MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 5195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007503	ACCA	2	8	238	245	50 %	0 %	0 %	50 %	78043997
2	NC_007503	GGCG	2	8	300	307	0 %	0 %	75 %	25 %	78043997
3	NC_007503	TTTC	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	78045102
4	NC_007503	GTAA	2	8	567	574	50 %	25 %	25 %	0 %	78045102
5	NC_007503	TCGA	2	8	759	766	25 %	25 %	25 %	25 %	78045102
6	NC_007503	CCAA	2	8	1491	1498	50 %	0 %	0 %	50 %	78043134
7	NC_007503	TCAA	2	8	1617	1624	50 %	25 %	0 %	25 %	78043134
8	NC_007503	GATC	2	8	1734	1741	25 %	25 %	25 %	25 %	78045166
9	NC_007503	TTAA	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	78045166
10	NC_007503	TAAT	2	8	3332	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	78044593
11	NC_007503	AGGA	2	8	3512	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	78044593
12	NC_007503	ATGT	2	8	4672	4679	25 %	50 %	25 %	0 %	78043339
13	NC_007503	TGAT	2	8	4991	4998	25 %	50 %	25 %	0 %	78043339
14	NC_007503	ATTT	2	8	5599	5606	25 %	75 %	0 %	0 %	78043339
15	NC_007503	AACG	2	8	5980	5987	50 %	0 %	25 %	25 %	78044839
16	NC_007503	CCAA	2	8	6505	6512	50 %	0 %	0 %	50 %	78043660
17	NC_007503	AAGG	2	8	6639	6646	50 %	0 %	50 %	0 %	78043660
18	NC_007503	TTAC	2	8	7023	7030	25 %	50 %	0 %	25 %	78043660
19	NC_007503	GAAA	2	8	7230	7237	75 %	0 %	25 %	0 %	78043660
20	NC_007503	AAAT	2	8	7292	7299	75 %	25 %	0 %	0 %	78043063
21	NC_007503	ACGT	2	8	7702	7709	25 %	25 %	25 %	25 %	78043063
22	NC_007503	ATTT	2	8	8196	8203	25 %	75 %	0 %	0 %	78044965
23	NC_007503	GAAG	2	8	8801	8808	50 %	0 %	50 %	0 %	78044965
24	NC_007503	GTTT	2	8	8921	8928	0 %	75 %	25 %	0 %	78044965
25	NC_007503	ATAA	2	8	9495	9502	75 %	25 %	0 %	0 %	78043356
26	NC_007503	GGTA	2	8	9959	9966	25 %	25 %	50 %	0 %	78043356
27	NC_007503	GGTG	2	8	10430	10437	0 %	25 %	75 %	0 %	78043356
28	NC_007503	GCAG	2	8	11160	11167	25 %	0 %	50 %	25 %	78044734
29	NC_007503	AAAT	2	8	11858	11865	75 %	25 %	0 %	0 %	78042797
30	NC_007503	TCCG	2	8	13253	13260	0 %	25 %	25 %	50 %	78043590
31	NC_007503	TTCA	2	8	13411	13418	25 %	50 %	0 %	25 %	78043673
32	NC_007503	AAGT	2	8	14166	14173	50 %	25 %	25 %	0 %	78043673
33	NC_007503	CGGG	2	8	14657	14664	0 %	0 %	75 %	25 %	78043587
34	NC_007503	CCGG	2	8	15354	15361	0 %	0 %	50 %	50 %	78042838
35	NC_007503	AATT	2	8	16506	16513	50 %	50 %	0 %	0 %	78044479
36	NC_007503	TTGT	2	8	17266	17273	0 %	75 %	25 %	0 %	78044479
37	NC_007503	GGAA	2	8	17380	17387	50 %	0 %	50 %	0 %	78045219
38	NC_007503	TTTA	2	8	18705	18712	25 %	75 %	0 %	0 %	78043016
39	NC_007503	AAGT	2	8	18756	18763	50 %	25 %	25 %	0 %	78043016
40	NC_007503	ATTA	2	8	18925	18932	50 %	50 %	0 %	0 %	78043016
41	NC_007503	ATTT	2	8	19019	19026	25 %	75 %	0 %	0 %	78043016
42	NC_007503	AGGA	2	8	19031	19038	50 %	0 %	50 %	0 %	78043016
43	NC_007503	TTTA	2	8	20458	20465	25 %	75 %	0 %	0 %	78045025
44	NC_007503	GTAC	2	8	21085	21092	25 %	25 %	25 %	25 %	78042960
45	NC_007503	AAAG	2	8	21336	21343	75 %	0 %	25 %	0 %	78042960
46	NC_007503	AATT	2	8	21368	21375	50 %	50 %	0 %	0 %	78042960
47	NC_007503	ATTT	2	8	22372	22379	25 %	75 %	0 %	0 %	78044067
