078	31085	0 %	25 %	0 %	75 %	78043822
75	NC_007503	CGCC	2	8	31303	31310	0 %	0 %	25 %	75 %	78043822
76	NC_007503	GCGG	2	8	33031	33038	0 %	0 %	75 %	25 %	78043236
77	NC_007503	CGAA	2	8	33295	33302	50 %	0 %	25 %	25 %	78043236
78	NC_007503	CGGC	2	8	33416	33423	0 %	0 %	50 %	50 %	78043236
79	NC_007503	TGGA	2	8	34737	34744	25 %	25 %	50 %	0 %	78044629
80	NC_007503	TAAT	2	8	34872	34879	50 %	50 %	0 %	0 %	78044629
81	NC_007503	TTAT	2	8	35343	35350	25 %	75 %	0 %	0 %	78044081
82	NC_007503	AGGG	2	8	36067	36074	25 %	0 %	75 %	0 %	78044081
83	NC_007503	TTCC	2	8	38806	38813	0 %	50 %	0 %	50 %	78042679
84	NC_007503	TATC	2	8	39934	39941	25 %	50 %	0 %	25 %	78045175
85	NC_007503	ACCG	2	8	40061	40068	25 %	0 %	25 %	50 %	78045175
86	NC_007503	TATT	2	8	41537	41544	25 %	75 %	0 %	0 %	78043743
87	NC_007503	TTAC	2	8	41856	41863	25 %	50 %	0 %	25 %	78043743
88	NC_007503	ATTC	2	8	41903	41910	25 %	50 %	0 %	25 %	78043743
89	NC_007503	AATT	2	8	42072	42079	50 %	50 %	0 %	0 %	78043743
90	NC_007503	GATT	2	8	42713	42720	25 %	50 %	25 %	0 %	78042958
91	NC_007503	GCGG	2	8	42826	42833	0 %	0 %	75 %	25 %	78042958
92	NC_007503	CGAG	2	8	43476	43483	25 %	0 %	50 %	25 %	78042983
93	NC_007503	GGAA	2	8	43485	43492	50 %	0 %	50 %	0 %	78042983
94	NC_007503	TTTA	2	8	44001	44008	25 %	75 %	0 %	0 %	78043617
95	NC_007503	AAGG	2	8	44542	44549	50 %	0 %	50 %	0 %	78043091
96	NC_007503	AAAG	2	8	45237	45244	75 %	0 %	25 %	0 %	78043675
97	NC_007503	TTAT	2	8	46324	46331	25 %	75 %	0 %	0 %	78044578
98	NC_007503	AAAG	2	8	47370	47377	75 %	0 %	25 %	0 %	78045158
99	NC_007503	CTTT	2	8	47709	47716	0 %	75 %	0 %	25 %	78045158
100	NC_007503	CATT	2	8	48368	48375	25 %	50 %	0 %	25 %	78042746
101	NC_007503	GATG	2	8	48999	49006	25 %	25 %	50 %	0 %	78042746
102	NC_007503	TCAA	2	8	49225	49232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007503	TAAA	2	8	49282	49289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007503	ATTA	2	8	49306	49313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007503	CGGG	2	8	49882	49889	0 %	0 %	75 %	25 %	78043316
106	NC_007503	TATT	2	8	50273	50280	25 %	75 %	0 %	0 %	78043316
107	NC_007503	ATTG	2	8	50377	50384	25 %	50 %	25 %	0 %	78043316
108	NC_007503	CGTT	2	8	50537	50544	0 %	50 %	25 %	25 %	78043316
109	NC_007503	ATTT	2	8	50737	50744	25 %	75 %	0 %	0 %	78043316
110	NC_007503	AGTT	2	8	50892	50899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007503	TGCT	2	8	51401	51408	0 %	50 %	25 %	25 %	78044230
112	NC_007503	CTAC	2	8	51999	52006	25 %	25 %	0 %	50 %	78043076
113	NC_007503	GGAT	2	8	52099	52106	25 %	25 %	50 %	0 %	78043076
114	NC_007503	ATTG	2	8	52238	52245	25 %	50 %	25 %	0 %	78043076
115	NC_007503	ATTG	2	8	52344	52351	25 %	50 %	25 %	0 %	78043076
116	NC_007503	AGTG	2	8	53656	53663	25 %	25 %	50 %	0 %	78044723
117	NC_007503	GCAG	2	8	53799	53806	25 %	0 %	50 %	25 %	78044723
118	NC_007503	ATGC	2	8	54723	54730	25 %	25 %	25 %	25 %	78044013
119	NC_007503	TTTC	2	8	54785	54792	0 %	75 %	0 %	25 %	78044013
120	NC_007503	CCGG	2	8	54878	54885	0 %	0 %	50 %	50 %	78044013
121	NC_007503	TGAA	2	8	55080	55087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007503	AGTA	2	8	55181	55188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007503	TGTA	2	8	55418	55425	25 %	50 %	25 %	0 %	78043435
124	NC_007503	GAGG	2	8	55445	55452	25 %	0 %	75 %	0 %	78043435
125	NC_007503	AATC	2	8	55823	55830	50 %	25 %	0 %	25 %	78043435
126	NC_007503	ATAG	2	8	56560	56567	50 %	25 %	25 %	0 %	78043041
127	NC_007503	GTTT	2	8	56841	56848	0 %	75 %	25 %	0 %	78043041
128	NC_007503	TTAA	2	8	57178	57185	50 %	50 %	0 %	0 %	78043041
129	NC_007503	TAAA	2	8	58422	58429	75 %	25 %	0 %	0 %	78044497
130	NC_007503	CCCA	2	8	58541	58548	25 %	0 %	0 %	75 %	78044497
131	NC_007503	CGGA	2	8	58635	58642	25 %	0 %	50 %	25 %	78044497
132	NC_007503	TTTG	2	8	59190	59197	0 %	75 %	25 %	0 %	78044612
133	NC_007503	TTAA	2	8	59641	59648	50 %	50 %	0 %	0 %	78044612
134	NC_007503	CTTT	2	8	59702	59709	0 %	75 %	0 %	25 %	78044612
135	NC_007503	TGCC	2	8	59774	59781	0 %	25 %	25 %	50 %	78044612
136	NC_007503	ATTT	2	8	60170	60177	25 %	75 %	0 %	0 %	78044612
137	NC_007503	TTAT	2	8	60217	60224	25 %	75 %	0 %	0 %	78044612
138	NC_007503	TAAA	2	8	60755	60762	75 %	25 %	0 %	0 %	78044032
139	NC_007503	GATT	2	8	60972	60979	25 %	50 %	25 %	0 %	78044032
140	NC_007503	GCGG	2	8	61967	61974	0 %	0 %	75 %	25 %	78042932
141	NC_007503	CTTT	2	8	62475	62482	0 %	75 %	0 %	25 %	78044978
142	NC_007503	TTAT	2	8	62667	62674	25 %	75 %	0 %	0 %	78044978
143	NC_007503	TAAA	2	8	64489	64496	75 %	25 %	0 %	0 %	78043610
144	NC_007503	ATGC	2	8	64594	64601	25 %	25 %	25 %	25 %	78043610
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