48	NC_007503	GAAA	2	8	22415	22422	75 %	0 %	25 %	0 %	78044067
49	NC_007503	GGCT	2	8	23034	23041	0 %	25 %	50 %	25 %	78044623
50	NC_007503	CCGG	2	8	23075	23082	0 %	0 %	50 %	50 %	78044623
51	NC_007503	TGGT	2	8	23184	23191	0 %	50 %	50 %	0 %	78044623
52	NC_007503	TTAC	2	8	23525	23532	25 %	50 %	0 %	25 %	78044623
53	NC_007503	AAGC	2	8	23593	23600	50 %	0 %	25 %	25 %	78044623
54	NC_007503	TTCC	2	8	23984	23991	0 %	50 %	0 %	50 %	78044617
55	NC_007503	CTCG	2	8	24080	24087	0 %	25 %	25 %	50 %	78044617
56	NC_007503	TTTA	2	8	24219	24226	25 %	75 %	0 %	0 %	78044617
57	NC_007503	CCGC	2	8	24584	24591	0 %	0 %	25 %	75 %	78044617
58	NC_007503	CGGG	2	8	24658	24665	0 %	0 %	75 %	25 %	78044617
59	NC_007503	TAAA	2	8	24968	24975	75 %	25 %	0 %	0 %	78044617
60	NC_007503	TAAA	2	8	25922	25929	75 %	25 %	0 %	0 %	78045203
61	NC_007503	AAAG	2	8	26628	26635	75 %	0 %	25 %	0 %	78043206
62	NC_007503	TTAA	2	8	26772	26779	50 %	50 %	0 %	0 %	78043206
63	NC_007503	GTTT	2	8	26995	27002	0 %	75 %	25 %	0 %	78043206
64	NC_007503	CCGG	2	8	27636	27643	0 %	0 %	50 %	50 %	78043206
65	NC_007503	GTAA	2	8	28345	28352	50 %	25 %	25 %	0 %	78042831
66	NC_007503	TTTA	2	8	29698	29705	25 %	75 %	0 %	0 %	78044007
67	NC_007503	AACC	2	8	29757	29764	50 %	0 %	0 %	50 %	78044007
68	NC_007503	CGGG	2	8	29860	29867	0 %	0 %	75 %	25 %	78044007
69	NC_007503	TCCC	2	8	31078	31085	0 %	25 %	0 %	75 %	78043822
70	NC_007503	CGCC	2	8	31303	31310	0 %	0 %	25 %	75 %	78043822
71	NC_007503	GCGG	2	8	33031	33038	0 %	0 %	75 %	25 %	78043236
72	NC_007503	CGAA	2	8	33295	33302	50 %	0 %	25 %	25 %	78043236
73	NC_007503	CGGC	2	8	33416	33423	0 %	0 %	50 %	50 %	78043236
74	NC_007503	TGGA	2	8	34737	34744	25 %	25 %	50 %	0 %	78044629
75	NC_007503	TAAT	2	8	34872	34879	50 %	50 %	0 %	0 %	78044629
76	NC_007503	TTAT	2	8	35343	35350	25 %	75 %	0 %	0 %	78044081
77	NC_007503	AGGG	2	8	36067	36074	25 %	0 %	75 %	0 %	78044081
78	NC_007503	TTCC	2	8	38806	38813	0 %	50 %	0 %	50 %	78042679
79	NC_007503	TATC	2	8	39934	39941	25 %	50 %	0 %	25 %	78045175
80	NC_007503	ACCG	2	8	40061	40068	25 %	0 %	25 %	50 %	78045175
81	NC_007503	TATT	2	8	41537	41544	25 %	75 %	0 %	0 %	78043743
82	NC_007503	TTAC	2	8	41856	41863	25 %	50 %	0 %	25 %	78043743
83	NC_007503	ATTC	2	8	41903	41910	25 %	50 %	0 %	25 %	78043743
84	NC_007503	AATT	2	8	42072	42079	50 %	50 %	0 %	0 %	78043743
85	NC_007503	GATT	2	8	42713	42720	25 %	50 %	25 %	0 %	78042958
86	NC_007503	GCGG	2	8	42826	42833	0 %	0 %	75 %	25 %	78042958
87	NC_007503	CGAG	2	8	43476	43483	25 %	0 %	50 %	25 %	78042983
88	NC_007503	GGAA	2	8	43485	43492	50 %	0 %	50 %	0 %	78042983
89	NC_007503	TTTA	2	8	44001	44008	25 %	75 %	0 %	0 %	78043617
90	NC_007503	AAGG	2	8	44542	44549	50 %	0 %	50 %	0 %	78043091
91	NC_007503	AAAG	2	8	45237	45244	75 %	0 %	25 %	0 %	78043675
92	NC_007503	TTAT	2	8	46324	46331	25 %	75 %	0 %	0 %	78044578
93	NC_007503	AAAG	2	8	47370	47377	75 %	0 %	25 %	0 %	78045158
94	NC_007503	CTTT	2	8	47709	47716	0 %	75 %	0 %	25 %	78045158
95	NC_007503	CATT	2	8	48368	48375	25 %	50 %	0 %	25 %	78042746
96	NC_007503	GATG	2	8	48999	49006	25 %	25 %	50 %	0 %	78042746
97	NC_007503	CGGG	2	8	49882	49889	0 %	0 %	75 %	25 %	78043316
98	NC_007503	TATT	2	8	50273	50280	25 %	75 %	0 %	0 %	78043316
99	NC_007503	ATTG	2	8	50377	50384	25 %	50 %	25 %	0 %	78043316
100	NC_007503	CGTT	2	8	50537	50544	0 %	50 %	25 %	25 %	78043316
101	NC_007503	ATTT	2	8	50737	50744	25 %	75 %	0 %	0 %	78043316
102	NC_007503	TGCT	2	8	51401	51408	0 %	50 %	25 %	25 %	78044230
103	NC_007503	CTAC	2	8	51999	52006	25 %	25 %	0 %	50 %	78043076
104	NC_007503	GGAT	2	8	52099	52106	25 %	25 %	50 %	0 %	78043076
105	NC_007503	ATTG	2	8	52238	52245	25 %	50 %	25 %	0 %	78043076
106	NC_007503	ATTG	2	8	52344	52351	25 %	50 %	25 %	0 %	78043076
107	NC_007503	AGTG	2	8	53656	53663	25 %	25 %	50 %	0 %	78044723
108	NC_007503	GCAG	2	8	53799	53806	25 %	0 %	50 %	25 %	78044723
109	NC_007503	ATGC	2	8	54723	54730	25 %	25 %	25 %	25 %	78044013
110	NC_007503	TTTC	2	8	54785	54792	0 %	75 %	0 %	25 %	78044013
111	NC_007503	CCGG	2	8	54878	54885	0 %	0 %	50 %	50 %	78044013
112	NC_007503	TGTA	2	8	55418	55425	25 %	50 %	25 %	0 %	78043435
113	NC_007503	GAGG	2	8	55445	55452	25 %	0 %	75 %	0 %	78043435
114	NC_007503	AATC	2	8	55823	55830	50 %	25 %	0 %	25 %	78043435
115	NC_007503	ATAG	2	8	56560	56567	50 %	25 %	25 %	0 %	78043041
116	NC_007503	GTTT	2	8	56841	56848	0 %	75 %	25 %	0 %	78043041
117	NC_007503	TTAA	2	8	57178	57185	50 %	50 %	0 %	0 %	78043041
118	NC_007503	TAAA	2	8	58422	58429	75 %	25 %	0 %	0 %	78044497
119	NC_007503	CCCA	2	8	58541	58548	25 %	0 %	0 %	75 %	78044497
120	NC_007503	CGGA	2	8	58635	58642	25 %	0 %	50 %	25 %	78044497
121	NC_007503	TTTG	2	8	59190	59197	0 %	75 %	25 %	0 %	78044612
122	NC_007503	TTAA	2	8	59641	59648	50 %	50 %	0 %	0 %	78044612
123	NC_007503	CTTT	2	8	59702	59709	0 %	75 %	0 %	25 %	78044612
124	NC_007503	TGCC	2	8	59774	59781	0 %	25 %	25 %	50 %	78044612
125	NC_007503	ATTT	2	8	60170	60177	25 %	75 %	0 %	0 %	78044612
126	NC_007503	TTAT	2	8	60217	60224	25 %	75 %	0 %	0 %	78044612
127	NC_007503	TAAA	2	8	60755	60762	75 %	25 %	0 %	0 %	78044032
128	NC_007503	GATT	2	8	60972	60979	25 %	50 %	25 %	0 %	78044032
129	NC_007503	GCGG	2	8	61967	61974	0 %	0 %	75 %	25 %	78042932
130	NC_007503	CTTT	2	8	62475	62482	0 %	75 %	0 %	25 %	78044978
131	NC_007503	TTAT	2	8	62667	62674	25 %	75 %	0 %	0 %	78044978
132	NC_007503	TAAA	2	8	64489	64496	75 %	25 %	0 %	0 %	78043610
133	NC_007503	ATGC	2	8	64594	64601	25 %	25 %	25 %	25 %	78043610
134	NC_007503	AGGC	2	8	65035	65042	25 %	0 %	50 %	25 %	78043036
135	NC_007503	ACAA	2	8	65451	65458	75 %	0 %	0 %	25 %	78043036
136	NC_007503	ACTT	2	8	65510	65517	25 %	50 %	0 %	25 %	78043036
137	NC_007503	TACC	2	8	66139	66146	25 %	25 %	0 %	50 %	78043036
138	NC_007503	AAAT	2	8	66273	66280	75 %	25 %	0 %	0 %	78043036
139	NC_007503	AATT	2	8	66739	66746	50 %	50 %	0 %	0 %	78045094
140	NC_007503	ATCA	2	8	66762	66769	50 %	25 %	0 %	25 %	78045094
141	NC_007503	TTCT	2	8	66868	66875	0 %	75 %	0 %	25 %	78045094
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143	NC_007503	TAAA	2	8	67429	67436	75 %	25 %	0 %	0 %	78045094
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